ChemComp-UFT: 2'-deoxy-2'-fluorouridine 5'-(dihydrogen phosphate)

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: UFT
• 名称: 名称: 2'-deoxy-2'-fluorouridine 5'-(dihydrogen phosphate); 日化辞名称: 2′-フルオロ-2′-デオキシウリジン5′-りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₂FN₂O₈P / 原子数: 33 / 化学式量: 326.172 / 形式電荷: 0

その他

3dd2

DU

タイプ: DNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: U / 3文字コード: UFT / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3DD2 / 親要素: DU

履歴

作成	2008年7月7日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OCC2OC(N1C(=O)NC(=O)C=C1)C(F)C2O
• CACTVS 3.341: O[CH]1[CH](F)[CH](O[CH]1CO[P](O)(O)=O)N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)NC1=O)C2C(C(C(O2)COP(=O)(O)O)O)F

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: O[C@H]1[C@@H](F)[C@@H](O[C@@H]1CO[P](O)(O)=O)N2C=CC(=O)NC2=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2[C@@H]([C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O)F

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H12FN2O8P/c10-6-7(14)4(3-19-21(16,17)18)20-8(6)12-2-1-5(13)11-9(12)15/h1-2,4,6-8,14H,3H2,(H,11,13,15)(H2,16,17,18)/t4-,6-,7-,8-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: RTGGYPQTXNSBPD-XVFCMESISA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2'-deoxy-2'-fluorouridine 5'-(dihydrogen phosphate)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3R,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-4-fluoro-3-hydroxy-oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-3mo7:
Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 2'-fluoro-6-iodo-UMP

PDB-3mwa:
Crystal structure of Plasmodium falciparum orotidine 5'-monophosphate decarboxylase covalently modified by 2-prime-fluoro-6-iodo-UMP