ChemComp-UDM: URIDINE-DIPHOSPHATE-METHYLENE-N-ACETYL-GLUCOSAMINE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: UDM
• 名称: 名称: uridine-diphosphate-methylene-N-acetyl-glucosamine; 別称: ((2S,3R,4R,5S,6R)-3-ACETAMIDO-4,5-DIHYDROXY-6-(HYDROXYMETHYL)-TETRAHYDRO-2H-PYRAN-2-YL)METHYLPHOSPHONIC; 日化辞名称: (5′-ウリジル酸)[2-(アセチルアミノ)-2-デオキシ-α-D-グルコピラノシルメチルホスホン酸]無水物

Chemical information

組成

組成式: C₁₈H₂₉N₃O₁₆P₂ / 原子数: 68 / 化学式量: 605.381 / 形式電荷: 0

その他

2apc

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: UDM / モデル座標のPDB-ID: 2APC

履歴

作成	2005年9月21日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• CACTVS 3.341: CC(=O)N[CH]1[CH](O)[CH](O)[CH](CO)O[CH]1C[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(=O)NC1C(OC(C(C1O)O)CO)CP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1C[P@@](O)(=O)O[P@@](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC(=O)N[C@H]1[C@H](O[C@@H]([C@H]([C@@H]1O)O)CO)C[P@](=O)(O)O[P@](=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C18H29N3O16P2/c1-7(23)19-12-10(35-8(4-22)13(25)15(12)27)6-38(30,31)37-39(32,33)34-5-9-14(26)16(28)17(36-9)21-3-2-11(24)20-18(21)29/h2-3,8-10,12-17,22,25-28H,4-6H2,1H3,(H,19,23)(H,30,31)(H,32,33)(H,20,24,29)/t8-,9-,10-,12+,13-,14-,15-,16-,17-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KUFKOJZYUNOEES-DLLWPQOWSA-N

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-2apc:
Crystal Structure of N-Acetylglucosaminyltransferase I in Complex with UDP-GlcNAc phosphonate

PDB-2jlb:
Xanthomonas campestris putative OGT (XCC0866), complex with UDP- GlcNAc phosphonate analogue