ChemComp-TFF: 5'-O-[(R)-{[(R)-[difluoro(phosphono)methyl](hydroxy)phosphoryl](d...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: TFF
• 名称: 名称: 5'-O-[(R)-{[(R)-[difluoro(phosphono)methyl](hydroxy)phosphoryl](difluoro)methyl}(hydroxy)phosphoryl]thymidine

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₁₇F₄N₂O₁₂P₃ / 原子数: 50 / 化学式量: 550.184 / 形式電荷: 0

その他

3lk9

DT

タイプ: DNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 3文字コード: TFF / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3LK9 / 親要素: DT

履歴

作成	2010年2月4日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.352: CC1=CN([CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)C(F)(F)[P](O)(=O)C(F)(F)[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2CC(C(O2)COP(=O)(C(F)(F)P(=O)(C(F)(F)P(=O)(O)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.352: CC1=CN([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)C(F)(F)[P](O)(=O)C(F)(F)[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.0: CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)CO[P@@](=O)(C(F)(F)[P@@](=O)(C(F)(F)P(=O)(O)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H17F4N2O12P3/c1-5-3-18(10(21)17-9(5)20)8-2-6(19)7(30-8)4-29-33(27,28)12(15,16)31(22,23)11(13,14)32(24,25)26/h3,6-8,19H,2,4H2,1H3,(H,22,23)(H,27,28)(H,17,20,21)(H2,24,25,26)/t6-,7+,8+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: HHJYLFURQLSDJT-XLPZGREQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 1.6.1: [[[difluoro-[hydroxy-[[(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy]phosphoryl]methyl]-hydroxy-phosphoryl]-difluoro-methyl]phosphonic acid

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-3lk9:
DNA polymerase beta with a gapped DNA substrate and dTMP(CF2)P(CF2)P