ChemComp-DT: THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: DT
• 名称: 名称: thymidine-5'-monophosphate / 日化辞名称: TMP
• コメント: dTMP*YM

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₅N₂O₈P / 原子数: 36 / 化学式量: 322.208 / 形式電荷: 0

その他

214d

T

タイプ: DNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: T / 3文字コード: DT / 理論座標の詳細: OpenEye OEToolkits / モデル座標のPDB-ID: 214D / 置き換え元: T

履歴

作成	2006年12月5日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / BindingDB / Brenda / ChEBI / ChEMBL / DrugBank / HMDB / KEGG_Ligand / Metabolights / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1NC(=O)N(C=C1C)C2OC(C(O)C2)COP(=O)(O)O
• CACTVS 3.341: CC1=CN([CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2CC(C(O2)COP(=O)(O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CC1=CN([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H15N2O8P/c1-5-3-12(10(15)11-9(5)14)8-2-6(13)7(20-8)4-19-21(16,17)18/h3,6-8,13H,2,4H2,1H3,(H,11,14,15)(H2,16,17,18)/t6-,7+,8+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: GYOZYWVXFNDGLU-XLPZGREQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5'-thymidylic acid
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,5R)-3-hydroxy-5-(5-methyl-2,4-dioxo-pyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-5cdm:
2.5A structure of QPT-1 with S.aureus DNA gyrase and DNA