ChemComp-SI3: 5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-D-glycero-D-galacto-non-2-ulosonic acid

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: SI3
• 名称: 名称: 5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-D-glycero-D-galacto-non-2-ulosonic acid; 別称: N-acetylneuraminic acid, ketone form / 日化辞名称: N-アセチルノイラミン酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₉NO₉ / 原子数: 40 / 化学式量: 309.27 / 形式電荷: 0

その他

4imf

タイプ: D-SACCHARIDE / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: SI3 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4IMF

履歴

作成	2013年1月4日
公開	2013年11月6日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)C(=O)CC(O)C(NC(=O)C)C(O)C(O)C(O)CO
• CACTVS 3.370: CC(=O)N[CH]([CH](O)CC(=O)C(O)=O)[CH](O)[CH](O)[CH](O)CO
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC(=O)NC(C(CC(=O)C(=O)O)O)C(C(C(CO)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CC(=O)N[C@H]([C@@H](O)CC(=O)C(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC(=O)N[C@H]([C@H](CC(=O)C(=O)O)O)[C@H]([C@@H]([C@@H](CO)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H19NO9/c1-4(14)12-8(5(15)2-6(16)11(20)21)10(19)9(18)7(17)3-13/h5,7-10,13,15,17-19H,2-3H2,1H3,(H,12,14)(H,20,21)/t5-,7+,8+,9+,10+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KBGAYAKRZNYFFG-BOHATCBPSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5-(acetylamino)-3,5-dideoxy-D-glycero-D-galacto-non-2-ulosonic acid
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: (4S,5R,6R,7S,8R)-5-acetamido-4,6,7,8,9-pentakis(oxidanyl)-2-oxidanylidene-nonanoic acid

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-4bwl:
Structure of the Y137A mutant of E. coli N-acetylneuraminic acid lyase in complex with pyruvate, N-acetyl-D-mannosamine and N- acetylneuraminic acid

PDB-4imf:
Crystal Structure of Pasteurella multocida N-Acetyl-D-Neuraminic acid lyase K164 mutant complexed with N-Acetylneuraminic acid

PDB-6rd1:
Ruminococcus gnavus sialic acid aldolase catalytic lysine mutant in complex with sialic acid