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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDG84 |
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試料 | Autoinhibited dimer of truncated 6xHis Cytohesin-2 (ARNO, amino acids 2-400) with Inositol 1,3,4,5-tetrakis phosphate (DAMMIF, GASBOR and antiparallel CORAL models)
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 extrinsic component of postsynaptic specialization membrane / Intra-Golgi traffic / regulation of ARF protein signal transduction / negative regulation of dendrite development / inositol 1,4,5 trisphosphate binding / bicellular tight junction / regulation of cell adhesion / ruffle / guanyl-nucleotide exchange factor activity / 接着結合 ...extrinsic component of postsynaptic specialization membrane / Intra-Golgi traffic / regulation of ARF protein signal transduction / negative regulation of dendrite development / inositol 1,4,5 trisphosphate binding / bicellular tight junction / regulation of cell adhesion / ruffle / guanyl-nucleotide exchange factor activity / 接着結合 / 成長円錐 / postsynapse / glutamatergic synapse / lipid binding / 細胞膜 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #3648 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (dammif (r9988)) / ダミー原子の半径: 3.00 A / 対称性: P1 / コメント: Most representative of 100 DAMMIF models / カイ2乗値: 1.219 / P-value: 0.127961 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #3649 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (DAMFILT 5.0 (r9988)) / ダミー原子の半径: 4.25 A / 対称性: P1 コメント: Filtered average of 10 filtered averages of 10 DAMMIF models カイ2乗値: 1.219 / P-value: 0.127961 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #3682 | タイプ: dummy / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 / コメント: Most representative of 100 GASBOR models / カイ2乗値: 1.30 / P-value: 0.001891 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #3683 | タイプ: dummy / ソフトウェア: (DAMFILT 5.0 (r9988)) / ダミー原子の半径: 3.75 A / 対称性: P1 コメント: Filtered average of 10 filtered averages of 10 GASBOR models カイ2乗値: 1.30 / P-value: 0.001891 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
モデル #3684 | タイプ: mix / ダミー原子の半径: 1.90 A / 対称性: P1 コメント: Derived from Grp1 63-399 (2R09) and a canonical antiparallel coiled coil カイ2乗値: 1.29 / P-value: 0.003841 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Autoinhibited dimer of truncated 6xHis Cytohesin-2 (ARNO, amino acids 2-400) with Inositol 1,3,4,5-tetrakis phosphate (DAMMIF, GASBOR and antiparallel CORAL models) 試料濃度: 10 mg/ml |
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バッファ | 名称: 20 mM Tris, 150 mM NaCl, 2 mM MgCl2, 0.1% 2-mercaptoethanol, 5% glycerol, 0.001 mM insitol 1,3,4,5-tetrakis phosphate pH: 8 |
要素 #1857 | 名称: Cyth2, ARNO / タイプ: protein / 記述: Cytohesin-2CYTH2 / 分子量: 47.595 / 分子数: 2 / 由来: Mus musculus / 参照: UniProt: P63034 配列: MGHHHHHHGS EDGVYEPPDL TPEERMELEN IRRRKQELLV EIQRLREELS EAMSEVEGLE ANEGSKTLQR NRKMAMGRKK FNMDPKKGIQ FLVEHELLQN TPEEIARFLY KGEGLNKTAI GDYLGEREEL NLSVLHAFVD LHEFTDLNLV QALRQFLWSF RLPGEAQKID ...配列: MGHHHHHHGS EDGVYEPPDL TPEERMELEN IRRRKQELLV EIQRLREELS EAMSEVEGLE ANEGSKTLQR NRKMAMGRKK FNMDPKKGIQ FLVEHELLQN TPEEIARFLY KGEGLNKTAI GDYLGEREEL NLSVLHAFVD LHEFTDLNLV QALRQFLWSF RLPGEAQKID RMMEAFAQRY CLCNPGVFQS TDTCYVLSFA VIMLNTSLHN PNVRDKPGLE RFVAMNRGIN EGGDLPEDLL RNLYDSIRNE PFKIPEDDGN DLTHTFFNPD REGWLLKLGG GRVKTWKRRW FILTDNCLYY FEYTTDKEPR GIIPLENLSI REVDDPRKPN CFELYIPNNK GQLIKACKTE ADGRVVEGNH MVYRISAPTQ EEKDEWIKSI QAAVSVDPFY EMLAARKKRI SVKKKQEQP |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Advanced Photon Source (APS), Argonne National Laboratory BioCAT 18ID 地域: Lemont, IL / 国: USA / 線源: X-ray synchrotronシンクロトロン / 波長: 0.10332 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 2.5 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: MAR 165 CCD | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Autoinhibited dimer of truncated 6xHis Cytohesin-2 (ARNO, amino acids 2-400) with Inositol 1,3,4,5-tetrakis phosphate (DAMMIF, GASBOR and antiparallel CORAL models) 測定日: 2013年11月15日 / セル温度: 20 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 121 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 5.0 / ポイント数: 76 /
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結果 | カーブのタイプ: sec コメント: The protein was equilibrated with a 1.2 molar excess of inositol 1,3,4,5-tetrakis phosphate (IP4) and concentrated to 10 mg/ml prior to injection.
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