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-基本情報
登録情報 | データベース: SASBDB / ID: SASDBV9 |
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試料 | Immunoglobulin domain 4 of Nucleoporin Pom152 (Pom152 Ig-4: amino acids 718-820)
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機能・相同性 | 機能・相同性情報 nuclear pore transmembrane ring / spindle pole body duplication / nuclear pore organization / structural constituent of nuclear pore / nucleocytoplasmic transport / nuclear envelope lumen / mRNA transport / nuclear pore / protein-membrane adaptor activity / nuclear periphery ...nuclear pore transmembrane ring / spindle pole body duplication / nuclear pore organization / structural constituent of nuclear pore / nucleocytoplasmic transport / nuclear envelope lumen / mRNA transport / nuclear pore / protein-membrane adaptor activity / nuclear periphery / cell periphery / protein import into nucleus / nuclear envelope / nuclear membrane / mitochondrion 類似検索 - 分子機能 |
生物種 | Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母) |
引用 | 日付: 2017 Feb タイトル: Molecular Architecture of the Major Membrane Ring Component of the Nuclear Pore Complex 著者: Upla P / Kim S / Sampathkumar P / Dutta K / Cahill S / Chemmama I / Williams R / Bonanno J / Rice W / Stokes D / Cowburn D / Almo S / Sali A / Rout M |
登録者 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-モデル
モデル #1108 | タイプ: atomic / ソフトウェア: MODELLER (9.13) / ダミー原子の半径: 1.90 A / コメント: A histag was modelled using MODELLER / カイ2乗値: 1.27743535816 / P-value: 0.011000 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
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モデル #1138 | タイプ: dummy / ソフトウェア: DAMMIN (5.3) / ダミー原子の半径: 1.50 A / カイ2乗値: 1.103 Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細) |
-試料
試料 | 名称: Immunoglobulin domain 4 of Nucleoporin Pom152 (Pom152 Ig-4: amino acids 718-820) 試料濃度: 0.50-11.90 |
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バッファ | 名称: 10mM HEPES, 150mM NaCl, 10%(v/v) glycerol, 5mM DTT / pH: 7.5 |
要素 #575 | タイプ: protein / 記述: Nucleoporin POM152 / 分子量: 12.386 / 分子数: 1 由来: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) 参照: UniProt: P39685 配列: RVKPSASLKL HHDLKLCLGD HSSVPVALKG QGPFTLTYDI IETFSSKRKT FEIKEIKTNE YVIKTPVFTT GGDYILSLVS IKDSTGCVVG LSQPDAKIQV RRDEGHHHHH H |
-実験情報
ビーム | 設備名称: Stanford Synchrotron Radiation Lightsource (SSRL) BL4-2 地域: Stanford, CA / 国: USA / 線源: X-ray synchrotron / 波長: 0.098 Å / スペクトロメータ・検出器間距離: 1.7 mm | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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検出器 | 名称: Rayonix MX225-HE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
スキャン | タイトル: Immunoglobulin domain 4 of Nucleoporin Pom152 (Pom152 Ig-4: amino acids 718-820) 測定日: 2015年4月12日 / 保管温度: 15 °C / セル温度: 15 °C / 照射時間: 1 sec. / フレーム数: 20 / 単位: 1/A /
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距離分布関数 P(R) | ソフトウェア P(R): GNOM 4.5a / ポイント数: 379 /
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結果 | カーブのタイプ: merged コメント: Guinier Rg and I(0) were calculated using AutoRg. The experimental MW was estimated using SAXSMOW.
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