ChemComp-PUA: ADENYLATE-3'-PHOSPHATE-[[2'-DEOXY-URIDINE-5'-PHOSPHATE]-3'-PHOSPHATE]

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: PUA
• 名称: 名称: adenylate-3'-phosphate-[[2'-deoxy-uridine-5'-phosphate]-3'-phosphate]; 別称: U-PI-A-PI; 日化辞名称: 3′-O-[(3′-O-ホスホノ-5′-アデニリル)オキシホスホニル]-2′-デオキシ-5′-ウリジル酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₉H₂₇N₇O₂₀P₄ / 原子数: 77 / 化学式量: 797.348 / 形式電荷: 0

その他

1qhc

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: PUA / モデル座標のPDB-ID: 1QHC

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / BindingDB / ChEMBL / DrugBank / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1C=CN(C(=O)N1)C5OC(COP(=O)(O)O)C(OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC4OC(n3cnc2c(ncnc23)N)C(O)C4OP(=O)(O)O)C5
• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[CH]4C[CH](O[CH]4CO[P](O)(O)=O)N5C=CC(=O)NC5=O)[CH](O[P](O)(O)=O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC4CC(OC4COP(=O)(O)O)N5C=CC(=O)NC5=O)OP(=O)(O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P@@](O)(=O)O[P@@](O)(=O)O[C@H]4C[C@@H](O[C@@H]4CO[P](O)(O)=O)N5C=CC(=O)NC5=O)[C@@H](O[P](O)(O)=O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)(O)O[P@](=O)(O)O[C@H]4C[C@@H](O[C@@H]4COP(=O)(O)O)N5C=CC(=O)NC5=O)OP(=O)(O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C19H27N7O20P4/c20-16-13-17(22-6-21-16)26(7-23-13)18-14(28)15(45-48(33,34)35)10(43-18)5-41-49(36,37)46-50(38,39)44-8-3-12(25-2-1-11(27)24-19(25)29)42-9(8)4-40-47(30,31)32/h1-2,6-10,12,14-15,18,28H,3-5H2,(H,36,37)(H,38,39)(H2,20,21,22)(H,24,27,29)(H2,30,31,32)(H2,33,34,35)/t8-,9+,10+,12+,14+,15+,18+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: JIAJERGOUFOENU-LNAOLWRRSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3S,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-2-[(phosphonooxy)methyl]tetrahydrofuran-3-yl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxy-oxolan-2-yl]methyl [[(2R,3S,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-hydroxy-phosphoryl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

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PDB-1qhc:
CRYSTAL STRUCTURE OF RIBONUCLEASE A IN COMPLEX WITH 5'-PHOSPHO-2'-DEOXYURIDINE-3'-PYROPHOSPHATE ADENOSINE-3'-PHOSPHATE