ChemComp-PE1: N~2~-({3-HYDROXY-2-METHYL-5-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]PYRIDIN-4-YL}ME...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: PE1
• 名称: 名称: N~2~-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methyl)-L-lysine; 別称: PYRIDOXYL-GLUTAMIC ACID-5'-MONOPHOSPHATE

Chemical information

組成

組成式: C₁₄H₂₄N₃O₇P / 原子数: 49 / 化学式量: 377.33 / 形式電荷: 0

その他

1wcb

LYS

タイプ: L-PEPTIDE LINKING / PDB分類: ATOMP / 1文字コード: K / 3文字コード: PE1 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 1WCB / 親要素: LYS

履歴

作成	2004年11月12日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2012年1月26日
Modify name	2012年1月31日
Modify parent residue	2012年1月31日
Modify linking type	2012年1月31日
Other modification	2012年1月31日
記述子を修正	2014年9月5日
Modify one letter code	2019年5月7日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)C(NCc1c(cnc(c1O)C)COP(=O)(O)O)CCCCN
• CACTVS 3.385: Cc1ncc(CO[P](O)(O)=O)c(CN[CH](CCCCN)C(O)=O)c1O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)CNC(CCCCN)C(=O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Cc1ncc(CO[P](O)(O)=O)c(CN[C@@H](CCCCN)C(O)=O)c1O
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)CN[C@@H](CCCCN)C(=O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C14H24N3O7P/c1-9-13(18)11(10(6-16-9)8-24-25(21,22)23)7-17-12(14(19)20)4-2-3-5-15/h6,12,17-18H,2-5,7-8,15H2,1H3,(H,19,20)(H2,21,22,23)/t12-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: GQMAOPRRHWJXFB-LBPRGKRZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N~2~-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methyl)-L-lysine
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: (2S)-6-azanyl-2-[[2-methyl-3-oxidanyl-5-(phosphonooxymethyl)pyridin-4-yl]methylamino]hexanoic acid

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-1wcb:
PLP-DEPENDENT CATALYTIC ANTIBODY 15A9 IN COMPLEX WITH ITS HAPTEN

PDB-4fs9:
Complex structure of a broad specificity amino acid racemase (Bar) within the reactive intermediate