ChemComp-PDD: N-(5'-PHOSPHOPYRIDOXYL)-D-ALANINE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: PDD
• 名称: 名称: N-(5'-phosphopyridoxyl)-D-alanine; 日化辞名称: N-[2-メチル-3-ヒドロキシ-5-(ホスホノオキシメチル)ピリジン-4-イルメチル]-D-アラニン

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₇N₂O₇P / 原子数: 38 / 化学式量: 320.236 / 形式電荷: 0

その他

1l6g

タイプ: D-PEPTIDE LINKING / PDB分類: ATOMP / 3文字コード: PDD / モデル座標のPDB-ID: 1L6G

履歴

作成	2002年3月18日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / DrugBank / 日化辞 / PubChem / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C(O)C(NCc1c(cnc(c1O)C)COP(=O)(O)O)C
• CACTVS 3.341: C[CH](NCc1c(O)c(C)ncc1CO[P](O)(O)=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)CNC(C)C(=O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: C[C@@H](NCc1c(O)c(C)ncc1CO[P](O)(O)=O)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: Cc1c(c(c(cn1)COP(=O)(O)O)CN[C@H](C)C(=O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H17N2O7P/c1-6-10(14)9(4-13-7(2)11(15)16)8(3-12-6)5-20-21(17,18)19/h3,7,13-14H,4-5H2,1-2H3,(H,15,16)(H2,17,18,19)/t7-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: WACJCHFWJNNBPR-SSDOTTSWSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: N-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methyl)-D-alanine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R)-2-[[3-hydroxy-2-methyl-5-(phosphonooxymethyl)pyridin-4-yl]methylamino]propanoic acid

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-1l6g:
Alanine racemase bound with N-(5'-phosphopyridoxyl)-D-alanine

PDB-2bmk:
Fab fragment of PLP-dependent catalytic antibody 15A9 in complex with phosphopyridoxyl-D-alanine

PDB-2zpu:
Crystal Structure of Modified Serine Racemase from S.pombe.

PDB-2zr8:
Crystal Structure of Modified Serine Racemase complexed with Serine

PDB-3daa:
CRYSTALLOGRAPHIC STRUCTURE OF D-AMINO ACID AMINOTRANSFERASE INACTIVATED BY PYRIDOXYL-D-ALANINE