[日本語] English

万見

- PDB-9uwh: human mitoribosome trapped by retapamulin -

+
データを開く

-
基本情報

登録情報

データベース: PDB / ID: 9uwh

タイトル

human mitoribosome trapped by retapamulin

要素

(Large ribosomal subunit protein ...) x 51
(Small ribosomal subunit protein ...) x 29
12S mitochondrial rRNA
16S mitochondrial rRNA
MRPS21 isoform 1
P/P-tRNA
mRNA
mitochondrial tRNAVal

キーワード

RIBOSOME / mitoribosome / retapamulin

機能・相同性

機能・相同性情報

rRNA import into mitochondrion / mitochondrial translational termination / mitochondrial transcription / mitochondrial ribosome assembly / mitochondrial translational elongation / Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / translation release factor activity, codon nonspecific / Mitochondrial translation initiation / translation release factor activity ...rRNA import into mitochondrion / mitochondrial translational termination / mitochondrial transcription / mitochondrial ribosome assembly / mitochondrial translational elongation / Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / translation release factor activity, codon nonspecific / Mitochondrial translation initiation / translation release factor activity / negative regulation of mitotic nuclear division / mitochondrial large ribosomal subunit / peptidyl-tRNA hydrolase / mitochondrial ribosome / mitochondrial small ribosomal subunit / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / peptidyl-tRNA hydrolase activity / mitochondrial translation / apoptotic mitochondrial changes / positive regulation of proteolysis / ribosomal small subunit binding / anatomical structure morphogenesis / RNA processing / Mitochondrial protein degradation / rescue of stalled ribosome / cellular response to leukemia inhibitory factor / apoptotic signaling pathway / fibrillar center / cell junction / double-stranded RNA binding / regulation of translation / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / endonuclease activity / nuclear membrane / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / tRNA binding / cell population proliferation / mitochondrial inner membrane / negative regulation of translation / rRNA binding / nuclear body / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / mitochondrial matrix / ribonucleoprotein complex / protein domain specific binding / nucleotide binding / intracellular membrane-bounded organelle / mRNA binding / apoptotic process / GTP binding / positive regulation of DNA-templated transcription / nucleolus / mitochondrion / extracellular space / RNA binding / nucleoplasm / nucleus / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能

Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRPS27/PTCD2 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S22, mitochondrial / Ribosomal protein S23, mitochondrial / Ribosomal protein S23/S25, mitochondrial ...Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRPS27/PTCD2 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S22, mitochondrial / Ribosomal protein S23, mitochondrial / Ribosomal protein S23/S25, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / : / Mitochondrial 28S ribosomal protein S22 / Mitochondrial ribosomal protein S23 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Ribosomal protein S29, mitochondrial / Ribosomal protein S28, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / 28S ribosomal protein S10, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein MRP-S35 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3 / 28S ribosomal protein S17, mitochondrial / 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / : / : / Mitochondrial ribosome subunit S24 / Small ribosomal subunit protein uS5m, N-terminal / Small ribosomal subunit protein mS39, PPR / 28S ribosomal protein S25, mitochondrial / : / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / : / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Pentatricopeptide repeat domain / Ribosomal protein S27/S33, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal subunit S27 / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Ribosomal protein S30, mitochondrial / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial, conserved domain / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Mitochondrial ribosomal subunit protein / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L35, mitochondrial / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Ribosomal protein L37/S30 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / : / : / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / : / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / : / MRPL44 dsRNA-binding domain / Large ribosomal subunit protein mL44, endonuclease domain / : / : / Large ribosomal subunit protein bL9m C-terminal domain / Large ribosomal subunit protein bL9m N-terminal domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Pentatricopeptide (PPR) repeat profile. / Tim44 / : / : / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation domain superfamily / Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein L7/L12 / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal / Ribosomal protein S23/S29, mitochondrial / Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain / Mitochondrial ribosomal death-associated protein 3 / Pentatricopeptide repeat / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal subunit 39S / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial
類似検索 - ドメイン・相同性

ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / Retapamulin / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / : / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / SPERMIDINE / VALINE / : / : ...ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER / Retapamulin / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / : / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / SPERMIDINE / VALINE / : / : / : / RNA / RNA (> 10) / RNA (> 100) / RNA (> 1000) / MRPS21 isoform 1 / Small ribosomal subunit protein uS12m / Small ribosomal subunit protein uS14m / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein bL19m / Small ribosomal subunit protein mS29 / Large ribosomal subunit protein bL12m / Small ribosomal subunit protein mS22 / Small ribosomal subunit protein mS25 / Small ribosomal subunit protein uS10m / Small ribosomal subunit protein mS35 / Small ribosomal subunit protein uS5m / Small ribosomal subunit protein uS11m / Small ribosomal subunit protein uS15m / Small ribosomal subunit protein mS34 / Small ribosomal subunit protein bS6m / Small ribosomal subunit protein uS9m / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein uL2m / Large ribosomal subunit protein mL54 / Large ribosomal subunit protein uL14m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Large ribosomal subunit protein mL55 / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein mL52 / Large ribosomal subunit protein mL41 / Large ribosomal subunit protein mL50 / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein mL64 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Small ribosomal subunit protein mS27 / Small ribosomal subunit protein mS31 / Large ribosomal subunit protein uL24m / Small ribosomal subunit protein mS37 / Large ribosomal subunit protein mL38 / Small ribosomal subunit protein uS3m / Large ribosomal subunit protein mL53 / Small ribosomal subunit protein mS39 / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein bL34m / Large ribosomal subunit protein mL63 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein bL32m / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein uL13m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Large ribosomal subunit protein uL4m / Small ribosomal subunit protein mS26 / Large ribosomal subunit protein mL37 / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL65 / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein mL66 / Small ribosomal subunit protein mS38 / Large ribosomal subunit protein uL22m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein mL39 / Large ribosomal subunit protein bL35m / Large ribosomal subunit protein uL15m / Large ribosomal subunit protein bL36m / Large ribosomal subunit protein bL27m / Small ribosomal subunit protein mS33 / Small ribosomal subunit protein bS1m / Small ribosomal subunit protein uS17m / Small ribosomal subunit protein uS7m / Small ribosomal subunit protein uS2m / Large ribosomal subunit protein uL11m / Small ribosomal subunit protein bS16m / Small ribosomal subunit protein bS18m / Small ribosomal subunit protein mS23 / Small ribosomal subunit protein mS40 / Large ribosomal subunit protein mL42
類似検索 - 構成要素

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3 Å

データ登録者

Ando, Y. / Nureki, O. / Itoh, Y.

資金援助

日本, 2件

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Monitoring the complexity and dynamics of mitochondrial translation
著者: Wakigawa, T. / Mito, M. / Ando, Y. / Yamashiro, H. / Tomuro, K. / Tani, H. / Tomizawa, K. / Chujo, T. / Nagao, A. / Suzuki, T. / Nureki, O. / Wei, F.Y. / Shichino, Y. / Itoh, Y. / Suzuki, T. / Iwasaki, S.

履歴

登録	2025年5月12日	登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ
改定 1.0	2025年10月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release

-
構造の表示

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	9uwh.cif.gz	4.3 MB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb9uwh.ent.gz		表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	9uwh.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	9uwh_validation.pdf.gz	2 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	9uwh_full_validation.pdf.gz	2.2 MB	表示
XML形式データ	9uwh_validation.xml.gz	360.6 KB	表示
CIF形式データ	9uwh_validation.cif.gz	605 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uw/9uwh ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/uw/9uwh	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	64554MC 64899C 64900C M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#121 - 2010年1月 70Sリボソーム (70S Ribosomes) 類似性 (9) #130 - 2010年10月リボスイッチ (Riboswitches) 類似性 (2) #16 - 2001年4月アミノアシル転移RNA合成酵素 (Aminoacyl-tRNA Synthetases) 類似性 (6) #253 - 2021年1月エクスプレソーム (Expressome) 類似性 (18) #157 - 2013年1月転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA) 類似性 (8) #260 - 2021年8月リボヌクレアーゼP (Ribonuclease P) 類似性 (4) #10 - 2000年10月リボソーム (Ribosome) 類似性 (4) #181 - 2015年1月カスケードとCRISPR (Cascade and CRISPR) 類似性 (1) #229 - 2019年1月蛍光RNAアプタマー (Fluorescent RNA Aptamers) 類似性 (1) #146 - 2012年2月アミノグリコシド系抗生物質 (Aminoglycoside Antibiotics) 類似性 (4) #15 - 2001年3月転移RNA (Transfer RNA) 類似性 (1) #249 - 2020年9月 SARSコロナウイルス2 RNA依存性RNAポリメラーゼ (SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA Polymerase) 類似性 (1) #210 - 2017年6月アデニンリボスイッチの動き (Adenine Riboswitch in Action) 類似性 (1) #87 - 2007年3月ジンクフィンガー (Zinc Fingers) 類似性 (1) #262 - 2021年10月 PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures ) 類似性 (14) #226 - 2018年10月アミノグリコシド系抗生物質と耐性 (Aminoglycoside Antibiotics and Resistance) 類似性 (3) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (2) #65 - 2005年5月自己スプライシングRNA (Self-splicing RNA) 類似性 (2) #105 - 2008年9月リボヌクレアーゼA (Ribonuclease A) 類似性 (4) #98 - 2008年2月低分子干渉RNA (Small Interfering RNA) 類似性 (2) #161 - 2013年5月リシン (Ricin) 類似性 (6) #266 - 2022年2月オリゴ糖転移酵素 (Oligosaccharyltransferase) 類似性 (5) #227 - 2018年11月テロメラーゼ (Telomerase) 類似性 (2) #104 - 2008年8月セレノシステイン合成酵素 (Selenocysteine Synthase) 類似性 (1) #106 - 2008年10月ポリAポリメラーゼ (Poly(A) Polymerase) 類似性 (1) #143 - 2011年11月 Toll様受容体 (Toll-like Receptors) 類似性 (1) #230 - 2019年2月開始因子eIF4E (Initiation Factor eIF4E) 類似性 (1) #81 - 2006年9月伸長因子 (Elongation Factors) 類似性 (1) #89 - 2007年5月アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1) 類似性 (1) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (3) #263 - 2021年11月アセトヒドロキシ酸合成酵素 (Acetohydroxyacid Synthase) 類似性 (1) #117 - 2009年9月キサンチン酸化還元酵素 (Xanthine Oxidoreductase) 類似性 (2) #36 - 2002年12月シトクロムc (Cytochrome c) 類似性 (2) #5 - 2000年5月シトクロムc酸化酵素 (Cytochrome c Oxidase) 類似性 (1) #154 - 2012年10月クエン酸回路 (Citric Acid Cycle) 類似性 (2) #82 - 2006年10月シトクロムp450 (Cytochrome p450) 類似性 (2) #137 - 2011年5月シトクロムbc1 (Cytochrome bc1) 類似性 (1) #144 - 2011年12月複合体I (Complex I) 類似性 (1) #44 - 2003年8月カルモジュリン (Calmodulin) 類似性 (1) #145 - 2012年1月伝令RNAのキャップ形成 (Messenger RNA Capping) 類似性 (1) #201 - 2016年9月イソプレン合成酵素 (Isoprene Synthase) 類似性 (1) #111 - 2009年3月ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#121 - 2010年1月
70Sリボソーム (70S Ribosomes)
類似性 (9)
#130 - 2010年10月
リボスイッチ (Riboswitches)
類似性 (2)
#16 - 2001年4月
アミノアシル転移RNA合成酵素 (Aminoacyl-tRNA Synthetases)
類似性 (6)
#253 - 2021年1月
エクスプレソーム (Expressome)
類似性 (18)
#157 - 2013年1月
転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA)
類似性 (8)
#260 - 2021年8月
リボヌクレアーゼP (Ribonuclease P)
類似性 (4)
#10 - 2000年10月
リボソーム (Ribosome)
類似性 (4)
#181 - 2015年1月
カスケードとCRISPR (Cascade and CRISPR)
類似性 (1)
#229 - 2019年1月
蛍光RNAアプタマー (Fluorescent RNA Aptamers)
類似性 (1)
#146 - 2012年2月
アミノグリコシド系抗生物質 (Aminoglycoside Antibiotics)
類似性 (4)
#15 - 2001年3月
転移RNA (Transfer RNA)
類似性 (1)
#249 - 2020年9月
SARSコロナウイルス2 RNA依存性RNAポリメラーゼ (SARS-CoV-2 RNA-dependent RNA Polymerase)
類似性 (1)
#210 - 2017年6月
アデニンリボスイッチの動き (Adenine Riboswitch in Action)
類似性 (1)
#87 - 2007年3月
ジンクフィンガー (Zinc Fingers)
類似性 (1)
#262 - 2021年10月
PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures )
類似性 (14)
#226 - 2018年10月
アミノグリコシド系抗生物質と耐性 (Aminoglycoside Antibiotics and Resistance)
類似性 (3)
#245 - 2020年5月
スプライソソーム (Spliceosomes)
類似性 (2)
#65 - 2005年5月
自己スプライシングRNA (Self-splicing RNA)
類似性 (2)
#105 - 2008年9月
リボヌクレアーゼA (Ribonuclease A)
類似性 (4)
#98 - 2008年2月
低分子干渉RNA (Small Interfering RNA)
類似性 (2)
#161 - 2013年5月
リシン (Ricin)
類似性 (6)
#266 - 2022年2月
オリゴ糖転移酵素 (Oligosaccharyltransferase)
類似性 (5)
#227 - 2018年11月
テロメラーゼ (Telomerase)
類似性 (2)
#104 - 2008年8月
セレノシステイン合成酵素 (Selenocysteine Synthase)
類似性 (1)
#106 - 2008年10月
ポリAポリメラーゼ (Poly(A) Polymerase)
類似性 (1)
#143 - 2011年11月
Toll様受容体 (Toll-like Receptors)
類似性 (1)
#230 - 2019年2月
開始因子eIF4E (Initiation Factor eIF4E)
類似性 (1)
#81 - 2006年9月
伸長因子 (Elongation Factors)
類似性 (1)
#89 - 2007年5月
アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (3)
#263 - 2021年11月
アセトヒドロキシ酸合成酵素 (Acetohydroxyacid Synthase)
類似性 (1)
#117 - 2009年9月
キサンチン酸化還元酵素 (Xanthine Oxidoreductase)
類似性 (2)
#36 - 2002年12月
シトクロムc (Cytochrome c)
類似性 (2)
#5 - 2000年5月
シトクロムc酸化酵素 (Cytochrome c Oxidase)
類似性 (1)
#154 - 2012年10月
クエン酸回路 (Citric Acid Cycle)
類似性 (2)
#82 - 2006年10月
シトクロムp450 (Cytochrome p450)
類似性 (2)
#137 - 2011年5月
シトクロムbc1 (Cytochrome bc1)
類似性 (1)
#144 - 2011年12月
複合体I (Complex I)
類似性 (1)
#44 - 2003年8月
カルモジュリン (Calmodulin)
類似性 (1)
#145 - 2012年1月
伝令RNAのキャップ形成 (Messenger RNA Capping)
類似性 (1)
#201 - 2016年9月
イソプレン合成酵素 (Isoprene Synthase)
類似性 (1)
#111 - 2009年3月
ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase)
類似性 (1)

-
集合体

登録構造単位

A: 16S mitochondrial rRNA

B: mitochondrial tRNAVal

D: Large ribosomal subunit protein uL2m

E: Large ribosomal subunit protein uL3m

F: Large ribosomal subunit protein uL4m

H: Large ribosomal subunit protein bL9m

I: Large ribosomal subunit protein uL10m

J: Large ribosomal subunit protein uL11m

K: Large ribosomal subunit protein uL13m

L: Large ribosomal subunit protein uL14m

M: Large ribosomal subunit protein uL15m

N: Large ribosomal subunit protein uL16m

O: Large ribosomal subunit protein bL17m

P: Large ribosomal subunit protein uL18m

Q: Large ribosomal subunit protein bL19m

R: Large ribosomal subunit protein bL20m

S: Large ribosomal subunit protein bL21m

T: Large ribosomal subunit protein uL22m

U: Large ribosomal subunit protein uL23m

V: Large ribosomal subunit protein uL24m

W: Large ribosomal subunit protein bL27m

X: Large ribosomal subunit protein bL28m

Y: Large ribosomal subunit protein uL29m

Z: Large ribosomal subunit protein uL30m

AA: 12S mitochondrial rRNA

AB: Small ribosomal subunit protein uS2m

AC: Small ribosomal subunit protein uS3m

AD: Small ribosomal subunit protein uS5m

AE: Small ribosomal subunit protein bS6m

AF: Small ribosomal subunit protein uS7m

AG: Small ribosomal subunit protein uS9m

AH: Small ribosomal subunit protein uS10m

AI: Small ribosomal subunit protein uS11m

AJ: Small ribosomal subunit protein uS12m

AK: Small ribosomal subunit protein uS14m

AL: Small ribosomal subunit protein uS15m

AM: Small ribosomal subunit protein bS16m

AN: Small ribosomal subunit protein uS17m

AO: Small ribosomal subunit protein mS40

AP: Small ribosomal subunit protein bS18m

AQ: MRPS21 isoform 1

AR: Small ribosomal subunit protein mS22

AS: Small ribosomal subunit protein mS23

AT: Small ribosomal subunit protein mS25

AU: Small ribosomal subunit protein mS26

AV: Small ribosomal subunit protein mS27

AW: Small ribosomal subunit protein bS1m

AX: Small ribosomal subunit protein mS29

AY: Small ribosomal subunit protein mS31

AZ: Small ribosomal subunit protein mS33

A0: Small ribosomal subunit protein mS34

A1: Small ribosomal subunit protein mS35

A2: Small ribosomal subunit protein mS37

A3: Small ribosomal subunit protein mS38

A4: Small ribosomal subunit protein mS39

Ax: P/P-tRNA

Az: mRNA

0: Large ribosomal subunit protein bL32m

1: Large ribosomal subunit protein bL33m

2: Large ribosomal subunit protein bL34m

3: Large ribosomal subunit protein bL35m

4: Large ribosomal subunit protein bL36m

5: Large ribosomal subunit protein mL37

6: Large ribosomal subunit protein mL38

7: Large ribosomal subunit protein mL39

8: Large ribosomal subunit protein mL40

9: Large ribosomal subunit protein mL41

a: Large ribosomal subunit protein mL42

b: Large ribosomal subunit protein mL43

c: Large ribosomal subunit protein mL44

d: Large ribosomal subunit protein mL45

e: Large ribosomal subunit protein mL46

f: Large ribosomal subunit protein mL48

g: Large ribosomal subunit protein mL49

h: Large ribosomal subunit protein mL50

i: Large ribosomal subunit protein mL51

j: Large ribosomal subunit protein mL52

k: Large ribosomal subunit protein mL53

l: Large ribosomal subunit protein mL54

m: Large ribosomal subunit protein mL55

o: Large ribosomal subunit protein mL63

p: Large ribosomal subunit protein mL62

q: Large ribosomal subunit protein mL64

r: Large ribosomal subunit protein mL66

s: Large ribosomal subunit protein mL65

t: Large ribosomal subunit protein bL12m

ヘテロ分子

2.94 MDa, 86 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

登録構造と同一
登録者が定義した集合体
根拠: 電子顕微鏡法, not applicable

-
要素

-
RNA鎖 , 5種, 5分子 ABAAAxAz

#1: RNA鎖	16S mitochondrial rRNA 分子量: 500727.125 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: GenBank: 2756414513
#2: RNA鎖	mitochondrial tRNAVal 分子量: 22989.752 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: GenBank: 1896813692
#25: RNA鎖	12S mitochondrial rRNA 分子量: 306218.312 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: GenBank: 1858621102
#56: RNA鎖	P/P-tRNA 分子量: 22692.508 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)
#57: RNA鎖	mRNA 分子量: 2489.489 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト)

+
Large ribosomal subunit protein ... , 51種, 51分子 DEFHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ01234567...

#3: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL2m / 39S ribosomal protein L2 / mitochondrial / L2mt / MRP-L2 分子量: 33355.941 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q5T653
#4: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL3m / 39S ribosomal protein L3 / mitochondrial / L3mt / MRP-L3 分子量: 38689.562 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P09001
#5: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL4m / 39S ribosomal protein L4 / mitochondrial / L4mt / MRP-L4 分子量: 34970.195 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD3
#6: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL9m / 39S ribosomal protein L9 / mitochondrial / L9mt / MRP-L9 分子量: 30296.355 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD2
#7: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL10m / 39S ribosomal protein L10 / mitochondrial / L10mt / MRP-L10 / 39S ribosomal protein L8 / L8mt / MRP-L8 分子量: 29322.529 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z7H8
#8: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL11m / 39S ribosomal protein L11 / mitochondrial / L11mt / MRP-L11 分子量: 20716.227 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3B7
#9: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL13m / 39S ribosomal protein L13 / mitochondrial / L13mt / MRP-L13 分子量: 20617.828 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYD1
#10: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL14m / 39S ribosomal protein L14 / mitochondrial / L14mt / MRP-L14 / 39S ribosomal protein L32 / L32mt / MRP-L32 分子量: 15973.702 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P1L8
#11: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL15m / 39S ribosomal protein L15 / mitochondrial / L15mt / MRP-L15 分子量: 33473.820 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P015
#12: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL16m / 39S ribosomal protein L16 / mitochondrial / L16mt / MRP-L16 分子量: 28496.285 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NX20
#13: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL17m / 39S ribosomal protein L17 / mitochondrial / L17mt / MRP-L17 / LYST-interacting protein 2 分子量: 20083.266 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NRX2
#14: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL18m / 39S ribosomal protein L18 / mitochondrial / L18mt / MRP-L18 分子量: 20607.570 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H0U6
#15: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL19m / 39S ribosomal protein L15 / mitochondrial / L15mt / MRP-L15 / 39S ribosomal protein L19 / L19mt / MRP-L19 分子量: 33584.996 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P49406
#16: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL20m / 39S ribosomal protein L20 / mitochondrial / L20mt / MRP-L20 分子量: 17479.654 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYC9
#17: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL21m / 39S ribosomal protein L21 / mitochondrial / L21mt / MRP-L21 分子量: 22847.682 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z2W9
#18: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL22m / 39S ribosomal protein L22 / mitochondrial / L22mt / MRP-L22 / 39S ribosomal protein L25 / L25mt / MRP-L25 分子量: 23683.732 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NWU5
#19: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL23m / 39S ribosomal protein L23 / mitochondrial / L23mt / MRP-L23 / L23 mitochondrial-related protein / ...39S ribosomal protein L23 / mitochondrial / L23mt / MRP-L23 / L23 mitochondrial-related protein / Ribosomal protein L23-like 分子量: 17702.029 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q16540
#20: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL24m / 39S ribosomal protein L24 / mitochondrial / L24mt / MRP-L24 分子量: 24953.875 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96A35
#21: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL27m / 39S ribosomal protein L27 / mitochondrial / L27mt / MRP-L27 分子量: 16102.859 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P0M9
#22: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL28m / 39S ribosomal protein L28 / mitochondrial / L28mt / MRP-L28 / Melanoma antigen p15 / Melanoma- ...39S ribosomal protein L28 / mitochondrial / L28mt / MRP-L28 / Melanoma antigen p15 / Melanoma-associated antigen recognized by T-lymphocytes 分子量: 30202.867 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13084
#23: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL29m / 39S ribosomal protein L47 / mitochondrial / L47mt / MRP-L47 / Nasopharyngeal carcinoma metastasis- ...39S ribosomal protein L47 / mitochondrial / L47mt / MRP-L47 / Nasopharyngeal carcinoma metastasis-related protein 1 分子量: 29508.535 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9HD33
#24: タンパク質	Large ribosomal subunit protein uL30m / 39S ribosomal protein L28 / mitochondrial / L28mt / MRP-L28 / 39S ribosomal protein L30 / L30mt / MRP-L30 分子量: 18582.812 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8TCC3
#58: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL32m / 39S ribosomal protein L32 / mitochondrial / L32mt / MRP-L32 分子量: 21437.799 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYC8
#59: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL33m / 39S ribosomal protein L33 / mitochondrial / L33mt / MRP-L33 分子量: 7635.204 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O75394
#60: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL34m / 39S ribosomal protein L34 / mitochondrial / L34mt / MRP-L34 分子量: 10183.913 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BQ48
#61: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL35m / 39S ribosomal protein L35 / mitochondrial / L35mt / MRP-L35 分子量: 21558.488 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NZE8
#62: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL36m / 39S ribosomal protein L36 / mitochondrial / L36mt / MRP-L36 / BRCA1-interacting protein 1 分子量: 11809.301 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9P0J6
#63: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL37 / 39S ribosomal protein L2 / mitochondrial / L2mt / MRP-L2 / 39S ribosomal protein L37 / L37mt / MRP-L37 分子量: 48183.344 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BZE1
#64: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL38 / 39S ribosomal protein L38 / mitochondrial / L38mt / MRP-L38 分子量: 44659.430 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96DV4
#65: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL39 / 39S ribosomal protein L39 / mitochondrial / L39mt / MRP-L39 / 39S ribosomal protein L5 / L5mt / MRP-L5 分子量: 38764.785 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NYK5
#66: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL40 / 39S ribosomal protein L40 / mitochondrial / L40mt / MRP-L40 / Nuclear localization signal- ...39S ribosomal protein L40 / mitochondrial / L40mt / MRP-L40 / Nuclear localization signal-containing protein deleted in velocardiofacial syndrome / Up-regulated in metastasis 分子量: 24534.422 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NQ50
#67: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL41 / 39S ribosomal protein L41 / mitochondrial / L41mt / MRP-L41 / Bcl-2-interacting mitochondrial ...39S ribosomal protein L41 / mitochondrial / L41mt / MRP-L41 / Bcl-2-interacting mitochondrial ribosomal protein L41 / Cell proliferation-inducing gene 3 protein / MRP-L27 homolog 分子量: 15404.708 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8IXM3
#68: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL42 / 39S ribosomal protein L31 / mitochondrial / L31mt / MRP-L31 / 39S ribosomal protein L42 / L42mt / MRP-L42 分子量: 16691.176 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y6G3
#69: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL43 / 39S ribosomal protein L43 / mitochondrial / L43mt / MRP-L43 / Mitochondrial ribosomal protein bMRP36a 分子量: 23352.633 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8N983
#70: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL44 / 39S ribosomal protein L44 / mitochondrial / L44mt / MRP-L44 分子量: 37583.312 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) 参照: UniProt: Q9H9J2, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ
#71: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL45 / 39S ribosomal protein L45 / mitochondrial / L45mt / MRP-L45 分子量: 35402.918 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BRJ2
#72: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL46 / 39S ribosomal protein L46 / mitochondrial / L46mt / MRP-L46 / P2ECSL 分子量: 31748.107 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9H2W6
#73: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL48 / 39S ribosomal protein L48 / mitochondrial / L48mt / MRP-L48 分子量: 23970.814 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96GC5
#74: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL49 / 39S ribosomal protein L49 / mitochondrial / L49mt / MRP-L49 / Neighbor of FAU / NOF / Protein NOF1 分子量: 19225.043 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q13405
#75: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL50 / 39S ribosomal protein L50 / mitochondrial / L50mt / MRP-L50 分子量: 18349.943 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8N5N7
#76: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL51 / 39S ribosomal protein L51 / mitochondrial / L51mt / MRP-L51 / bMRP-64 / bMRP64 分子量: 15125.917 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q4U2R6
#77: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL52 / 39S ribosomal protein L52 / mitochondrial / L52mt / MRP-L52 分子量: 13682.658 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q86TS9
#78: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL53 / 39S ribosomal protein L53 / mitochondrial / L53mt / MRP-L53 分子量: 12125.859 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EL3
#79: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL54 / 39S ribosomal protein L54 / mitochondrial / L54mt / MRP-L54 分子量: 15844.178 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q6P161
#80: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL55 / 39S ribosomal protein L55 / mitochondrial / L55mt / MRP-L55 / Mitochondrial large ribosomal subunit ...39S ribosomal protein L55 / mitochondrial / L55mt / MRP-L55 / Mitochondrial large ribosomal subunit protein bL31m 分子量: 15160.433 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q7Z7F7
#81: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL63 / Mitochondrial ribosomal protein 63 / Mitochondrial ribosomal protein L57 / Ribosomal protein 63 / ...Mitochondrial ribosomal protein 63 / Mitochondrial ribosomal protein L57 / Ribosomal protein 63 / mitochondrial / hMRP63 分子量: 12292.333 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BQC6
#82: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL62 / 39S ribosomal protein L58 / mitochondrial / MRP-L58 / Digestion substraction 1 / DS-1 / Immature ...39S ribosomal protein L58 / mitochondrial / MRP-L58 / Digestion substraction 1 / DS-1 / Immature colon carcinoma transcript 1 protein / Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1 分子量: 23674.203 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q14197, peptidyl-tRNA hydrolase
#83: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL64 / 39S ribosomal protein L59 / mitochondrial / MRP-L59 / CKII beta-associating protein / CR6- ...39S ribosomal protein L59 / mitochondrial / MRP-L59 / CKII beta-associating protein / CR6-interacting factor 1 / CRIF1 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Papillomavirus L2-interacting nuclear protein 1 / PLINP / PLINP-1 / p53-responsive gene 6 protein 分子量: 25426.895 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q8TAE8
#84: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL66 / 39S ribosomal protein S18-3 / mitochondrial / MRP-S18-3 / 39S ribosomal protein S18a / MRP-S18-a / ...39S ribosomal protein S18-3 / mitochondrial / MRP-S18-3 / 39S ribosomal protein S18a / MRP-S18-a / Mrps18a / S18mt-a / Large ribosomal subunit protein bS18a 分子量: 22224.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NVS2
#85: タンパク質	Large ribosomal subunit protein mL65 / 39S ribosomal protein S30 / mitochondrial / MRP-S30 / S30mt / Large ribosomal subunit protein mS30 ...39S ribosomal protein S30 / mitochondrial / MRP-S30 / S30mt / Large ribosomal subunit protein mS30 / Programmed cell death protein 9 分子量: 50429.578 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NP92
#86: タンパク質	Large ribosomal subunit protein bL12m / 39S ribosomal protein L12 / mitochondrial / L12mt / MRP-L12 / 5c5-2 分子量: 21378.164 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P52815

+
Small ribosomal subunit protein ... , 29種, 29分子 ABACADAEAFAGAHAIAJAKALAMANAOAPARASATAUAVAWAXAYAZA0A1A2A3A4

#26: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS2m / 28S ribosomal protein S2 / mitochondrial / MRP-S2 / S2mt 分子量: 33298.238 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y399
#27: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS3m / 28S ribosomal protein S24 / mitochondrial / MRP-S24 / S24mt / bMRP-47 / bMRP47 分子量: 19046.164 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EL2
#28: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS5m / 28S ribosomal protein S5 / mitochondrial / MRP-S5 / S5mt 分子量: 48094.594 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82675
#29: タンパク質	Small ribosomal subunit protein bS6m / 28S ribosomal protein S6 / mitochondrial / MRP-S6 / S6mt 分子量: 14250.588 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82932
#30: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS7m / 28S ribosomal protein S7 / mitochondrial / MRP-S7 / S7mt / bMRP-27a / bMRP27a 分子量: 28186.154 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2R9
#31: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS9m / 28S ribosomal protein S9 / mitochondrial / MRP-S9 / S9mt 分子量: 45909.859 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82933
#32: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS10m / 28S ribosomal protein S10 / mitochondrial / MRP-S10 / S10mt 分子量: 23033.500 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82664
#33: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS11m / 28S ribosomal protein S11 / mitochondrial / MRP-S11 / S11mt / Cervical cancer proto-oncogene 2 protein / HCC-2 分子量: 20663.805 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82912
#34: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS12m / 28S ribosomal protein S12 / mitochondrial / MRP-S12 / S12mt / MT-RPS12 分子量: 15200.947 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O15235
#35: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS14m / 28S ribosomal protein S14 / mitochondrial / MRP-S14 / S14mt 分子量: 15168.788 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: O60783
#36: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS15m / 28S ribosomal protein S15 / mitochondrial / MRP-S15 / S15mt 分子量: 29903.293 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82914
#37: タンパク質	Small ribosomal subunit protein bS16m / 28S ribosomal protein S16 / mitochondrial / MRP-S16 / S16mt 分子量: 15371.899 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D3
#38: タンパク質	Small ribosomal subunit protein uS17m / 28S ribosomal protein S17 / mitochondrial / MRP-S17 / S17mt 分子量: 14526.078 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2R5
#39: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS40 / 28S ribosomal protein S18-2 / mitochondrial / MRP-S18-2 / 28S ribosomal protein S18b / MRP-S18-b / ...28S ribosomal protein S18-2 / mitochondrial / MRP-S18-2 / 28S ribosomal protein S18b / MRP-S18-b / Mrps18-b / S18mt-b / Small ribosomal subunit protein bS18b 分子量: 29440.629 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y676
#40: タンパク質	Small ribosomal subunit protein bS18m / 28S ribosomal protein S18-1 / mitochondrial / MRP-S18-1 / 28S ribosomal protein S18c / MRP-S18-c / ...28S ribosomal protein S18-1 / mitochondrial / MRP-S18-1 / 28S ribosomal protein S18c / MRP-S18-c / Mrps18-c / S18mt-c / Small ribosomal subunit protein bS18c 分子量: 15876.786 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D5
#42: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS22 / 28S ribosomal protein S22 / mitochondrial / MRP-S22 / S22mt 分子量: 41337.316 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82650
#43: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS23 / 28S ribosomal protein S23 / mitochondrial / MRP-S23 / S23mt 分子量: 21805.664 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y3D9
#44: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS25 / 28S ribosomal protein S25 / mitochondrial / MRP-S25 / S25mt 分子量: 20146.428 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82663
#45: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS26 / 28S ribosomal protein S13 / mitochondrial / MRP-S13 / S13mt / 28S ribosomal protein S26 / MRP-S26 / S26mt 分子量: 24259.820 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9BYN8
#46: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS27 / 28S ribosomal protein S27 / mitochondrial / MRP-S27 / S27mt / Mitochondrial ribosomal protein S27 分子量: 47669.262 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q92552
#47: タンパク質	Small ribosomal subunit protein bS1m / 28S ribosomal protein S28 / mitochondrial / MRP-S28 / S28mt / 28S ribosomal protein S35 / MRP-S35 / S35mt 分子量: 20878.846 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y2Q9
#48: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS29 / 28S ribosomal protein S29 / mitochondrial / MRP-S29 / S29mt / Death-associated protein 3 / DAP-3 / ...28S ribosomal protein S29 / mitochondrial / MRP-S29 / S29mt / Death-associated protein 3 / DAP-3 / Ionizing radiation resistance conferring protein 分子量: 45634.406 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P51398
#49: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS31 / 28S ribosomal protein S31 / mitochondrial / MRP-S31 / S31mt / Imogen 38 分子量: 45391.473 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q92665
#50: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS33 / 28S ribosomal protein S33 / mitochondrial / MRP-S33 / S33mt 分子量: 12657.776 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9Y291
#51: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS34 / 28S ribosomal protein S34 / mitochondrial / MRP-S34 / S34mt 分子量: 25564.354 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82930
#52: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS35 / 28S ribosomal protein S28 / mitochondrial / MRP-S28 / S28mt / 28S ribosomal protein S35 / MRP-S35 / S35mt 分子量: 36898.328 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P82673
#53: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS37 / 28S ribosomal protein S37 / mitochondrial / MRP-S37 / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain- ...28S ribosomal protein S37 / mitochondrial / MRP-S37 / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / Nuclear protein C2360 分子量: 13393.661 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96BP2
#54: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS38 / 28S ribosomal protein S38 / mitochondrial / MRP-S38 / Aurora kinase A-interacting protein / AURKA- ...28S ribosomal protein S38 / mitochondrial / MRP-S38 / Aurora kinase A-interacting protein / AURKA-interacting protein 分子量: 22395.326 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q9NWT8
#55: タンパク質	Small ribosomal subunit protein mS39 / 28S ribosomal protein S39 / mitochondrial / MRP-S39 / Pentatricopeptide repeat domain-containing ...28S ribosomal protein S39 / mitochondrial / MRP-S39 / Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3 / Transformation-related gene 15 protein / TRG-15 分子量: 78648.547 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: Q96EY7

-
タンパク質 , 1種, 1分子 AQ

#41: タンパク質	MRPS21 isoform 1 / MRPS21 isoform 2 / Mitochondrial ribosomal protein S21 分子量: 10659.494 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: A0A2J8VEN6

-
非ポリマー , 10種, 273分子

#87: 化合物	... ChemComp-MG / MAGNESIUM ION 分子量: 24.305 Da / 分子数: 208 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#88: 化合物	... ChemComp-K / POTASSIUM ION 分子量: 39.098 Da / 分子数: 53 / 由来タイプ: 合成 / 式: K
#89: 化合物	ChemComp-G34 / Retapamulin 分子量: 517.763 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₀H₄₇NO₄S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#90: 化合物	ChemComp-VAL / VALINE タイプ: L-peptide linking / 分子量: 117.146 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₅H₁₁NO₂
#91: 化合物	ChemComp-NAD / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE 分子量: 663.425 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₂₇N₇O₁₄P₂ / コメント: NAD*YM
#92: 化合物	ChemComp-SPD / SPERMIDINE / N-(2-AMINO-PROPYL)-1,4-DIAMINOBUTANE / PA(34) 分子量: 145.246 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₇H₁₉N₃
#93: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#94: 化合物	ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER 分子量: 175.820 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Fe₂S₂
#95: 化合物	ChemComp-ATP / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE 分子量: 507.181 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / コメント: ATP, エネルギー貯蔵分子*YM
#96: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y
Has protein modification	Y

-
実験情報

-
実験

実験	手法: 電子顕微鏡法
EM実験	試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

-
試料調製

構成要素	名称: human mitoribosome trapped by retapamulin / タイプ: RIBOSOME / Entity ID: #1-#8, #10-#18, #20-#40, #42-#52, #54-#86 / 由来: NATURAL
分子量	実験値: NO
由来(天然)	生物種: Homo sapiens (ヒト)
緩衝液	pH: 7.5
試料	包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
試料支持	グリッドの材料: GOLD / グリッドのサイズ: 300 divisions/in. / グリッドのタイプ: Quantifoil R2/1
急速凍結	凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % / 凍結前の試料温度: 297 K

-
電子顕微鏡撮影

実験機器	モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡	モデル: TFS KRIOS
電子銃	電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
電子レンズ	モード: BRIGHT FIELD / 最大デフォーカス（公称値）: 1600 nm / 最小デフォーカス（公称値）: 800 nm
撮影	電子線照射量: 30 e/Å² / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k)

-
解析

EMソフトウェア

名称: PHENIX / バージョン: 1.20.1_4487: / カテゴリ: モデル精密化

CTF補正

タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION

3次元再構成

解像度: 3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 114776 / 対称性のタイプ: POINT

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
ELECTRON MICROSCOPY	f_bond_d	0.001	180507
ELECTRON MICROSCOPY	f_angle_d	0.38	256558
ELECTRON MICROSCOPY	f_dihedral_angle_d	10.73	77431
ELECTRON MICROSCOPY	f_chiral_restr	0.031	30168
ELECTRON MICROSCOPY	f_plane_restr	0.004	23470

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
RNA鎖 , 5種, 5分子 ABAAAxAz

+
Large ribosomal subunit protein ... , 51種, 51分子 DEFHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ01234567...

+
Small ribosomal subunit protein ... , 29種, 29分子 ABACADAEAFAGAHAIAJAKALAMANAOAPARASATAUAVAWAXAYAZA0A1A2A3A4

-
タンパク質 , 1種, 1分子 AQ

-
非ポリマー , 10種, 273分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
電子顕微鏡撮影

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-RNA鎖 , 5種, 5分子 ABAAAxAz

+Large ribosomal subunit protein ... , 51種, 51分子 DEFHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ01234567...

+Small ribosomal subunit protein ... , 29種, 29分子 ABACADAEAFAGAHAIAJAKALAMANAOAPARASATAUAVAWAXAYAZA0A1A2A3A4

-タンパク質 , 1種, 1分子 AQ

-非ポリマー , 10種, 273分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-電子顕微鏡撮影

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
RNA鎖 , 5種, 5分子 ABAAAxAz

+
Large ribosomal subunit protein ... , 51種, 51分子 DEFHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ01234567...

+
Small ribosomal subunit protein ... , 29種, 29分子 ABACADAEAFAGAHAIAJAKALAMANAOAPARASATAUAVAWAXAYAZA0A1A2A3A4

-
タンパク質 , 1種, 1分子 AQ

-
非ポリマー , 10種, 273分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
電子顕微鏡撮影

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)