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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8y7o | |||||||||
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タイトル | FluPol-NS2 complex (hexamer) | |||||||||
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![]() | PROTEIN BINDING | |||||||||
機能・相同性 | ![]() exit of virus from host cell nucleus through nuclear pore / cap snatching / viral transcription / symbiont-mediated suppression of host mRNA transcription via inhibition of RNA polymerase II activity / host cell mitochondrion / 7-methylguanosine mRNA capping / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / virion component / endonuclease activity / host cell cytoplasm ...exit of virus from host cell nucleus through nuclear pore / cap snatching / viral transcription / symbiont-mediated suppression of host mRNA transcription via inhibition of RNA polymerase II activity / host cell mitochondrion / 7-methylguanosine mRNA capping / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of MAVS activity / virion component / endonuclease activity / host cell cytoplasm / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / RNA-directed RNA polymerase / viral RNA genome replication / RNA-dependent RNA polymerase activity / nucleotide binding / virus-mediated perturbation of host defense response / DNA-templated transcription / host cell nucleus / RNA binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3 Å | |||||||||
![]() | Peng, Q. / Sun, J.Q. | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: NS2 stabilizes polymerase hexamer to regulate transcription-replication switch of influenza A virus 著者: Peng, Q. / Sun, J.Q. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 2 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 1.6 MB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1001.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 243.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 382.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 39022MC ![]() 8y7mC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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3 | ![]()
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 84625.414 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: A/nt/60/1968(H3N2) / 遺伝子: PA / 細胞株 (発現宿主): HEK293 / 発現宿主: ![]() 参照: UniProt: P03434, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 #2: タンパク質 | 分子量: 86524.086 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: A/Hong Kong/1/1968(H3N2) / 遺伝子: PB1 / 細胞株 (発現宿主): HEK293 / 発現宿主: ![]() #3: タンパク質 | 分子量: 89495.930 Da / 分子数: 6 / Mutation: L691R / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: A/nt/60/1968(H3N2) / 遺伝子: PB2 / 細胞株 (発現宿主): HEK293 / 発現宿主: ![]() #4: タンパク質 | 分子量: 14355.328 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 株: A/Hong Kong/1/1968 H3N2 / 遺伝子: NS / 細胞株 (発現宿主): HEK293 / 発現宿主: ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 |
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由来(天然) |
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由来(組換発現) | 生物種: ![]() | ||||||||||||||||||||||||
緩衝液 | pH: 8 | ||||||||||||||||||||||||
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES | ||||||||||||||||||||||||
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1000 nm / Cs: 0.001 mm |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 / フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
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3次元再構成 | 解像度: 3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 351243 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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