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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8wi3 | ||||||
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タイトル | ND-hMRP5-inward open | ||||||
![]() | ATP-binding cassette sub-family C member 5 | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / ND-hMRP5 | ||||||
機能・相同性 | ![]() purine nucleotide transport / macromolecule transmembrane transporter activity / cGMP transport / carbohydrate derivative transmembrane transporter activity / Hyaluronan biosynthesis and export / folate transmembrane transport / purine nucleotide transmembrane transporter activity / cAMP transport / heme transmembrane transporter activity / glutathione transmembrane transport ...purine nucleotide transport / macromolecule transmembrane transporter activity / cGMP transport / carbohydrate derivative transmembrane transporter activity / Hyaluronan biosynthesis and export / folate transmembrane transport / purine nucleotide transmembrane transporter activity / cAMP transport / heme transmembrane transporter activity / glutathione transmembrane transport / glutathione transmembrane transporter activity / heme transmembrane transport / hyaluronan biosynthetic process / ATPase-coupled inorganic anion transmembrane transporter activity / organic anion transmembrane transporter activity / xenobiotic transmembrane transport / export across plasma membrane / ABC-type xenobiotic transporter / Paracetamol ADME / xenobiotic transport / ABC-type xenobiotic transporter activity / トランスロカーゼ; 他の化合物の輸送を触媒; ヌクレオシド三リン酸の加水分解に伴う / Azathioprine ADME / efflux transmembrane transporter activity / xenobiotic transmembrane transporter activity / transport across blood-brain barrier / ATPase-coupled transmembrane transporter activity / xenobiotic metabolic process / ABC-family proteins mediated transport / transmembrane transport / Golgi lumen / basolateral plasma membrane / endosome membrane / apical plasma membrane / ATP hydrolysis activity / ATP binding / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.38 Å | ||||||
![]() | Liu, Z.M. / Huang, Y. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Inhibition and transport mechanisms of the ABC transporter hMRP5. 著者: Ying Huang / Chenyang Xue / Ruiqian Bu / Cang Wu / Jiachen Li / Jinqiu Zhang / Jinyu Chen / Zhaoying Shi / Yonglong Chen / Yong Wang / Zhongmin Liu / ![]() 要旨: Human multidrug resistance protein 5 (hMRP5) effluxes anticancer and antivirus drugs, driving multidrug resistance. To uncover the mechanism of hMRP5, we determine six distinct cryo-EM structures, ...Human multidrug resistance protein 5 (hMRP5) effluxes anticancer and antivirus drugs, driving multidrug resistance. To uncover the mechanism of hMRP5, we determine six distinct cryo-EM structures, revealing an autoinhibitory N-terminal peptide that must dissociate to permit subsequent substrate recruitment. Guided by these molecular insights, we design an inhibitory peptide that could block substrate entry into the transport pathway. We also identify a regulatory motif, comprising a positively charged cluster and hydrophobic patches, within the first nucleotide-binding domain that modulates hMRP5 localization by engaging with membranes. By integrating our structural, biochemical, computational, and cell biological findings, we propose a model for hMRP5 conformational cycling and localization. Overall, this work provides mechanistic understanding of hMRP5 function, while informing future selective hMRP5 inhibitor development. More broadly, this study advances our understanding of the structural dynamics and inhibition of ABC transporters. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 223.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 174.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 37556MC ![]() 8kciC ![]() 8wi0C ![]() 8wi2C ![]() 8wi4C ![]() 8wi5C M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 164451.391 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 参照: UniProt: O15440, トランスロカーゼ; 他の化合物の輸送を触媒; ヌクレオシド三リン酸の加水分解に伴う, ABC-type xenobiotic transporter |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: hMRP5-ND inward-open / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 1200 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 800 nm |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
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3次元再構成 | 解像度: 3.38 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 865700 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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