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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8imz | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of mouse Piezo1-MDFIC complex (composite map) | |||||||||
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![]() | MEMBRANE PROTEIN / Piezo1 complex / mechanosensation / mechanotransduction | |||||||||
機能・相同性 | ![]() mechanosensitive monoatomic cation channel activity / positive regulation of viral transcription / positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin / detection of mechanical stimulus / Tat protein binding / mechanosensitive monoatomic ion channel activity / positive regulation of integrin activation / regulation of Wnt signaling pathway / negative regulation of protein import into nucleus / positive regulation of myotube differentiation ...mechanosensitive monoatomic cation channel activity / positive regulation of viral transcription / positive regulation of cell-cell adhesion mediated by integrin / detection of mechanical stimulus / Tat protein binding / mechanosensitive monoatomic ion channel activity / positive regulation of integrin activation / regulation of Wnt signaling pathway / negative regulation of protein import into nucleus / positive regulation of myotube differentiation / monoatomic cation transport / lamellipodium membrane / regulation of JNK cascade / monoatomic cation channel activity / endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane / cyclin binding / regulation of membrane potential / cellular response to mechanical stimulus / DNA-binding transcription factor binding / negative regulation of DNA-templated transcription / endoplasmic reticulum membrane / nucleolus / positive regulation of DNA-templated transcription / endoplasmic reticulum / extracellular region / identical protein binding / nucleus / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.66 Å | |||||||||
![]() | Zhou, Z. / Ma, X. / Lin, Y. / Cheng, D. / Bavi, N. / Li, J.V. / Sutton, D. / Yao, M. / Harvey, N. / Corry, B. ...Zhou, Z. / Ma, X. / Lin, Y. / Cheng, D. / Bavi, N. / Li, J.V. / Sutton, D. / Yao, M. / Harvey, N. / Corry, B. / Zhang, Y. / Cox, C.D. | |||||||||
資金援助 | ![]() ![]()
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![]() | ![]() タイトル: MyoD-family inhibitor proteins act as auxiliary subunits of Piezo channels. 著者: Zijing Zhou / Xiaonuo Ma / Yiechang Lin / Delfine Cheng / Navid Bavi / Genevieve A Secker / Jinyuan Vero Li / Vaibhao Janbandhu / Drew L Sutton / Hamish S Scott / Mingxi Yao / Richard P ...著者: Zijing Zhou / Xiaonuo Ma / Yiechang Lin / Delfine Cheng / Navid Bavi / Genevieve A Secker / Jinyuan Vero Li / Vaibhao Janbandhu / Drew L Sutton / Hamish S Scott / Mingxi Yao / Richard P Harvey / Natasha L Harvey / Ben Corry / Yixiao Zhang / Charles D Cox / ![]() ![]() ![]() 要旨: Piezo channels are critical cellular sensors of mechanical forces. Despite their large size, ubiquitous expression, and irreplaceable roles in an ever-growing list of physiological processes, few ...Piezo channels are critical cellular sensors of mechanical forces. Despite their large size, ubiquitous expression, and irreplaceable roles in an ever-growing list of physiological processes, few Piezo channel-binding proteins have emerged. In this work, we found that MyoD (myoblast determination)-family inhibitor proteins (MDFIC and MDFI) are PIEZO1/2 interacting partners. These transcriptional regulators bind to PIEZO1/2 channels, regulating channel inactivation. Using single-particle cryogenic electron microscopy, we mapped the interaction site in MDFIC to a lipidated, C-terminal helix that inserts laterally into the PIEZO1 pore module. These Piezo-interacting proteins fit all the criteria for auxiliary subunits, contribute to explaining the vastly different gating kinetics of endogenous Piezo channels observed in many cell types, and elucidate mechanisms potentially involved in human lymphatic vascular disease. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 724.3 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 547.5 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 434.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 488.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 71.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 109 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 35577MC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 292320.656 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: タンパク質 | 分子量: 26122.732 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Piezo1 in complex with MDFIC / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: MULTIPLE SOURCES |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 7.9 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / 最大 デフォーカス(公称値): 2400 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 49.4 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k) |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.18.2_3874: / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.66 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 102644 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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