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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 8ieq | |||||||||
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タイトル | Cryo-EM structure of G-protein free GPR156 | |||||||||
![]() | Probable G-protein coupled receptor 156 | |||||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / G-protein coupled receptor / Signal transduction / Phospholipid | |||||||||
機能・相同性 | ![]() G protein-coupled GABA receptor activity / G protein-coupled receptor heterodimeric complex / gamma-aminobutyric acid signaling pathway / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.73 Å | |||||||||
![]() | Shin, J. / Park, J. / Cho, Y. | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Constitutive activation mechanism of a class C GPCR. 著者: Jinwoo Shin / Junhyeon Park / Jieun Jeong / Jordy Homing Lam / Xingyu Qiu / Di Wu / Kuglae Kim / Joo-Youn Lee / Carol V Robinson / Jaekyung Hyun / Vsevolod Katritch / Kwang Pyo Kim / Yunje Cho / ![]() ![]() ![]() 要旨: Class C G-protein-coupled receptors (GPCRs) are activated through binding of agonists to the large extracellular domain (ECD) followed by rearrangement of the transmembrane domains (TMDs). GPR156, a ...Class C G-protein-coupled receptors (GPCRs) are activated through binding of agonists to the large extracellular domain (ECD) followed by rearrangement of the transmembrane domains (TMDs). GPR156, a class C orphan GPCR, is unique because it lacks an ECD and exhibits constitutive activity. Impaired GPR156-G signaling contributes to loss of hearing. Here we present the cryo-electron microscopy structures of human GPR156 in the G-free and G-coupled states. We found that an endogenous phospholipid molecule is located within each TMD of the GPR156 dimer. Asymmetric binding of Gα to the phospholipid-bound GPR156 dimer restructures the first and second intracellular loops and the carboxy-terminal part of the elongated transmembrane 7 (TM7) without altering dimer conformation. Our findings reveal that GPR156 is a transducer for phospholipid signaling. Constant binding of abundant phospholipid molecules and the G-protein-induced reshaping of the cytoplasmic face provide a basis for the constitutive activation of GPR156. | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 242.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 表示 | ![]() | |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 35390MC ![]() 8iebC ![]() 8iecC ![]() 8iedC ![]() 8ieiC ![]() 8iepC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 65628.484 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-A1LYA / [( 分子量: 760.076 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C42H82NO8P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION 研究の焦点であるリガンドがあるか | Y | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: G-protein free GPR156 / タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1 / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 値: 262.4 kDa/nm / 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: OTHER / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: OTHER |
電子レンズ | モード: OTHER / 最大 デフォーカス(公称値): 2000 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1000 nm |
撮影 | 電子線照射量: 64 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON IV (4k x 4k) |
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解析
CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
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3次元再構成 | 解像度: 2.73 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 493410 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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