+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7xho | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Structure of human inner kinetochore CCAN complex | ||||||
![]() |
| ||||||
![]() | CELL CYCLE | ||||||
機能・相同性 | ![]() positive regulation of protein localization to kinetochore / FANCM-MHF complex / Mis6-Sim4 complex / centromere complex assembly / kinetochore organization / Fanconi anaemia nuclear complex / spindle attachment to meiosis I kinetochore / metaphase chromosome alignment / kinetochore binding / centromeric DNA binding ...positive regulation of protein localization to kinetochore / FANCM-MHF complex / Mis6-Sim4 complex / centromere complex assembly / kinetochore organization / Fanconi anaemia nuclear complex / spindle attachment to meiosis I kinetochore / metaphase chromosome alignment / kinetochore binding / centromeric DNA binding / sex differentiation / CENP-A containing chromatin assembly / resolution of meiotic recombination intermediates / chordate embryonic development / negative regulation of epithelial cell apoptotic process / kinetochore assembly / inner kinetochore / condensed chromosome, centromeric region / attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore / replication fork processing / mitotic sister chromatid segregation / chromosome, centromeric region / centriolar satellite / chromosome organization / pericentric heterochromatin / Amplification of signal from unattached kinetochores via a MAD2 inhibitory signal / interstrand cross-link repair / Mitotic Prometaphase / EML4 and NUDC in mitotic spindle formation / Deposition of new CENPA-containing nucleosomes at the centromere / Resolution of Sister Chromatid Cohesion / NRIF signals cell death from the nucleus / mitotic spindle organization / positive regulation of protein ubiquitination / chromosome segregation / positive regulation of epithelial cell proliferation / RHO GTPases Activate Formins / Fanconi Anemia Pathway / PKR-mediated signaling / kinetochore / nuclear matrix / Separation of Sister Chromatids / actin cytoskeleton / chromosome / mitotic cell cycle / midbody / nuclear body / cell adhesion / protein heterodimerization activity / cell division / DNA repair / apoptotic process / DNA damage response / chromatin binding / regulation of DNA-templated transcription / chromatin / nucleolus / signal transduction / DNA binding / nucleoplasm / identical protein binding / membrane / nucleus / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.29 Å | ||||||
![]() | Tian, T. / Wang, C.L. / Yang, Z.S. / Sun, L.F. / Zang, J.Y. | ||||||
資金援助 | ![]()
| ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structural insights into human CCAN complex assembled onto DNA. 著者: Tian Tian / Lili Chen / Zhen Dou / Zhisen Yang / Xinjiao Gao / Xiao Yuan / Chengliang Wang / Ran Liu / Zuojun Shen / Ping Gui / Maikun Teng / Xianlei Meng / Donald L Hill / Lin Li / Xuan ...著者: Tian Tian / Lili Chen / Zhen Dou / Zhisen Yang / Xinjiao Gao / Xiao Yuan / Chengliang Wang / Ran Liu / Zuojun Shen / Ping Gui / Maikun Teng / Xianlei Meng / Donald L Hill / Lin Li / Xuan Zhang / Xing Liu / Linfeng Sun / Jianye Zang / Xuebiao Yao / ![]() ![]() 要旨: In mitosis, accurate chromosome segregation depends on kinetochores that connect centromeric chromatin to spindle microtubules. The centromeres of budding yeast, which are relatively simple, are ...In mitosis, accurate chromosome segregation depends on kinetochores that connect centromeric chromatin to spindle microtubules. The centromeres of budding yeast, which are relatively simple, are connected to individual microtubules via a kinetochore constitutive centromere associated network (CCAN). However, the complex centromeres of human chromosomes comprise millions of DNA base pairs and attach to multiple microtubules. Here, by use of cryo-electron microscopy and functional analyses, we reveal the molecular basis of how human CCAN interacts with duplex DNA and facilitates accurate chromosome segregation. The overall structure relates to the cooperative interactions and interdependency of the constituent sub-complexes of the CCAN. The duplex DNA is topologically entrapped by human CCAN. Further, CENP-N does not bind to the RG-loop of CENP-A but to DNA in the CCAN complex. The DNA binding activity is essential for CENP-LN localization to centromere and chromosome segregation during mitosis. Thus, these analyses provide new insights into mechanisms of action underlying kinetochore assembly and function in mitosis. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 573.3 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 422.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.2 MB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 1.3 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 87 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 132.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 33197MC ![]() 7xhnC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
---|---|
類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
|
---|---|
1 |
|
-
要素
-Centromere protein ... , 15種, 16分子 CcHIKLMNOPQSTXRU
#1: タンパク質 | 分子量: 107022.273 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q03188 #2: タンパク質 | | 分子量: 28520.941 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #3: タンパク質 | | 分子量: 86820.188 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #4: タンパク質 | | 分子量: 31696.070 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #5: タンパク質 | | 分子量: 39040.625 Da / 分子数: 1 / Mutation: N116D / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q8N0S6 #6: タンパク質 | | 分子量: 19761.945 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #7: タンパク質 | | 分子量: 39595.523 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q96H22 #8: タンパク質 | | 分子量: 33830.637 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #9: タンパク質 | | 分子量: 33210.949 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #10: タンパク質 | | 分子量: 30648.375 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #11: タンパク質 | | 分子量: 15917.875 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q8N2Z9 #12: タンパク質 | | 分子量: 60502.613 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q96BT3 #14: タンパク質 | | 分子量: 8972.415 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: A8MT69 #15: タンパク質 | | 分子量: 20228.297 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() #16: タンパク質 | | 分子量: 47609.766 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() |
---|
-タンパク質 , 1種, 1分子 W
#13: タンパク質 | 分子量: 10087.236 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() 発現宿主: ![]() ![]() 参照: UniProt: Q5EE01 |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
---|---|
EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
-
試料調製
構成要素 | 名称: CCAN / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
---|---|
分子量 | 実験値: NO |
由来(天然) | 生物種: ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 7.5 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
-
電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
---|---|
顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: DIFFRACTION / 最大 デフォーカス(公称値): 2700 nm / 最小 デフォーカス(公称値): 1700 nm |
撮影 | 電子線照射量: 50 e/Å2 フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k) |
-
解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.20.1_4487: / 分類: 精密化 |
---|---|
CTF補正 | タイプ: NONE |
3次元再構成 | 解像度: 3.29 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 200560 / 対称性のタイプ: POINT |