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- PDB-7nsi: 55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E) -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7nsi
タイトル55S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E)
要素
  • (28S ribosomal protein ...) x 16
  • (39S ribosomal protein ...) x 33
  • (Mitochondrial ribosomal protein ...) x 17
  • 12S rRNA
  • 16S rRNA
  • Aurora kinase A interacting protein 1
  • CP tRNAPhe
  • Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1
  • Death associated protein 3
  • ICT1
  • Interferon alpha-inducible protein 6
  • Mitoribosomal protein us12m, mrps12
  • Pentatricopeptide repeat domain 3,Pentatricopeptide repeat domain 3,mS39,Pentatricopeptide repeat domain 3,Pentatricopeptide repeat domain 3
  • Ribosomal protein
  • Ribosomal_L2_C domain-containing protein
  • Ribosome-recycling factor, mitochondrial
  • TGS domain-containing protein
  • bL32m
  • mL42
  • mL53
  • mRNA
  • tRNA (P/E)
  • uL14m
  • uS17m
  • unknown
キーワードTRANSLATION / Ribosome / Mitochondria / mtRRF / Recycling
機能・相同性
機能・相同性情報


Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / rRNA import into mitochondrion / mitochondrial translational termination / mitochondrial transcription / mitochondrial ribosome assembly / mitochondrial translational elongation / ribonuclease III activity / Mitochondrial translation termination / translation release factor activity, codon nonspecific ...Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / rRNA import into mitochondrion / mitochondrial translational termination / mitochondrial transcription / mitochondrial ribosome assembly / mitochondrial translational elongation / ribonuclease III activity / Mitochondrial translation termination / translation release factor activity, codon nonspecific / Mitochondrial protein degradation / mitochondrial large ribosomal subunit / peptidyl-tRNA hydrolase / mitochondrial ribosome / mitochondrial small ribosomal subunit / ribosomal subunit / ribosome disassembly / peptidyl-tRNA hydrolase activity / mitochondrial translation / organelle membrane / apoptotic mitochondrial changes / ribosomal large subunit binding / positive regulation of proteolysis / ribosomal small subunit binding / RNA processing / rescue of stalled ribosome / cellular response to leukemia inhibitory factor / cell junction / large ribosomal subunit / double-stranded RNA binding / regulation of translation / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / nuclear body / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / mitochondrial matrix / ribonucleoprotein complex / protein domain specific binding / nucleotide binding / mRNA binding / intracellular membrane-bounded organelle / positive regulation of DNA-templated transcription / nucleolus / mitochondrion / RNA binding / nucleoplasm / nucleus / plasma membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ribosome recycling factor / Ribosome recycling factor domain / RRF superfamily / Ribosome recycling factor / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRPS27/PTCD2 ...Ribosome recycling factor / Ribosome recycling factor domain / RRF superfamily / Ribosome recycling factor / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1 / Cysteine alpha-hairpin motif superfamily / 28S ribosomal protein S26 / Mitochondrial ribosome subunit S26 / 28S ribosomal protein S27, mitochondrial / MRPS27/PTCD2 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S22, mitochondrial / Ribosomal protein S23, mitochondrial / Ribosomal protein S23/S25, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / : / Mitochondrial 28S ribosomal protein S22 / Mitochondrial ribosomal protein S23 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S31 / Ribosomal protein S29, mitochondrial / Ribosomal protein S28, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / 28S ribosomal protein S10, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein MRP-S35 / Mitochondrial 28S ribosomal protein S34 / 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3 / 28S ribosomal protein S17, mitochondrial / 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / : / : / Mitochondrial ribosome subunit S24 / Small ribosomal subunit protein uS5m, N-terminal / Small ribosomal subunit protein mS39, PPR / 28S ribosomal protein S25, mitochondrial / : / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Pentatricopeptide repeat domain / Ribosomal protein S27/S33, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal subunit S27 / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Ribosomal protein S30, mitochondrial / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Ribosomal protein S24/S35, mitochondrial, conserved domain / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Mitochondrial ribosomal subunit protein / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L35, mitochondrial / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Ribosomal protein L37/S30 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / : / : / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / : / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / : / MRPL44 dsRNA-binding domain / Large ribosomal subunit protein mL44, endonuclease domain / : / : / Large ribosomal subunit protein bL9m C-terminal domain / Large ribosomal subunit protein bL9m N-terminal domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Pentatricopeptide (PPR) repeat profile. / Tim44 / : / : / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation / Ribosomal protein S23/S29, mitochondrial / Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation domain superfamily / Mitochondrial ribosomal death-associated protein 3 / Ribosomal protein L7/L12 dimerisation domain / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein L7/L12 / Ribosomal protein L7/L12, C-terminal / Ribosomal protein L7/L12 C-terminal domain / Pentatricopeptide repeat / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal subunit 39S / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Mitochondrial mRNA-processing protein COX24, C-terminal
類似検索 - ドメイン・相同性
GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / SPERMINE / : / : / : / RNA / RNA (> 10) / RNA (> 100) / RNA (> 1000) ...GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / SPERMINE / : / : / : / RNA / RNA (> 10) / RNA (> 100) / RNA (> 1000) / Small ribosomal subunit protein uS12m / 28S ribosomal protein S14, mitochondrial / Small ribosomal subunit protein bS18m / Small ribosomal subunit protein mS25 / 28S ribosomal protein S28, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Small ribosomal subunit protein uS7m / Small ribosomal subunit protein uS11m / Large ribosomal subunit protein mL62 / 28S ribosomal protein S21, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein mL64 / Large ribosomal subunit protein bL34m / Large ribosomal subunit protein uL2m / 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S22 / Large ribosomal subunit protein bL12m / Mitochondrial ribosomal protein S34 / Mitochondrial ribosomal protein L41 / Large ribosomal subunit protein uL4m / Small ribosomal subunit protein mS38 / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein mL37 / Mitochondrial ribosomal protein L57 / Large ribosomal subunit protein mL42 / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Small ribosomal subunit protein bS16m / Large ribosomal subunit protein uL11m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein mL54 / 39S ribosomal protein S30, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein uL10m / Small ribosomal subunit protein mS31 / Ribosomal protein / Large ribosomal subunit protein mL39 / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein uL14m / Small ribosomal subunit protein uS15m / Large ribosomal subunit protein mL66 / Large ribosomal subunit protein mL40 / Small ribosomal subunit protein mS27 / Large ribosomal subunit protein uL15m / Mitochondrial ribosomal protein S23 / Large ribosomal subunit protein uL24m / Small ribosomal subunit protein uS17m / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein uL22m / Large ribosomal subunit protein bL27m / Small ribosomal subunit protein uS10m / Large ribosomal subunit protein mL38 / Large ribosomal subunit protein bL21m / Small ribosomal subunit protein uS2m / Small ribosomal subunit protein mS26 / Small ribosomal subunit protein mS33 / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein mL52 / 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1 / Small ribosomal subunit protein uS5m / Small ribosomal subunit protein mS39 / Large ribosomal subunit protein bL35m / Large ribosomal subunit protein mL50 / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Mitochondrial ribosomal protein S6 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein bL19m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Small ribosomal subunit protein mS29 / Large ribosomal subunit protein bL32m / Small ribosomal subunit protein uS9m / Large ribosomal subunit protein uL13m / Small ribosomal subunit protein mS40 / Ribosome-recycling factor, mitochondrial
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
Sus scrofa (ブタ)
手法電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.6 Å
データ登録者Kummer, E. / Schubert, K. / Ban, N.
資金援助 スイス, 2件
組織認可番号国
European Molecular Biology Organization (EMBO) スイス
Swiss National Science Foundation スイス
引用ジャーナル: Mol Cell / 年: 2021
タイトル: Structural basis of translation termination, rescue, and recycling in mammalian mitochondria.
著者: Eva Kummer / Katharina Noel Schubert / Tanja Schoenhut / Alain Scaiola / Nenad Ban /
要旨: The mitochondrial translation system originates from a bacterial ancestor but has substantially diverged in the course of evolution. Here, we use single-particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) as ...The mitochondrial translation system originates from a bacterial ancestor but has substantially diverged in the course of evolution. Here, we use single-particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) as a screening tool to identify mitochondrial translation termination mechanisms and to describe them in molecular detail. We show how mitochondrial release factor 1a releases the nascent chain from the ribosome when it encounters the canonical stop codons UAA and UAG. Furthermore, we define how the peptidyl-tRNA hydrolase ICT1 acts as a rescue factor on mitoribosomes that have stalled on truncated messages to recover them for protein synthesis. Finally, we present structural models detailing the process of mitochondrial ribosome recycling to explain how a dedicated elongation factor, mitochondrial EFG2 (mtEFG2), has specialized for cooperation with the mitochondrial ribosome recycling factor to dissociate the mitoribosomal subunits at the end of the translation process.
履歴
登録2021年3月7日登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.02021年6月2日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12021年12月15日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author / database_2
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.22024年11月6日Group: Data collection / Structure summary
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / em_admin / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature
Item: _em_admin.last_update / _pdbx_entry_details.has_protein_modification

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構造の表示

ムービー
  • 登録構造単位
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  • ダウンロード
  • EMマップとの重ね合わせ
  • マップデータ: EMDB-12568
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
B0: 39S ribosomal protein L27, mitochondrial
B1: 39S ribosomal protein L28, mitochondrial
B2: Mitochondrial ribosomal protein L47
B3: 39S ribosomal protein L30, mitochondrial
B4: Mitochondrial ribosomal protein L55
B5: bL32m
B6: 39S ribosomal protein L33, mitochondrial
BB: CP tRNAPhe
B7: 39S ribosomal protein L34, mitochondrial
BD: Ribosomal_L2_C domain-containing protein
BE: ICT1
BF: Mitochondrial ribosomal protein L4
BG: Ribosome-recycling factor, mitochondrial
BI: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial
BJ: 39S ribosomal protein L10, mitochondrial isoform a
BK: 39S ribosomal protein L11, mitochondrial isoform a
BN: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial
BO: uL14m
BP: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial
BQ: 39S ribosomal protein L16, mitochondrial
BR: 39S ribosomal protein L17, mitochondrial
BS: 39S ribosomal protein L18, mitochondrial isoform 1
BT: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial
BU: 39S ribosomal protein L20, mitochondrial isoform 1
BV: 39S ribosomal protein L21, mitochondrial isoform d
BW: 39S ribosomal protein L22, mitochondrial
BX: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial
BY: 39S ribosomal protein L24, mitochondrial isoform X1
Ba: 39S ribosomal protein L37, mitochondrial
Bb: 39S ribosomal protein L38, mitochondrial
Bc: TGS domain-containing protein
Bd: Mitochondrial ribosomal protein L40
Be: Mitochondrial ribosomal protein L41
Bf: mL42
Bg: 39S ribosomal protein L43, mitochondrial isoform X2
B8: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial
Bh: 39S ribosomal protein L44, mitochondrial
Bi: Mitochondrial ribosomal protein L45
Bj: 39S ribosomal protein L46, mitochondrial
Bk: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial
Bl: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial
Bm: 39S ribosomal protein L50, mitochondrial
Bn: 39S ribosomal protein L51, mitochondrial
Bo: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial
Bp: mL53
Bq: 39S ribosomal protein L54, mitochondrial
Bt: Mitochondrial ribosomal protein L57
Bu: Mitochondrial ribosomal protein L58
Bv: 39S ribosomal protein L59, mitochondrial
Bw: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial
Bx: Mitochondrial ribosomal protein S18A
AA: 12S rRNA
B9: Ribosomal protein
AV: tRNA (P/E)
AX: mRNA
BA: 16S rRNA
AB: 28S ribosomal protein S2, mitochondrial
AC: 28S ribosomal protein S24, mitochondrial
AE: 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2
AF: Mitochondrial ribosomal protein S6
AG: 28S ribosomal protein S7, mitochondrial
AI: 28S ribosomal protein S9, mitochondrial
AJ: 28S ribosomal protein S10, mitochondrial
AK: Mitochondrial ribosomal protein S11
AL: Mitoribosomal protein us12m, mrps12
AN: 28S ribosomal protein S14, mitochondrial
AO: 28S ribosomal protein S15, mitochondrial
AP: 28S ribosomal protein S16, mitochondrial
AQ: uS17m
AR: 28S ribosomal protein S18c, mitochondrial isoform 1
AU: 28S ribosomal protein S21, mitochondrial
AZ: unknown
Aa: Mitochondrial ribosomal protein S22
Ab: Mitochondrial ribosomal protein S23
Ac: Interferon alpha-inducible protein 6
Ad: 28S ribosomal protein S26, mitochondrial
Ae: Mitochondrial ribosomal protein S27
Af: 28S ribosomal protein S28, mitochondrial
Ag: Death associated protein 3
Ah: 28S ribosomal protein S31, mitochondrial
Ai: Mitochondrial ribosomal protein S33
Aj: Mitochondrial ribosomal protein S34
Ak: 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1
Am: Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1
An: Aurora kinase A interacting protein 1
Ao: Pentatricopeptide repeat domain 3,Pentatricopeptide repeat domain 3,mS39,Pentatricopeptide repeat domain 3,Pentatricopeptide repeat domain 3
Ap: 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial
CL: Mitochondrial ribosomal protein L12
DL: Mitochondrial ribosomal protein L12
EL: Mitochondrial ribosomal protein L12
FL: Mitochondrial ribosomal protein L12
GL: Mitochondrial ribosomal protein L12
HL: Mitochondrial ribosomal protein L12
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)3,103,770431
ポリマ－3,093,93793
非ポリマー9,834338
水543
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: microscopy
タイプ名称対称操作数
identity operation1_5551

-
要素

+
39S ribosomal protein ... , 33種, 33分子 B0B1B3B6B7BIBJBKBNBPBQBRBSBTBUBVBWBXBYBaBbBgB8BhBjBkBlBmBnBo...

#1: タンパク質 39S ribosomal protein L27, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27


分子量: 15943.688 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RT79
#2: タンパク質 39S ribosomal protein L28, mitochondrial


分子量: 30148.953 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZTW8
#4: タンパク質 39S ribosomal protein L30, mitochondrial


分子量: 18921.100 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1STE5
#7: タンパク質 39S ribosomal protein L33, mitochondrial


分子量: 7508.097 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZU68
#9: タンパク質 39S ribosomal protein L34, mitochondrial


分子量: 10871.729 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287A119
#14: タンパク質 39S ribosomal protein L9, mitochondrial


分子量: 30373.449 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LR45
#15: タンパク質 39S ribosomal protein L10, mitochondrial isoform a


分子量: 29449.689 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480VPY3
#16: タンパク質 39S ribosomal protein L11, mitochondrial isoform a


分子量: 20809.271 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480KRD0
#17: タンパク質 39S ribosomal protein L13, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L13


分子量: 20633.801 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: K7GP19
#19: タンパク質 39S ribosomal protein L15, mitochondrial


分子量: 33481.723 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A5G2RG26
#20: タンパク質 39S ribosomal protein L16, mitochondrial


分子量: 28680.531 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480MAF3
#21: タンパク質 39S ribosomal protein L17, mitochondrial


分子量: 19268.178 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RMQ4
#22: タンパク質 39S ribosomal protein L18, mitochondrial isoform 1 / ICT1 / Mitochondrial ribosomal protein L18


分子量: 20582.568 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A0R4J8D5
#23: タンパク質 39S ribosomal protein L19, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L19


分子量: 33441.539 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LNJ0
#24: タンパク質 39S ribosomal protein L20, mitochondrial isoform 1 / Mitochondrial ribosomal protein L20


分子量: 17554.793 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZU56
#25: タンパク質 39S ribosomal protein L21, mitochondrial isoform d


分子量: 23154.861 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RY70
#26: タンパク質 39S ribosomal protein L22, mitochondrial


分子量: 24313.357 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RQC9
#27: タンパク質 39S ribosomal protein L23, mitochondrial


分子量: 17643.205 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480JJI1
#28: タンパク質 39S ribosomal protein L24, mitochondrial isoform X1 / Mitochondrial ribosomal protein L24


分子量: 24893.529 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RHJ1
#29: タンパク質 39S ribosomal protein L37, mitochondrial / 39S ribosomal protein L37 / mitochondrial isoform 2 / Mitochondrial ribosomal protein L37


分子量: 47917.988 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287BIV6
#30: タンパク質 39S ribosomal protein L38, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L38


分子量: 44656.387 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RW03
#35: タンパク質 39S ribosomal protein L43, mitochondrial isoform X2 / Mitochondrial ribosomal protein L43


分子量: 17728.109 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1S8U4
#36: タンパク質 39S ribosomal protein L35, mitochondrial


分子量: 21548.543 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SVC5
#37: タンパク質 39S ribosomal protein L44, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L44


分子量: 37527.195 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SR64
#39: タンパク質 39S ribosomal protein L46, mitochondrial


分子量: 32215.998 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SRT0
#40: タンパク質 39S ribosomal protein L48, mitochondrial / 39S ribosomal protein L48 / mitochondrial isoform 1 / Mitochondrial ribosomal protein L48


分子量: 29942.523 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480J9Z6
#41: タンパク質 39S ribosomal protein L49, mitochondrial


分子量: 18957.779 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1V1G7
#42: タンパク質 39S ribosomal protein L50, mitochondrial


分子量: 22785.357 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3L9H6
#43: タンパク質 39S ribosomal protein L51, mitochondrial


分子量: 15249.048 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287BE26
#44: タンパク質 39S ribosomal protein L52, mitochondrial


分子量: 13813.705 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1S9B7
#46: タンパク質 39S ribosomal protein L54, mitochondrial


分子量: 15957.357 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480PHA9
#49: タンパク質 39S ribosomal protein L59, mitochondrial / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1


分子量: 25815.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZXA6
#50: タンパク質 39S ribosomal protein S30, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S30


分子量: 49100.504 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480QIM3

-
Mitochondrial ribosomal protein ... , 17種, 22分子 B2B4BFBdBeBiBtBuBxAFAKAaAbAeAiAjCLDLELFLGLHL

#3: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L47


分子量: 30085.088 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SGC7
#5: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L55


分子量: 15156.537 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3L9J0
#12: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L4


分子量: 33251.469 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287B2W3
#32: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L40


分子量: 24075.658 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A5G2R2V2
#33: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L41


分子量: 15073.404 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287AWS0
#38: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L45


分子量: 35331.805 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LGM5
#47: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L57


分子量: 12001.915 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287BP93
#48: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein L58 / Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1 / mitochondrial / mitochondrial isoform 1


分子量: 23545.873 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZJR2
#51: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S18A


分子量: 22273.084 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A5G2R1G5
#60: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S6


分子量: 30365.266 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LEJ9
#64: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S11


分子量: 20841.922 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZJJ6
#73: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S22


分子量: 43234.645 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287AQT5
#74: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S23


分子量: 21666.674 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A5G2RMZ2
#77: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S27


分子量: 51945.984 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A5G2R5D6
#81: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S33


分子量: 12544.650 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1S8G3
#82: タンパク質 Mitochondrial ribosomal protein S34


分子量: 25843.818 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287AVS9
#88: タンパク質
Mitochondrial ribosomal protein L12


分子量: 21268.975 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287ARV8

-
タンパク質 , 16種, 16分子 B5BDBEBGBOBcBfBpB9ALAQAcAgAmAnAo

#6: タンパク質 bL32m


分子量: 21537.930 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LTC4
#10: タンパク質 Ribosomal_L2_C domain-containing protein


分子量: 33270.934 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287A143
#11: タンパク質 ICT1 / Mitochondrial ribosomal protein L3


分子量: 43708.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A140UHW4
#13: タンパク質 Ribosome-recycling factor, mitochondrial / RRF / Ribosome-releasing factor / mitochondrial


分子量: 28689.992 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: MRRF / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q96E11
#18: タンパク質 uL14m


分子量: 15955.632 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1V5Y7
#31: タンパク質 TGS domain-containing protein


分子量: 38523.422 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1UDR3
#34: タンパク質 mL42


分子量: 16680.178 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287BQA1
#45: タンパク質 mL53


分子量: 12015.747 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
#53: タンパク質 Ribosomal protein


分子量: 10841.016 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1THS9
#65: タンパク質 Mitoribosomal protein us12m, mrps12


分子量: 15257.107 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A0M3KL52
#69: タンパク質 uS17m


分子量: 14452.014 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RIU0
#75: タンパク質 Interferon alpha-inducible protein 6 / Mitochondrial ribosomal protein S25 / Mitoribosomal protein ms25 / mrps25


分子量: 19954.186 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A0M3KL55
#79: タンパク質 Death associated protein 3


分子量: 46966.062 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LS10
#84: タンパク質 Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 1


分子量: 13561.903 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SU49
#85: タンパク質 Aurora kinase A interacting protein 1


分子量: 22843.941 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287B3R8
#86: タンパク質 Pentatricopeptide repeat domain 3,Pentatricopeptide repeat domain 3,mS39,Pentatricopeptide repeat domain 3,Pentatricopeptide repeat domain 3


分子量: 76524.648 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SVC4

-
RNA鎖 , 5種, 5分子 BBAAAVAXBA

#8: RNA鎖 CP tRNAPhe


分子量: 23402.018 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: GenBank: 45826169
#52: RNA鎖 12S rRNA


分子量: 308989.062 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: GenBank: 11055671
#54: RNA鎖 tRNA (P/E)


分子量: 21713.891 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
#55: RNA鎖 mRNA


分子量: 1485.872 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)
#56: RNA鎖 16S rRNA


分子量: 504852.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: GenBank: 33320725

-
28S ribosomal protein ... , 16種, 16分子 ABACAEAGAIAJANAOAPARAUAdAfAhAkAp

#57: タンパク質 28S ribosomal protein S2, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S2


分子量: 31731.604 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1S001
#58: タンパク質 28S ribosomal protein S24, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S24


分子量: 18935.172 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A287ANU4
#59: タンパク質 28S ribosomal protein S5, mitochondrial isoform X2 / Mitochondrial ribosomal protein S5


分子量: 48213.074 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SU66
#61: タンパク質 28S ribosomal protein S7, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S7


分子量: 28150.918 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZJ25
#62: タンパク質 28S ribosomal protein S9, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S9


分子量: 45604.570 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: I3LU08
#63: タンパク質 28S ribosomal protein S10, mitochondrial


分子量: 23105.678 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1RUU2
#66: タンパク質 28S ribosomal protein S14, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S14 / Mitoribosomal protein us14m / mrps14


分子量: 15120.739 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A0M3KL53
#67: タンパク質 28S ribosomal protein S15, mitochondrial


分子量: 27411.428 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1VVY1
#68: タンパク質 28S ribosomal protein S16, mitochondrial


分子量: 15182.668 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A480JTD7
#70: タンパク質 28S ribosomal protein S18c, mitochondrial isoform 1 / Mitoribosomal protein bs18m / mrps18c


分子量: 16211.086 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A0M3KL54
#71: タンパク質 28S ribosomal protein S21, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S21


分子量: 10682.506 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A286ZNB3
#76: タンパク質 28S ribosomal protein S26, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S26


分子量: 23637.900 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1S8A5
#78: タンパク質 28S ribosomal protein S28, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein S28 / Mitoribosomal protein ms28 / mrps28


分子量: 21014.912 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A0M3KL56
#80: タンパク質 28S ribosomal protein S31, mitochondrial


分子量: 44091.996 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: A0A4X1SQW0
#83: タンパク質 28S ribosomal protein S35, mitochondrial isoform 1


分子量: 37104.809 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: F1SG95
#87: タンパク質 28S ribosomal protein S18b, mitochondrial / MRP-S18-b / Mrps18-b / S18mt-b / 28S ribosomal protein S18-2 / mitochondrial / MRP-S18-2


分子量: 29220.465 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: Q767K8

-
タンパク質・ペプチド , 1種, 1分子 AZ

#72: タンパク質・ペプチド unknown


分子量: 1549.902 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 詳細: unknown polypeptide modeled as poly-alanine / 由来: (天然) Sus scrofa (ブタ)

-
非ポリマー , 6種, 341分子

#89: 化合物...
ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン


分子量: 24.305 Da / 分子数: 327 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#90: 化合物
ChemComp-ZN / ZINC ION


分子量: 65.409 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn
#91: 化合物 ChemComp-SPM / SPERMINE / スペルミン


分子量: 202.340 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C10H26N4
#92: 化合物 ChemComp-5GP / GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE / GMP


分子量: 363.221 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C10H14N5O8P
#93: 化合物 ChemComp-GTP / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP


分子量: 523.180 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C10H16N5O14P3 / コメント: GTP, エネルギー貯蔵分子*YM
#94: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかN
Has protein modificationY

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実験情報

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実験

実験手法: 電子顕微鏡法
EM実験試料の集合状態: PARTICLE / ３次元再構成法: 単粒子再構成法

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試料調製

構成要素
ID名称タイプEntity IDParent-ID由来
155S mammalian mitochondrial ribosome with mtRRF (pre) and tRNA(P/E)RIBOSOME#1-#880MULTIPLE SOURCES
255S mammalian mitochondrial ribosomeRIBOSOME#1-#12, #14-#881NATURAL
3Ribosome-recycling factor, mitochondrialRIBOSOME#131RECOMBINANT
由来(天然)
IDEntity assembly-ID生物種Ncbi tax-ID
12Sus scrofa (ブタ)9823
23Homo sapiens (ヒト)9606
由来(組換発現)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
緩衝液pH: 7.6
試料包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES
急速凍結凍結剤: ETHANE-PROPANE

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電子顕微鏡撮影

実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company
顕微鏡モデル: FEI TITAN KRIOS
電子銃電子線源: FIELD EMISSION GUN / 加速電圧: 300 kV / 照射モード: FLOOD BEAM
電子レンズモード: BRIGHT FIELD
撮影電子線照射量: 40 e/Å2 / 検出モード: INTEGRATING
フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON III (4k x 4k)

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解析

CTF補正タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION
3次元再構成解像度: 4.6 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 15545 / 対称性のタイプ: POINT

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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