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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7n9w | ||||||
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タイトル | CLC-ec1 pH 4.5 100mM Cl Twist1 | ||||||
![]() | H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / CLC / chloride proton antiporter / dimer | ||||||
機能・相同性 | Chloride channel, ClcA / Chloride channel, voltage gated / Chloride channel, core / Voltage gated chloride channel / voltage-gated chloride channel activity / antiporter activity / plasma membrane / H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.16 Å | ||||||
![]() | Fortea, E. / Boudker, O. / Accardi, A. | ||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural basis of common gate activation in CLC transporters 著者: Fortea, E. / Lee, S. / Argyros, Y. / Chadda, R. / Ciftci, D. / Falzone, M. / Huysmans, G. / Robertson, J.L. / Boudker, O. / Accardi, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 151.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 119.9 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 705.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 710.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 28.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 42.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 24263MC ![]() 7n8pC ![]() 7rnxC ![]() 7ro0C ![]() 7rp5C ![]() 7rp6C ![]() 7rq7C ![]() 7rsbC M: このデータのモデリングに利用したマップデータ C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ | 類似検索 - 機能・相同性 ![]() |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 50390.402 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Structure of ecCLC at pH 4.5 in 100mM Cl Twist 1 / タイプ: COMPLEX / Entity ID: all / 由来: RECOMBINANT |
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分子量 | 値: 100 kDa/nm / 実験値: YES |
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
由来(組換発現) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 4.5 |
試料 | 濃度: 1.7 mg/ml / 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
試料支持 | グリッドのタイプ: UltrAuFoil R1.2/1.3 |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE / 湿度: 100 % / 凍結前の試料温度: 294.15 K |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD / Calibrated defocus min: 1200 nm / 最大 デフォーカス(補正後): 2200 nm |
撮影 | 電子線照射量: 72.61 e/Å2 / 検出モード: COUNTING フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.14_3260: / 分類: 精密化 |
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CTF補正 | タイプ: NONE |
3次元再構成 | 解像度: 4.16 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 66022 / 対称性のタイプ: POINT |