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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7lma | ||||||||||||
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タイトル | Tetrahymena telomerase T3D2 structure at 3.3 Angstrom | ||||||||||||
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![]() | REPLICATION/RNA/DNA / telomerase / polymerase / reverse transcriptase / ribonucleoprotein / REPLICATION / REPLICATION-RNA-DNA complex | ||||||||||||
機能・相同性 | ![]() telomerase catalytic core complex assembly / telomerase RNA stabilization / telomerase catalytic core complex / : / DNA replication factor A complex / single-stranded telomeric DNA binding / telomerase holoenzyme complex / telomerase RNA binding / telomeric DNA binding / telomere maintenance via telomerase ...telomerase catalytic core complex assembly / telomerase RNA stabilization / telomerase catalytic core complex / : / DNA replication factor A complex / single-stranded telomeric DNA binding / telomerase holoenzyme complex / telomerase RNA binding / telomeric DNA binding / telomere maintenance via telomerase / RNA-directed DNA polymerase / DNA recombination / DNA replication / chromosome, telomeric region / DNA repair / DNA binding / zinc ion binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.3 Å | ||||||||||||
![]() | He, Y. / Wang, Y. / Liu, B. / Helmling, C. / Susac, L. / Cheng, R. / Zhou, Z.H. / Feigon, J. | ||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structures of telomerase at several steps of telomere repeat synthesis. 著者: Yao He / Yaqiang Wang / Baocheng Liu / Christina Helmling / Lukas Sušac / Ryan Cheng / Z Hong Zhou / Juli Feigon / ![]() 要旨: Telomerase is unique among the reverse transcriptases in containing a noncoding RNA (known as telomerase RNA (TER)) that includes a short template that is used for the processive synthesis of G-rich ...Telomerase is unique among the reverse transcriptases in containing a noncoding RNA (known as telomerase RNA (TER)) that includes a short template that is used for the processive synthesis of G-rich telomeric DNA repeats at the 3' ends of most eukaryotic chromosomes. Telomerase maintains genomic integrity, and its activity or dysregulation are critical determinants of human longevity, stem cell renewal and cancer progression. Previous cryo-electron microscopy structures have established the general architecture, protein components and stoichiometries of Tetrahymena and human telomerase, but our understandings of the details of DNA-protein and RNA-protein interactions and of the mechanisms and recruitment involved remain limited. Here we report cryo-electron microscopy structures of active Tetrahymena telomerase with telomeric DNA at different steps of nucleotide addition. Interactions between telomerase reverse transcriptase (TERT), TER and DNA reveal the structural basis of the determination of the 5' and 3' template boundaries, handling of the template-DNA duplex and separation of the product strand during nucleotide addition. The structure and binding interface between TERT and telomerase protein p50 (a homologue of human TPP1) define conserved interactions that are required for telomerase activation and recruitment to telomeres. Telomerase La-related protein p65 remodels several regions of TER, bridging the 5' and 3' ends and the conserved pseudoknot to facilitate assembly of the TERT-TER catalytic core. | ||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 452.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 339.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 929.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 953.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 52.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 82.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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要素
-タンパク質 , 3種, 3分子 HAG
#1: タンパク質 | 分子量: 64207.363 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#2: タンパク質 | 分子量: 133486.938 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
#6: タンパク質 | 分子量: 50049.688 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
-Telomerase holoenzyme ... , 3種, 3分子 DEF
#3: タンパク質 | 分子量: 82040.289 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#4: タンパク質 | 分子量: 30993.035 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
#5: タンパク質 | 分子量: 14007.626 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
-RNA鎖 / DNA鎖 / 非ポリマー , 3種, 3分子 BC![](data/chem/img/ZN.gif)
![](data/chem/img/ZN.gif)
#7: RNA鎖 | 分子量: 50746.984 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() |
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#8: DNA鎖 | 分子量: 9581.087 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() ![]() |
#9: 化合物 | ChemComp-ZN / |
-詳細
研究の焦点であるリガンドがあるか | N |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 電子顕微鏡法 |
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EM実験 | 試料の集合状態: PARTICLE / 3次元再構成法: 単粒子再構成法 |
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試料調製
構成要素 | 名称: Tetrahymena telomerase T3D2 structure at 3.3 Angstrom タイプ: COMPLEX / Entity ID: #1-#8 / 由来: NATURAL |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
緩衝液 | pH: 8 |
試料 | 包埋: NO / シャドウイング: NO / 染色: NO / 凍結: YES |
急速凍結 | 凍結剤: ETHANE |
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電子顕微鏡撮影
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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顕微鏡 | モデル: FEI TITAN KRIOS |
電子銃 | 電子線源: ![]() |
電子レンズ | モード: BRIGHT FIELD |
撮影 | 電子線照射量: 48 e/Å2 / 検出モード: SUPER-RESOLUTION フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) |
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解析
ソフトウェア | 名称: PHENIX / バージョン: 1.17.1_3660: / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||
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CTF補正 | タイプ: PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION | ||||||||||||||||||||||||
3次元再構成 | 解像度: 3.3 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 粒子像の数: 193117 / 対称性のタイプ: POINT | ||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
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