登録情報 | データベース: PDB / ID: 7dod |
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タイトル | Capsid structure of human sapovirus |
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要素 | Calicivirin |
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キーワード | VIRUS / CAPSID / SAPOVIRUS / CALICIVIRUS / CRYOEM / VIRUS LIKE PARTICLE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
RNA-protein covalent cross-linking / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / host cell cytoplasm / RNA helicase activity / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / RNA binding / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Caliciviridae (CV) 3C-like protein profile. / Peptidase C24, Calicivirus polyprotein Orf1 / 2C endopeptidase (C24) cysteine protease family / Helicase/polymerase/peptidase polyprotein, Calicivirus-type / Calicivirus coat protein / Calicivirus coat protein / Helicase, superfamily 3, single-stranded RNA virus / Superfamily 3 helicase of positive ssRNA viruses domain profile. / Helicase, superfamily 3, single-stranded DNA/RNA virus / RNA helicase ...Caliciviridae (CV) 3C-like protein profile. / Peptidase C24, Calicivirus polyprotein Orf1 / 2C endopeptidase (C24) cysteine protease family / Helicase/polymerase/peptidase polyprotein, Calicivirus-type / Calicivirus coat protein / Calicivirus coat protein / Helicase, superfamily 3, single-stranded RNA virus / Superfamily 3 helicase of positive ssRNA viruses domain profile. / Helicase, superfamily 3, single-stranded DNA/RNA virus / RNA helicase / Picornavirus/Calicivirus coat protein / Viral coat protein subunit / RNA-directed RNA polymerase, C-terminal domain / Viral RNA-dependent RNA polymerase / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / RNA-directed RNA polymerase, catalytic domain / RdRp of positive ssRNA viruses catalytic domain profile. / Peptidase S1, PA clan / DNA/RNA polymerase superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Sapovirus Hu/GI.6/Nichinan/FP05284/2005/JPN (ウイルス) |
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手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.9 Å |
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データ登録者 | Miyazaki, N. / Murakami, K. / Oka, T. / Iwasaki, K. / Katayama, K. / Murata, K. |
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資金援助 | 日本, 2件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Japan Agency for Medical Research and Development (AMED) | 20fk0108121h0402 | 日本 | Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (Japan) | JP16H00786 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Atomic structure of human sapovirus capsid by single particle cryo-electron microscopy 著者: Miyazaki, N. / Murakami, K. / Oka, T. / Iwasaki, K. / Katayama, K. / Murata, K. |
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履歴 | 登録 | 2020年12月14日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2021年12月15日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2024年6月5日 | Group: Data collection / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_struct_oper_list Item: _pdbx_struct_oper_list.name / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _pdbx_struct_oper_list.type |
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