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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7b9s | ||||||
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タイトル | Structure of the mycobacterial ESX-5 Type VII Secretion System hexameric pore complex | ||||||
要素 |
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キーワード | TRANSPORT PROTEIN / Mycobacterial ESX-5 Type VII Secretion System | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 hydrolase activity / ATP hydrolysis activity / DNA binding / ATP binding / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Mycobacterium xenopi RIVM700367 (バクテリア) | ||||||
手法 | 電子顕微鏡法 / 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.4 Å | ||||||
データ登録者 | Chojnowski, G. / Ritter, C. / Beckham, K.S.H. / Mullapudi, E. / Rettel, M. / Savitski, M.M. / Mortensen, S.A. / Ziemianowicz, D. / Kosinski, J. / Wilmanns, M. | ||||||
引用 | ジャーナル: Sci Adv / 年: 2021 タイトル: Structure of the mycobacterial ESX-5 type VII secretion system pore complex. 著者: Katherine S H Beckham / Christina Ritter / Grzegorz Chojnowski / Daniel S Ziemianowicz / Edukondalu Mullapudi / Mandy Rettel / Mikhail M Savitski / Simon A Mortensen / Jan Kosinski / Matthias Wilmanns / 要旨: The ESX-5 type VII secretion system is a membrane-spanning protein complex key to the virulence of mycobacterial pathogens. However, the overall architecture of the fully assembled translocation ...The ESX-5 type VII secretion system is a membrane-spanning protein complex key to the virulence of mycobacterial pathogens. However, the overall architecture of the fully assembled translocation machinery and the composition of the central secretion pore have remained unknown. Here, we present the high-resolution structure of the 2.1-megadalton ESX-5 core complex. Our structure captured a dynamic, secretion-competent conformation of the pore within a well-defined transmembrane section, sandwiched between two flexible protein layers at the cytosolic entrance and the periplasmic exit. We propose that this flexibility endows the ESX-5 machinery with large conformational plasticity required to accommodate targeted protein secretion. Compared to known secretion systems, a highly dynamic state of the pore may represent a fundamental principle of bacterial secretion machineries. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
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構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7b9s.cif.gz | 1.7 MB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb7b9s.ent.gz | 1.3 MB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7b9s.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 7b9s_validation.pdf.gz | 1.1 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 7b9s_full_validation.pdf.gz | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | 7b9s_validation.xml.gz | 208 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 7b9s_validation.cif.gz | 331.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b9/7b9s ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/b9/7b9s | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
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