ChemComp-O34: yersiniabactin

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: O34
• 名称: 名称: yersiniabactin; 別称: (4S)-2-[(1S)-1-hydroxy-1-{(2R,4R)-2-[(4R)-2-(2-hydroxyphenyl)-4,5-dihydro-1,3-thiazol-4-yl]-1,3-thiazolidin-4-yl}-2-met; 日化辞名称: イエルシニアバクチン

Chemical information

組成

組成式: C₂₁H₂₇N₃O₄S₃ / 原子数: 58 / 化学式量: 481.652 / 形式電荷: 0

その他

6p6j

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: O34 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6P6J

履歴

作成	2019年6月5日
公開	2020年3月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / NMRShiftDB / 日化辞 / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: N1=C(SCC1C2NC(CS2)C(O)C(C3=NC(CS3)(C(O)=O)C)(C)C)c4c(O)cccc4
• CACTVS 3.385: CC(C)([CH](O)[CH]1CS[CH](N1)[CH]2CSC(=N2)c3ccccc3O)C4=N[C](C)(CS4)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CC1(CSC(=N1)C(C)(C)C(C2CSC(N2)C3CSC(=N3)c4ccccc4O)O)C(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC(C)([C@H](O)[C@@H]1CS[C@@H](N1)[C@H]2CSC(=N2)c3ccccc3O)C4=N[C@](C)(CS4)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C[C@@]1(CSC(=N1)C(C)(C)[C@@H]([C@@H]2CS[C@@H](N2)[C@H]3CSC(=N3)c4ccccc4O)O)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C21H27N3O4S3/c1-20(2,18-24-21(3,10-31-18)19(27)28)15(26)12-8-30-17(22-12)13-9-29-16(23-13)11-6-4-5-7-14(11)25/h4-7,12-13,15,17,22,25-26H,8-10H2,1-3H3,(H,27,28)/t12-,13+,15+,17+,21+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: JHYVWAMMAMCUIR-NIJJZIDKSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (4S)-2-[(1S)-1-hydroxy-1-{(2R,4R)-2-[(4R)-2-(2-hydroxyphenyl)-4,5-dihydro-1,3-thiazol-4-yl]-1,3-thiazolidin-4-yl}-2-methylpropan-2-yl]-4-methyl-4,5-dihydro-1,3-thiazole-4-carboxylic acid
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: (4~{S})-2-[(1~{S})-1-[(2~{R},4~{R})-2-[(4~{R})-2-(2-hydroxyphenyl)-4,5-dihydro-1,3-thiazol-4-yl]-1,3-thiazolidin-4-yl]-2-methyl-1-oxidanyl-propan-2-yl]-4-methyl-5~{H}-1,3-thiazole-4-carboxylic acid

PDBエントリ

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PDB-6p6j:
Structure of YbtPQ importer with substrate Ybt-Fe bound