ChemComp-NZV: ceftriaxone, bound form

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: NZV
• 名称: 名称: ceftriaxone, bound form

Chemical information

組成

組成式: C₁₈H₂₀N₈O₈S₃ / 原子数: 57 / 化学式量: 572.595 / 形式電荷: 0

その他

6p54

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: NZV / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6P54

履歴

作成	2019年5月30日
Other modification	2019年5月30日
公開	2019年8月7日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(/C(c1csc(N)n1)=N\OC)NC(C(O)=O)C2SCC(=C(N2)C(O)=O)CSC=3N(NC(C(N=3)=O)=O)C
• CACTVS 3.385: CON=C(C(=O)N[CH]([CH]1NC(=C(CS1)CSC2=NC(=O)C(=O)NN2C)C(O)=O)C(O)=O)c3csc(N)n3
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CN1C(=NC(=O)C(=O)N1)SCC2=C(NC(SC2)C(C(=O)O)NC(=O)C(=NOC)c3csc(n3)N)C(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CO\N=C(/C(=O)N[C@@H]([C@@H]1NC(=C(CS1)CSC2=NC(=O)C(=O)NN2C)C(O)=O)C(O)=O)c3csc(N)n3
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CN1C(=NC(=O)C(=O)N1)SCC2=C(N[C@H](SC2)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)/C(=N\OC)/c3csc(n3)N)C(=O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C18H20N8O8S3/c1-26-18(23-12(28)13(29)24-26)37-4-6-3-35-14(22-8(6)15(30)31)10(16(32)33)21-11(27)9(25-34-2)7-5-36-17(19)20-7/h5,10,14,22H,3-4H2,1-2H3,(H2,19,20)(H,21,27)(H,24,29)(H,30,31)(H,32,33)/b25-9-/t10-,14+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: DQDUICUGMZVNPK-KQSJCSLWSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R)-2-[(R)-{[(2Z)-2-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-2-(methoxyimino)acetyl]amino}(carboxy)methyl]-5-{[(2-methyl-5,6-dioxo-1,2,5,6-tetrahydro-1,2,4-triazin-3-yl)sulfanyl]methyl}-3,6-dihydro-2H-1,3-thiazine-4-carboxylic acid
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: (2~{R})-2-[(1~{R})-1-[[(2~{Z})-2-(2-azanyl-1,3-thiazol-4-yl)-2-methoxyimino-ethanoyl]amino]-2-oxidanyl-2-oxidanylidene-ethyl]-5-[[2-methyl-5,6-bis(oxidanylidene)-1~{H}-1,2,4-triazin-3-yl]sulfanylmethyl]-3,6-dihydro-2~{H}-1,3-thiazine-4-carboxylic acid

PDBエントリ

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PDB-6p54:
Crystal structure of transpeptidase domain of PBP2 from Neisseria gonorrhoeae acylated by ceftriaxone