ChemComp-NGC: N-glycolyl-alpha-neuraminic acid

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: NGC
• 名称: 名称: N-glycolyl-alpha-neuraminic acid / 別称: N-glycolylneuraminic acid; sialic acid; / 日化辞名称: N-グリコリル-α-ノイラミン酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₁₉NO₁₀ / 原子数: 41 / 化学式量: 325.269 / 形式電荷: 0

その他

3dwp

タイプ: D-saccharide, alpha linking / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: NGC / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3DWP

履歴

作成	2008年7月25日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2011年6月23日
Modify leaving atom flag	2011年6月23日
Other modification	2019年8月12日
Other modification	2019年12月19日
Other modification	2020年7月3日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / Metabolights / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(O)C1(O)OC(C(NC(=O)CO)C(O)C1)C(O)C(O)CO
• CACTVS 3.370: OC[CH](O)[CH](O)[CH]1O[C](O)(C[CH](O)[CH]1NC(=O)CO)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: C1C(C(C(OC1(C(=O)O)O)C(C(CO)O)O)NC(=O)CO)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@](O)(C[C@H](O)[C@H]1NC(=O)CO)C(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: C1[C@@H]([C@H]([C@@H](O[C@]1(C(=O)O)O)[C@@H]([C@@H](CO)O)O)NC(=O)CO)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H19NO10/c13-2-5(16)8(18)9-7(12-6(17)3-14)4(15)1-11(21,22-9)10(19)20/h4-5,7-9,13-16,18,21H,1-3H2,(H,12,17)(H,19,20)/t4-,5+,7+,8+,9+,11+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FDJKUWYYUZCUJX-VTERZIIISA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 3,5-dideoxy-5-[(hydroxyacetyl)amino]-D-glycero-alpha-D-galacto-non-2-ulopyranosonic acid
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: (2R,4S,5R,6R)-2,4-bis(oxidanyl)-5-(2-oxidanylethanoylamino)-6-[(1R,2R)-1,2,3-tris(oxidanyl)propyl]oxane-2-carboxylic

CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL

• GMML 1.0: DNeup5Gca

一般名

• GMML 1.0: N-glycolyl-a-D-neuraminic acid

IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL

• PDB-CARE 1.0: a-D-Neup5Gc

SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL

• GMML 1.0: Neu5Gc

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-3dwp:
Crystal structure of the B-subunit of the AB5 toxin from E. Coli with Neu5Gc

PDB-7ee5:
Crystal structure of Neu5Gc bound PltC

PDB-8u5o:
The structure of the catalytic domain of NanI sialdase in complex with Neu5Gc