ChemComp-N6T: 2'-deoxy-5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: N6T
• 名称: 名称: 2'-deoxy-5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]methyl}phosphoryl]-3,4-dihydrothymidine

Chemical information

組成

組成式: C₁₁H₂₀N₃O₁₂P₃ / 原子数: 49 / 化学式量: 479.211 / 形式電荷: 0

その他

4rt2

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: N6T / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4RT2

履歴

作成	2014年11月13日
公開	2015年7月1日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=P(O)(O)NP(=O)(O)CP(=O)(O)OCC2OC(N1C(=O)NC(=O)C(=C1)C)CC2O
• CACTVS 3.385: CC1=CN([CH]2C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)C[P](O)(=O)N[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2CC(C(O2)COP(=O)(CP(=O)(NP(=O)(O)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CC1=CN([C@H]2C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)C[P](O)(=O)N[P](O)(O)=O)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@H]2C[C@@H]([C@H](O2)COP(=O)(CP(=O)(NP(=O)(O)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C11H20N3O12P3/c1-6-3-14(11(17)12-10(6)16)9-2-7(15)8(26-9)4-25-28(20,21)5-27(18,19)13-29(22,23)24/h3,7-9,15H,2,4-5H2,1H3,(H,20,21)(H,12,16,17)(H4,13,18,19,22,23,24)/t7-,8+,9+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FTYKINXQGSFHAF-DJLDLDEBSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-deoxy-5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]methyl}phosphoryl]-3,4-dihydrothymidine
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [[[[(2R,3S,5R)-5-[5-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]methyl-oxidanyl-phosphoryl]amino]phosphonic acid

PDBエントリ

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PDB-4rt2:
Ternary complex crystal structure of DNA polymerase Beta with (alpha,beta)-CH2-(beta,gamma)-NH-dTTP