ChemComp-MBE: 4-nitrophenyl beta-D-mannopyranoside

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: MBE
• 名称: 名称: 4-nitrophenyl beta-D-mannopyranoside; 別称: 4-Nitrophenyl-beta-D-mannopyranoside; 4-nitrophenyl beta-D-mannoside; 4-nitrophenyl D-mannoside; 4-nitrophenyl

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₁₅NO₈ / 原子数: 36 / 化学式量: 301.249 / 形式電荷: 0

その他

5ggk

BMA

タイプ: D-saccharide / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: MBE / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5GGK / 親要素: BMA

履歴

作成	2016年7月7日
公開	2016年8月10日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: OC[CH]1O[CH](Oc2ccc(cc2)[N+]([O-])=O)[CH](O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.5: c1cc(ccc1[N+](=O)[O-])OC2C(C(C(C(O2)CO)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: OC[C@H]1O[C@@H](Oc2ccc(cc2)[N+]([O-])=O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.5: c1cc(ccc1[N+](=O)[O-])O[C@H]2[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O2)CO)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H15NO8/c14-5-8-9(15)10(16)11(17)12(21-8)20-7-3-1-6(2-4-7)13(18)19/h1-4,8-12,14-17H,5H2/t8-,9-,10+,11+,12-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: IFBHRQDFSNCLOZ-LDMBFOFVSA-N

PDBエントリ

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PDB-5ggk:
Crystal structure of N-terminal domain of human protein O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase in complex with Man-beta-pNP

PDB-5xfc:
Serial femtosecond X-ray structure of a stem domain of human O-mannose beta-1,2-N-acetylglucosaminyltransferase solved by Se-SAD using XFEL (refined against 13,000 patterns)