ChemComp-LR7: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: LR7
• 名称: 名称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-3-(hex-5-ynoylamino)-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl] hydrogen phosphate

Chemical information

組成

組成式: C₂₁H₃₁N₃O₁₇P₂ / 原子数: 74 / 化学式量: 659.428 / 形式電荷: 0

その他

6nqt

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: LR7 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6NQT

履歴

作成	2019年3月12日
公開	2020年1月29日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1C=CN(C(N1)=O)C2C(C(C(O2)COP(O)(OP(=O)(O)OC3OC(CO)C(C(O)C3NC(=O)CCCC#C)O)=O)O)O
• CACTVS 3.385: OC[CH]1O[CH](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O)[CH](NC(=O)CCCC#C)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C#CCCCC(=O)NC1C(C(C(OC1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: OC[C@H]1O[C@H](O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O)[C@H](NC(=O)CCCC#C)[C@@H](O)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: C#CCCCC(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@H](O[C@@H]1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C21H31N3O17P2/c1-2-3-4-5-12(26)22-14-17(30)15(28)10(8-25)39-20(14)40-43(35,36)41-42(33,34)37-9-11-16(29)18(31)19(38-11)24-7-6-13(27)23-21(24)32/h1,6-7,10-11,14-20,25,28-31H,3-5,8-9H2,(H,22,26)(H,33,34)(H,35,36)(H,23,27,32)/t10-,11-,14-,15+,16-,17-,18-,19-,20-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: SPUYDPWWABYYLH-SSBRDYMUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: [(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methyl (2R,3R,4R,5R,6R)-3-(hex-5-ynoylamino)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-2-yl dihydrogen diphosphate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R},6~{R})-3-(hex-5-ynoylamino)-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl] hydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-6nqt:
GalNac-T2 soaked with UDP-sugar