ChemComp-LGN: N-[(2S,3R,4E)-1-{[alpha-D-galactopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactop...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: LGN
• 名称: 名称: N-[(2S,3R,4E)-1-{[alpha-D-galactopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-beta-D-glucopyranosyl]oxy}-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl]hexacosanamide; 別称: Isoglobotrihexosylceramide; 日化辞名称: 1-O-(3′-O-α-D-ガラクトピラノシル-β-ラクトシル)-N-ヘキサコサノイルスフィンゴシン

Chemical information

組成

組成式: C₆₂H₁₁₇NO₁₈ / 原子数: 198 / 化学式量: 1164.588 / 形式電荷: 0

その他

3rzc

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: LGN / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3RZC

履歴

作成	2011年5月13日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / ChEBI / LipidMaps / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SwissLipids / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C(NC(COC3OC(C(OC2OC(CO)C(O)C(OC1OC(CO)C(O)C(O)C1O)C2O)C(O)C3O)CO)C(O)/C=C/CCCCCCCCCCCCC)CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC
• CACTVS 3.370: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[CH](CO[CH]1O[CH](CO)[CH](O[CH]2O[CH](CO)[CH](O)[CH](O[CH]3O[CH](CO)[CH](O)[CH](O)[CH]3O)[CH]2O)[CH](O)[CH]1O)[CH](O)C=CCCCCCCCCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)NC(COC1C(C(C(C(O1)CO)OC2C(C(C(C(O2)CO)O)OC3C(C(C(C(O3)CO)O)O)O)O)O)O)C(C=CCCCCCCCCCCCCC)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O[C@@H]2O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]3O)[C@H]2O)[C@H](O)[C@H]1O)[C@H](O)\C=C\CCCCCCCCCCCCC
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CO[C@H]1[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O1)CO)O[C@H]2[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O2)CO)O)O[C@@H]3[C@@H]([C@H]([C@H]([C@H](O3)CO)O)O)O)O)O)O)[C@@H](/C=C/CCCCCCCCCCCCC)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C62H117NO18/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-18-19-20-21-22-23-24-25-26-28-30-32-34-36-38-40-50(68)63-45(46(67)39-37-35-33-31-29-27-16-14-12-10-8-6-4-2)44-76-60-56(74)54(72)58(49(43-66)79-60)80-62-57(75)59(52(70)48(42-65)78-62)81-61-55(73)53(71)51(69)47(41-64)77-61/h37,39,45-49,51-62,64-67,69-75H,3-36,38,40-44H2,1-2H3,(H,63,68)/b39-37+/t45-,46+,47+,48+,49+,51-,52-,53-,54+,55+,56+,57+,58+,59-,60+,61+,62-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: JMENXJYBCQFIRK-KRJDXUSZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: N-[(2S,3R,4E)-1-{[alpha-D-galactopyranosyl-(1->3)-beta-D-galactopyranosyl-(1->4)-beta-D-glucopyranosyl]oxy}-3-hydroxyoctadec-4-en-2-yl]hexacosanamide
• OpenEye OEToolkits 1.7.2: N-[(E,2S,3R)-1-[(2R,3R,4R,5S,6R)-6-(hydroxymethyl)-5-[(2S,3R,4S,5S,6R)-6-(hydroxymethyl)-4-[(2R,3R,4S,5R,6R)-6-(hydroxymethyl)-3,4,5-tris(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3,4-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]oxy-3-oxidanyl-octadec-4-en-2-yl]hexacosanamide

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-3rzc:
Structure of the self-antigen iGb3 bound to mouse CD1d and in complex with the iNKT TCR

PDB-3scm:
Crystal structure of autoreactive-Valpha14-Vbeta6 NKT TCR in complex with CD1d-isoglobotrihexosylceramide