ChemComp-LAE: 3-OXO-OCTANOIC ACID (2-OXO-TETRAHYDRO-FURAN-3-YL)-AMIDE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: LAE
• 名称: 名称: 3-oxo-octanoic acid (2-oxo-tetrahydro-furan-3-yl)-amide; 別称: N-(3-OXO-OCTANAL-1-YL)-HOMOSERINE LACTONE; 日化辞名称: N-(3-オキソオクタノイル)-L-ホモセリンラクトン

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₁₉NO₄ / 原子数: 36 / 化学式量: 241.284 / 形式電荷: 0

その他

1l3l

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: LAE / モデル座標のPDB-ID: 1L3L

履歴

作成	2002年3月7日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1OCCC1NC(=O)CC(=O)CCCCC
• CACTVS 3.341: CCCCCC(=O)CC(=O)N[CH]1CCOC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CCCCCC(=O)CC(=O)NC1CCOC1=O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CCCCCC(=O)CC(=O)N[C@H]1CCOC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CCCCCC(=O)CC(=O)N[C@H]1CCOC1=O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H19NO4/c1-2-3-4-5-9(14)8-11(15)13-10-6-7-17-12(10)16/h10H,2-8H2,1H3,(H,13,15)/t10-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: FXCMGCFNLNFLSH-JTQLQIEISA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 3-oxo-N-[(3S)-2-oxotetrahydrofuran-3-yl]octanamide
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: 3-oxo-N-[(3S)-2-oxooxolan-3-yl]octanamide

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-1h0m:
Three-dimensional structure of the quorum sensing protein TraR bound to its autoinducer and to its target DNA

PDB-1l3l:
Crystal structure of a bacterial quorum-sensing transcription factor complexed with pheromone and DNA

PDB-2q0o:
Crystal structure of an anti-activation complex in bacterial quorum sensing

PDB-4y17:
SdiA in complex with 3-oxo-C8-homoserine lactone

PDB-6jst:
Structure of Geobacillus kaustophilus lactonase, Y99P/D266N double mutant with bound 3-oxo-C8-HSL