ChemComp-IE5: Biliverdine IX Alpha

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: IE5
• 名称: 名称: Biliverdine ix Alpha; 別称: 3-[5-[(3-ethenyl-4-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-ylidene)methyl]-2-[(~{Z})-[5-[(~{Z})-(4-ethenyl-3-methyl-5-oxidanylidene-pyrrol-2-ylidene)methyl]-3-(3-hydroxy-3-oxopropyl)-4-methyl-pyrrol-2-ylidene]methyl]-4-methyl-1~{H}-pyrrol-3-yl]propanoic acid; 日化辞名称: ビリベルジン

Chemical information

組成

組成式: C₃₃H₃₄N₄O₆ / 原子数: 77 / 化学式量: 582.646 / 形式電荷: 0

その他

7y48

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: IE5 / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7Y48

履歴

作成	2022年6月27日
Other modification	2023年5月15日
公開	2023年5月24日
Modify name	2023年9月20日

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詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: Cc1c([nH]c(C=C2N=C(C=C3NC(=O)C(=C3C)C=C)C(=C2CCC(O)=O)C)c1CCC(O)=O)C=C4NC(=O)C(=C4C=C)C
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: Cc1c(c([nH]c1C=C2C(=C(C(=O)N2)C)C=C)C=C3C(=C(C(=N3)C=C4C(=C(C(=O)N4)C=C)C)C)CCC(=O)O)CCC(=O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Cc1c([nH]c(\C=C2/N=C(\C=C3/NC(=O)C(=C3C)C=C)C(=C2CCC(O)=O)C)c1CCC(O)=O)/C=C/4NC(=O)C(=C/4C=C)C
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: Cc1c(c([nH]c1C=C2C(=C(C(=O)N2)C)C=C)/C=C\3/C(=C(C(=N3)/C=C\4/C(=C(C(=O)N4)C=C)C)C)CCC(=O)O)CCC(=O)O

InChI

• InChI 1.06: InChI=1S/C33H34N4O6/c1-7-20-19(6)32(42)37-27(20)14-25-18(5)23(10-12-31(40)41)29(35-25)15-28-22(9-11-30(38)39)17(4)24(34-28)13-26-16(3)21(8-2)33(43)36-26/h7-8,13-15,35H,1-2,9-12H2,3-6H3,(H,36,43)(H,37,42)(H,38,39)(H,40,41)/b26-13-,27-14-,28-15-

InChIKey

• InChI 1.06: QBUVFDKTZJNUPP-BBROENKCSA-N

PDBエントリ

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PDB-7y48:
Cryo-EM Structure of biliverdin-bound mitochondrial ABC transporter ABCB10 from Biortus