ChemComp-IDC: (5R,6R,7R,8S)-7,8-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-5,6,7,8-tetrahydroi...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: IDC
• 名称: 名称: (5R,6R,7R,8S)-7,8-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-6-yl beta-D-glucopyranoside; 別称: 5-HYDROXYMETHYL-5,6,7,8-TETRAHYDRO-IMIDAZO[1,2-A]PYRIDIN-6YL-7,8-DIOL-GLUCOPYRANOSIDE; IMIDAZOLE-DERIVED CELLOBIOSE;; 日化辞名称: (3S)-5α-(β-D-グルコピラノシルオキシ)-3α,4β-ジヒドロキシ-6β-(ヒドロキシメチル)-N,1-ビニ(以下略)

Chemical information

組成

組成式: C₁₄H₂₂N₂O₉ / 原子数: 47 / 化学式量: 362.332 / 形式電荷: 0

その他

8a3h

BGC

タイプ: D-saccharide / PDB分類: ATOMS / 3文字コード: IDC / モデル座標のPDB-ID: 8A3H / 親要素: BGC

履歴

作成	1999年8月3日
記述子を修正	2011年6月4日
Other modification	2020年7月3日
Modify parent residue	2020年7月17日
Modify name	2020年7月17日
Modify synonyms	2020年7月17日
Modify internal type	2020年7月17日
Modify linking type	2020年7月17日
Modify atom id	2020年7月17日
Modify component atom id	2020年7月17日
Modify leaving atom flag	2020年7月17日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / DrugBank / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O(C2C(O)C(O)c1nccn1C2CO)C3OC(C(O)C(O)C3O)CO
• CACTVS 3.341: OC[CH]1O[CH](O[CH]2[CH](O)[CH](O)c3nccn3[CH]2CO)[CH](O)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1cn2c(n1)C(C(C(C2CO)OC3C(C(C(C(O3)CO)O)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)c3nccn3[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1cn2c(n1)[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H]2CO)O[C@H]3[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O3)CO)O)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C14H22N2O9/c17-3-5-12(9(21)10(22)13-15-1-2-16(5)13)25-14-11(23)8(20)7(19)6(4-18)24-14/h1-2,5-12,14,17-23H,3-4H2/t5-,6-,7-,8+,9-,10-,11-,12-,14+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: CSXOUJBOYXGFCL-OFKZETBZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (5R,6R,7R,8S)-7,8-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,2-a]pyridin-6-yl beta-D-glucopyranoside
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,3R,4S,5S,6R)-2-[[(5R,6R,7R,8S)-7,8-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)-5,6,7,8-tetrahydroimidazo[2,1-f]pyridin-6-yl]oxy]-6-

PDBエントリ

全4件を表示しています

PDB-1z3w:
Structure of Phanerochaete chrysosporium cellobiohydrolase Cel7D (CBH58) in complex with cellobioimidazole

PDB-2oyl:
Endo-glycoceramidase II from Rhodococcus sp.: cellobiose-like imidazole complex

PDB-8a3h:
Cellobiose-derived imidazole complex of the endoglucanase cel5A from Bacillus agaradhaerens at 0.97 A resolution

PDB-8x0i:
X-Ray crystal structure of glycoside hydrolase family 6 cellobiohydrolase from Phanerochaete chrysosporium PcCel6A C240S/C393S soaked in cellobioimidazole