ChemComp-GOM: GLUTAMOL-AMP

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: GOM
• 名称: 名称: glutamol-amp

Chemical information

組成

組成式: C₁₅H₂₂N₆O₉P / 原子数: 53 / 化学式量: 461.344 / 形式電荷: -1

その他

G

タイプ: RNA LINKING / PDB分類: ATOMN / 1文字コード: G / 3文字コード: GOM / 親要素: G

履歴

作成	2002年11月26日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: [O-]C(=O)CCC([NH3+])COP([O-])(=O)OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3O
• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P]([O-])(=O)OC[CH]([NH3+])CCC([O-])=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)([O-])OCC(CCC(=O)[O-])[NH3+])O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P]([O-])(=O)OC[C@@H]([NH3+])CCC([O-])=O)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO[P@](=O)([O-])OC[C@H](CCC(=O)[O-])[NH3+])O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C15H23N6O9P/c16-7(1-2-9(22)23)3-28-31(26,27)29-4-8-11(24)12(25)15(30-8)21-6-20-10-13(17)18-5-19-14(10)21/h5-8,11-12,15,24-25H,1-4,16H2,(H,22,23)(H,26,27)(H2,17,18,19)/p-1/t7-,8+,11+,12+,15+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: JDELUWYDJMPPMI-SBZSCLMQSA-M

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 5'-O-({[(2S)-2-ammonio-4-carboxylatobutyl]oxy}phosphinato)adenosine
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (4S)-5-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-oxido-phosphoryl]oxy-4-azaniumyl-pentanoate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-1n78:
Crystal structure of Thermus thermophilus glutamyl-tRNA synthetase complexed with tRNA(Glu) and glutamol-AMP.