登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-30793 |
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タイトル | Capsid structure of human sapovirus |
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マップデータ | |
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試料 | - ウイルス:
Sapovirus Hu/GI.6/Nichinan/FP05284/2005/JPN (ウイルス) |
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キーワード | CAPSID / VIRUS / SAPOVIRUS / CALICIVIRUS / CRYOEM / VIRUS LIKE PARTICLE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
RNA-protein covalent cross-linking / ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / host cell cytoplasm / RNA helicase activity / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / RNA binding / ATP binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Caliciviridae (CV) 3C-like protein profile. / Peptidase C24, Calicivirus polyprotein Orf1 / 2C endopeptidase (C24) cysteine protease family / Helicase/polymerase/peptidase polyprotein, Calicivirus-type / Calicivirus coat protein / Calicivirus coat protein / Helicase, superfamily 3, single-stranded RNA virus / Superfamily 3 helicase of positive ssRNA viruses domain profile. / Helicase, superfamily 3, single-stranded DNA/RNA virus / RNA helicase ...Caliciviridae (CV) 3C-like protein profile. / Peptidase C24, Calicivirus polyprotein Orf1 / 2C endopeptidase (C24) cysteine protease family / Helicase/polymerase/peptidase polyprotein, Calicivirus-type / Calicivirus coat protein / Calicivirus coat protein / Helicase, superfamily 3, single-stranded RNA virus / Superfamily 3 helicase of positive ssRNA viruses domain profile. / Helicase, superfamily 3, single-stranded DNA/RNA virus / RNA helicase / Picornavirus/Calicivirus coat protein / Viral coat protein subunit / RNA-directed RNA polymerase, C-terminal domain / Viral RNA-dependent RNA polymerase / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / RNA-directed RNA polymerase, catalytic domain / RdRp of positive ssRNA viruses catalytic domain profile. / Peptidase S1, PA clan / DNA/RNA polymerase superfamily / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Sapovirus Hu/GI.6/Nichinan/FP05284/2005/JPN (ウイルス) |
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手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.9 Å |
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データ登録者 | Miyazaki N / Murakami K |
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資金援助 | 日本, 2件 Organization | Grant number | 国 |
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Japan Agency for Medical Research and Development (AMED) | 20fk0108121h0402 | 日本 | Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology (Japan) | JP16H00786 | 日本 |
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引用 | ジャーナル: To Be Published タイトル: Atomic structure of human sapovirus capsid by single particle cryo-electron microscopy 著者: Miyazaki N / Murakami K / Oka T / Iwasaki K / Katayama K / Murata K |
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履歴 | 登録 | 2020年12月14日 | - |
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ヘッダ(付随情報) 公開 | 2021年12月15日 | - |
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マップ公開 | 2021年12月15日 | - |
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更新 | 2024年6月5日 | - |
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現状 | 2024年6月5日 | 処理サイト: PDBj / 状態: 公開 |
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