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基本情報
登録情報 | ![]() | |||||||||||||||
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タイトル | Structure of the mitochondrial ribosome from Polytomella magna with tRNA bound to the P site | |||||||||||||||
![]() | Consensus refinement | |||||||||||||||
![]() |
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生物種 | ![]() | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.1 Å | |||||||||||||||
![]() | Tobiasson V / Berzina I / Amunts A | |||||||||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structure of a mitochondrial ribosome with fragmented rRNA in complex with membrane-targeting elements. 著者: Victor Tobiasson / Ieva Berzina / Alexey Amunts / ![]() 要旨: Mitoribosomes of green algae display a great structural divergence from their tracheophyte relatives, with fragmentation of both rRNA and proteins as a defining feature. Here, we report a 2.9 Å ...Mitoribosomes of green algae display a great structural divergence from their tracheophyte relatives, with fragmentation of both rRNA and proteins as a defining feature. Here, we report a 2.9 Å resolution structure of the mitoribosome from the alga Polytomella magna harbouring a reduced rRNA split into 13 fragments. We found that the rRNA contains a non-canonical reduced form of the 5S, as well as a permutation of the LSU domain I. The mt-5S rRNA is stabilised by mL40 that is also found in mitoribosomes lacking the 5S, which suggests an evolutionary pathway. Through comparison to other ribosomes with fragmented rRNAs, we observe that the pattern is shared across large evolutionary distances, and between cellular compartments, indicating an evolutionary convergence and supporting the concept of a primordial fragmented ribosome. On the protein level, eleven peripherally associated HEAT-repeat proteins are involved in the binding of 3' rRNA termini, and the structure features a prominent pseudo-trimer of one of them (mL116). Finally, in the exit tunnel, mL128 constricts the tunnel width of the vestibular area, and mL105, a homolog of a membrane targeting component mediates contacts with an inner membrane bound insertase. Together, the structural analysis provides insight into the evolution of the ribosomal machinery in mitochondria. | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 1 GB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 130.2 KB 130.2 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 70.9 KB | ||
マスクデータ | ![]() | 1.3 GB | ![]() | |
その他 | ![]() ![]() ![]() | 709.7 MB 1 GB 1 GB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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-
マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||
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注釈 | Consensus refinement | ||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.846 Å | ||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
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-添付データ
-マスク #1
ファイル | ![]() | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
-追加マップ: Composite map from merged masked refinements
ファイル | emd_15576_additional_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Composite map from merged masked refinements | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map for consensus refinement
ファイル | emd_15576_half_map_1.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map for consensus refinement | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-ハーフマップ: Half map for consensus refinement
ファイル | emd_15576_half_map_2.map | ||||||||||||
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注釈 | Half map for consensus refinement | ||||||||||||
投影像・断面図 |
| ||||||||||||
密度ヒストグラム |
-
試料の構成要素
+全体 : Mitochondrial ribosome from Polytomella magna in complex with P-s...
全体 | 名称: Mitochondrial ribosome from Polytomella magna in complex with P-site tRNA as well as mRNA |
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要素 |
|
+超分子 #1: Mitochondrial ribosome from Polytomella magna in complex with P-s...
超分子 | 名称: Mitochondrial ribosome from Polytomella magna in complex with P-site tRNA as well as mRNA タイプ: complex / ID: 1 / キメラ: Yes / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#121 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
+分子 #1: mtLSU-1
分子 | 名称: mtLSU-1 / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 35.302168 KDa |
配列 | 文字列: UGUGACCGUU AGCGCAUAGU ACAGUAAUGG AAGUGCAUAA ACCAAAUUAA AGGCUUAAAU UAAAAAUAAA AUGGCUGGUG CAAUGGCAC AAAAAAUAAG AAAGUUUAAA |
+分子 #2: mtLSU-2
分子 | 名称: mtLSU-2 / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 26.056578 KDa |
配列 | 文字列: AAUAAAUAAG UUUAAUACCU UUUGCAGCAU GGACCAGCGA UUAAAUGCCG GUAAUUAGCA AAGUUAAACU AACGAAAAAU A |
+分子 #3: mtLSU-3
分子 | 名称: mtLSU-3 / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 66.621523 KDa |
配列 | 文字列: UUACAGGCAU UUAAUUCGAA GCAUAGCGAG CUAACGUUUA GCAGGUUUGC AUAAAUUAAA UAUAUUAAAA AAGCAAGACC GCAAAGGUU UCUGUAGCAA UAGAAUCUUG UGACUUAACG UUAGGGGCGA UAAACCAAUC ACGCUAUGGC AUAGCUAAGU U UCUGCGAA ...文字列: UUACAGGCAU UUAAUUCGAA GCAUAGCGAG CUAACGUUUA GCAGGUUUGC AUAAAUUAAA UAUAUUAAAA AAGCAAGACC GCAAAGGUU UCUGUAGCAA UAGAAUCUUG UGACUUAACG UUAGGGGCGA UAAACCAAUC ACGCUAUGGC AUAGCUAAGU U UCUGCGAA AUAUAUUUAG GUAUAGCUUA AAAAACUUUA UAGAUAAAA |
+分子 #4: mtLSU-4
分子 | 名称: mtLSU-4 / タイプ: rna / ID: 4 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 23.661262 KDa |
配列 | 文字列: UAAGUCAGAC GCAAAGCUAC AAGGUUUCGC GUCAAAAGGA AAAAAGUCCG CCAGCGAGGC UAAGGUACAU AAA |
+分子 #5: mtLSU-5
分子 | 名称: mtLSU-5 / タイプ: rna / ID: 5 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 43.735016 KDa |
配列 | 文字列: UAAUGUGCAC CAAACAACCA GGAGGUGGGC UUGGAAGCAG CCAUCCUUUG AAGAAAGCGU AAUAGCUCUG CUUUUUGUGU AACAUUACA CUACACGCAG AAAAUAAAAG CCGAAGCUCG CUUGUUCAGU UAAAUAU |
+分子 #6: mtLSU-6
分子 | 名称: mtLSU-6 / タイプ: rna / ID: 6 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 35.225027 KDa |
配列 | 文字列: GCAGGUAGCA GAACGUUCUA UAUAAUAGAA UUGCUAAUGC UGGUAUAAGU AACUAUGUAA AAAUACAGCU AAGCUAAAGG UUUUGCGCA ACAGUGAAAC GAUAAAGUAA |
+分子 #7: mtLSU-7
分子 | 名称: mtLSU-7 / タイプ: rna / ID: 7 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 171.975 KDa |
配列 | 文字列: AAUCGUACCG CAAACCAACA CAGGUUAGUU AUUGUAAAGG CUGUAUAAAA CCAGGAUAAA GGAACUCGGC AAAAUAGGUU AUGUUUUCG UACAAAACCA CAACAAAAGU AGUGACUGUU UACCAAAAAC ACAAGACUCU GCUAACACUU AUAGUGGAAG U AUAGUGUC ...文字列: AAUCGUACCG CAAACCAACA CAGGUUAGUU AUUGUAAAGG CUGUAUAAAA CCAGGAUAAA GGAACUCGGC AAAAUAGGUU AUGUUUUCG UACAAAACCA CAACAAAAGU AGUGACUGUU UACCAAAAAC ACAAGACUCU GCUAACACUU AUAGUGGAAG U AUAGUGUC UGAUACCUGC CCAAAGGCAA AGCAAACGGC AGCUGUAACU CUAACGGCUC UAAGGUAGCA AAAUUCCAUG GC AUUUAAA UGAUGUCCCG CAUGAAUGGU AUAACAACUU CUUAACUGUC UCUAUUCUGG AUUAGGCGAA CUUUAAAUGC UUG UGCAGA UGCAGGCUAG CUAACAAGGG ACGAAGAGAC CCUAUGCAGC UUUAGGGCAG GUUAUUAUUC AAUAAACUAC CUUU UUUCU GGGACGGACG CUCUUAUUAA AGAAACAAGA GUGAGCAAUG GUUUUUACUA AUUAUAAAAA AGAAAAGCUU AACUG CAAU ACAAACAAUU AAAGCAGGGG CAUUGUCGGC AAUAAUGCAU UGAAGAAAUA |
+分子 #8: mtLSU-8
分子 | 名称: mtLSU-8 / タイプ: rna / ID: 8 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 112.621266 KDa |
配列 | 文字列: CGUUCUUCAA CCAACGGAAU AAAGCUACGC UAGGGAUAAC AGGCUUAUUC GCUCACAGAG UUUUAUCGAC GAGCGCGGUU GGCACCUCG AUGUUGGAUC ACCGCUUCCU GUAGCUGCAA ACGGUUAUAA GGGUUAGACU GUUCGUCUGA UAAUGCGGUA C GUGAUCUG ...文字列: CGUUCUUCAA CCAACGGAAU AAAGCUACGC UAGGGAUAAC AGGCUUAUUC GCUCACAGAG UUUUAUCGAC GAGCGCGGUU GGCACCUCG AUGUUGGAUC ACCGCUUCCU GUAGCUGCAA ACGGUUAUAA GGGUUAGACU GUUCGUCUGA UAAUGCGGUA C GUGAUCUG AGUUCAAAGC GUCGUAAGAC AGUUUGGUUU CUAUCUUUGU UAGCAUAAGU AUUACGGCGU UGUGUACAGU AC GAAAGGA UUGUUGCACA AUUAACCAAU AGUUUAAAGA GCAACGUUAA UAAACCGGAA AACUUUUAAC UGCACUGUGC AGU UGCAGG CAAAGCAAUG UUCAGCUAAA AAAA |
+分子 #9: mt-5S
分子 | 名称: mt-5S / タイプ: rna / ID: 9 / コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 22.130088 KDa |
配列 | 文字列: UAAUGCGAUA AUACGCAUGA CGGUUCAUUU UUGCCGUGUG UGGUCACGGU AAAACUUAAG AAUCGUCCA |
+分子 #60: mtSSU-1
分子 | 名称: mtSSU-1 / タイプ: rna / ID: 60 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 32.708301 KDa |
配列 | 文字列: CAUAGGGUUU GGUUUUUGCC CAGCCUUUAG CUUAGCGUUA AGCUUAUACA UGCUAGCCUA AAAGACGGCG CACAGGUGCA UAUUUUGUA AGCAUGUAAA AUA |
+分子 #61: mtSSU-2
分子 | 名称: mtSSU-2 / タイプ: rna / ID: 61 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 67.69625 KDa |
配列 | 文字列: AAAGUGUACU UUAUAAAGUC AUUGUAUUGC UUACAAAUAA CUAGGCAGUU GGGUCGGCUG CUAUACUAUA GCGCCCCAAG CCUGAUAAU UAGCUAGGCG UAACAGCGGC AAGCCACAGU AGCACAUAAA AAUUGCUACC GUUAACGCAG CAGUAAGAAA G AUUGGACA ...文字列: AAAGUGUACU UUAUAAAGUC AUUGUAUUGC UUACAAAUAA CUAGGCAGUU GGGUCGGCUG CUAUACUAUA GCGCCCCAAG CCUGAUAAU UAGCUAGGCG UAACAGCGGC AAGCCACAGU AGCACAUAAA AAUUGCUACC GUUAACGCAG CAGUAAGAAA G AUUGGACA AUAGCUUAAG GGCAGAUCCA GGUAAGCGCU AAAAUCUUUG UG |
+分子 #62: mtSSU-3
分子 | 名称: mtSSU-3 / タイプ: rna / ID: 62 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 122.239391 KDa |
配列 | 文字列: GAGCUCCGGC UAAUUGUGUG CCAGCAGCCG CGGGAAUACA CAAGGGGCCA GUUUAAGGUU AAAACAAGGC AACGGUGUUU AAAAACUGG AAAUGCGCCU AAAAUAGCUU AAUGCGUUGG AGUAAGGGUU AAAUCUGUAA AAACCUUGCA GAAAGCCUUA A AGUAAAAG ...文字列: GAGCUCCGGC UAAUUGUGUG CCAGCAGCCG CGGGAAUACA CAAGGGGCCA GUUUAAGGUU AAAACAAGGC AACGGUGUUU AAAAACUGG AAAUGCGCCU AAAAUAGCUU AAUGCGUUGG AGUAAGGGUU AAAUCUGUAA AAACCUUGCA GAAAGCCUUA A AGUAAAAG CAGCUAUUCA UGCCCAUAAA ACAGUCUAUA AACGAGAGCU GCGGUAGCAA AACGGAUUAG AUACCCGUGU AG UCCCAGC CGUAAAUUAU UUAUUAAAUU AAAGCGCCUA GCGAUAUUGC CUAUGGCACU AAACUAGGGA AUCUGACAGC AUU AAACUG ACGCGGUGGA GCAUACUUCU UAAUUUGAUA AUACGCAAAA ACAUUACCAC GAU |
+分子 #63: mtSSU-4
分子 | 名称: mtSSU-4 / タイプ: rna / ID: 63 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 108.517188 KDa |
配列 | 文字列: AAACCACGGU AUUGCAUGGC UGAUAUAUAA UCCAUACAAA GGAUAUAACC AAGUAGCAUG GUCUUAUAUU GUGGGCUGGC GGUGUGCUA CAAGUAACAA AAAGUACAAC CGGAUUAAUU ACUGAAAUCA UAAAUAUAAA GAGGGAAUCG CUAGUAAUCU U UAUUAUAA ...文字列: AAACCACGGU AUUGCAUGGC UGAUAUAUAA UCCAUACAAA GGAUAUAACC AAGUAGCAUG GUCUUAUAUU GUGGGCUGGC GGUGUGCUA CAAGUAACAA AAAGUACAAC CGGAUUAAUU ACUGAAAUCA UAAAUAUAAA GAGGGAAUCG CUAGUAAUCU U UAUUAUAA CAUAAAGGUG AACCAGUUUA GUGUGCACAC ACUGCCCGUC ACAUCCGGGA AAACCACAAA GCCCUAAGUU UG UAUAGUG UUUAAUAAAC CAAUUCAAAC AUAAGCUUAU UGUUAACAAG GAUGAAGUCG UAACAAGGUU UGCGUAGGGG AAC CUGCUC AAGAUUAUGC U |
+分子 #108: P-site tRNA
分子 | 名称: P-site tRNA / タイプ: rna / ID: 108 / コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 23.344812 KDa |
配列 | 文字列: AAAUACAUAG CUUAGCGGCU AAAGCACUGG UUUCAUAAGC CAGCUAUCAA CAGUUCGAGU CUGUUUGUAU UUA |
+分子 #109: mRNA
分子 | 名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 109 / コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 1.264826 KDa |
配列 | 文字列: AAUG |
+分子 #10: uL2m
分子 | 名称: uL2m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 33.873227 KDa |
配列 | 文字列: KYTYKFKQAR AVPGLVYWKP RTPGLRHKIS IDYDFLGVYT GAPHKDLSAA VPKLSGRNNH GRITARHRGG GMKKVLRQVD YSREKVDGI PGVVERVEKD PNRSGFLALV KYQPEGQLPI FKYHLAPAEI KAGDVLLSGD GAPVQAGSTL PLRSIPLGTP I HNLELTPG ...文字列: KYTYKFKQAR AVPGLVYWKP RTPGLRHKIS IDYDFLGVYT GAPHKDLSAA VPKLSGRNNH GRITARHRGG GMKKVLRQVD YSREKVDGI PGVVERVEKD PNRSGFLALV KYQPEGQLPI FKYHLAPAEI KAGDVLLSGD GAPVQAGSTL PLRSIPLGTP I HNLELTPG KGGQLARAAN VSAVIQSKQL ENAIVKLPSG EIRLINLDCR ATVGRVSNHL QRMINYGKAG ERRKLGWRPS VR GIAKNPN DHPHGGRTNG GRPSCTPWGV YCKGQRTRRR NNYTNKFIIT RKGGQPIRKF AEAKKLKAR |
+分子 #11: uL3m
分子 | 名称: uL3m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 34.287707 KDa |
配列 | 文字列: GYRPAKPVYP LPDSIASLVE DKIAELKKFG PTPEPALEPL PLTPDSVRVG CITVKAGMTH EWDEHGVMIP LTVLWIDECQ VVGLKYFEK NGYYAVQLGA GCVKQHTVLP QIAGYYLKHD LPIKREMKEY QVSSPEALLP VGTHITAAHF VVGQQVDVTG Y TTDKGFQG ...文字列: GYRPAKPVYP LPDSIASLVE DKIAELKKFG PTPEPALEPL PLTPDSVRVG CITVKAGMTH EWDEHGVMIP LTVLWIDECQ VVGLKYFEK NGYYAVQLGA GCVKQHTVLP QIAGYYLKHD LPIKREMKEY QVSSPEALLP VGTHITAAHF VVGQQVDVTG Y TTDKGFQG VMKRWGFKGM PASHGVSLSH RKPGATGGRQ DPGKIWKEKK LPGHMGDEKR TQLGLELYKV DPKRNLLYVK GA VPGPRGA SILVRDSNRM DYEERVALNL PYPTFIGSPD ELPVLVRKSD KDPYLMYKKE IDYFPIKWK |
+分子 #12: uL4m
分子 | 名称: uL4m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 33.741516 KDa |
配列 | 文字列: VASYLARICP NTYVPPPFVA TKKGFNGIGG RYDPSSPFPP DTGSSPLTLQ YPFEVEYHKD REIPVCNVSD GSQVSTTTLN GKIFSDKVR LDILHTVVRY LRAKWQQGTH KTKDRSEVSG GGRKPRPQKG SGRSRQGSIR SPIWRGGGCT FPKIPRSHAF K LPRNVVRI ...文字列: VASYLARICP NTYVPPPFVA TKKGFNGIGG RYDPSSPFPP DTGSSPLTLQ YPFEVEYHKD REIPVCNVSD GSQVSTTTLN GKIFSDKVR LDILHTVVRY LRAKWQQGTH KTKDRSEVSG GGRKPRPQKG SGRSRQGSIR SPIWRGGGCT FPKIPRSHAF K LPRNVVRI GIRSALSAKA NEGRLFVVDS FVRGVESYDQ LKAGLAEVTK DAIGESLLLV DSGECGEDYS GVKLRRLLPK DS PRVEVLS YQDLTVYHML KYHKLVVSEP AVRLIEQELT RPLRNPARAA FWQEREARIG AAVEDL |
+分子 #13: uL5m
分子 | 名称: uL5m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 21.894408 KDa |
配列 | 文字列: SSLHLTSRYH HMFYNVLYRE MMLKAPKTKV EQGPHLESIT LTIKTTDTRL DKDIVDKWEL LLFSLALEHI TGEPAAFLPP PNRHVANKS AGVTVTLKGE KMFNFLEKLV YTILPNQTGF EGVPQPKTLV PGPDGVVKRV VDFGVTNLLL YPDFEEHFGV F EPIRSMQV ...文字列: SSLHLTSRYH HMFYNVLYRE MMLKAPKTKV EQGPHLESIT LTIKTTDTRL DKDIVDKWEL LLFSLALEHI TGEPAAFLPP PNRHVANKS AGVTVTLKGE KMFNFLEKLV YTILPNQTGF EGVPQPKTLV PGPDGVVKRV VDFGVTNLLL YPDFEEHFGV F EPIRSMQV RMMIRSDSDE SCNMLVSGLL VPQLE |
+分子 #14: uL6m
分子 | 名称: uL6m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 27.446111 KDa |
配列 | 文字列: YKIPDKIKWP KTPYSKICGR PAPEAYPIFE ILKNADKPDV WQRSLIRFPE GVEARVDEET RVLHLEGKAG SVSINMKNLD PTGLLAYSF EQNSLVMLSP SKEKLNAFVQ EIQKSVRGAS QGYLVGLTVK GVGYRMEPVE DIPAKYLSWS RPVYFDRTTP P AYPFKKPA ...文字列: YKIPDKIKWP KTPYSKICGR PAPEAYPIFE ILKNADKPDV WQRSLIRFPE GVEARVDEET RVLHLEGKAG SVSINMKNLD PTGLLAYSF EQNSLVMLSP SKEKLNAFVQ EIQKSVRGAS QGYLVGLTVK GVGYRMEPVE DIPAKYLSWS RPVYFDRTTP P AYPFKKPA KAVLLKIGFT DPAVFMLPPT IKAFFLKPTL MYLYGLNIDE LRKTAMDIRA LRKPNVFTGN GIALLDETVR IK QR |
+分子 #15: uL9m
分子 | 名称: uL9m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 6.16306 KDa |
配列 | 文字列: VEESNGKLVK IVLLDDVDRV GQQGQTVVVK AGLMRHLLFP EGKALYATPE NEAKYS |
+分子 #16: uL13m
分子 | 名称: uL13m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 21.549129 KDa |
配列 | 文字列: MQPILNHTFP RNVQLRALKE LKNIDLNGLR MRFVDAKGVG LGSLAMKVAT ILQGKDKPTY SPYRENGDVV VVVNAAHIYL SQDKWETMK YWWHTGYAGG ARELTAKQMW EKDPCQIIVR AVNGMLPKNV TRIQRMEKLK VFAEDEHPFK DFPLTPLVIE Q RKGFGWAP PEGFKPLNPE RFDLRRRI |
+分子 #17: Hypothetical protein
分子 | 名称: Hypothetical protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 13.522091 KDa |
配列 | 文字列: MLPNYSFLKV VDNSGAKLVK IIGFYGHPGK AVGVGEVVKV AIKEAKGEKV SAGEMKKAVI VEQKFPVFRP NGSHFRHLRN SCVLLSEKG QPLGNKVRAL LTYEFIKPRW SKLRTITTKK LF |
+分子 #18: uL15m
分子 | 名称: uL15m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 22.826402 KDa |
配列 | 文字列: NPNYFVHLGN LRPNPGATQQ RIREGRGLSS RRGVSCGMGF KGQKARGRSL HMLYDGGQLG LVKFPVTRQI PSYEVLYNQL GVSKLVEFI QLGLLDHTKT ITMKELLNAG CVSSLKYGVL LYGNVSLSFP INIEVTACDD RARRSIEAAG GKVTRVYYTK D GLEGLLFP ...文字列: NPNYFVHLGN LRPNPGATQQ RIREGRGLSS RRGVSCGMGF KGQKARGRSL HMLYDGGQLG LVKFPVTRQI PSYEVLYNQL GVSKLVEFI QLGLLDHTKT ITMKELLNAG CVSSLKYGVL LYGNVSLSFP INIEVTACDD RARRSIEAAG GKVTRVYYTK D GLEGLLFP KRFTDKNLPL PRPAVAWHPK FDGKFDAVGQ IPPVYEAV |
+分子 #19: uL16m
分子 | 名称: uL16m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 19.33423 KDa |
配列 | 文字列: FRRRTWPAVC GSLHIWKKMP WRIDQAPPPM PDSKPLTRLR AKRYEGIKKV VMPNSTQLQF GLYGIRSMES ARLKDNTLEA IRRTIRRKI KKTGRLWIMI RATVPMTKKP LGIRMGKGKG SIDHYVTPIR PGQILYEFDR ISRPIALQAL RAIQPKLPCR L GLVEWS |
+分子 #20: bL17m
分子 | 名称: bL17m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 20.047506 KDa |
配列 | 文字列: TVKRFLRPGG WNRLNRPVKE RLALIKNMAT QLVEKERIRT TLSKAKNLQR YGDKLITLGK AGTRESWLKA NDIVRTDREL HKLFTTLAL RYKDRQGGYV RLIRAGFRRG DAAPVAIVEL VDREGELRQA RPAVTPVPKF SVMRWVKQQL DPKFISEPAP L LPPLVRDY LKEQN |
+分子 #21: uL18m
分子 | 名称: uL18m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 12.928119 KDa |
配列 | 文字列: PLKPLVFRPL KLFFWATNRH VHAKVVRFSS PFNEGVPVVD ISTFDAFNKL KGSAPVVAPR SLECYKEVAK MVKEETARQN INEVTLHLN SHASDRGVRE VVRELKNLGL LVKKV |
+分子 #22: bL19m
分子 | 名称: bL19m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 19.849031 KDa |
配列 | 文字列: EVIIPTIPKY ANPYKLTPGV SQRLRTPKAL YEPWCPSRLL LKKRNVRARM QFLLDVLETE KEVEFQKQRN YPDFKVGDVL DVTMVAAEN ERKTYVHRGL CIQKRDRGYG SSFKLYCVFS DSGGFIQHLP LCMPDILDIK IVGQVDYKDE EDLKELVESE S RECKFLDK VL |
+分子 #23: bL20m
分子 | 名称: bL20m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 13.695711 KDa |
配列 | 文字列: TFSREQVFTF AKNFTGRARN VYKVALRRVE RGLQHSYVGR KEKKRTIRSL WIQRINAGCR EHGFAYSALI NGLNQENIQL NRKVLSELA MHEPDSFKAV LDQVRFMKGQ EIYANVEP |
+分子 #24: bL21m
分子 | 名称: bL21m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #48: mL116
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 46.617367 KDa |
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+分子 #49: mL118
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 40.870789 KDa |
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+分子 #50: mL120
分子 | 名称: mL120 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 22.283516 KDa |
配列 | 文字列: IEEYYVVPPA CPPPPHNPKT LKYVPKLNRT QIIARVYEAK TPTELENSAL GKKFFSEFAA VAKLVRLSQL RRANVYNSRD DAMCVSIYN TSVRVADKLL HLSSDEELCG LIWALSQLPY PEYENLVDRS LQILLEEDKP LKTGSSLAVS RAAAGLASLG R WDASTWEV ...文字列: IEEYYVVPPA CPPPPHNPKT LKYVPKLNRT QIIARVYEAK TPTELENSAL GKKFFSEFAA VAKLVRLSQL RRANVYNSRD DAMCVSIYN TSVRVADKLL HLSSDEELCG LIWALSQLPY PEYENLVDRS LQILLEEDKP LKTGSSLAVS RAAAGLASLG R WDASTWEV LVPLLRKNVQ EGKEVELSNL ALGLYDARET V |
+分子 #51: mL121
分子 | 名称: mL121 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 27.805775 KDa |
配列 | 文字列: ITTLEFYEQN KEKLSFLVGN DVYSEFEEKW KPKPKVFDPE IPIAEAMWPE GRSEKLQSVI VKKLSFSTES AGSVVAGMKH GYCPDSVDV IVSRVEQLKA FEGYFPGFKT EEFVSVNPRL LNFSTDRIYW AMLTFQDMFS SAEVGPLMAN IGHFIIENPI R CAKNLFCL ...文字列: ITTLEFYEQN KEKLSFLVGN DVYSEFEEKW KPKPKVFDPE IPIAEAMWPE GRSEKLQSVI VKKLSFSTES AGSVVAGMKH GYCPDSVDV IVSRVEQLKA FEGYFPGFKT EEFVSVNPRL LNFSTDRIYW AMLTFQDMFS SAEVGPLMAN IGHFIIENPI R CAKNLFCL ATELESQLSM KLDVTAVKQD SWFTLSSEET IRERVAALAT IFGSKTAGDI LLRDINYLRL DSKDVNRDAV KI REHF |
+分子 #52: mL122
分子 | 名称: mL122 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 7.019003 KDa |
配列 | 文字列: RKNIVWPEQL EEQKRNKQYE YQWVISNGKK FIARRESTST KWEIWKSIEK VTPGQKP |
+分子 #53: mL123
分子 | 名称: mL123 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 45.953566 KDa |
配列 | 文字列: YRNKVTIEYI KLKEPENDDY ATRDPTNYAQ LLGAISISRH LDRTTYLYET FKDKFDTIHY VTALTKLPGL VHYRGADLVM RDGVQWSEG VKPFWQKPNA QPRKHLLPKA QGLLSKLEEQ FPPHLNNLFP RQTANLIWAY GQLKRKQVVA ACPFLGDFLL S LRRDNFLA ...文字列: YRNKVTIEYI KLKEPENDDY ATRDPTNYAQ LLGAISISRH LDRTTYLYET FKDKFDTIHY VTALTKLPGL VHYRGADLVM RDGVQWSEG VKPFWQKPNA QPRKHLLPKA QGLLSKLEEQ FPPHLNNLFP RQTANLIWAY GQLKRKQVVA ACPFLGDFLL S LRRDNFLA LDKHATGADY AQIVKGLANL QTAGSPADED TRALIEDFVD QLTQEMLLRR GHARLLDARE AQSILWGLGK LN RRKNTAI IDVLCDVVLA GVNSLTPTAL AGAFSALAKL GHSSRTDVFE AMAKGYHLQT TLMSPQDVSL TVCACADLGF RDD NLLKIC GLKAADMLGE FSNASLAWLM AGFGRLGYNH EAFFSAVNKS VLAEPVVEVE PGFAWRVLSA YAGSGRKDSE SLKV CGRIT EAFLAKLY |
+分子 #54: mL124
分子 | 名称: mL124 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 52.21218 KDa |
配列 | 文字列: FHTGVNLVQP IDTSKLTRQI KKLTLLHEAA LTVLQYSNYC NPEQATEILR RLPFLMRHEE SRVLKGQTLD PKLPPMFHGL LHVMGDRFV QVFSDCNLRQ IERGAWALAA ARHQHDGVAL ALSEKLKQLT QELLDLNAKP FNTRVTKPTP EQLNSGIFAS R VLVPESVN ...文字列: FHTGVNLVQP IDTSKLTRQI KKLTLLHEAA LTVLQYSNYC NPEQATEILR RLPFLMRHEE SRVLKGQTLD PKLPPMFHGL LHVMGDRFV QVFSDCNLRQ IERGAWALAA ARHQHDGVAL ALSEKLKQLT QELLDLNAKP FNTRVTKPTP EQLNSGIFAS R VLVPESVN QLPVKAVLPE FNALAGIAWA LATVAGEHSA AAAKAALEQL AEKFGALQVD PKPLPDADSL CRLAWAFAKA GV HNPAAVD KLFHLAEERL KSQLQAHDPA SGPLRPRCTY RYKTVRGWVD QHFPRKPRDS SYLGDTAPKI IPRDFEIDSL GSL LSAAAL LRDQVPVERL QTILNLAAQH TAASSVAGGA LQPLMVTYEE VTRVLAACEQ LGFRSSTLVT PLLHGLPMAA LSAE ALSQL AAAATLHHVR SRTVYLRIVR AFNAKLSVSP TLVAGAGIGA EGKKEGEAAA ALGAQLLLAV TKAGLPANAS VSRIA SLV |
+分子 #55: mL125
分子 | 名称: mL125 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 22.855125 KDa |
配列 | 文字列: RPALTPSFSR VSDPWTGEKE AKYAAPYRIP EEVWKNSGAP KILFQDPWNS PDYDEVRKKH AVLVHDYLKQ QSQPINVQTI LEGVNKTHG LVLGTIEYVT SLLENMLWHD MAYVVKPVFS SPRKAKLSKI PLLYGANKYQ QVFRGTPKEV AERYEAARAK H IKVAFTRL ...文字列: RPALTPSFSR VSDPWTGEKE AKYAAPYRIP EEVWKNSGAP KILFQDPWNS PDYDEVRKKH AVLVHDYLKQ QSQPINVQTI LEGVNKTHG LVLGTIEYVT SLLENMLWHD MAYVVKPVFS SPRKAKLSKI PLLYGANKYQ QVFRGTPKEV AERYEAARAK H IKVAFTRL RTSKTPQPFR RRTDEYSHVQ ASQSALGLAA AAA |
+分子 #56: mL126
分子 | 名称: mL126 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 44.063215 KDa |
配列 | 文字列: SVKYIPNHAA TPNKYKDAQQ KVLWDRAKKL GKKPEYKVPN IKDTQTVFEI GKLTKLCLEH WKPMHFAAAL GHVINVWTTQ ALKSGRYGG KSFTVRELLG FRSLPYGVNS ITAVLPLQSP EDFLSQPLAK QPFSFKPVSV REEVKKIIAS NPGLLIHNWS L KIEGQPNH ...文字列: SVKYIPNHAA TPNKYKDAQQ KVLWDRAKKL GKKPEYKVPN IKDTQTVFEI GKLTKLCLEH WKPMHFAAAL GHVINVWTTQ ALKSGRYGG KSFTVRELLG FRSLPYGVNS ITAVLPLQSP EDFLSQPLAK QPFSFKPVSV REEVKKIIAS NPGLLIHNWS L KIEGQPNH PITDEDRAAA VIAICTSSFR ARFNEAGDVA VALVLSRLAR CGYWLPPLYE LIAPFAAFQG ARIDHSSPAV IA NVLLVLA RAKGQAEMGQ PTALQIRAIA PALEQKCLQR LGELLPSLEA LVISDTLAAT ALLSSPEARA LLAQIKAEVL ARN FLGFES RDIIACFKEL VANVYQPLQL SADLPAPGEL RDELPGGEKV LDEQLLAALS GAVVEGGAL(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #57: mL127
分子 | 名称: mL127 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 16.291125 KDa |
配列 | 文字列: HYPSNPENVI RPLTPRELGN LQQPHNEKLV KHQYKLLRMC KLVPLEERKQ LPLTKEQAKK LWDRAEELAH LDALPEVIVG KFGLTANLI RNVDFALKGR KLVRVKIGST APSLSPKFVA FVLENTLDCA TVRTKGYTVT IFRG |
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分子 | 名称: mL128 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 2.949474 KDa |
配列 | 文字列: KFQSRAEKKY RIMDEKVGKP RFQA |
+分子 #59: mL129
分子 | 名称: mL129 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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配列 | 文字列: AKRLLREAPP FTEQVDEKNF DDKDYLGAGA MSNEQLRKEL EKVEPGEAKW DEESPLIPPP QPRQYRNKGH Q |
+分子 #64: bS1m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #65: uS2m
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+分子 #66: uS3m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #67: uS4m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #68: uS5m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #69: uS6m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 13.776003 KDa |
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+分子 #70: uS7m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #71: uS8m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 43.012633 KDa |
配列 | 文字列: AAQAYFDLRY HVKKQGLLTV NRAASIINSI FPEFSHESHR NQLAVPLPRK EIPTYIMQNA KVQPWALLPT KAAAYAQYPN FFRSSSLFF GSLNREIVNR RPYSLLPADK LSMDLAQVCT NLGILNGWDI VQKREKLKDL DFVWPANELP RDHHEVKLFK H LHLRLALK ...文字列: AAQAYFDLRY HVKKQGLLTV NRAASIINSI FPEFSHESHR NQLAVPLPRK EIPTYIMQNA KVQPWALLPT KAAAYAQYPN FFRSSSLFF GSLNREIVNR RPYSLLPADK LSMDLAQVCT NLGILNGWDI VQKREKLKDL DFVWPANELP RDHHEVKLFK H LHLRLALK WEQHKPLWED GSMVKDQREY RDQQQVQQQQ PLPHLPLAPL FGPLPLTVRN LSKASQPVLL YPLQLRELAQ RM PSGLFLL YHHELGVITD AQAFLFDVPV VALAHVGLPV SMAAAVNGAV NRTFRAELGK PLREVTKLKD WSLSATIAAQ VRE RRQQLL ERAEQTKRER KQIQDLVTVR VGKFKAEVDK EDSSLALQDE LLAWQLKE |
+分子 #72: uS9m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #73: uS10m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
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+分子 #74: uS11m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 12.426539 KDa |
配列 | 文字列: VLQLEGVVHI LNTSNNIVLT LTDKEGRVKA WTTPSSVGYK NAKKRLPVAA ETAAGELAKR ALALGYSTVA VKIKGIGTMT QYAVQMLSS SGIKITQLVD VTPVPYGGCR PSRKRRV |
+分子 #75: uS12m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 13.729266 KDa |
配列 | 文字列: LTVGQLLRGG RTKKVRRSKS PALEQCPYKK GICLRVYTTA PKKPNSANRK VCKVQLSNGY KVLAYIPGEG HNLQEHSIVL VRGGRTKDL PGVKYKVIRG KYDCAGVKGR KTSRSKYGVK RPKE |
+分子 #76: uS13m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 12.807903 KDa |
配列 | 文字列: VQIQRVTLPP HQCVYMALKK VFGLGGPTSL AVVEACGISK GVRVRDLKEN HVQQITQFIQ DNFVTEDNLR RKVREDIVKL VNIKSRDGL RHDWGVSIKG HTSCNGKTAK RLRH |
+分子 #77: uS14m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 13.921226 KDa |
配列 | 文字列: TTKNFRLRFR IPQYPDIVGS RRIDKDQTRR VLYDQHEVDR RLYKAMTRDE SLTLPVRLQV QRLFETEMPR DSAPSRIVDR CVLTGRVRG LVKFAGLSRI MLRQLIHYGH IGGVAKASW |
+分子 #78: uS15m
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由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 18.048543 KDa |
配列 | 文字列: QNAKAHLVEK FLGPEFRPRI KQLKAKRLEA VNDIKRHEAD VSSPEVRVSL MTYRIRDSIP LFDECKKELT GMRKLEIMFN KRRRILRGL RKHNFPIYSM IINKLGMRDI YSDPG(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) ...文字列: QNAKAHLVEK FLGPEFRPRI KQLKAKRLEA VNDIKRHEAD VSSPEVRVSL MTYRIRDSIP LFDECKKELT GMRKLEIMFN KRRRILRGL RKHNFPIYSM IINKLGMRDI YSDPG(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) |
+分子 #79: bS16m
分子 | 名称: bS16m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 79 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 14.298446 KDa |
配列 | 文字列: MNNLLTQLPK HDLLKIKLVR WGFNKKPFYV LSVMKRRQAR NSGNRYEDIG WWDPSPHQDG NSHFGIKFDR VKYWLSQGAV PTEKVYGLF GQAGIIPQKP APPKYKPADG NADTKWRPEL QKNL |
+分子 #80: uS17m
分子 | 名称: uS17m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 80 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 15.002346 KDa |
配列 | 文字列: GGFEFVGKVV SNRMQKGVVV AVNYVVWIPK YKVYERRTAR HMAHDEGNSC VIGDIVRIQQ HRKLSKNKAY VVVSTLKHAD VYNAKQAAV LNTERSQNKL GRVEYAESRL SEVQQRLLKL REMYQKELAL N |
+分子 #81: bS18m
分子 | 名称: bS18m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 81 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 10.606415 KDa |
配列 | 文字列: FRPRSTHQEV TEMADFKNVS FLTQFLSPAG RIQPRRVTKL TEPLQRRIAK SVKLARNMAL MAGEARLDKL HLTRVRQEEL HRYQLKKSV Q |
+分子 #82: bS19m
分子 | 名称: bS19m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 82 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 10.38481 KDa |
配列 | 文字列: GRAVWRGPYV SVSLLEQVIT FAKRNPEWWN IGRFQGSKAP EAINTFCRSS TVLPDFLGLK FGVHNGREFV GVEVQEAMVG HKLGEFSQT TFR |
+分子 #83: bS21m
分子 | 名称: bS21m / タイプ: protein_or_peptide / ID: 83 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 8.829331 KDa |
配列 | 文字列: AFVAEVRDGN VDAALAQVKK YRKTEGVNDS VRKKEYFLRP SLQKFRDSEL TYAKNMGKLI HERVNWVVKR KKIKL |
+分子 #84: mS23
分子 | 名称: mS23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 84 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 19.393281 KDa |
配列 | 文字列: AFSRYFVQKF KQSYTRKYMR DMESGAFSFP KCHDILGKYR PDVLFAAAAA PLKLELPEQA VYKKLYRDFP ELRKDAVDLS SLEAPLAKQ FALKHLVLSA EIAANSPRTR HILRRDLEAD PAYERLKEEF MPRIAELRKQ QEQTASLQQL QADEEEHLKL A LTYVAAQ |
+分子 #85: mS26
分子 | 名称: mS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 85 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 19.292008 KDa |
配列 | 文字列: RVFTSNKMDE ERAKRITEQR DFIQARVEWK KATISLYKEW RRTFLQKDIE EQHTKEVAAE QAKVAFAEQK AAAEHVRRQA ALEELLRKT EIECQLAMVR VGRAQKAEET GRLIKKAENL RYAMLLEESR NWIDSEEELE KRINQSLENP EAFGFIVDLP I AKGL |
+分子 #86: mS29
分子 | 名称: mS29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 86 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 39.111852 KDa |
配列 | 文字列: SKILVEKRSP ELTQEHIGNY YKVTTERVPE GFMPFHQAFY AKPDAGQERK GGCRGIQHEF DISGHHNVML RSSTLELFDL IKEGDKNRI LLSGPTGTGK SVALFSLVEW ARQQDWIVLY IPSAFTLTRG GFFYRRPGTD LFDTLTSAQH LLKGLLDCHQ A QLAKLPLS ...文字列: SKILVEKRSP ELTQEHIGNY YKVTTERVPE GFMPFHQAFY AKPDAGQERK GGCRGIQHEF DISGHHNVML RSSTLELFDL IKEGDKNRI LLSGPTGTGK SVALFSLVEW ARQQDWIVLY IPSAFTLTRG GFFYRRPGTD LFDTLTSAQH LLKGLLDCHQ A QLAKLPLS SDDSKLLELV QKGLLNDDAH TAVDCCLEVV KELSLAAATQ PVLFAIDGYN ALFQHTDYGV TEGDIQVARR RL LKVEELT LANSMRLLER ADLGKARVVV APSWSIRSSL QVGKPVETTE FVMPRFDFAE TANALYYYQC CGLAPDVPTE KQA KLMQHI TNGNAFEIRS LAIKMSMLKL NKL |
+分子 #87: mS31
分子 | 名称: mS31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 87 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 66.912 KDa |
配列 | 文字列: SSAARWRAAI AQRLGVEAAA AAQALAALLG QGDLALTVLA AASEADVLNI TELLENNSVD EAVTNARKVA IVSGHGLFLA TATSEDLAA LSDVEAGELA ALMGKVHVVG LPLADALLGS DSLTHDQLLT LTRSEKQALL WRLASVGKLR EGRAKAVAAL R KAALDRAA ...文字列: SSAARWRAAI AQRLGVEAAA AAQALAALLG QGDLALTVLA AASEADVLNI TELLENNSVD EAVTNARKVA IVSGHGLFLA TATSEDLAA LSDVEAGELA ALMGKVHVVG LPLADALLGS DSLTHDQLLT LTRSEKQALL WRLASVGKLR EGRAKAVAAL R KAALDRAA AAAEASEGLL SAAAMMKLEH DIAEFDLVRE RYLPGPGLPE GVQEAFAPSG LPSAFSRDEQ ALYDAYFGLR SH AASAQPE PLEGPSAAQL HSSFLDGFQC REEDSQMEEL PESFGQWVAN IKGLIVKAPV PLLGLLAKFV TAKIDGADAR DAS ETQSRL RLLAAEIATD IARRREARLA VSPWWQRASA PIDALAISSI DHPSSDPLVQ LLEVLLGHSG ADEFGSWISA VAMR PVSPY EILADEHRLM DLERYLSMTS ASELHLELAA TPLPWASPAV HVPPAAFLEE MRAKFNNYLL ATGLSPLSAA EWSAY KDWA LEEFAEKRAL GEEALLQEGH SGFFNPKADE IYLRALLEAT IPPEAPLREQ AVRYLETVNM NKTWTFLKKK HMVQRL AEL SRHLTEHPPV EEQGSPFAAL FAVGPGAKPT PLVPKLSKRL PAHGPESLDL PELPEIFR |
+分子 #88: mS33
分子 | 名称: mS33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 88 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 9.192518 KDa |
配列 | 文字列: SYIPPSEVPE EHLKNIYEGI FGSPVAEFER TGRCALAKPL IGTKLSSYYF LPPNRQPGFH NEEHEYAKVR LMSKRQKK (UNK) (UNK) |
+分子 #89: mS34
分子 | 名称: mS34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 89 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 14.053026 KDa |
配列 | 文字列: SYLAQLVPRD KRTLSNVILN LPNHGIGGIF ARDTWHPESK RYWEILEVVT AKDSSAKVDA YGYLYYQGEK THPFPKRVHS VWRYGWYWK PKPEQEKLLQ PLKERYNTLV DMGIIDPSQL |
+分子 #90: mS35
分子 | 名称: mS35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 90 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 19.588945 KDa |
配列 | 文字列: QASATQWKAG VEALRQANPD VLATWIGTTG SEACMEAATA RPPYAGARPL LRWRQTTILH AGSAFMVHPR NAPVQLDVRV SDLKQELGL SDDSAALLTR LAGPERLDEK TKRRVSPCWY NSEEDTLSIA ADRYNDRESN RRLALEQLQA LVKECDTRYP G ETTPAKQY LSGFGFFQ |
+分子 #91: mS37
分子 | 名称: mS37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 91 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 9.493043 KDa |
配列 | 文字列: PWQLKEPDNS RVVKNLVKPS KPCGKELLAL IDCTRRNFSG DADGTCMRER AALARCSSQR KKTSKGEILN HLKNLAASWK RFGF |
+分子 #92: mS45
分子 | 名称: mS45 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 92 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 30.779939 KDa |
配列 | 文字列: PSVNDLASLL SLSEQYRGAD VLAEGAALPG TGFANARGTF LPHELPTAIE YLKELDPEAE MKLEQMEAMY KLLYSRNESE REVGRQMMY DLLKLSGHPF RELELCNWDY MAAFLDARVA GRVFHRGSGE RLVHRTATFP AFEGYPLAEV DQTTEGEVSK L NREESKRQ ...文字列: PSVNDLASLL SLSEQYRGAD VLAEGAALPG TGFANARGTF LPHELPTAIE YLKELDPEAE MKLEQMEAMY KLLYSRNESE REVGRQMMY DLLKLSGHPF RELELCNWDY MAAFLDARVA GRVFHRGSGE RLVHRTATFP AFEGYPLAEV DQTTEGEVSK L NREESKRQ DNAMFQDFRK KLLFNLGMVG EQLWEPVQGV LSANLRSALD RPLVVYDITA ATGETVYPPK FVAEVDGTRR AL NEQERAY QAKRKPGPRL PYYMRRIARK EEL |
+分子 #93: mS38
分子 | 名称: mS38 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 93 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 4.004099 KDa |
配列 | 文字列: ITTMQWRKLK IKKHKLRKRR KANRMRVVKV R |
+分子 #94: mS106
分子 | 名称: mS106 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 94 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 18.551984 KDa |
配列 | 文字列: IAPSQLDKLE KFVHVRPPKT DYEEDIKQAI SSVTDNEGLK KCLDLFLTNH AAQTWVGKHE YANAGQVSDF IKVCEKVGSS APLVTLWQS AYRYGVDPTV PLLRSSAAAC AALGEGADAA LVLLYGSCYI VNVPEDLAAA VRTALEAHEK AQEGNAEALA K VQKYREAL DRL |
+分子 #95: mS107
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---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 42.316926 KDa |
配列 | 文字列: MATIPKGLDI DPESPMLYHY FKSIHPHQVS FRIKKRKQLQ HLWELCKLYE NKMDTLASAA MLGQLFRLQK RNNPDYSVEL ANQIFEHCV KRLSFTIRFA TYQEIVPVLF TLARMNVSIV PSDTLLLDPT HRVSREFVHL FLKRAVRNHV HIRVVNPRQM A RVLWATAK ...文字列: MATIPKGLDI DPESPMLYHY FKSIHPHQVS FRIKKRKQLQ HLWELCKLYE NKMDTLASAA MLGQLFRLQK RNNPDYSVEL ANQIFEHCV KRLSFTIRFA TYQEIVPVLF TLARMNVSIV PSDTLLLDPT HRVSREFVHL FLKRAVRNHV HIRVVNPRQM A RVLWATAK LFPEDQRMDP RVQDAVDKLA RSSVKRLSEL HPGSLSIYAS AFAKLSPAPT SQEGPLKDVD VSSWDATITG VK SSLLDLD SKELAFVARA RTLKVFQGIS REILLRVGDL NHEQFTVRNV FHVLGAYIRA QIQDPLVAKV LAENITGRIQ DVY AEELIA LVRAAERLDG FKNPDLTAAV LRRAREVDLP EETQKDYAKR LQSA |
+分子 #96: uS4m-2
分子 | 名称: uS4m-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 96 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 20.395135 KDa |
配列 | 文字列: ADLVRHLQSS GSKLQKLANL TSASCSYRDI SVSLFGLQAR QLGCTKPFVY TFSASEQAQS KSKPFDGKLR LPDVSQLSDT ITVSGDAAP ATLNLDQKYM DKISCWTQTI PSHLEMSYQN LTSVKLFPPV DASYPTYVDF EHATRLLDHF TSRKRLNYQR K MIKKRDKF QIKSWDHHAG EA |
+分子 #97: mS108
分子 | 名称: mS108 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 97 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 5.864713 KDa |
配列 | 文字列: HRFRNNKFLR LEPDLDPKVY GQTETLQKQV DDNFSLLLAK HRLDMKAAAA |
+分子 #98: mS109
分子 | 名称: mS109 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 98 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 18.394961 KDa |
配列 | 文字列: NNPEDNIAIR NAPQKVFQLI GDPRSGVADD VTHNPFGEIT VEMVWHQLKN EVYWYRYEFA GQTTEQSHRD SRLSDYTKNL IYLLRAKNP RKWTIEALAE KFHIRKQRVL AILALKEMEA HKIESGKQLQ GPLSPYGLKV RVEDLKLLSL DPTGCGWVEP |
+分子 #99: mS110
分子 | 名称: mS110 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 99 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 11.167972 KDa |
配列 | 文字列: TTRRRKLLGS RYGARLAKKN RQQFERARVI LDCYSDEELR PDSPPVAVKE VTINTLQTMR FLFPQTSKEH LDIKQNIASY KIFSLNREL LSLLPK |
+分子 #100: uS3m-2
分子 | 名称: uS3m-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 100 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 12.220075 KDa |
配列 | 文字列: GRHLLPATAI RVRLNRGFES AWYTDVSYRE MIKKDFLLAK LASSFVNRSS RASLRQIFPG GKDFPNFRTS RIFMQHLPYK SYASTFSYV APKDGPQAKY GLFQSKL |
+分子 #101: mS111
分子 | 名称: mS111 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 101 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 17.507816 KDa |
配列 | 文字列: PFNVSDANPK DVEFLQVLLS KFLPDADKAT VYRTGQEPRR LRLGDLPATS QFMESFVSEK LPKEPLYDMP SWLANNMPQY DAQPKSPHY HWSSWMRQHL SLDLQRLYAA FAEYMASEPH RLGIVRQANF ELARLWDWQH RRVAAGLSPD L |
+分子 #102: mS112
分子 | 名称: mS112 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 102 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 7.917274 KDa |
配列 | 文字列: SADVYKEFFK MARVAVRTMK EPTKSIMKDL QRNARRSENI QRDNNLDKGV YMRFLRQRAG LSVPPIK |
+分子 #103: mS113
分子 | 名称: mS113 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 103 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 7.505579 KDa |
配列 | 文字列: GADGVLRRHN EVRGALRFFL DSWYKNKTSG TIADKNQVMF DYLKYKGVTE IAQHLHAPAP QVFRK |
+分子 #104: mS114
分子 | 名称: mS114 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 104 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 15.270999 KDa |
配列 | 文字列: AHYLQRFGEA ALKTRSVGGK ILPPLVPFSE ALKIREEAYK LGQVWPFEHV VPGVPKAPNA TAYLERKKQK EEKRTKRAKE INDALAKMP QLIADYKAAR KIDWAEVSII DKLTLSKKQI REKYVKRRLM KQN |
+分子 #105: mS115
分子 | 名称: mS115 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 105 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 40.611492 KDa |
配列 | 文字列: EYNGQGYVFS LLQRPPAPTL ELLAEYLTVK YQDVIAQRDF VTHILGRMSV LERGGELPAA DAAASGTWTG GAKRRLSPQE IRDINGELN RLFDADLNEY VSLAQRLATE NVLSPADLAT CLQAARSKAQ TSSFASLAAP GSSNVDRNIL AQVLQGKQDV S ALAAAAAA ...文字列: EYNGQGYVFS LLQRPPAPTL ELLAEYLTVK YQDVIAQRDF VTHILGRMSV LERGGELPAA DAAASGTWTG GAKRRLSPQE IRDINGELN RLFDADLNEY VSLAQRLATE NVLSPADLAT CLQAARSKAQ TSSFASLAAP GSSNVDRNIL AQVLQGKQDV S ALAAAAAA AAASGPEGAR VAWDEALQVG KYGAWATKAK AWAADDIAAR REKGQQISPE QEAALVCLWD NPLSYDAAAG LW HQYAEKA GAVSAPSLAD VISADQAIQA AKAAAAADPA SLPAVKATAE KAAQVQEAVK KLYLGFAARQ GSTSGAVTVD GVP LPFADV VKANAELDVA SPAALAAAFQ PLELGELLAC HWEAVSRTFM WEDMYQLMLE TAKEIEVNGA |
+分子 #106: mS116
分子 | 名称: mS116 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 106 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 10.018448 KDa |
配列 | 文字列: GPLPEDVFLV APKVAAAVQQ TQAQLIDLLA PYGYSFDAFS EAVLEDLSKT KELCVKARFV LWEARVLEAL EAVRPFVSGP VFRTESEAA ALT |
+分子 #107: uS7m-2
分子 | 名称: uS7m-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 107 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 9.622189 KDa |
配列 | 文字列: TVVLAPSKYD SQLKIPLKPT EMDEFEELRS FVDISIEKEA DYVMNKFVGR LIKGGEKATA QQVLLRTLLH TRRLMQEGNI TSLK |
+分子 #110: mL105
分子 | 名称: mL105 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 110 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 15.554754 KDa |
配列 | 文字列: RDEIIKLLES RKDMDVNGYV MYCREELGKL TVPRPRAPPV SPKHEDYKTF VDEERVTYMR MKQHEKISLF LTEEEKNTVT TKGKDILDD KRFIQTIASR TGFYIAEEVR DCLSEFFNFR DSSRRLLTYY A |
+分子 #111: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 111 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 2.813459 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)R(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #112: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 112 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 3.677524 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #113: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 113 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 4.017944 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #114: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 114 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 6.230672 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #115: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 115 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 5.379623 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #116: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 116 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 4.103049 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #117: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 117 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 2.230741 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #118: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 118 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 783.958 Da |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #119: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 119 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 1.975426 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #120: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 120 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 1.379692 KDa |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) |
+分子 #121: Unknown
分子 | 名称: Unknown / タイプ: protein_or_peptide / ID: 121 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() |
分子量 | 理論値: 954.168 Da |
配列 | 文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) |
+分子 #122: MAGNESIUM ION
分子 | 名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 122 / コピー数: 112 / 式: MG |
---|---|
分子量 | 理論値: 24.305 Da |
+分子 #123: POTASSIUM ION
分子 | 名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 123 / コピー数: 31 / 式: K |
---|---|
分子量 | 理論値: 39.098 Da |
+分子 #124: ZINC ION
分子 | 名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 124 / コピー数: 1 / 式: ZN |
---|---|
分子量 | 理論値: 65.409 Da |
+分子 #125: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子 | 名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 125 / コピー数: 1 / 式: ATP |
---|---|
分子量 | 理論値: 507.181 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-ATP: |
+分子 #126: water
分子 | 名称: water / タイプ: ligand / ID: 126 / コピー数: 504 / 式: HOH |
---|---|
分子量 | 理論値: 18.015 Da |
Chemical component information | ![]() ChemComp-HOH: |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.45 構成要素:
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
グリッド | モデル: Quantifoil R2/2 / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2.0 nm | ||||||||||||
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 298 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
-
電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
---|---|
特殊光学系 | エネルギーフィルター - 名称: GIF Bioquantum / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV |
撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 (6k x 4k) / 撮影したグリッド数: 1 / 実像数: 45850 / 平均露光時間: 1.5 sec. / 平均電子線量: 30.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 150.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス(公称値): 3.0 µm / 最小 デフォーカス(公称値): 0.4 µm / 倍率(公称値): 130000 |
試料ステージ | 試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER ホルダー冷却材: NITROGEN |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
+
画像解析
粒子像選択 | 選択した数: 2999000 |
---|---|
初期モデル | モデルのタイプ: PDB ENTRY PDBモデル - PDB ID: |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.1 Å / 解像度の算出法: OTHER / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.1) / 使用した粒子像数: 59000 |
初期 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.1) |
最終 角度割当 | タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.1) |
最終 3次元分類 | クラス数: 3 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.0.1) |
-原子モデル構築 1
精密化 | プロトコル: OTHER |
---|---|
得られたモデル | ![]() PDB-8apn: |
+
万見について
-お知らせ
-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
- EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
- これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。
関連情報:EMDBヘッダ
-2020年8月12日: 新型コロナ情報
新型コロナ情報
![](../emnavi/img/about_covid19.jpg)
URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php
新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。
関連情報:Covid-19情報 /
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
新型コロナウイルスの構造データ
- 国際ウイルス分類委員会(ICTV)は、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の病原ウイルスの略称を「SARS-CoV-2」と決定しました。
- 万見で扱っている構造データベースでは、"COVID-19 virus"、"2019-nCoV"といった別称・仮称でも登録されています。こちらでウイルスの詳細と構造データの一覧を見られます。
関連情報:万見生物種 /
2020年8月12日: 新型コロナ情報
+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更
EMDBのIDの桁数の変更
- EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
- EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。
関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? /
万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記
+2017年7月12日: PDB大規模アップデート
PDB大規模アップデート
- 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
- 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
- このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
- EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。
外部リンク:wwPDB Remediation /
OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。
-万見 (Yorodumi)
幾万の構造データを、幾万の視点から
- 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
- EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。
関連情報:EMDB /
PDB /
SASBDB /
3つのデータバンクの比較 /
万見検索 /
2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 /
万見文献 /
Jmol/JSmol /
機能・相同性情報 /
新しいEM Navigatorと万見の変更点