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- EMDB-12865: Structure of a human mitochondrial ribosome large subunit assembl... -

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登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-12865
タイトルStructure of a human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 (dataset1).
マップデータGlobal refinement map.
試料
  • 複合体: Human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 (dataset1).
    • タンパク質・ペプチド: x 54種
    • RNA: x 2種
  • リガンド: x 2種
キーワードMitochondria / Ribosome / Biogenesis / GTPase / NSUN4 / MTERF4
機能・相同性
機能・相同性情報


tRNA (cytidine-5-)-methyltransferase activity / rRNA modification in the mitochondrion / negative regulation of mitochondrial translation / mitochondrial large ribosomal subunit assembly / rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity / Complex I biogenesis / protein lipoylation / negative regulation of ribosome biogenesis / Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / Protein lipoylation ...tRNA (cytidine-5-)-methyltransferase activity / rRNA modification in the mitochondrion / negative regulation of mitochondrial translation / mitochondrial large ribosomal subunit assembly / rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity / Complex I biogenesis / protein lipoylation / negative regulation of ribosome biogenesis / Mitochondrial Fatty Acid Beta-Oxidation / Protein lipoylation / rRNA import into mitochondrion / mitochondrial [2Fe-2S] assembly complex / Respiratory electron transport / rRNA methyltransferase activity / mitochondrial transcription / mitochondrial translational termination / mitochondrial translational elongation / mitochondrial ribosome assembly / translation release factor activity, codon nonspecific / positive regulation of mitochondrial translation / microprocessor complex / Mitochondrial translation elongation / Mitochondrial translation termination / Mitochondrial translation initiation / protein targeting to mitochondrion / camera-type eye development / iron-sulfur cluster assembly complex / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial fission / mitochondrial large ribosomal subunit binding / peptidyl-tRNA hydrolase / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ / mitochondrial ribosome / mitochondrial small ribosomal subunit / rRNA methylation / mitochondrial translation / aminoacyl-tRNA hydrolase activity / [2Fe-2S] cluster assembly / iron-sulfur cluster assembly / ribosomal large subunit binding / proton motive force-driven mitochondrial ATP synthesis / respiratory chain complex I / : / mitochondrial respiratory chain complex I assembly / mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone / acyl binding / anatomical structure morphogenesis / acyl carrier activity / RNA processing / Mitochondrial protein degradation / aerobic respiration / rescue of stalled ribosome / ribosomal large subunit biogenesis / 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの / cellular response to leukemia inhibitory factor / methyltransferase activity / fatty acid binding / mitochondrial membrane / fibrillar center / fatty acid biosynthetic process / rRNA processing / double-stranded RNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / cell junction / heart development / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / double-stranded DNA binding / endonuclease activity / mitochondrial inner membrane / negative regulation of translation / nuclear body / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / mitochondrial matrix / ribonucleoprotein complex / translation / protein domain specific binding / mRNA binding / nucleotide binding / calcium ion binding / synapse / regulation of DNA-templated transcription / nucleolus / apoptotic process / mitochondrion / RNA binding / extracellular space / nucleoplasm / nucleus / plasma membrane / cytosol
類似検索 - 分子機能
: / Mitochondrial termination factor repeats / Transcription termination factor, mitochondrial/chloroplastic / MTERF superfamily, mitochondrial/chloroplastic / mTERF / MIEF1-MP, LYR domain / Protein Iojap/ribosomal silencing factor RsfS / Ribosomal silencing factor during starvation / SAM-dependent methyltransferase RsmB/NOP2-type / RNA (C5-cytosine) methyltransferase ...: / Mitochondrial termination factor repeats / Transcription termination factor, mitochondrial/chloroplastic / MTERF superfamily, mitochondrial/chloroplastic / mTERF / MIEF1-MP, LYR domain / Protein Iojap/ribosomal silencing factor RsfS / Ribosomal silencing factor during starvation / SAM-dependent methyltransferase RsmB/NOP2-type / RNA (C5-cytosine) methyltransferase / : / 16S rRNA methyltransferase RsmB/F / SAM-dependent MTase RsmB/NOP-type domain profile. / : / : / Ribosomal protein L55, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L48 / 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L55 superfamily / Mitochondrial ribosomal protein L55 / Mitochondrial ribosomal protein L46 NUDIX / Ribosomal protein S30, mitochondrial / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / Mitochondrial 28S ribosomal protein S32 / Ribosomal protein L28/L40, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L28 / Ribosomal protein 63, mitochondrial / Growth arrest/ DNA-damage-inducible protein-interacting protein 1 / Ribosomal protein L51, mitochondrial / Growth arrest and DNA-damage-inducible proteins-interacting protein 1 / Mitochondrial ribosomal subunit / Mitochondrial ribosome protein 63 / Ribosomal protein L37/S30 / Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1 domain superfamily / : / : / Mitochondrial 28S ribosomal protein S30 (PDCD9) / 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / Mitoribosomal protein mL52 / : / Ribosomal protein L35, mitochondrial / MRPL44, double-stranded RNA binding domain / MRPL44 dsRNA-binding domain / Large ribosomal subunit protein mL44, endonuclease domain / : / Large ribosomal subunit protein bL9m C-terminal domain / Tim44-like domain / Tim44-like domain / Tim44 / : / : / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27 / Ribosomal subunit 39S / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / : / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein, eukaryotic / PEBP-like superfamily / Threonyl/alanyl tRNA synthetase, class II-like, putative editing domain superfamily / TGS-like / TGS domain profile. / TGS / Peptide chain release factor class I / RF-1 domain / Ribonuclease III, endonuclease domain superfamily / Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile. / Double-stranded RNA-binding domain / Complex 1 LYR protein domain / Complex 1 protein (LYR family) / : / Beta-grasp domain superfamily / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Acyl carrier protein (ACP) / NTF2-like domain superfamily / Ribosomal protein L11, bacterial-type / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Phosphopantetheine attachment site / Nucleotidyltransferase superfamily / Phosphopantetheine attachment site. / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / Phosphopantetheine attachment site / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain
類似検索 - ドメイン・相同性
Mitochondrial ribosome and complex I assembly factor AltMIEF1 / Acyl carrier protein, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein bL19m / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein mL51 ...Mitochondrial ribosome and complex I assembly factor AltMIEF1 / Acyl carrier protein, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein bL19m / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein mL62 / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein mL51 / Large ribosomal subunit protein uL2m / Large ribosomal subunit protein uL14m / Large ribosomal subunit protein bL21m / Transcription termination factor 4, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein mL55 / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein mL52 / Large ribosomal subunit protein mL41 / Large ribosomal subunit protein mL50 / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein mL64 / Large ribosomal subunit protein uL30m / Large ribosomal subunit protein uL24m / 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4 / Large ribosomal subunit protein mL38 / Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1 / Large ribosomal subunit protein mL53 / Large ribosomal subunit protein mL48 / Large ribosomal subunit protein bL34m / Large ribosomal subunit protein mL63 / Large ribosomal subunit protein mL45 / Large ribosomal subunit protein bL32m / Large ribosomal subunit protein bL20m / Large ribosomal subunit protein uL13m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Large ribosomal subunit protein uL4m / Large ribosomal subunit protein mL37 / Large ribosomal subunit protein uL18m / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein mL65 / Large ribosomal subunit protein mL40 / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein mL66 / Large ribosomal subunit protein uL22m / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein mL39 / Large ribosomal subunit protein bL35m / Large ribosomal subunit protein uL15m / Large ribosomal subunit protein bL36m / Large ribosomal subunit protein bL27m / Large ribosomal subunit protein uL11m / Large ribosomal subunit protein mL42
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.2 Å
データ登録者Hillen HS / Lavdovskaia E
資金援助 ドイツ, 5件
OrganizationGrant number国
German Research Foundation (DFG)RI 2715/1-1 ドイツ
German Research Foundation (DFG)EXC 2067/1-390729940 ドイツ
German Research Foundation (DFG)FOR2848 ドイツ
German Research Foundation (DFG)SFB860 ドイツ
German Research Foundation (DFG)SFB1160 ドイツ
引用
ジャーナル: Nat Commun / 年: 2021
タイトル: Structural basis of GTPase-mediated mitochondrial ribosome biogenesis and recycling.
著者: Hauke S Hillen / Elena Lavdovskaia / Franziska Nadler / Elisa Hanitsch / Andreas Linden / Katherine E Bohnsack / Henning Urlaub / Ricarda Richter-Dennerlein /
要旨: Ribosome biogenesis requires auxiliary factors to promote folding and assembly of ribosomal proteins and RNA. Particularly, maturation of the peptidyl transferase center (PTC) is mediated by ...Ribosome biogenesis requires auxiliary factors to promote folding and assembly of ribosomal proteins and RNA. Particularly, maturation of the peptidyl transferase center (PTC) is mediated by conserved GTPases, but the molecular basis is poorly understood. Here, we define the mechanism of GTPase-driven maturation of the human mitochondrial large ribosomal subunit (mtLSU) using endogenous complex purification, in vitro reconstitution and cryo-EM. Structures of transient native mtLSU assembly intermediates that accumulate in GTPBP6-deficient cells reveal how the biogenesis factors GTPBP5, MTERF4 and NSUN4 facilitate PTC folding. Addition of recombinant GTPBP6 reconstitutes late mtLSU biogenesis in vitro and shows that GTPBP6 triggers a molecular switch and progression to a near-mature PTC state. Additionally, cryo-EM analysis of GTPBP6-treated mature mitochondrial ribosomes reveals the structural basis for the dual-role of GTPBP6 in ribosome biogenesis and recycling. Together, these results provide a framework for understanding step-wise PTC folding as a critical conserved quality control checkpoint.
#1: ジャーナル: Biorxiv / 年: 2021
タイトル: Structural basis of GTPase-mediated mitochondrial ribosome biogenesis and recycling
著者: Hillen HS / Lavdovskaia E / Nadler F / Hanitsch E / Linden A / Bohnsack KE / Urlaub H / Richter-Dennerlein R
履歴
登録2021年5月4日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年6月9日-
マップ公開2021年6月9日-
更新2024年7月10日-
現状2024年7月10日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.005
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.005
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-7of0
  • 表面レベル: 0.005
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_12865.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_12865.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 163.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Global refinement map.
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.05 Å/pix.
x 350 pix.
= 367.5 Å		1.05 Å/pix.
x 350 pix.
= 367.5 Å		1.05 Å/pix.
x 350 pix.
= 367.5 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.05 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.004 / ムービー #1: 0.005
最小 - 最大-0.034526818 - 0.12782337
平均 (標準偏差)-0.00022099097 (±0.0038141133)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ350350350
Spacing350350350
セルA=B=C: 367.49997 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.051.051.05
M x/y/z350350350
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z367.500367.500367.500
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ727265
NX/NY/NZ157157169
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS350350350
D min/max/mean-0.0350.128-0.000

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_12865_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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マスク #2

ファイルemd_12865_msk_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refinement half-map 2.

ファイルemd_12865_additional_1.map
注釈Focused refinement half-map 2.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refinement half-map 1.

ファイルemd_12865_additional_2.map
注釈Focused refinement half-map 1.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Post-processed map from focused refinement.

ファイルemd_12865_additional_3.map
注釈Post-processed map from focused refinement.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Focused refinement map.

ファイルemd_12865_additional_4.map
注釈Focused refinement map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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追加マップ: Global refinement post-processed map.

ファイルemd_12865_additional_5.map
注釈Global refinement post-processed map.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Global refinement half-map 1.

ファイルemd_12865_half_map_1.map
注釈Global refinement half-map 1.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: Global refinement half-map 2.

ファイルemd_12865_half_map_2.map
注釈Global refinement half-map 2.
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate ...

全体名称: Human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 (dataset1).
要素
  • 複合体: Human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 (dataset1).
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L32, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L33, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L34, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L36, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L37, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L38, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L39, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L40, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L41, mitochondrial
    • RNA: 16S ribosomal RNA
    • RNA: mitochondrial tRNAVal
    • タンパク質・ペプチド: 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L2, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L3, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Transcription termination factor 4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L10, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L11, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L14, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L16, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L17, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L18, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L20, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L21, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L22, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L24, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L27, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L28, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L47, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L30, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L42, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L43, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L44, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L45, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L46, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L50, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L51, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L53, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein L55, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein 63, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1
    • タンパク質・ペプチド: MIEF1 upstream open reading frame protein
    • タンパク質・ペプチド: Acyl carrier protein, mitochondrial
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: MAGNESIUM ION

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超分子 #1: Human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate ...

超分子名称: Human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 (dataset1).
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#56
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト) / 株: HEK293-Flp-In T-Rex / Organelle: Mitochondria

+
分子 #1: 39S ribosomal protein L32, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L32, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 21.437799 KDa
配列文字列:
MALAMLVLVV SPWSAARGVL RNYWERLLRK LPQSRPGFPS PPWGPALAVQ GPAMFTEPAN DTSGSKENSS LLDSIFWMAA PKNRRTIEV NRCRRRNPQK LIKVKNNIDV CPECGHLKQK HVLCAYCYEK VCKETAEIRR QIGKQEGGPF KAPTIETVVL Y TGETPSEQ DQGKRIIERD RKRPSWFTQN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32m

+
分子 #2: 39S ribosomal protein L33, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L33, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 7.635204 KDa
配列文字列:
MFLSAVFFAK SKSKNILVRM VSEAGTGFCF NTKRNRLREK LTLLHYDPVV KQRVLFVEKK KIRSL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33m

+
分子 #3: 39S ribosomal protein L34, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L34, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 10.183913 KDa
配列文字列:
MAVLAGSLLG PTSRSAALLG GRWLQPRAWL GFPDAWGLPT PQQARGKARG NEYQPSNIKR KNKHGWVRRL STPAGVQVIL RRMLKGRKS LSH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34m

+
分子 #4: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L35, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 21.558488 KDa
配列文字列:
MAASAFAGAV RAASGILRPL NILASSTYRN CVKNASLISA LSTGRFSHIQ TPVVSSTPRL TTSERNLTCG HTSVILNRMA PVLPSVLKL PVRSLTYFSA RKGKRKTVKA VIDRFLRLHC GLWVRRKAGY KKKLWKKTPA RKKRLREFVF CNKTQSKLLD K MTTSFWKR RNWYVDDPYQ KYHDRTNLKV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35m

+
分子 #5: 39S ribosomal protein L36, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L36, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 11.809301 KDa
配列文字列:
MANLFIRKMV NPLLYLSRHT VKPRALSTFL FGSIRGAAPV AVEPGAAVRS LLSPGLLPHL LPALGFKNKT VLKKRCKDCY LVKRRGRWY VYCKTHPRHK QRQM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36m

+
分子 #6: 39S ribosomal protein L37, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L37, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 48.183344 KDa
配列文字列: MALASGPARR ALAGSGQLGL GGFGAPRRGA YEWGVRSTRK SEPPPLDRVY EIPGLEPITF AGKMHFVPWL ARPIFPPWDR GYKDPRFYR SPPLHEHPLY KDQACYIFHH RCRLLEGVKQ ALWLTKTKLI EGLPEKVLSL VDDPRNHIEN QDECVLNVIS H ARLWQTTE ...文字列:
MALASGPARR ALAGSGQLGL GGFGAPRRGA YEWGVRSTRK SEPPPLDRVY EIPGLEPITF AGKMHFVPWL ARPIFPPWDR GYKDPRFYR SPPLHEHPLY KDQACYIFHH RCRLLEGVKQ ALWLTKTKLI EGLPEKVLSL VDDPRNHIEN QDECVLNVIS H ARLWQTTE EIPKRETYCP VIVDNLIQLC KSQILKHPSL ARRICVQNST FSATWNRESL LLQVRGSGGA RLSTKDPLPT IA SREEIEA TKNHVLETFY PISPIIDLHE CNIYDVKNDT GFQEGYPYPY PHTLYLLDKA NLRPHRLQPD QLRAKMILFA FGS ALAQAR LLYGNDAKVL EQPVVVQSVG TDGRVFHFLV FQLNTTDLDC NEGVKNLAWV DSDQLLYQHF WCLPVIKKRV VVEP VGPVG FKPETFRKFL ALYLHGAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL37

+
分子 #7: 39S ribosomal protein L38, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L38, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 44.65943 KDa
配列文字列: MAAPWWRAAL CECRRWRGFS TSAVLGRRTP PLGPMPNSDI DLSNLERLEK YRSFDRYRRR AEQEAQAPHW WRTYREYFGE KTDPKEKID IGLPPPKVSR TQQLLERKQA IQELRANVEE ERAARLRTAS VPLDAVRAEW ERTCGPYHKQ RLAEYYGLYR D LFHGATFV ...文字列:
MAAPWWRAAL CECRRWRGFS TSAVLGRRTP PLGPMPNSDI DLSNLERLEK YRSFDRYRRR AEQEAQAPHW WRTYREYFGE KTDPKEKID IGLPPPKVSR TQQLLERKQA IQELRANVEE ERAARLRTAS VPLDAVRAEW ERTCGPYHKQ RLAEYYGLYR D LFHGATFV PRVPLHVAYA VGEDDLMPVY CGNEVTPTEA AQAPEVTYEA EEGSLWTLLL TSLDGHLLEP DAEYLHWLLT NI PGNRVAE GQVTCPYLPP FPARGSGIHR LAFLLFKQDQ PIDFSEDARP SPCYQLAQRT FRTFDFYKKH QETMTPAGLS FFQ CRWDDS VTYIFHQLLD MREPVFEFVR PPPYHPKQKR FPHRQPLRYL DRYRDSHEPT YGIY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL38

+
分子 #8: 39S ribosomal protein L39, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L39, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 38.764785 KDa
配列文字列: MEALAMGSRA LRLWLVAPGG GIKWRFIATS SASQLSPTEL TEMRNDLFNK EKARQLSLTP RTEKIEVKHV GKTDPGTVFV MNKNISTPY SCAMHLSEWY CRKSILALVD GQPWDMYKPL TKSCEIKFLT FKDCDPGEVN KAYWRSCAMM MGCVIERAFK D EYMVNLVR ...文字列:
MEALAMGSRA LRLWLVAPGG GIKWRFIATS SASQLSPTEL TEMRNDLFNK EKARQLSLTP RTEKIEVKHV GKTDPGTVFV MNKNISTPY SCAMHLSEWY CRKSILALVD GQPWDMYKPL TKSCEIKFLT FKDCDPGEVN KAYWRSCAMM MGCVIERAFK D EYMVNLVR APEVPVISGA FCYDVVLDSK LDEWMPTKEN LRSFTKDAHA LIYKDLPFET LEVEAKVALE IFQHSKYKVD FI EEKASQN PERIVKLHRI GDFIDVSEGP LIPRTSICFQ YEVSAVHNLQ PTQPSLIRRF QGVSLPVHLR AHFTIWDKLL ERS RKMVTE DQSKATEECT ST

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL39

+
分子 #9: 39S ribosomal protein L40, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L40, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 24.534422 KDa
配列文字列: MTASVLRSIS LALRPTSGLL GTWQTQLRET HQRASLLSFW ELIPMRSEPL RKKKKVDPKK DQEAKERLKR KIRKLEKATQ ELIPIEDFI TPLKFLDKAR ERPQVELTFE ETERRALLLK KWSLYKQQER KMERDTIRAM LEAQQEALEE LQLESPKLHA E AIKRDPNL ...文字列:
MTASVLRSIS LALRPTSGLL GTWQTQLRET HQRASLLSFW ELIPMRSEPL RKKKKVDPKK DQEAKERLKR KIRKLEKATQ ELIPIEDFI TPLKFLDKAR ERPQVELTFE ETERRALLLK KWSLYKQQER KMERDTIRAM LEAQQEALEE LQLESPKLHA E AIKRDPNL FPFEKEGPHY TPPIPNYQPP EGRYNDITKV YTQVEFKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL40

+
分子 #10: 39S ribosomal protein L41, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L41, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.404708 KDa
配列文字列:
MGVLAAAARC LVRGADRMSK WTSKRGPRSF RGRKGRGAKG IGFLTSGWRF VQIKEMVPEF VVPDLTGFKL KPYVSYLAPE SEETPLTAA QLFSEAVAPA IEKDFKDGTF DPDNLEKYGF EPTQEGKLFQ LYPRNFLR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL41

+
分子 #13: 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4

分子名称: 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 43.140473 KDa
配列文字列: MAALTLRGVR ELLKRVDLAT VPRRHRYKKK WAATEPKFPA VRLALQNFDM TYSVQFGDLW PSIRVSLLSE QKYGALVNNF AAWDHVSAK LEQLSAKDFV NEAISHWELQ SEGGQSAAPS PASWACSPNL RCFTFDRGDI SRFPPARPGS LGVMEYYLMD A ASLLPVLA ...文字列:
MAALTLRGVR ELLKRVDLAT VPRRHRYKKK WAATEPKFPA VRLALQNFDM TYSVQFGDLW PSIRVSLLSE QKYGALVNNF AAWDHVSAK LEQLSAKDFV NEAISHWELQ SEGGQSAAPS PASWACSPNL RCFTFDRGDI SRFPPARPGS LGVMEYYLMD A ASLLPVLA LGLQPGDIVL DLCAAPGGKT LALLQTGCCR NLAANDLSPS RIARLQKILH SYVPEEIRDG NQVRVTSWDG RK WGELEGD TYDRVLVDVP CTTDRHSLHE EENNIFKRSR KKERQILPVL QVQLLAAGLL ATKPGGHVVY STCSLSHLQN EYV VQGAIE LLANQYSIQV QVEDLTHFRR VFMDTFCFFS SCQVGELVIP NLMANFGPMY FCKMRRLT

UniProtKB: 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4

+
分子 #14: 39S ribosomal protein L2, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L2, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 33.355941 KDa
配列文字列: MALCALTRAL RSLNLAPPTV AAPAPSLFPA AQMMNNGLLQ QPSALMLLPC RPVLTSVALN ANFVSWKSRT KYTITPVKMR KSGGRDHTG RIRVHGIGGG HKQRYRMIDF LRFRPEETKS GPFEEKVIQV RYDPCRSADI ALVAGGSRKR WIIATENMQA G DTILNSNH ...文字列:
MALCALTRAL RSLNLAPPTV AAPAPSLFPA AQMMNNGLLQ QPSALMLLPC RPVLTSVALN ANFVSWKSRT KYTITPVKMR KSGGRDHTG RIRVHGIGGG HKQRYRMIDF LRFRPEETKS GPFEEKVIQV RYDPCRSADI ALVAGGSRKR WIIATENMQA G DTILNSNH IGRMAVAARE GDAHPLGALP VGTLINNVES EPGRGAQYIR AAGTCGVLLR KVNGTAIIQL PSKRQMQVLE TC VATVGRV SNVDHNKRVI GKAGRNRWLG KRPNSGRWHR KGGWAGRKIR PLPPMKSYVK LPSASAQS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2m

+
分子 #15: 39S ribosomal protein L3, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L3, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 38.689562 KDa
配列文字列: MPGWRLLTQV GAQVLGRLGD GLGAALGPGN RTHIWLFVRG LHGKSGTWWD EHLSEENVPF IKQLVSDEDK AQLASKLCPL KDEPWPIHP WEPGSFRVGL IALKLGMMPL WTKDGQKHVV TLLQVQDCHV LKYTSKENCN GKMATLSVGG KTVSRFRKAT S ILEFYREL ...文字列:
MPGWRLLTQV GAQVLGRLGD GLGAALGPGN RTHIWLFVRG LHGKSGTWWD EHLSEENVPF IKQLVSDEDK AQLASKLCPL KDEPWPIHP WEPGSFRVGL IALKLGMMPL WTKDGQKHVV TLLQVQDCHV LKYTSKENCN GKMATLSVGG KTVSRFRKAT S ILEFYREL GLPPKQTVKI FNITDNAAIK PGTPLYAAHF RPGQYVDVTA KTIGKGFQGV MKRWGFKGQP ATHGQTKTHR RP GAVATGD IGRVWPGTKM PGKMGNIYRT EYGLKVWRIN TKHNIIYVNG SVPGHKNCLV KVKDSKLPAY KDLGKNLPFP TYF PDGDEE ELPEDLYDEN VCQPGAPSIT FA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3m

+
分子 #16: 39S ribosomal protein L4, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L4, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 34.970195 KDa
配列文字列: MLQFVRAGAR AWLRPTGSQG LSSLAEEAAR ATENPEQVAS EGLPEPVLRK VELPVPTHRR PVQAWVESLR GFEQERVGLA DLHPDVFAT APRLDILHQV AMWQKNFKRI SYAKTKTRAE VRGGGRKPWP QKGTGRARHG SIRSPLWRGG GVAHGPRGPT S YYYMLPMK ...文字列:
MLQFVRAGAR AWLRPTGSQG LSSLAEEAAR ATENPEQVAS EGLPEPVLRK VELPVPTHRR PVQAWVESLR GFEQERVGLA DLHPDVFAT APRLDILHQV AMWQKNFKRI SYAKTKTRAE VRGGGRKPWP QKGTGRARHG SIRSPLWRGG GVAHGPRGPT S YYYMLPMK VRALGLKVAL TVKLAQDDLH IMDSLELPTG DPQYLTELAH YRRWGDSVLL VDLTHEEMPQ SIVEATSRLK TF NLIPAVG LNVHSMLKHQ TLVLTLPTVA FLEDKLLWQD SRYRPLYPFS LPYSDFPRPL PHATQGPAAT PYHC

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4m

+
分子 #17: Transcription termination factor 4, mitochondrial

分子名称: Transcription termination factor 4, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 44.012473 KDa
配列文字列: MAAFGRQVLD WHRLIPLTWA CMARQTPHLG EQRRTTASLL RKLTTASNGG VIEELSCVRS NNYVQEPECR RNLVQCLLEK QGTPVVQGS LELERVMSSL LDMGFSNAHI NELLSVRRGA SLQQLLDIIS EFILLGLNPE PVCVVLKKSP QLLKLPIMQM R KRSSYLQK ...文字列:
MAAFGRQVLD WHRLIPLTWA CMARQTPHLG EQRRTTASLL RKLTTASNGG VIEELSCVRS NNYVQEPECR RNLVQCLLEK QGTPVVQGS LELERVMSSL LDMGFSNAHI NELLSVRRGA SLQQLLDIIS EFILLGLNPE PVCVVLKKSP QLLKLPIMQM R KRSSYLQK LGLGEGKLKR VLYCCPEIFT MRQQDINDTV RLLKEKCLFT VQQVTKILHS CPSVLREDLG QLEYKFQYAY FR MGIKHPD IVKSEYLQYS LTKIKQRHIY LERLGRYQTP DKKGQTQIPN PLLKDILRVS EAEFLARTAC TSVEEFQVFK KLL AREEEE SESSTSDDKR ASLDEDEDDD DEEDNDEDDN DEDDDDEDDD EAEDNDEDED DDEEE

UniProtKB: Transcription termination factor 4, mitochondrial

+
分子 #18: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L9, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 30.296355 KDa
配列文字列: MAAPVVTAPG RALLRAGAGR LLRGGVQELL RPRHEGNAPD LACNFSLSQN RGTVIVERWW KVPLAGEGRK PRLHRRHRVY KLVEDTKHR PKENLELILT QSVENVGVRG DLVSVKKSLG RNRLLPQGLA VYASPENKKL FEEEKLLRQE GKLEKIQTKA G EATVKFLK ...文字列:
MAAPVVTAPG RALLRAGAGR LLRGGVQELL RPRHEGNAPD LACNFSLSQN RGTVIVERWW KVPLAGEGRK PRLHRRHRVY KLVEDTKHR PKENLELILT QSVENVGVRG DLVSVKKSLG RNRLLPQGLA VYASPENKKL FEEEKLLRQE GKLEKIQTKA G EATVKFLK SCRLEVGMKN NVKWELNPEI VARHFFKNLG VVVAPHTLKL PEEPITRWGE YWCEVTVNGL DTVRVPMSVV NF EKPKTKR YKYWLAQQAA KAMAPTSPQI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9m

+
分子 #19: 39S ribosomal protein L10, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L10, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.322529 KDa
配列文字列: MAAAVAGMLR GGLLPQAGRL PTLQTVRYGS KAVTRHRRVM HFQRQKLMAV TEYIPPKPAI HPSCLPSPPS PPQEEIGLIR LLRREIAAV FQDNRMIAVC QNVALSAEDK LLMRHQLRKH KILMKVFPNQ VLKPFLEDSK YQNLLPLFVG HNMLLVSEEP K VKEMVRIL ...文字列:
MAAAVAGMLR GGLLPQAGRL PTLQTVRYGS KAVTRHRRVM HFQRQKLMAV TEYIPPKPAI HPSCLPSPPS PPQEEIGLIR LLRREIAAV FQDNRMIAVC QNVALSAEDK LLMRHQLRKH KILMKVFPNQ VLKPFLEDSK YQNLLPLFVG HNMLLVSEEP K VKEMVRIL RTVPFLPLLG GCIDDTILSR QGFINYSKLP SLPLVQGELV GGLTCLTAQT HSLLQHQPLQ LTTLLDQYIR EQ REKDSVM SANGKPDPDT VPDS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10m

+
分子 #20: 39S ribosomal protein L11, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L11, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 20.716227 KDa
配列文字列: MSKLGRAARG LRKPEVGGVI RAIVRAGLAM PGPPLGPVLG QRGVSINQFC KEFNERTKDI KEGIPLPTKI LVKPDRTFEI KIGQPTVSY FLKAAAGIEK GARQTGKEVA GLVTLKHVYE IARIKAQDEA FALQDVPLSS VVRSIIGSAR SLGIRVVKDL S SEELAAFQ ...文字列:
MSKLGRAARG LRKPEVGGVI RAIVRAGLAM PGPPLGPVLG QRGVSINQFC KEFNERTKDI KEGIPLPTKI LVKPDRTFEI KIGQPTVSY FLKAAAGIEK GARQTGKEVA GLVTLKHVYE IARIKAQDEA FALQDVPLSS VVRSIIGSAR SLGIRVVKDL S SEELAAFQ KERAIFLAAQ KEADLAAQEE AAKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11m

+
分子 #21: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L13, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 20.722988 KDa
配列文字列:
MSSFSRAPQQ WATFARIWYL LDGKMQPPGK LAAMASIRLQ GLHKPVYHAL SDCGDHVVIM NTRHIAFSGN KWEQKVYSSH TGYPGGFRQ VTAAQLHLRD PVAIVKLAIY GMLPKNLHRR TMMERLHLFP DEYIPEDILK NLVEELPQPR KIPKRLDEYT Q EEIDAFPR LWTPPEDYRL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13m

+
分子 #22: 39S ribosomal protein L14, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L14, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.973702 KDa
配列文字列:
MAFFTGLWGP FTCVSRVLSH HCFSTTGSLS AIQKMTRVRV VDNSALGNSP YHRAPRCIHV YKKNGVGKVG DQILLAIKGQ KKKALIVGH CMPGPRMTPR FDSNNVVLIE DNGNPVGTRI KTPIPTSLRK REGEYSKVLA IAQNFV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14m

+
分子 #23: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L15, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 33.47382 KDa
配列文字列: MAGPLQGGGA RALDLLRGLP RVSLANLKPN PGSKKPERRP RGRRRGRKCG RGHKGERQRG TRPRLGFEGG QTPFYIRIPK YGFNEGHSF RRQYKPLSLN RLQYLIDLGR VDPSQPIDLT QLVNGRGVTI QPLKRDYGVQ LVEEGADTFT AKVNIEVQLA S ELAIAAIE ...文字列:
MAGPLQGGGA RALDLLRGLP RVSLANLKPN PGSKKPERRP RGRRRGRKCG RGHKGERQRG TRPRLGFEGG QTPFYIRIPK YGFNEGHSF RRQYKPLSLN RLQYLIDLGR VDPSQPIDLT QLVNGRGVTI QPLKRDYGVQ LVEEGADTFT AKVNIEVQLA S ELAIAAIE KNGGVVTTAF YDPRSLDIVC KPVPFFLRGQ PIPKRMLPPE ELVPYYTDAK NRGYLADPAK FPEARLELAR KY GYILPDI TKDELFKMLC TRKDPRQIFF GLAPGWVVNM ADKKILKPTD ENLLKYYTS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15m

+
分子 #24: 39S ribosomal protein L16, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L16, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 28.496285 KDa
配列文字列: MWRLLARASA PLLRVPLSDS WALLPASAGV KTLLPVPSFE DVSIPEKPKL RFIERAPLVP KVRREPKNLS DIRGPSTEAT EFTEGNFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRSMDPKNMF AIWRVPAPFK PITRKSVGHR MGGGKGAIDH YVTPVKAGRL V VEMGGRCE ...文字列:
MWRLLARASA PLLRVPLSDS WALLPASAGV KTLLPVPSFE DVSIPEKPKL RFIERAPLVP KVRREPKNLS DIRGPSTEAT EFTEGNFAI LALGGGYLHW GHFEMMRLTI NRSMDPKNMF AIWRVPAPFK PITRKSVGHR MGGGKGAIDH YVTPVKAGRL V VEMGGRCE FEEVQGFLDQ VAHKLPFAAK AVSRGTLEKM RKDQEERERN NQNPWTFERI ATANMLGIRK VLSPYDLTHK GK YWGKFYM PKRV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16m

+
分子 #25: 39S ribosomal protein L17, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L17, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 20.083266 KDa
配列文字列:
MRLSVAAAIS HGRVFRRMGL GPESRIHLLR NLLTGLVRHE RIEAPWARVD EMRGYAEKLI DYGKLGDTNE RAMRMADFWL TEKDLIPKL FQVLAPRYKD QTGGYTRMLQ IPNRSLDRAK MAVIEYKGNC LPPLPLPRRD SHLTLLNQLL QGLRQDLRQS Q EASNHSSH TAQTPGI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17m

+
分子 #26: 39S ribosomal protein L18, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L18, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 20.60757 KDa
配列文字列:
MALRSRFWGL FSVCRNPGCR FAALSTSSEP AAKPEVDPVE NEAVAPEFTN RNPRNLELLS VARKERGWRT VFPSREFWHR LRVIRTQHH VEALVEHQNG KVVVSASTRE WAIKKHLYST RNVVACESIG RVLAQRCLEA GINFMVYQPT PWEAASDSMK R LQSAMTEG GVVLREPQRI YE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18m

+
分子 #27: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L19, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 33.584996 KDa
配列文字列: MAACIAAGHW AAMGLGRSFQ AARTLLPPPA SIACRVHAGP VRQQSTGPSE PGAFQPPPKP VIVDKHRPVE PERRFLSPEF IPRRGRTDP LKFQIERKDM LERRKVLHIP EFYVGSILRV TTADPYASGK ISQFLGICIQ RSGRGLGATF ILRNVIEGQG V EICFELYN ...文字列:
MAACIAAGHW AAMGLGRSFQ AARTLLPPPA SIACRVHAGP VRQQSTGPSE PGAFQPPPKP VIVDKHRPVE PERRFLSPEF IPRRGRTDP LKFQIERKDM LERRKVLHIP EFYVGSILRV TTADPYASGK ISQFLGICIQ RSGRGLGATF ILRNVIEGQG V EICFELYN PRVQEIQVVK LEKRLDDSLL YLRDALPEYS TFDVNMKPVV QEPNQKVPVN ELKVKMKPKP WSKRWERPNF NI KGIRFDL CLTEQQMKEA QKWNQPWLEF DMMREYDTSK IEAAIWKEIE ASKRS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19m

+
分子 #28: 39S ribosomal protein L20, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L20, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 17.479654 KDa
配列文字列:
MVFLTAQLWL RNRVTDRYFR IQEVLKHARH FRGRKNRCYR LAVRTVIRAF VKCTKARYLK KKNMRTLWIN RITAASQEHG LKYPALIGN LVKCQVELNR KVLADLAIYE PKTFKSLAAL ASRRRHEGFA AALGDGKEPE GIFSRVVQYH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20m

+
分子 #29: 39S ribosomal protein L21, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L21, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.847682 KDa
配列文字列: MAASSLTVTL GRLASACSHS ILRPSGPGAA SLWSASRRFN SQSTSYLPGY VPKTSLSSPP WPEVVLPDPV EETRHHAEVV KKVNEMIVT GQYGRLFAVV HFASRQWKVT SEDLILIGNE LDLACGERIR LEKVLLVGAD NFTLLGKPLL GKDLVRVEAT V IEKTESWP ...文字列:
MAASSLTVTL GRLASACSHS ILRPSGPGAA SLWSASRRFN SQSTSYLPGY VPKTSLSSPP WPEVVLPDPV EETRHHAEVV KKVNEMIVT GQYGRLFAVV HFASRQWKVT SEDLILIGNE LDLACGERIR LEKVLLVGAD NFTLLGKPLL GKDLVRVEAT V IEKTESWP RIIMRFRKRK NFKKKRIVTT PQTVLRINSI EIAPCLL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21m

+
分子 #30: 39S ribosomal protein L22, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L22, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.683732 KDa
配列文字列: MAAAVLGQLG ALWIHNLRSR GKLALGVLPQ SYIHTSASLD ISRKWEKKNK IVYPPQLPGE PRRPAEIYHC RRQIKYSKDK MWYLAKLIR GMSIDQALAQ LEFNDKKGAK IIKEVLLEAQ DMAVRDHNVE FRSNLYIAES TSGRGQCLKR IRYHGRGRFG I MEKVYCHY ...文字列:
MAAAVLGQLG ALWIHNLRSR GKLALGVLPQ SYIHTSASLD ISRKWEKKNK IVYPPQLPGE PRRPAEIYHC RRQIKYSKDK MWYLAKLIR GMSIDQALAQ LEFNDKKGAK IIKEVLLEAQ DMAVRDHNVE FRSNLYIAES TSGRGQCLKR IRYHGRGRFG I MEKVYCHY FVKLVEGPPP PPEPPKTAVA HAKEYIQQLR SRTIVHTL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22m

+
分子 #31: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L23, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 17.807189 KDa
配列文字列:
MARNVVYPLY RLGGPQLRVF RTNFFIQLVR PGVAQPEDTV QFRIPMEMTR VDLRNYLEGI YNVPVAAVRT RVQHGSNKRR DHRNVRIKK PDYKVAYVQL AHGQTFTFPD LFPEKDESPE GSAADDLYSM LEEERQQRQS SDPRRGGVPS WFGL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23m

+
分子 #32: 39S ribosomal protein L24, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L24, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 24.953875 KDa
配列文字列: MRLSALLALA SKVTLPPHYR YGMSPPGSVA DKRKNPPWIR RRPVVVEPIS DEDWYLFCGD TVEILEGKDA GKQGKVVQVI RQRNWVVVG GLNTHYRYIG KTMDYRGTMI PSEAPLLHRQ VKLVDPMDRK PTEIEWRFTE AGERVRVSTR SGRIIPKPEF P RADGIVPE ...文字列:
MRLSALLALA SKVTLPPHYR YGMSPPGSVA DKRKNPPWIR RRPVVVEPIS DEDWYLFCGD TVEILEGKDA GKQGKVVQVI RQRNWVVVG GLNTHYRYIG KTMDYRGTMI PSEAPLLHRQ VKLVDPMDRK PTEIEWRFTE AGERVRVSTR SGRIIPKPEF P RADGIVPE TWIDGPKDTS VEDALERTYV PCLKTLQEEV MEAMGIKETR KYKKVYWY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24m

+
分子 #33: 39S ribosomal protein L27, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L27, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 16.102859 KDa
配列文字列:
MASVVLALRT RTAVTSLLSP TPATALAVRY ASKKSGGSSK NLGGKSSGRR QGIKKMEGHY VHAGNIIATQ RHFRWHPGAH VGVGKNKCL YALEEGIVRY TKEVYVPHPR NTEAVDLITR LPKGAVLYKT FVHVVPAKPE GTFKLVAML

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27m

+
分子 #34: 39S ribosomal protein L28, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L28, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 30.202867 KDa
配列文字列: MPLHKYPVWL WKRLQLREGI CSRLPGHYLR SLEEERTPTP VHYRPHGAKF KINPKNGQRE RVEDVPIPIY FPPESQRGLW GGEGWILGQ IYANNDKLSK RLKKVWKPQL FEREFYSEIL DKKFTVTVTM RTLDLIDEAY GLDFYILKTP KEDLCSKFGM D LKRGMLLR ...文字列:
MPLHKYPVWL WKRLQLREGI CSRLPGHYLR SLEEERTPTP VHYRPHGAKF KINPKNGQRE RVEDVPIPIY FPPESQRGLW GGEGWILGQ IYANNDKLSK RLKKVWKPQL FEREFYSEIL DKKFTVTVTM RTLDLIDEAY GLDFYILKTP KEDLCSKFGM D LKRGMLLR LARQDPQLHP EDPERRAAIY DKYKEFAIPE EEAEWVGLTL EEAIEKQRLL EEKDPVPLFK IYVAELIQQL QQ QALSEPA VVQKRASGQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28m

+
分子 #35: 39S ribosomal protein L47, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L47, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.508535 KDa
配列文字列: MAAAGLALLC RRVSSALKSS RSLITPQVPA CTGFFLSLLP KSTPNVTSFH QYRLLHTTLS RKGLEEFFDD PKNWGQEKVK SGAAWTCQQ LRNKSNEDLH KLWYVLLKER NMLLTLEQEA KRQRLPMPSP ERLDKVVDSM DALDKVVQER EDALRLLQTG Q ERARPGAW ...文字列:
MAAAGLALLC RRVSSALKSS RSLITPQVPA CTGFFLSLLP KSTPNVTSFH QYRLLHTTLS RKGLEEFFDD PKNWGQEKVK SGAAWTCQQ LRNKSNEDLH KLWYVLLKER NMLLTLEQEA KRQRLPMPSP ERLDKVVDSM DALDKVVQER EDALRLLQTG Q ERARPGAW RRDIFGRIIW HKFKQWVIPW HLNKRYNRKR FFALPYVDHF LRLEREKRAR IKARKENLER KKAKILLKKF PH LAEAQKS SLV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29m

+
分子 #36: 39S ribosomal protein L30, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L30, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 18.582812 KDa
配列文字列:
MAGILRLVVQ WPPGRLQTVT KGVESLICTD WIRHKFTRSR IPEKVFQASP EDHEKYGGDP QNPHKLHIVT RIKSTRRRPY WEKDIIKML GLEKAHTPQV HKNIPSVNAK LKVVKHLIRI KPLKLPQGLP AEENMSNTCL KSTGELVVQW HLKPVEQKAH E S

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30m

+
分子 #37: 39S ribosomal protein L42, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L42, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 16.691176 KDa
配列文字列:
MAVAAVKWVM SKRTILKHLF PVQNGALYCV CHKSTYSPLP DDYNCNVELA LTSDGRTIVC YHPSVDIPYE HTKPIPRPDP VHNNEETHD QVLKTRLEEK VEHLEEGPMI EQLSKMFFTT KHRWYPHGRY HRCRKNLNPP KDR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL42

+
分子 #38: 39S ribosomal protein L43, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L43, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.457789 KDa
配列文字列: MTARGTPSRF LASVLHNGLG RYVQQLQRLS FSVSRDGASS RGAREFVERE VIDFARRNPG VVIYVNSRPC CVPRVVAEYL NGAVREESI HCKSVEEIST LVQKLADQSG LDVIRIRKPF HTDNPSIQGQ WHPFTNKPTT FRGLRPREVQ DPAPAQDTGL R LSAVAPQI ...文字列:
MTARGTPSRF LASVLHNGLG RYVQQLQRLS FSVSRDGASS RGAREFVERE VIDFARRNPG VVIYVNSRPC CVPRVVAEYL NGAVREESI HCKSVEEIST LVQKLADQSG LDVIRIRKPF HTDNPSIQGQ WHPFTNKPTT FRGLRPREVQ DPAPAQDTGL R LSAVAPQI LLPGWPDPPD LPTVDPISSS LTSAPAPMLS AVSCLPIVPA LTTVCSA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL43

+
分子 #39: 39S ribosomal protein L44, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L44, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
EC番号: 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; 5'-リン酸モノエステル産生エンドリボヌクレアーゼ
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 37.583312 KDa
配列文字列: MASGLVRLLQ QGHRCLLAPV APKLVPPVRG VKKGFRAAFR FQKELERQRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EIQAFGHRLQ ENFSLDLLK TAFVNSCYIK SEEAKRQQLG IEKEAVLLNL KSNQELSEQG TSFSQTCLTQ FLEDEYPDMP TEGIKNLVDF L TGEEVVCH ...文字列:
MASGLVRLLQ QGHRCLLAPV APKLVPPVRG VKKGFRAAFR FQKELERQRL LRCPPPPVRR SEKPNWDYHA EIQAFGHRLQ ENFSLDLLK TAFVNSCYIK SEEAKRQQLG IEKEAVLLNL KSNQELSEQG TSFSQTCLTQ FLEDEYPDMP TEGIKNLVDF L TGEEVVCH VARNLAVEQL TLSEEFPVPP AVLQQTFFAV IGALLQSSGP ERTALFIRDF LITQMTGKEL FEMWKIINPM GL LVEELKK RNVSAPESRL TRQSGGTTAL PLYFVGLYCD KKLIAEGPGE TVLVAEEEAA RVALRKLYGF TENRRPWNYS KPK ETLRAE KSITAS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL44

+
分子 #40: 39S ribosomal protein L45, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L45, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 35.402918 KDa
配列文字列: MAAPIPQGFS CLSRFLGWWF RQPVLVTQSA AIVPVRTKKR FTPPIYQPKF KTEKEFMQHA RKAGLVIPPE KSDRSIHLAC TAGIFDAYV PPEGDARISS LSKEGLIERT ERMKKTMASQ VSIRRIKDYD ANFKIKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTEHC ...文字列:
MAAPIPQGFS CLSRFLGWWF RQPVLVTQSA AIVPVRTKKR FTPPIYQPKF KTEKEFMQHA RKAGLVIPPE KSDRSIHLAC TAGIFDAYV PPEGDARISS LSKEGLIERT ERMKKTMASQ VSIRRIKDYD ANFKIKDFPE KAKDIFIEAH LCLNNSDHDR L HTLVTEHC FPDMTWDIKY KTVRWSFVES LEPSHVVQVR CSSMMNQGNV YGQITVRMHT RQTLAIYDRF GRLMYGQEDV PK DVLEYVV FEKQLTNPYG SWRMHTKIVP PWAPPKQPIL KTVMIPGPQL KPEEEYEEAQ GEAQKPQLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL45

+
分子 #41: 39S ribosomal protein L46, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 31.748107 KDa
配列文字列: MAAPVRRTLL GVAGGWRRFE RLWAGSLSSR SLALAAAPSS NGSPWRLLGA LCLQRPPVVS KPLTPLQEEM ASLLQQIEIE RSLYSDHEL RALDENQRLA KKKADLHDEE DEQDILLAQD LEDMWEQKFL QFKLGARITE ADEKNDRTSL NRKLDRNLVL L VREKFGDQ ...文字列:
MAAPVRRTLL GVAGGWRRFE RLWAGSLSSR SLALAAAPSS NGSPWRLLGA LCLQRPPVVS KPLTPLQEEM ASLLQQIEIE RSLYSDHEL RALDENQRLA KKKADLHDEE DEQDILLAQD LEDMWEQKFL QFKLGARITE ADEKNDRTSL NRKLDRNLVL L VREKFGDQ DVWILPQAEW QPGETLRGTA ERTLATLSEN NMEAKFLGNA PCGHYTFKFP QAMRTESNLG AKVFFFKALL LT GDFSQAG NKGHHVWVTK DELGDYLKPK YLAQVRRFVS DL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL46

+
分子 #42: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L48, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.970814 KDa
配列文字列: MSGTLEKVLC LRNNTIFKQA FSLLRFRTSG EKPIYSVGGI LLSISRPYKT KPTHGIGKYK HLIKAEEPKK KKGKVEVRAI NLGTDYEYG VLNIHLTAYD MTLAESYAQY VHNLCNSLSI KVEESYAMPT KTIEVLQLQD QGSKMLLDSV LTTHERVVQI S GLSATFAE ...文字列:
MSGTLEKVLC LRNNTIFKQA FSLLRFRTSG EKPIYSVGGI LLSISRPYKT KPTHGIGKYK HLIKAEEPKK KKGKVEVRAI NLGTDYEYG VLNIHLTAYD MTLAESYAQY VHNLCNSLSI KVEESYAMPT KTIEVLQLQD QGSKMLLDSV LTTHERVVQI S GLSATFAE IFLEIIQSSL PEGVRLSVKE HTEEDFKGRF KARPELEELL AKLK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL48

+
分子 #43: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L49, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 19.225043 KDa
配列文字列:
MAATMFRATL RGWRTGVQRG CGLRLLSQTQ GPPDYPRFVE SVDEYQFVER LLPATRIPDP PKHEHYPTPS GWQPPRDPPP NLPYFVRRS RMHNIPVYKD ITHGNRQMTV IRKVEGDIWA LQKDVEDFLS PLLGKTPVTQ VNEVTGTLRI KGYFDQELKA W LLEKGF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL49

+
分子 #44: 39S ribosomal protein L50, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L50, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 18.349943 KDa
配列文字列:
MAARSVSGIT RRVFMWTVSG TPCREFWSRF RKEKEPVVVE TVEEKKEPIL VCPPLRSRAY TPPEDLQSRL ESYVKEVFGS SLPSNWQDI SLEDSRLKFN LLAHLADDLG HVVPNSRLHQ MCRVRDVLDF YNVPIQDRSK FDELSASNLP PNLKITWSY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL50

+
分子 #45: 39S ribosomal protein L51, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L51, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.125917 KDa
配列文字列:
MAGNLLSGAG RRLWDWVPLA CRSFSLGVPR LIGIRLTLPP PKVVDRWNEK RAMFGVYDNI GILGNFEKHP KELIRGPIWL RGWKGNELQ RCIRKRKMVG SRMFADDLHN LNKRIRYLYK HFNRHGKFR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL51

+
分子 #46: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L52, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 13.682658 KDa
配列文字列:
MAALGTVLFT GVRRLHCSVA AWAGGQWRLQ QGLAANPSGY GPLTELPDWS YADGRPAPPM KGQLRRKAER ETFARRVVLL SQEMDAGLQ AWQLRQQKLQ EEQRKQENAL KPKGASLKSP LPSQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL52

+
分子 #47: 39S ribosomal protein L53, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L53, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 12.125859 KDa
配列文字列:
MAAALARLGL RPVKQVRVQF CPFEKNVEST RTFLQTVSSE KVRSTNLNCS VIADVRHDGS EPCVDVLFGD GHRLIMRGAH LTALEMLTA FASHIRARDA AGSGDKPGAD TGR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL53

+
分子 #48: 39S ribosomal protein L55, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein L55, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.160433 KDa
配列文字列:
MAAVGSLLGR LRQSTVKATG PALRRLHTSS WRADSSRASL TRVHRQAYAR LYPVLLVKQD GSTIHIRYRE PRRMLAMPID LDTLSPEER RARLRKREAQ LQSRKEYEQE LSDDLHVERY RQFWTRTKK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL55

+
分子 #49: Ribosomal protein 63, mitochondrial

分子名称: Ribosomal protein 63, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 12.292333 KDa
配列文字列:
MFLTALLWRG RIPGRQWIGK HRRPRFVSLR AKQNMIRRLE IEAENHYWLS MPYMTREQER GHAAVRRREA FEAIKAAATS KFPPHRFIA DQLDHLNVTK KWS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL63

+
分子 #50: Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial

分子名称: Peptidyl-tRNA hydrolase ICT1, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO / EC番号: peptidyl-tRNA hydrolase
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.674203 KDa
配列文字列: MAATRCLRWG LSRAGVWLLP PPARCPRRAL HKQKDGTEFK SIYSLDKLYP ESQGSDTAWR VPNGAKQADS DIPLDRLTIS YCRSSGPGG QNVNKVNSKA EVRFHLATAE WIAEPVRQKI AITHKNKINR LGELILTSES SRYQFRNLAD CLQKIRDMIT E ASQTPKEP ...文字列:
MAATRCLRWG LSRAGVWLLP PPARCPRRAL HKQKDGTEFK SIYSLDKLYP ESQGSDTAWR VPNGAKQADS DIPLDRLTIS YCRSSGPGG QNVNKVNSKA EVRFHLATAE WIAEPVRQKI AITHKNKINR LGELILTSES SRYQFRNLAD CLQKIRDMIT E ASQTPKEP TKEDVKLHRI RIENMNRERL RQKRIHSAVK TSRRVDMD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL62

+
分子 #51: Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1

分子名称: Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 25.426895 KDa
配列文字列: MAASVRQARS LLGVAATLAP GSRGYRARPP PRRRPGPRWP DPEDLLTPRW QLGPRYAAKQ FARYGAASGV VPGSLWPSPE QLRELEAEE REWYPSLATM QESLRVKQLA EEQKRREREQ HIAECMAKMP QMIVNWQQQQ RENWEKAQAD KERRARLQAE A QELLGYQV ...文字列:
MAASVRQARS LLGVAATLAP GSRGYRARPP PRRRPGPRWP DPEDLLTPRW QLGPRYAAKQ FARYGAASGV VPGSLWPSPE QLRELEAEE REWYPSLATM QESLRVKQLA EEQKRREREQ HIAECMAKMP QMIVNWQQQQ RENWEKAQAD KERRARLQAE A QELLGYQV DPRSARFQEL LQDLEKKERK RLKEEKQKRK KEARAAALAA AVAQDPAASG APSS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL64

+
分子 #52: 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.224078 KDa
配列文字列: MAALKALVSG CGRLLRGLLA GPAATSWSRL PARGFREVVE TQEGKTTIIE GRITATPKES PNPPNPSGQC PICRWNLKHK YNYDDVLLL SQFIRPHGGM LPRKITGLCQ EEHRKIEECV KMAHRAGLLP NHRPRLPEGV VPKSKPQLNR YLTRWAPGSV K PIYKKGPR ...文字列:
MAALKALVSG CGRLLRGLLA GPAATSWSRL PARGFREVVE TQEGKTTIIE GRITATPKES PNPPNPSGQC PICRWNLKHK YNYDDVLLL SQFIRPHGGM LPRKITGLCQ EEHRKIEECV KMAHRAGLLP NHRPRLPEGV VPKSKPQLNR YLTRWAPGSV K PIYKKGPR WNRVRMPVGS PLLRDNVCYS RTPWKLYH

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL66

+
分子 #53: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial

分子名称: 39S ribosomal protein S30, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 50.429578 KDa
配列文字列: MAAARCWRPL LRGPRLSLHT AANAAATATE TTCQDVAATP VARYPPIVAS MTADSKAARL RRIERWQATV HAAESVDEKL RILTKMQFM KYMVYPQTFA LNADRWYQYF TKTVFLSGLP PPPAEPEPEP EPEPEPALDL AALRAVACDC LLQEHFYLRR R RRVHRYEE ...文字列:
MAAARCWRPL LRGPRLSLHT AANAAATATE TTCQDVAATP VARYPPIVAS MTADSKAARL RRIERWQATV HAAESVDEKL RILTKMQFM KYMVYPQTFA LNADRWYQYF TKTVFLSGLP PPPAEPEPEP EPEPEPALDL AALRAVACDC LLQEHFYLRR R RRVHRYEE SEVISLPFLD QLVSTLVGLL SPHNPALAAA ALDYRCPVHF YWVRGEEIIP RGHRRGRIDD LRYQIDDKPN NQ IRISKQL AEFVPLDYSV PIEIPTIKCK PDKLPLFKRQ YENHIFVGSK TADPCCYGHT QFHLLPDKLR RERLLRQNCA DQI EVVFRA NAIASLFAWT GAQAMYQGFW SEADVTRPFV SQAVITDGKY FSFFCYQLNT LALTTQADQN NPRKNICWGT QSKP LYETI EDNDVKGFND DVLLQIVHFL LNRPKEEKSQ LLEN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL65

+
分子 #54: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1

分子名称: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 26.203076 KDa
配列文字列: MGPGGRVARL LAPLMWRRAV SSVAGSAVGA EPGLRLLAVQ RLPVGAAFCR ACQTPNFVRG LHSEPGLEER AEGTVNEGRP ESDAADHTG PKFDIDMMVS LLRQENARDI CVIQVPPEMR YTDYFVIVSG TSTRHLHAMA FYVVKMYKHL KCKRDPHVKI E GKDTDDWL ...文字列:
MGPGGRVARL LAPLMWRRAV SSVAGSAVGA EPGLRLLAVQ RLPVGAAFCR ACQTPNFVRG LHSEPGLEER AEGTVNEGRP ESDAADHTG PKFDIDMMVS LLRQENARDI CVIQVPPEMR YTDYFVIVSG TSTRHLHAMA FYVVKMYKHL KCKRDPHVKI E GKDTDDWL CVDFGSMVIH LMLPETREIY ELEKLWTLRS YDDQLAQIAP ETVPEDFILG IEDDTSSVTP VELKCE

UniProtKB: Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1

+
分子 #55: MIEF1 upstream open reading frame protein

分子名称: MIEF1 upstream open reading frame protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 8.460787 KDa
配列文字列:
MAPWSREAVL SLYRALLRQG RQLRYTDRDF YFASIRREFR KNQKLEDAEA RERQLEKGLV FLNGKLGRII

UniProtKB: Mitochondrial ribosome and complex I assembly factor AltMIEF1

+
分子 #56: Acyl carrier protein, mitochondrial

分子名称: Acyl carrier protein, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 17.434273 KDa
配列文字列:
MASRVLSAYV SRLPAAFAPL PRVRMLAVAR PLSTALCSAG TQTRLGTLQP ALVLAQVPGR VTQLCRQYSD MPPLTLEGIQ DRVLYVLKL YDKIDPEKLS VNSHFMKDLG LDSLDQVEII MAMEDEFGFE IPDIDAEKLM CPQEIVDYIA DKKDVYE

UniProtKB: Acyl carrier protein, mitochondrial

+
分子 #11: 16S ribosomal RNA

分子名称: 16S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 11 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 500.019594 KDa
配列文字列: GCUAAACCUA GCCCCAAACC CACUCCACCU UACUACCAGA CAACCUUAGC CAAACCAUUU ACCCAAAUAA AGUAUAGGCG AUAGAAAUU GAAACCUGGC GCAAUAGAUA UAGUACCGCA AGGGAAAGAU GAAAAAUUAU AACCAAGCAU AAUAUAGCAA G GACUAACC ...文字列:
GCUAAACCUA GCCCCAAACC CACUCCACCU UACUACCAGA CAACCUUAGC CAAACCAUUU ACCCAAAUAA AGUAUAGGCG AUAGAAAUU GAAACCUGGC GCAAUAGAUA UAGUACCGCA AGGGAAAGAU GAAAAAUUAU AACCAAGCAU AAUAUAGCAA G GACUAACC CCUAUACCUU CUGCAUAAUG AAUUAACUAG AAAUAACUUU GCAAGGAGAG CCAAAGCUAA GACCCCCGAA AC CAGACGA GCUACCUAAG AACAGCUAAA AGAGCACACC CGUCUAUGUA GCAAAAUAGU GGGAAGAUUU AUAGGUAGAG GCG ACAAAC CUACCGAGCC UGGUGAUAGC UGGUUGUCCA AGAUAGAAUC UUAGUUCAAC UUUAAAUUUG CCCACAGAAC CCUC UAAAU CCCCUUGUAA AUUUAACUGU UAGUCCAAAG AGGAACAGCU CUUUGGACAC UAGGAAAAAA CCUUGUAGAG AGAGU AAAA AAUUUAACAC CCAUAGUAGG CCUAAAAGCA GCCACCAAUU AAGAAAGCGU UCAAGCUCAA CACCCACUAC CUAAAA AAU CCCAAACAUA UAACUGAACU CCUCACACCC AAUUGGACCA AUCUAUCACC CUAUAGAAGA ACUAAUGUUA GUAUAAG UA ACAUGAAAAC AUUCUCCUCC GCAUAAGCCU GCGUCAGAUU AAAACACUGA ACUGACAAUU AACAGCCCAA UAUCUACA A UCAACCAACA AGUCAUUAUU ACCCUCACUG UCAACCCAAC ACAGGCAUGC UCAUAAGGAA AGGUUAAAAA AAGUAAAAG GAACUCGGCA AAUCUUACCC CGCCUGUUUA CCAAAAACAU CACCUCUAGC AUCACCAGUA UUAGAGGCAC CGCCUGCCCA GUGACACAU GUUUAACGGC CGCGGUACCC UAACCGUGCA AAGGUAGCAU AAUCACUUGU UCCUUAAAUA GGGACCUGUA U GAAUGGCU CCACGAGGGU UCAGCUGUCU CUUACUUUUA ACCAGUGAAA UUGACCUGCC CGUGAAGAGG CGGGCAUAAC AC AGCAAGA CGAGAAGACC CUAUGGAGCU UUAAUUUAUU AAUGCAAACA GUACCUAACA AACCCACAGG UCCUAAACUA CCA AACCUG CAUUAAAAAU UUCGGUUGGG GCGACCUCGG AGCAGAACCC AACCUCCGAG CAGUACAUGC UAAGACUUCA CCAG UCAAA GCGAACUACU AUACUCAAUU GAUCCAAUAA CUUGACCAAC GGAACAAGUU ACCCUAGGGA UAACAGCGCA AUCCU AUUC UAGAGUCCAU AUCAACAAUA GGGUUUACGA CCUCGAUGUU GGAUCAGGAC AUCCCGAUGG UGCAGCCGCU AUUAAA GGU UCGUUUGUUC AACGAUUAAA GUCCUACGUG AUCUGAGUUC AGACCGGAGU AAUCCAGGUC GGUUUCUAUC UACUUUC AA AUUCCUCCCU GUACGAAAGG ACAAGAGAAA UAAGGCCUAC UUCACAAAGC GCCUUCCCCC GUAAAUGAUA UCAUCUCA A CUUAGUAUUA UACCCACACC CACCCAAGAA CAGGGUUU

GENBANK: GENBANK: KU686631.1

+
分子 #12: mitochondrial tRNAVal

分子名称: mitochondrial tRNAVal / タイプ: rna / ID: 12 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.022131 KDa
配列文字列:
CAGAGUGUAG CUUAACACAA AGCACCCAAC UUACACUUAG GAGAUUUCAA CUUAACUUGA CCGCUCUGA

+
分子 #57: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 57 / コピー数: 3 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #58: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 58 / コピー数: 61 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.4
グリッドモデル: Quantifoil R3.5/1 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 0.25 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277.15 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
特殊光学系エネルギーフィルター - 名称: GIF Bioquantum / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K3 BIOQUANTUM (6k x 4k)
平均電子線量: 36.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系最大 デフォーカス（補正後）: 2.8000000000000003 µm
最小 デフォーカス（補正後）: 0.3 µm / 照射モード: SPOT SCAN / 撮影モード: BRIGHT FIELD / 倍率（公称値）: 81000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 9378438
初期モデルモデルのタイプ: INSILICO MODEL / In silico モデル: ab initio
最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.2 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION / 使用した粒子像数: 1060638
初期 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 3次元分類クラス数: 4 / ソフトウェア - 名称: RELION
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

5ool


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
精密化空間: REAL / プロトコル: FLEXIBLE FIT
得られたモデル

PDB-7of0:
Structure of a human mitochondrial ribosome large subunit assembly intermediate in complex with MTERF4-NSUN4 (dataset1).

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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