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- EMDB-11437: Structure of the Paranosema locustae ribosome in complex with Lso2 -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-11437
タイトルStructure of the Paranosema locustae ribosome in complex with Lso2
マップデータCombined focused maps, state 2
試料
  • 複合体: Lso2 bound to the ribosome of Paranosema locustae
    • RNA: x 3種
    • タンパク質・ペプチド: x 71種
  • リガンド: x 3種
キーワードMicrosporidia / Pathogen / Ribosome / Hibernation / Genome Compaction
生物種Paranosema locustae (菌類)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.9 Å
データ登録者Ehrenbolger K / Jespersen N / Sharma H / Sokolova YY / Tokarev YS / Vossbrinck CR / Barandun J
資金援助 スウェーデン, 1件
OrganizationGrant number国
Swedish Research Council2019-02011 スウェーデン
引用ジャーナル: PLoS Biol / 年: 2020
タイトル: Differences in structure and hibernation mechanism highlight diversification of the microsporidian ribosome.
著者: Kai Ehrenbolger / Nathan Jespersen / Himanshu Sharma / Yuliya Y Sokolova / Yuri S Tokarev / Charles R Vossbrinck / Jonas Barandun /
要旨: Assembling and powering ribosomes are energy-intensive processes requiring fine-tuned cellular control mechanisms. In organisms operating under strict nutrient limitations, such as pathogenic ...Assembling and powering ribosomes are energy-intensive processes requiring fine-tuned cellular control mechanisms. In organisms operating under strict nutrient limitations, such as pathogenic microsporidia, conservation of energy via ribosomal hibernation and recycling is critical. The mechanisms by which hibernation is achieved in microsporidia, however, remain poorly understood. Here, we present the cryo-electron microscopy structure of the ribosome from Paranosema locustae spores, bound by the conserved eukaryotic hibernation and recycling factor Lso2. The microsporidian Lso2 homolog adopts a V-shaped conformation to bridge the mRNA decoding site and the large subunit tRNA binding sites, providing a reversible ribosome inactivation mechanism. Although microsporidian ribosomes are highly compacted, the P. locustae ribosome retains several rRNA segments absent in other microsporidia, and represents an intermediate state of rRNA reduction. In one case, the near complete reduction of an expansion segment has resulted in a single bound nucleotide, which may act as an architectural co-factor to stabilize a protein-protein interface. The presented structure highlights the reductive evolution in these emerging pathogens and sheds light on a conserved mechanism for eukaryotic ribosome hibernation.
履歴
登録2020年7月21日-
ヘッダ(付随情報) 公開2020年11月4日-
マップ公開2020年11月4日-
更新2024年5月1日-
現状2024年5月1日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.011
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.011
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6zu5
  • 表面レベル: 0.011
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_11437.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_11437.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Combined focused maps, state 2
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.04 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.011 / ムービー #1: 0.011
最小 - 最大-0.029643921 - 0.07906209
平均 (標準偏差)0.0004284839 (±0.0030867218)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 416.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.041.041.04
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z416.000416.000416.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ400400400
MAP C/R/S321
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS400400400
D min/max/mean-0.0300.0790.000

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添付データ

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追加マップ: Additional map 3 (SSU head focused)

ファイルemd_11437_additional_1.map
注釈Additional map 3 (SSU head focused)
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: Additional map 1 (LSU focused)

ファイルemd_11437_additional_2.map
注釈Additional map 1 (LSU focused)
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
追加マップ: Additional map 2 (SSU body focused)

ファイルemd_11437_additional_3.map
注釈Additional map 2 (SSU body focused)
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Combined focused half map 1, state 2

ファイルemd_11437_half_map_1.map
注釈Combined focused half map 1, state 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: Combined focused half map 2, state 2

ファイルemd_11437_half_map_2.map
注釈Combined focused half map 2, state 2
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Lso2 bound to the ribosome of Paranosema locustae

全体名称: Lso2 bound to the ribosome of Paranosema locustae
要素
  • 複合体: Lso2 bound to the ribosome of Paranosema locustae
    • RNA: 25S rRNA
    • RNA: 5S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: uL2
    • タンパク質・ペプチド: uL15
    • タンパク質・ペプチド: uL3
    • タンパク質・ペプチド: eL29
    • タンパク質・ペプチド: uL4
    • タンパク質・ペプチド: eL30
    • タンパク質・ペプチド: uL18
    • タンパク質・ペプチド: eL31
    • タンパク質・ペプチド: eL6
    • タンパク質・ペプチド: eL32
    • タンパク質・ペプチド: uL30
    • タンパク質・ペプチド: eL33
    • タンパク質・ペプチド: eL8
    • タンパク質・ペプチド: eL34
    • タンパク質・ペプチド: uL6
    • タンパク質・ペプチド: uL29
    • タンパク質・ペプチド: uL16
    • タンパク質・ペプチド: eL36
    • タンパク質・ペプチド: uL5
    • タンパク質・ペプチド: eL37
    • タンパク質・ペプチド: eL13
    • タンパク質・ペプチド: eL39
    • タンパク質・ペプチド: eL14
    • タンパク質・ペプチド: eL40
    • タンパク質・ペプチド: eL15
    • タンパク質・ペプチド: Lso2
    • タンパク質・ペプチド: uL13
    • タンパク質・ペプチド: eL42
    • タンパク質・ペプチド: uL22
    • タンパク質・ペプチド: eL43
    • タンパク質・ペプチド: eL18
    • タンパク質・ペプチド: eL19
    • タンパク質・ペプチド: eL20
    • タンパク質・ペプチド: eL21
    • タンパク質・ペプチド: eL22
    • タンパク質・ペプチド: uL14
    • タンパク質・ペプチド: eL24
    • タンパク質・ペプチド: uL23
    • タンパク質・ペプチド: uL24
    • タンパク質・ペプチド: eL27
    • RNA: 18S rRNA
    • タンパク質・ペプチド: uS2
    • タンパク質・ペプチド: eS26
    • タンパク質・ペプチド: eS1
    • タンパク質・ペプチド: eS27
    • タンパク質・ペプチド: uS5
    • タンパク質・ペプチド: eS28
    • タンパク質・ペプチド: uS3
    • タンパク質・ペプチド: uS14
    • タンパク質・ペプチド: eS4
    • タンパク質・ペプチド: eS30
    • タンパク質・ペプチド: uS7
    • タンパク質・ペプチド: eS6
    • タンパク質・ペプチド: RACK1
    • タンパク質・ペプチド: eS7
    • タンパク質・ペプチド: eS8
    • タンパク質・ペプチド: uS4
    • タンパク質・ペプチド: eS10
    • タンパク質・ペプチド: uS17
    • タンパク質・ペプチド: uS15
    • タンパク質・ペプチド: uS11
    • タンパク質・ペプチド: uS19
    • タンパク質・ペプチド: uS9
    • タンパク質・ペプチド: eS17
    • タンパク質・ペプチド: uS13
    • タンパク質・ペプチド: eS19
    • タンパク質・ペプチド: uS10
    • タンパク質・ペプチド: eS21
    • タンパク質・ペプチド: uS8
    • タンパク質・ペプチド: uS12
    • タンパク質・ペプチド: eS24
    • タンパク質・ペプチド: eS25
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: ADENOSINE MONOPHOSPHATE

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超分子 #1: Lso2 bound to the ribosome of Paranosema locustae

超分子名称: Lso2 bound to the ribosome of Paranosema locustae / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#74
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)

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分子 #1: 25S rRNA

分子名称: 25S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 854.380562 KDa
配列文字列: ACACACCCCG GUGGGGGAUC CCUCGGCCUG CGCGCCGGGC AAGGACGCGG ACGCACGCGA UAGACGGCAC GAUCCUCAGA CACGACUGC CGGUCUCCGA CAGCGGCGCA GCCGCAGACA ACCCCCCGGA CUUAAGCAUA UCACUAGGGG GCGGAGAAGA A ACCAACAG ...文字列:
ACACACCCCG GUGGGGGAUC CCUCGGCCUG CGCGCCGGGC AAGGACGCGG ACGCACGCGA UAGACGGCAC GAUCCUCAGA CACGACUGC CGGUCUCCGA CAGCGGCGCA GCCGCAGACA ACCCCCCGGA CUUAAGCAUA UCACUAGGGG GCGGAGAAGA A ACCAACAG GGAUUCCUGC AGUAGCGGCG AGCGAACAGG GACGAGCCCG CAUGGCAAUC GGCAUCGCCG AGUUGUGACA GC GCACCGC GAACGCCCCG GACAGGGCGG CCACAGAGGG CGACAGCCCC GUAGCAGCGC GCAGCGGAGC GAGUAGCGCU GCU UGGUCA UGCAGCGCGA AGCGGUGGUG GCGCCAUCGA AGGCUAAAUA CGCCGCAGGA CCGAUAGCGC ACAAGUACCG CGAG GGGAC GGCGACGAGC AGCCCGCAGG GGCGGCGAAA GCGUGAAACC ACCGGGGCGC CCACUUGUGG GCCCCGUCUU GAAAC ACGG ACCAAGGAGU GCAUGUGCGC AGCGAGUCCG CUCCGCGGCG CAGCGAAGGC CAUCGAGCUG CGCACAUGCG ACCCGA UAG GCAGUGAACU ACGCCUGGGC AGGGCGAAGC CCGCGGAAAC GCAGGUGGAG GCCCCGAGCC GUUCUGACGU GCAAUUC GA UGGCGCGACC UGGGCGUAGC GGCGAAAGAC CAAUCGAACU GCCUGGUAGC UGGUUCCCUC CGAAAUGUCC CGCAGGAC A GCGGGCGCCC CGCAGGUCUG CCGCGUAGAG CAAUGGCGCG GCGUCCGGCA GCGCCGGCGC ACCCCCAAAC UGCGAAGCG GCAGGGCGCG CGCAGCAGCG UGCGCGCGCA CAACUGCGGG CGCCUAGUGG GCCGCCGCUG GUAAGCAGCG CCGGCAAUGA GGACACAAC CUCGUGCGCG GGCAAGGGAC CCCAGCUGCG CACACAGACG AAGGGCGCGG GCGCGUCGCG ACAGCAGGGC G GUGGCCAU AGAGGUCGGC ACCCGCUAAG AACCGUGUUG CAACGUACCU GCCGAACACG CCCGCCCCGA AAAUGGACGG UG CUCAGCG CAGCCCCGAC CCCGCGCACG CACAGCGUGG UAGGAGGGCG CGCCGGCGCC GCAGAAGCGC AUGCGUGCGC AUG CGUGGA GGCACCCGCG GCGCAGAUCU UGGUGGCAGU AGCACACUCG GGCGCGAGCC CCGAGGGCCG GGAGACGGGU UCUU CCGCC AGGCCGCUCC GCGGAAGGUG AGCCGGGUCC UAAGGACGCG CUGGCCCGCA ACCGACAGGC AAGCGGGCAC ACAUU CCCG CGCCGUGUGC CAUGCGGCAA CGCACCGUGC GCGGCCGGGC GCAGGGCUGG CGCCGGGGGC CCUCCUCCCC CGCAAA GCG GCCCGCCUGC GGACUCUUGC AGCACGAGGC AGCCCGCGCC GCGUGGCGGG GCCGUCGCCG CGCGCCAGGA CUCGCCC CC CGUGAAGCCC CGCGCACGCA CACACACGCC CGUACCAAUC CGCACCAGGG CUCCAGGGCG CGCACCCCAC GGCCAGGG C CCACGCAGGU UUGGGAAUUC GGCAAGCUGG AUCCGCAACC UCGGGACAAG GAUUGGCUCC GGGCGCCGGA GCUGUCGCU UCCAAGGGGA AUCCGACUGU UUAGUAAAAA CAUAGCCUUG CGCCGCACGC AAGGUGAAUU CUGCCCAGUG CCCGGGACGU CACGCCGGC GCGACCCGCG CACGCACGGG UCAACGGCGG GAGUAACUAU GACUCUCUUA AGGUAGCCAA ACGCCUCGUC A UCUAAUUA GUGACGCGCA UGAAUGGAGC AACGAGAUUC CCACUGUCCC UACCUGCUCC CCAGCGAACC CACUGCCAAG GG AACGGGC UUGGCGCAGU CAGCGGGGAA AGAAGACCCU GUUGAGCUUG ACUCUAGUGU GGGGCCGCGG CGCGCCGCGC CGG CGUAGG CAGGUGGGAG GUGCGCCGUG AGUGAAAGAC CACUGCGCGC GCGCGCGCCC GCUUCGCGCA GCAACGCCCC CAGA UGGGG AGUUUGGCUG GGGCGGCACG UCUGCUAGAC CCCAACGCAG ACGUCCUACG GUGGGCUCAG CGCGGACAGA ACCCG CGCG UCGAGCACAA GGGCAAACGC CCGCCUCACG GCGCCCCCCC GGGUGCCGGC GGGAAACCGG GGCCUAGCGA UCCCUC GCG CAUGCACGCC GCGUCGCGGG GGUGGCUGAA AAGUUACCAC AGGGAUAACU GGCUUGUGGC GGCCAAGCGU CCGCAGC GA CGCCGCUUUU UGAUUCUUCG AUGUCGGCUC UUCCUAGCAU GGCGUGGCAG CGCGCGCCAA GUGUUGGAUU GUUCACCC A CUGACAGGGA ACGUGAGCUG GGUUUAGACC GUCGUGAGAC AGGUUAGUUU UACCCUACUG AGCGCGGACA CACCGGGCA GCGCGGGCUA GUACGAGAGG AACGCCCGUG CGGGGCCGCU GGUCCGCGCC UGUCCGACAG GGCAGGUGCG CCGCUACGCC CCGUGCGUG UACGGCUGGA CGCCUCUAAG CCGGAGCCGC CCCCCCGUGU GUCUAAACCC CUGGUUUCCG CCCCCCGCGA C CACGACGC GGCCGGGGGC UGGUGCUGUG CGCGUGCGAG CUCUGCGAGC CGCUGAGGCU UCCAGACCCC UGCGGGGUGU U

+
分子 #2: 5S rRNA

分子名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 38.434832 KDa
配列文字列:
AGCUGCGGUC AUAUCCACAG UAGAGCACCA GAACCCGUCA GAUCUCUGAA GUUAAGCCUG UGAGAGCCUG UGGAGUACUU GGGUGGGCG ACCACCUGGG AAAUGCAGGU ACUGUAGCUU

+
分子 #43: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 43 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 456.967562 KDa
配列文字列: CACCAGGUUG AUUCUGCCUG ACGUGUGCGC UAGUCUUGGG GACUUAGCCA UGCAAGCCAG CGAAGCGGCG CGGAGCGGCG GACGGCUCA GUAGGACGGC GAUAAUCCAC CCGCAGCAGA GACAAGGAUA ACCGCGGCAA GCUGCGGCUA AGACAUGGAC A GGCUGCGG ...文字列:
CACCAGGUUG AUUCUGCCUG ACGUGUGCGC UAGUCUUGGG GACUUAGCCA UGCAAGCCAG CGAAGCGGCG CGGAGCGGCG GACGGCUCA GUAGGACGGC GAUAAUCCAC CCGCAGCAGA GACAAGGAUA ACCGCGGCAA GCUGCGGCUA AGACAUGGAC A GGCUGCGG CGCGGGGAGG CGCGGGCAGC GGACAGGGAG CGGCUGCGGC GGAGUUGCUG GCCCAUCAGC UGGUAGGUAG GG UAAGGGC CUACCUAGGC GACGACGGGU GACGGGGGGU GAGAGCCCGG AACCGGAGAG GGAGCCUGAG AAACAGCUCC CAC GUCCAA GGACGGCAGC AGGCGCGGAA CUUGCCCAAU CCCGGCGGGG GAGGCAGCCA CAAGACGUGG GGGCCCGGAA CGCA CGGCA AAGGAGUGCG GGGCGACUGG AGGGCAAGUC UGGUGCCAGC AGCCGCGGUA AUUCCAGCUC CAGGAGCGCA CAUGA GUGU UGCUGCAGUU AAAACGUCCG UAGUCGGCCC GGGCGCGCUG UGAGGAAACC GCGGGGCCCA AGGCGGCGGG CAGCAC GGG AGCGGGGGCG ACAGGAACGG ACAACGGCCG CGGGAUCCGG GGGCGAGAGG UGAAAAUCGG GGACCCCGCG GGGACGG GC GGAAGCGAAG GCGGCGGCCG GGGACGUGUC CGUUGAUCAA GGACGAAGGC CGGAGGAUCA AAGAUGAUUA GAUACCGU C GUAGUUCCGG CAGUAAACGA UGCCGACGGG GCGAGGCCAG GGGGCUGUGU CCGGGAGAAA UUGGAGUGUU UGGGCUCUG GGGAUAGUAC GGUCGCAAGA CAGAAACUUA AAGAAAUUGA CGGAAGGACA CCACAAGGAG UGGAGUGUGC GGCUUAAUUU GACUCAACG CGGGGCAGCU UACCAGGGCC GGAUGCGCGG GAGAUUGGCG GCGGAGCGCC CCCGAGAUUG CGCAGGGAGU G GUGCAUGG CCGUUUGCAA CACGUGGGGU GACCUGUCUG GUUGAUUCCG ACAACGCGUG AGGCCUGGGG UGCAGCAGGG GC UGUGCGA CGGGCGGCGG CAAGCUGCAG GAGGGCAGGC GAAAACAGGU CAGUGAUGCC CUCAGAUGCU CUGGGCUGCA CGC GCACUA CAAUGGCGCG GCGAGCGGGA GUGCCGGGAG GCGCGGGCGA GGCCGUGGCG CAGCAGGGAU GGGGGCCUGG AAGG GUGCC CUGAACGAGG AAUUCCUAGU AGCCGCGGGU CACCAAGCCG CGGCGAAUGA GUCCCUGUUC UUUGUACACA CCGCC CGUC ACUACCUAAG AUGGAUGUGC AGGCGAGGAG GCUGGGCAGG CACCCGAGCC UGUGCAACUA GAUAAGGUAU AAGUCG UAA CAAGGCUGCA GUAGGUGAAC CUGCGGCAGG AUCACUA

+
分子 #3: uL2

分子名称: uL2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 26.693215 KDa
配列文字列: MSKVIRRLRL LKPHHRPKAM WKVGETRIPV VSETMHGVVS EIVHERGKVA PLAKIRVDTG KCVRRELLVA VEGNYVGQKV EIGDSVPVA VGNALKLKNI PEGTGVCSVE RRPYDGGKMA KSSGAYVTVV GHNRDTNITT VRLPSGEKRS VSSECRAVVG V IAGGGVNE ...文字列:
MSKVIRRLRL LKPHHRPKAM WKVGETRIPV VSETMHGVVS EIVHERGKVA PLAKIRVDTG KCVRRELLVA VEGNYVGQKV EIGDSVPVA VGNALKLKNI PEGTGVCSVE RRPYDGGKMA KSSGAYVTVV GHNRDTNITT VRLPSGEKRS VSSECRAVVG V IAGGGVNE KPLLKASRAH YRAKARGLYW PTVRGVAMNP VDHPHGGGNK QHIGHPSTIS KHAPPGQKVG LVAARRTGLR RG SKKVLNK

+
分子 #4: uL15

分子名称: uL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 17.532795 KDa
配列文字列:
MYQNFYPMAS KDKKTRKLRG HVSHGHGRVG KHRKHPGGRG KCGGMAHRKT LFMKYHPDHF GKRGMNCTHL KKNARYAPPI NVSKLWSLI PKSQLETIMN DNTIAPIINC RSFGYHIVRG GGQLSLKRPI VVMARYFTPK AVSMIESLGG RCIISP

+
分子 #5: uL3

分子名称: uL3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 43.599754 KDa
配列文字列: MSCRKFEAPR HGSLAYMPRR RARSVKQSIR AFEKDNPEDP IHLTAFYVYK AGMTHVVRNK AMNDKKGTIK EVTESVTILE APPMVVFGI VGYVNTPQGL KINKTLLSSH INESVLRRFY RKFYLSKKRM FSSARRKAGQ KELDADILVL KDSDVIRVLA H TQVEKIKS ...文字列:
MSCRKFEAPR HGSLAYMPRR RARSVKQSIR AFEKDNPEDP IHLTAFYVYK AGMTHVVRNK AMNDKKGTIK EVTESVTILE APPMVVFGI VGYVNTPQGL KINKTLLSSH INESVLRRFY RKFYLSKKRM FSSARRKAGQ KELDADILVL KDSDVIRVLA H TQVEKIKS IRTKKAHISE IQVNGGTVND KVEWAVSMLE REVKISDVFS TNEFVDTIGV TKGKGFQGVT KRFGTRILPR KT NKGRRKV ACIGAWHPAN VLRTVPRAGQ LGFHRRTELN KLIYLIGNGK EEIKTDFDPT LKSINPMGGF PHYGLVNNDF LMV KGGITG PVKRVLAIRK NLIGKKNNEN IQIKFIDTSS KIGSGRFQTS EEKRAFFGIT KKDVSEEIK

+
分子 #6: eL29

分子名称: eL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 7.622708 KDa
配列文字列:
MAKRKNHTNH NQNRKNHRNG IKKVKKSAPS FRGLNHKYLR NMLYSRKYNN IGRAAYEAEH GPQQ

+
分子 #7: uL4

分子名称: uL4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 37.110934 KDa
配列文字列: MRDTVNCYGI DGETVEKQLE MPDVLRVPIR KDLVEDAFRC VRMDNRQPYA VSPNAGMQHS AHSWGTGRAM ARVPRVSGSG TTRSGQGAF ANFCRKGRLA HPTKVIRRWQ RKFNLNAKRH AEAMALAATA IPPLVESRGH RIAGVKMIPL VVSNSIKEIK S TKEAFEML ...文字列:
MRDTVNCYGI DGETVEKQLE MPDVLRVPIR KDLVEDAFRC VRMDNRQPYA VSPNAGMQHS AHSWGTGRAM ARVPRVSGSG TTRSGQGAF ANFCRKGRLA HPTKVIRRWQ RKFNLNAKRH AEAMALAATA IPPLVESRGH RIAGVKMIPL VVSNSIKEIK S TKEAFEML KRFGLAEELA RVKESKCIRA GKGKMRNRRY VMKKGLLIIY DNQSDIQKAF RNIAGVDLAC VDSLSLLDLC PG SHLGRLV MWTLGAFEKL NEIYGQYGKE APLTSGYFLP TNVVSKDDVE SLFFSDEIQA FLDVPNLIKY EKTSRKPETI ESL NPYLNL MESN

+
分子 #8: eL30

分子名称: eL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 11.819787 KDa
配列文字列:
MSRKRNVTDG LAFKLPLAMR TGVYKVGYKS AIKLLQAGRT KYIVAAANFP SVKRKLLEYY AALSNNVPVV IFKGSNNELA KVCDHHYRI GVISILDDGE SGLISAGTQ

+
分子 #9: uL18

分子名称: uL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 31.082008 KDa
配列文字列: MTDNKIKKSY FSRFQTKLRR RREGKTDYKH RYNLIRQDVN KHGLMKIRLV VRITNSRIIC EILRAHVDGD RSIAYADSTE LKRYGITFG LKNYTAAYAT GLLVACRYNN KIAGEGPRPE CYLDIGLRRS TRGARVFGAM KGALDGGLVM PHSLKRVPGY V SEEEFDSE ...文字列:
MTDNKIKKSY FSRFQTKLRR RREGKTDYKH RYNLIRQDVN KHGLMKIRLV VRITNSRIIC EILRAHVDGD RSIAYADSTE LKRYGITFG LKNYTAAYAT GLLVACRYNN KIAGEGPRPE CYLDIGLRRS TRGARVFGAM KGALDGGLVM PHSLKRVPGY V SEEEFDSE VFRNKLFGKI LAGYMKEMME NYPEKYKKTF QEYIKKGINP DDLENIYENA FKKIREDPSR VSKTHGDYSI FK EFKRVRL SKEERAARSR AKLLDIEVK

+
分子 #10: eL31

分子名称: eL31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 12.772054 KDa
配列文字列:
MASLSNKAVE MTVNLGKLAR KASWRYKAPK CIYYLKKFIR SQFKSENDIL IAPEVNKYIW RHGIKNIPKR MRIKIERGPS NKNPELNVF RVCLVNVNTF KGLQSQSYTE

+
分子 #11: eL6

分子名称: eL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 20.550104 KDa
配列文字列:
MIDTSKLSML SRRGIKVIPE EAGLYPSDDL PAYIEKLEKR MQKKPRVRRT DLVKGCIVVV LEGDFTARRV VFLKQVENNK ALCCGPAPI NNVPFFVIDE RYLLRTSTVL DLKEDVNIDI STVFESKRGV VADRMDIDAN SDQKRIENAI VDAVSSIRFM K RYLATPFK MPKFKSVSSL KF

+
分子 #12: eL32

分子名称: eL32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 15.613396 KDa
配列文字列:
MEPYLRVPRQ RKTKHKFNRF HSDRFKRVKK SWRRPKGIDN RVRRKLSGAI KMPNKGYGTD KLAKHMVHGG FRLVQIRNVG DLLPLISQN RFYCAEVAHS VGAKKRIEIF YKAMEYGIHL TNGKARLVEE NKE

+
分子 #13: uL30

分子名称: uL30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 30.087014 KDa
配列文字列: MDQEVPYSYR RKMEYEERME VLSRKMNEEY QARREENARY ALQRTKELIA EYKEHMKKEE DARREAEARG AFYVPKEPEF YVVVRIRGI HKVPPRERKI LELIRLKKPN HAVFVRNNAP MRAMLHKVRA YIAFGFADIH LLRTLVYKRG MAKVSKRPLA N NSSVFKIG ...文字列:
MDQEVPYSYR RKMEYEERME VLSRKMNEEY QARREENARY ALQRTKELIA EYKEHMKKEE DARREAEARG AFYVPKEPEF YVVVRIRGI HKVPPRERKI LELIRLKKPN HAVFVRNNAP MRAMLHKVRA YIAFGFADIH LLRTLVYKRG MAKVSKRPLA N NSSVFKIG QDMRLNLTNE AIEDHFGGRI RCVEELIYQI YMGTDLFKKA NNFLWPFTLC SPRKGFGGRK AKDITQGGST GC HYDKIGN LIYRMIE

+
分子 #14: eL33

分子名称: eL33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 12.309279 KDa
配列文字列:
MKDVFDPCLT AIPATFISHM RGRRIVHPSH SLLRIEGVKT REDAKFFLGN GVVSLYELSG KKMENRGRIR RLHGNSGVVA AKFERNLPP NKIGTEVFVK LYKVEDDDY

+
分子 #15: eL8

分子名称: eL8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 24.884227 KDa
配列文字列: MASQAKREMI ERRRNPRDLD QKHQREERKA LIAERVHLYR NALRIPPAVY QFSTFLNQQD MDQVLSLFRN YIPETRAEKK KRLMSENPR AGRKPILIKF GLKHVTDLIE RKEARIVIIA SDVDPIEVVV FLPTLCRKMG IPYAIVNGKK ELGTLVHLKS T SCICLCDV ...文字列:
MASQAKREMI ERRRNPRDLD QKHQREERKA LIAERVHLYR NALRIPPAVY QFSTFLNQQD MDQVLSLFRN YIPETRAEKK KRLMSENPR AGRKPILIKF GLKHVTDLIE RKEARIVIIA SDVDPIEVVV FLPTLCRKMG IPYAIVNGKK ELGTLVHLKS T SCICLCDV APKDSVEFKN ILAKINAIFM DNYEITMKKW GGGALLRDKP QESSAPQA

+
分子 #16: eL34

分子名称: eL34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 12.87806 KDa
配列文字列:
MVQHLTHRGR RTYNNASNQK KIRRTPGNRR VYIPKKKPGR VPKCVKCRSK LRGIDICRPA AFARLRKSQR TVARTYGGNL CGSCLENRI LDAFLSAEEQ LLLGKKQTNA ADNN

+
分子 #17: uL6

分子名称: uL6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 21.066457 KDa
配列文字列:
MKRLLCEEKV EIPEGCSVEI LERVMTVRGK RATAVRDLSH FVLTMDVHEG HVRLRLWNGT NRERSKLITC ASVIRNCIVG CMSGYEYTL KVVYKHFPMS VAIEDDGKTV VVKNFLGQKH ARRYKMRGDS IARLGTEKDT FVVEGSSLED VSQSAGTIQE N CQVKKIDS RTFLDGIYFL SRNVVGAK

+
分子 #18: uL29

分子名称: uL29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 15.35223 KDa
配列文字列:
MKIRTLELRE KSVEELETLA FSLKEELLRL RQQKNTQTLK PHEIRVMRKN IARVLTVRTE KLYAEMYEKH KNDKRMPKDL RPRLTKAKR MALTKRQLNM SVHSVCKRRR AYPRMYFSYS EPVDPKN

+
分子 #19: uL16

分子名称: uL16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 24.798129 KDa
配列文字列: MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDPK LAIYDLGRKR ARVTEFPLSV HLVSNEREQL SAEALEAARI AANRYMIKHA GKDNFHMRI RVHPLHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGSF GKPYGRVARV DFGQEILSIR TKDAFKAVAC EALRRAKAKF P GHQQIKVS ...文字列:
MGRRPARCYR YCKNKPYPKS RFCRGVPDPK LAIYDLGRKR ARVTEFPLSV HLVSNEREQL SAEALEAARI AANRYMIKHA GKDNFHMRI RVHPLHVIRI NKMLSCAGAD RLQTGMRGSF GKPYGRVARV DFGQEILSIR TKDAFKAVAC EALRRAKAKF P GHQQIKVS CAFGFTGISR EEFERLRKEG KLISQGSHVT IIKEKGSIVG YKEKLSKAIQ

+
分子 #20: eL36

分子名称: eL36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 11.43164 KDa
配列文字列:
MRKKLRRMRV KYPVTPLVGI EPIPRPGKKH DWNNHGSPMA KAIASEICGL APYEKKALEL IKSDQERKCR RFLKKRLGNL TRTKRKQEA LTAIAREQQ

+
分子 #21: uL5

分子名称: uL5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 19.817166 KDa
配列文字列:
MTEQLENPMR QIRIEKLCIN CCVGESGEKL NRALKVLEQI SGQKPCTGKA RLTIRGFGIR RNEKISAYVT VRGEKAREIL NNALKVKEY EIKKSSFSNT GGFGFGIDEH IDLGIKYDPS IGIYGMDFIV VLSRPGLRVS KRRIKKSRVG NKQRISKEEA M QWFVKNYD GVLLNK

+
分子 #22: eL37

分子名称: eL37 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 10.792647 KDa
配列文字列:
SKGTSSFGKK NKRNHILCVR CGSMSYHKQK LRCSSCGYPE KKLRNRGSPK ARRRRGEGTG RMRHLKKVRR AARNGFKGNA ILRALRNAN TTSDSK

+
分子 #23: eL13

分子名称: eL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 19.552008 KDa
配列文字列:
MKHNNTLPNN HFKKTAIRFK TWFNQPAKKE KRIQLRKEKA EKMYPMPVEK LRPIVRCSSI RYNIKQRLGR GFTPEECRAA GLDYNYART IGIAVDMRRK NMNKETFDQN VERIKVYTSR LTFYKDRKEA KASGAAQHIG KIMPPKKTPP VVQTIKVEEI A QKFPTK

+
分子 #24: eL39

分子名称: eL39 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 6.467752 KDa
配列文字列:
GSRKTEIIKT RLSRALVRNR PIPVWKRRMR GNTQQYNMKR RHWRRNKLKI Y

+
分子 #25: eL14

分子名称: eL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 12.682446 KDa
配列文字列:
MAKNFVQVGR LATPRFLAQR NILYVITDIQ DDSMVIVQDA QGTRKLVSVK SLHLMDDVVE IHRDMSVEEV SKKIPQQKEE EVSENDFER FKRELRTEIE EEVLRSRGF

+
分子 #26: eL40

分子名称: eL40 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 14.495183 KDa
配列文字列:
MQVFIKSPGL LEVVSIDRDT TISDLQAMSR YLCNMAFVVN GVLLDKDISL ASQGIQDLST VSAIPLLVGG AGDKQMNEND KALALKRKE AMICRSCYAR LAPRAINCRK KKKCGGSNNL RPKKKLKETK KGK

+
分子 #27: eL15

分子名称: eL15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 23.671502 KDa
配列文字列: MSASEYLREI RKKKQSDLAR YLGTIRNYEF RLNTAVHRAE RPTFPERAHK LGYKAKQGIC IFRVRIRRGG RKRLVNNGNT RGKPVNAGI YQLKPANSLQ SMAELKAGKR AGNLRVLNSY WVGQDGVYKY FEVIMVDPNH NAIRNDPKLN WICKSTMKHR E CRGLTSAS ...文字列:
MSASEYLREI RKKKQSDLAR YLGTIRNYEF RLNTAVHRAE RPTFPERAHK LGYKAKQGIC IFRVRIRRGG RKRLVNNGNT RGKPVNAGI YQLKPANSLQ SMAELKAGKR AGNLRVLNSY WVGQDGVYKY FEVIMVDPNH NAIRNDPKLN WICKSTMKHR E CRGLTSAS RKSRGLGKGI RYNHTIGGSR KAAWRRRNTV SLRRYR

+
分子 #28: Lso2

分子名称: Lso2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 9.415085 KDa
配列文字列:
MSRTRNAQKK YEGMMRKLKA KEERMRKEEE LKEEEAKKFW SIGAKDESKK QALELKRQEK IARRAMRKKI YEEELGL

+
分子 #29: uL13

分子名称: uL13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 23.119289 KDa
配列文字列: MINKEIIVDG TGHIAGKLGT YIAKKLLEGY TITVLCAESI VLTGPIHRTK LRYKDYLNKR CLVNPLRGPF HYKEPSKLFM RLVKRMVPY KKKRGAAALQ RLQVFEGIPE KFENTERSIC PRALLEYCAN PIRKSATYGK LLSEFGWKHL NITEEMKKKV L QREEKAKK ...文字列:
MINKEIIVDG TGHIAGKLGT YIAKKLLEGY TITVLCAESI VLTGPIHRTK LRYKDYLNKR CLVNPLRGPF HYKEPSKLFM RLVKRMVPY KKKRGAAALQ RLQVFEGIPE KFENTERSIC PRALLEYCAN PIRKSATYGK LLSEFGWKHL NITEEMKKKV L QREEKAKK EKDARMEEIQ RIRESSSFNK EVEEIMSRIE

+
分子 #30: eL42

分子名称: eL42 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 13.239604 KDa
配列文字列:
NGKWQNNLKV NIPDKRNTHC KKCNKHTEHK VSQYKKSKEG RNGQGTRRYR RKQRGYHGQT KPILRRKAKV TKKLVIKLRC SVCDAKHQQ TMKRTKHVEF GGKKKTKGQA LTY

+
分子 #31: uL22

分子名称: uL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 19.492047 KDa
配列文字列:
MKKKYAPEIH DPGNTVKCRI DNARVSFKNT RETSRVLVNR KLGDALNYLY DVIKKKQCVP MKRYARGVGR TAQAKAFKTQ RGRWPVKSA KFFIELINNL KVNAVNKNLN PDEMVIKNII VNKAPIIPGR IHRAYGRINP YNSHPCHIQM IAVKKMVAVP K AIDGEYAA EVV

+
分子 #32: eL43

分子名称: eL43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 9.214776 KDa
配列文字列:
AKSRGTKKVG IVGKYGVRYG SSLRKRIKAI EISQHAKYEC KACGKTSVKR EVVGIWKCKA CAFTFAGGAF APTTSAGAHS NSITRQ

+
分子 #33: eL18

分子名称: eL18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 20.01642 KDa
配列文字列:
MVATAFASKK YVSRGRKKLV SRNIYLEGLA ALYERIAKSS ANEIVHKIAA QLKMSRNNRP PMKVSKLANI SEKYPGKVYV VVAKVLDDN CFLEVPKMQI VALQFSKSAK EKIEKAGGST HTLDQLFEVA PGLENVELFR GDLTARKAYK YFGAPGDRHS R TYPKTTSK GKNREKRLLK

+
分子 #34: eL19

分子名称: eL19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 19.522418 KDa
配列文字列:
MTKLPTIRRI AASIFKCGKN KIWFDPGETP RLASSSTRMQ VRRLIKDGVI LRKPNTVHSR WRANKRAEAR KKGRHMGIGK RKGTKNARM PEKRVWIKKI RGQRASLKEM KKSGHITPEE FRQYYMQAKG NMFKSLKVME DHIEKKREEK MRIKDLAAQA A ALRMKK

+
分子 #35: eL20

分子名称: eL20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 20.855656 KDa
配列文字列:
MWRCGGIKEY RIYGSKMPTE QEVAPQIFFH NVFAKNEIVA RSRFNNLMKT KYKIKSGKIV ILKIEELVED LKDMKIKNYG IQLVYRSKK GIHNMYKEFR SISRCKAVEM LFNDMAGRHK AKRDDIKIVS LKELRSEDLR RDRVIQFTKD DVMYPVFKKV L NSKYDFVL KGTNIFN

+
分子 #36: eL21

分子名称: eL21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 18.688811 KDa
配列文字列:
MRSNGYRRGT RHRFSQAFRK HGMPKPSILT RVFKKGQYVD VVVNPAIHKG MPHKFFHGRT GKIFNIDKRS IGILMNKRCG PRYVEKMVI ARVEHVRPSR CNEEYIKRRT ENDRLRREAA ARGEKLGSLK RKPGGPRGAV LISTENNTPI EIRNEPYFEV Y

+
分子 #37: eL22

分子名称: eL22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 13.247385 KDa
配列文字列:
MNSVQAENDT RCYELNCSVL VKDSLLSTED LNSYLEARMK VNGRTGNLAG NIDLVCTEES ILVKPRVRLS KKYLKYLVKK FLYKKELID WVRILSTGKS SYKLAYYRVV SNKYE

+
分子 #38: uL14

分子名称: uL14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 15.257077 KDa
配列文字列:
MPSKHVLEDR RPKIRSTCGV QVGTRIACAD NTGAKIMQII GVKGVRGRLN RLPAASVGDV VLCSVKKGRP DMRKKIVLCV VIRQKKAWR RRDGSHICFE DNAAVVITNK GDPKGTQIAG PVPREVADIW PKISSNAPAI I

+
分子 #39: eL24

分子名称: eL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 15.20979 KDa
配列文字列:
MVKEGVCVYS GYEVPKGSGL IRVTNDTRSF LFLNKKVQSL SNRKINPRDV AWTAASRAFH KKGMKKVVRK EAEIQVVKEV RGFPSVPKS IIVQPKRDDD QKKKAERGAE TFRAQKKVTK AEGRKMKADG RWQR

+
分子 #40: uL23

分子名称: uL23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 11.872828 KDa
配列文字列:
MEIKRNNPKY TRKAVTQPAT GHPADIIRFG ACNEKAVRLI ENNNTLVFIC DKYATKPQIG NAVTRFYKVP VEKVNTARSI KGYKKAYVK LKNEGDALKI ANEAGII

+
分子 #41: uL24

分子名称: uL24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 16.620605 KDa
配列文字列:
MKFNKEKTAS RRKNRKAHFT ANSTERRIRM SSPLSKELRE KYGFRSFPIR RNDKVVVMKG RFKGNTGTVV EVRRKMYKVY VDSCEASKM NGRKVRVGID ASNLKIIELY QGDGRDKILE RKMNNRRMQM ERAAKIKMEQ K

+
分子 #42: eL27

分子名称: eL27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 14.285909 KDa
配列文字列:
MLLKPNTVVV ALKGRFAGKK GVVVSASEDG RKILVAGIEK MPQPVTDDMS ECKKKRLSRM SAFIKNYNSR HLLATRYYGD VGLGAIDFS RIFENFESKK MAIDAVKKAF INANKQKKAA WLFEKLVF

+
分子 #44: uS2

分子名称: uS2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 27.336201 KDa
配列文字列: MQKEIEIPED FVKAIILSNA HLGSTTATTN FKQYIYGRRK NDLIHVIDIN EMWKKLIIAA RLFVSIEDPS SIIVASNKKF GKRAVLRFC SETGATPLIG RFIPGGFTNQ VINDVKESRL VVVSDTYADK QTVMEASYVN TPCIAFCNSD NSLSRVDVVI P MNNRSPLS ...文字列:
MQKEIEIPED FVKAIILSNA HLGSTTATTN FKQYIYGRRK NDLIHVIDIN EMWKKLIIAA RLFVSIEDPS SIIVASNKKF GKRAVLRFC SETGATPLIG RFIPGGFTNQ VINDVKESRL VVVSDTYADK QTVMEASYVN TPCIAFCNSD NSLSRVDVVI P MNNRSPLS IGCGFYLFAK VIKYIKGEES FDVDVRSEIE LYFYRDPVEL DMIIQEQKEK NETSFQVKDA APEVPAEAEQ WA DA

+
分子 #45: eS26

分子名称: eS26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 11.985991 KDa
配列文字列:
MPVKRKNHGR AKKNRGHVKL IRCDNCASAV PKDKAIKRFQ IKSLIEAAAH DDVRTATIYE EYEVPKFFHK NQYCVSCAVH LKAVRCRSA EGRKDRSNPH ARVKQ

+
分子 #46: eS1

分子名称: eS1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 26.208701 KDa
配列文字列: MAKKDQPVTK KSLKKGLKKK ATDSFAKKEW FSLRIPSGFV TAEPGKTLCT KQNTKANLEK YLLGRNFEVN QGDLNPGNEE SAVRKFRFI VNNVNGRIAE SEFNGMELTT EKKRGIVRKW HTLIEAFRDV CTKDGYHLRV FVTALTKHRP GSVSRTCYAK T SDVKKVRR ...文字列:
MAKKDQPVTK KSLKKGLKKK ATDSFAKKEW FSLRIPSGFV TAEPGKTLCT KQNTKANLEK YLLGRNFEVN QGDLNPGNEE SAVRKFRFI VNNVNGRIAE SEFNGMELTT EKKRGIVRKW HTLIEAFRDV CTKDGYHLRV FVTALTKHRP GSVSRTCYAK T SDVKKVRR LMFEVIENEV SGSELAKVVK KLSVEKLGKE IEKKASVILP LQNCYTAKVK VVKRPRPEVI RN

+
分子 #47: eS27

分子名称: eS27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 9.923966 KDa
配列文字列:
MAIKDLAFPT AEELRTTCKR KRLIPQNNSY FLYLRCKSCD IIILAYSHSQ TRRTCPGCNM VMLMPKGGKA RIEGDVKIKK IKRLVE

+
分子 #48: uS5

分子名称: uS5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 28.251029 KDa
配列文字列: MESSVAGRNT GPLPRKKEEA VRPRVPRQQD KEWVPTTDLG ILVKMGKINM EDIFQYSLKI KESGIVDHLL KGQLKEEVIK IKSVQKQTR AGQRTRMKVV VVVGNGAGYV GIGTKTSKEA ATAIKGAIER AKCAIRPVRL GFWGNNYGKE HTVPCKATGK S GSVIMRVI ...文字列:
MESSVAGRNT GPLPRKKEEA VRPRVPRQQD KEWVPTTDLG ILVKMGKINM EDIFQYSLKI KESGIVDHLL KGQLKEEVIK IKSVQKQTR AGQRTRMKVV VVVGNGAGYV GIGTKTSKEA ATAIKGAIER AKCAIRPVRL GFWGNNYGKE HTVPCKATGK S GSVIMRVI PAPKGSGIRA GSVPKKIFQL AGVKDVFTLS KGQTSTTENF AKATVSALDK SSCFFVPEFW REKEPELNPL SR YSRLIKE YREKIARK

+
分子 #49: eS28

分子名称: eS28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 7.325566 KDa
配列文字列:
MTDQVFLGEV MQLYNKTGPG GSITLCQLKL EDTGRMLHRA VIGPIKIGDV VTLLDCEREH RRGRF

+
分子 #50: uS3

分子名称: uS3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 24.6821 KDa
配列文字列: MVSTKQVLSK FIEKGIMKAE LNEFFSKEFE DEVYSGMEMK PHEIPVQITV RVNKTHEVIG ERKSRLNRIK HVLMERFPLL RTGVEINVE MVKNKGLCPK TQAEYIKAKL IENVPFRRAV NSVMRSIKES GAQGCVIIVS GKLKGQRARS VKYADGLLIH T GSSKEDYV ...文字列:
MVSTKQVLSK FIEKGIMKAE LNEFFSKEFE DEVYSGMEMK PHEIPVQITV RVNKTHEVIG ERKSRLNRIK HVLMERFPLL RTGVEINVE MVKNKGLCPK TQAEYIKAKL IENVPFRRAV NSVMRSIKES GAQGCVIIVS GKLKGQRARS VKYADGLLIH T GSSKEDYV KEALSVVHLK QGVIGIKVRI MLPYDPENVN GPSKVISDKI KIFEPKELY

+
分子 #51: uS14

分子名称: uS14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 7.481745 KDa
配列文字列:
MEENIKIKPG SYAGRVDTRK FGRGSRSCRA CFTHRGIIRQ YNLYLCRRCF REYALEIGFK KVD

+
分子 #52: eS4

分子名称: eS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 30.011957 KDa
配列文字列: MTRGPRRHLK RLNAPSSWQL DKLGGKYAPK PSSGPHRLSE CIPLCILLTR KLEYATTTKE LKYILRKKMI KVNGVVRTDK DFPVGFMDV ISIDTTNENM RLLYSNNRAF MLHNISSEEA TYRLCRVSKK KMGIGGIPYI YTQDGSTFRY CDPKINVNDV V KVNIKEKK ...文字列:
MTRGPRRHLK RLNAPSSWQL DKLGGKYAPK PSSGPHRLSE CIPLCILLTR KLEYATTTKE LKYILRKKMI KVNGVVRTDK DFPVGFMDV ISIDTTNENM RLLYSNNRAF MLHNISSEEA TYRLCRVSKK KMGIGGIPYI YTQDGSTFRY CDPKINVNDV V KVNIKEKK VVGFLPFKSG MKVFITKGKN LGCIGVISGI EKHMGSHDIA YVVDAKGRSF STRTSNAFII GDSESYWISL PE GEGIKIS ELEKSNIKYG EIASVPVAEE

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分子 #53: eS30

分子名称: eS30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 7.010182 KDa
配列文字列:
LESKGSIARA GKVRNQTPKV EKQEKPKALT GRARKRALYE RRLEANFFET RKMKMNPNFS

+
分子 #54: uS7

分子名称: uS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 21.633299 KDa
配列文字列: MSIACDSGEL LLFDKYSRDE VVVNDRSLKN YIFLRSLSSY PHTASRKGSR QFGKGEIPIE ERFVCGLMRR GRNSGKKRLA MAALRNAFI IINTLTGKNP LQVLVDALVN CGPREDCARI GKGGAMKRTS VDVSPLRRLN VAIFLVCKGI RQACMKSTKT I AEAIADEL ...文字列:
MSIACDSGEL LLFDKYSRDE VVVNDRSLKN YIFLRSLSSY PHTASRKGSR QFGKGEIPIE ERFVCGLMRR GRNSGKKRLA MAALRNAFI IINTLTGKNP LQVLVDALVN CGPREDCARI GKGGAMKRTS VDVSPLRRLN VAIFLVCKGI RQACMKSTKT I AEAIADEL IAASRNSPNS FGVKKKDEIE RMAKSNR

+
分子 #55: eS6

分子名称: eS6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 25.832584 KDa
配列文字列: MKLNVAYPAK GTQKMIPIDF QTSMRLYGLR LGAQVEGELI GEDFRGYVFK ITGGDDVSGL PMKDGVFTDK RVRLLLKKGN KGYRCREKG VRKRKSVRGC IISGEIAVVS MIILKEGEKP IEGLTDRVVE CSHLPKRASK LRKLFNIPKD ANIVEFIKEQ I RNNSDSEK ...文字列:
MKLNVAYPAK GTQKMIPIDF QTSMRLYGLR LGAQVEGELI GEDFRGYVFK ITGGDDVSGL PMKDGVFTDK RVRLLLKKGN KGYRCREKG VRKRKSVRGC IISGEIAVVS MIILKEGEKP IEGLTDRVVE CSHLPKRASK LRKLFNIPKD ANIVEFIKEQ I RNNSDSEK KIRYPRIKVT RLITPMRIER KRKRLEEKEA RKIKSENERK EYMKKYYPEK IESL

+
分子 #56: RACK1

分子名称: RACK1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 35.50725 KDa
配列文字列: MTTTARLNEV ATFSGHKDAV MALGTCETPD AKLLFSASRD RRVLGWSLGE GAMFGRIVKE FTKHGHSVND VAVARSGSFV VSAGCDGLG RIIDVQSGER TLLRGHESDL TCAAINCQEN KIVTGSVDKT LRLWNMCGEL QHTFDAAIEC AHEDWVMCAE F RPLDENEV ...文字列:
MTTTARLNEV ATFSGHKDAV MALGTCETPD AKLLFSASRD RRVLGWSLGE GAMFGRIVKE FTKHGHSVND VAVARSGSFV VSAGCDGLG RIIDVQSGER TLLRGHESDL TCAAINCQEN KIVTGSVDKT LRLWNMCGEL QHTFDAAIEC AHEDWVMCAE F RPLDENEV VSGSVDGTVK VWDIDARVVK STFFDGCLIQ SCAEGSEYRT RPVADGSFAV RALALSADGS CCAYGGSNCK TY ILNLAES EAIAAFETDT PVSALAFGLT DVILACGTQD KIYIWDVVSN CLLAVADLSA HGKRVRCRSL VWTTSNLIAG LGN GKILVF EFVR

+
分子 #57: eS7

分子名称: eS7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 20.213059 KDa
配列文字列:
MSEQTEHEKK VAQEIKKLYS QDMSGEFGDK LSDIRIQTID REQGKKILLI RVPEEVLEVV HIGYSKLSGK LKALYPDFHT LVIRNTPIV NVSSIKGNVY RIDSKNTKKS VHENWIRDLC YPALVEMRKT DVFNGCERIE SALVSSNSNY SDDDFAAMEC A FKTLTGRT IHYGNIFY

+
分子 #58: eS8

分子名称: eS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 20.07343 KDa
配列文字列:
MGLSRSNRHK RTKTGAKKPI FCKKRKFHMA RQPSNTKIGE DKLQELRCRG GVIKKRALRL SSGNFTCRTH GFSYKTKIMQ VMYHPSSNE LMRTNTLTKS AVIKLDSKQF KEKFDSILST DSELKNTDPL FFSNLDAGKL YGVIVSRPGQ CGRADGYILQ G DELNFYIN KFKKKAR

+
分子 #59: uS4

分子名称: uS4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 21.702346 KDa
配列文字列:
MARPKYSKRS RVPRKPYEKD RLIDEMKLLG EFGLKNKREL WTQEKICDDI KKRARDLLIS TDESEIIING RALLNKLIKL GIFSDVDFK DMDDIKRNLE KVLDLTASHF LRRRLQHRVF EACLAKSVHH ARNLINHRHI TVRGCVIDKP GYMVFAENEG H IEINKFSS VGGAKPGRSK KKHAVAQGE

+
分子 #60: eS10

分子名称: eS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 60 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 11.604676 KDa
配列文字列:
MLIPTKNILA VKRHMLEKRC IVVEDTPKGN HPVLNIPNLQ VLNIMKSLVS KRYVKKTFCW RHGYYFLEDT AVDVLKDQLC MSDDEAAGL YAPSAVVSNI KAQ

+
分子 #61: uS17

分子名称: uS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 61 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 18.735699 KDa
配列文字列:
MGDILDKAKT YPKQKKPHLV SRREGKDIKP ERYYKNIGMG YNVPETAING TYIDKKCPFT GNVTIRGRIF KGEVFKMKQE KTIVVVKRY FHYNKKYKRY ERRNTKFNVH LSPCFFGLVR VGDTVTCGET RALSKTKHFA VIDYKQKDSE DGQYAQFTGF S

+
分子 #62: uS15

分子名称: uS15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 62 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 16.639475 KDa
配列文字列:
MARMHSKGRG VSESTVPYNR VRPHWVTQSK DEVVGTILSL SRKGLKPSEI GKIMRDEYAI GHVRNVTGMN ILQILRAHGL APAIPEDLC ALLDKRAGIL SHLNTFRNDK SARYRLNLVE SRMYRLARYY KRTMVLPATW KPHAASK

+
分子 #63: uS11

分子名称: uS11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 63 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 14.354504 KDa
配列文字列:
MTEDISTKDL VFGVAHILAT SNDTFVHITD LTGSETVCKV SGGMKVKAHR DESSPYAAML AAQDAAQKAI ERGITAVHVK LRGRGGVKS AIPGPGAQAA LRALIRNGLK LGRVEDATPT PTDRTRRKGG RRGRRL

+
分子 #64: uS19

分子名称: uS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 64 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 16.5375 KDa
配列文字列:
MEGDVEKERR QFKKYTYRGV PLSELVKMPL LKFSELLTSS KRRRLRRGIS ERELDLLKKC ALSKKNAEGT QEKPDMVKTQ ARTMVIVPQ MVGCVIGVHN GRVYVPVEIK PEMIGYYLKD FSDTKTCSTH GKPGVGATSG SKFVPLK

+
分子 #65: uS9

分子名称: uS9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 65 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 16.499248 KDa
配列文字列:
AIPMEKKVIA IGQKKTAKAR SECMEGDVFS VTVNNVPLRL LPDDMMASKL RDIITRVGLK YFENLVFSIT VRGGGPVSKI YAVRQAFAK SLVAYYGTYM DEWTRQEIRS NLLSFDKFTL VADPRRAEPK KYGGRGARAR RQKSYR

+
分子 #66: eS17

分子名称: eS17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 66 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 14.702942 KDa
配列文字列:
MGRVRNSNVK RAAKNIVEKY FPKLDCDFHH NKRVLESVTE IQTKRFKNQI AGYVTHLYTR VEKGKVKKIF IKKHEEERER RENMIPSSS IMDTEKIEVD DITMQMIKDY CYRGNYVVSV SEEQ

+
分子 #67: uS13

分子名称: uS13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 67 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 18.093031 KDa
配列文字列:
MEGRKSLFET FTSEPAQIQH IIRMLNTNID GSRRVVHALT QIKGIGKRMS DAIVKRTGVD ASKRMGALSA SELELLQDGI QNPAKYGIP RWMFNHQFDA VDGTDSHLIG NQIDANLRFY IEKGKKMKHI RVCRLARGLK VRGQRTKSNG RGGKTIGVSR K K

+
分子 #68: eS19

分子名称: eS19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 68 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 16.191979 KDa
配列文字列:
MKELFMVRAD ALNEALAGYL KSKNIVKLPE NFDIIKTSHG KQRAPSDKDW YYKRAASIFR KLLIAMHEEK RIGVKRLSRK YGCAKNRGS RPSKHVDGSR GHIRKIMQDL ERAGLIVKDG NYRKVSDMGI IETGQLISQI KE

+
分子 #69: uS10

分子名称: uS10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 69 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 12.699567 KDa
配列文字列:
MELEIDEKKY SVDINLEGTS VEEIEKVCRD FYAYAKTLVP DMGGVKRLQT KKGKITTRRS PCGEGTNTWS RYRISVHRRS FSAHLYPSV LEKFATFLKG SNVEISLVIK SN

+
分子 #70: eS21

分子名称: eS21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 70 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 7.38031 KDa
配列文字列:
MSFEQRICTF TGRPIPHTDN ASVQLTFVEL DSDGRATDKV LIYNVCGKIR KDGTIDEILT NTLAQN

+
分子 #71: uS8

分子名称: uS8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 71 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 14.36996 KDa
配列文字列:
MNRLAATCKA INNANRSGKR QVLIRFVTKT TRKFLEKMQV CGYISTLTYI DDHRQGKVII GLNGRLNKCG AICPNYCLTL KDVEKFKDK ILPARQFGHL ILNTSKGMID HNECVTMKSG GEVLGFFY

+
分子 #72: uS12

分子名称: uS12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 72 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 15.789745 KDa
配列文字列:
MKGLYCAKKL KRNRQAKRRN DPTYRKRLLG TKYKQDIIGV APQAKGIVLE KIEVEAKQPN SAIRKAVRVQ LIKNGKKVSA FVPYDGAIN DIDMNDIVTL EGFGKKGRSK GDIPGIRYKV CKVQNVSLLA LFRGKKDKPS R

+
分子 #73: eS24

分子名称: eS24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 73 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 15.866901 KDa
配列文字列:
MSLETQICMM RENRPLQRRE VVLSISHPKS RTPSKEDICS QISSLFKVRK ELIIVSGCST RFGTHQTKCK VRIYESPEML REIERDFVV KRKTGEEVRK KKARRVRKKE RKEKAKIFGT LRRHLKKAEK RAQK

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分子 #74: eS25

分子名称: eS25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 74 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Paranosema locustae (菌類)
分子量理論値: 13.719942 KDa
配列文字列:
MVKKVLESKE KKAAKIASTS NKEKKKWTQG KTREAVRRSV TVEADVFSKI ERDVAKASLV TAPSVAEKFN LNVGVAQKIL EHLCAGGVL CCLSRNSRLR LYSRAQKVGA RPADTTLPAA EAPAQTE

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分子 #75: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 75 / コピー数: 179 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #76: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 76 / コピー数: 8 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

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分子 #77: ADENOSINE MONOPHOSPHATE

分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE / タイプ: ligand / ID: 77 / コピー数: 1 / 式: AMP
分子量理論値: 347.221 Da
Chemical component information

ChemComp-AMP:
ADENOSINE MONOPHOSPHATE / AMP / AMP*YM

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

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試料調製

緩衝液pH: 7.5
詳細: 30 mM Tris-HCl, pH 7.5, 25 mM KCl, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT, 1 mM EDTA
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 300 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 30 sec.
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 298 K / 装置: FEI VITROBOT MARK I

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
撮影したグリッド数: 1 / 平均電子線量: 28.6 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 320669
初期モデルモデルのタイプ: OTHER / 詳細: Cryosparc de-novo generated initial model
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1) / 使用した粒子像数: 124947
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
最終 3次元分類クラス数: 3 / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 3.1)
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデルPDB ID:

4v88


Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
精密化プロトコル: OTHER
得られたモデル

PDB-6zu5:
Structure of the Paranosema locustae ribosome in complex with Lso2

+
万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る