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- EMDB-0058: Cryo-EM map of a partial yeast 48S preinitiation complex in its c... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-0058
タイトルCryo-EM map of a partial yeast 48S preinitiation complex in its closed conformation obtained by focused classification using masks for eIF3b-eIF3i.
マップデータFor optimal visualization of eIF2, and of eIF3c, eIF3b and eIf3a c-term at the subunit interface, gauss-filter the map by 1.34 and display it at 0.035
試料
  • 複合体: Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation
    • 複合体: tRNA
      • RNA: x 1種
    • 複合体: Initiation factors
      • タンパク質・ペプチド: x 8種
    • 複合体: mRNA
      • RNA: x 1種
    • 複合体: Initiation factors
      • タンパク質・ペプチド: x 2種
    • 細胞器官・細胞要素: Ribosome
      • RNA: x 1種
      • タンパク質・ペプチド: x 34種
  • リガンド: x 4種
キーワードribosome / translation / initiation factors / 40S / eIF1A / eIF3 / eIF2 / tRNAi / 48S PIC / small ribosome subunit
機能・相同性
機能・相同性情報


formation of translation initiation ternary complex / Recycling of eIF2:GDP / Cellular response to mitochondrial stress / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / ABC-family proteins mediated transport / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / methionyl-initiator methionine tRNA binding / incipient cellular bud site / translation reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 2 complex ...formation of translation initiation ternary complex / Recycling of eIF2:GDP / Cellular response to mitochondrial stress / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3e / ABC-family proteins mediated transport / eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m / methionyl-initiator methionine tRNA binding / incipient cellular bud site / translation reinitiation / eukaryotic translation initiation factor 2 complex / eukaryotic translation initiation factor 3 complex / formation of cytoplasmic translation initiation complex / multi-eIF complex / cytoplasmic translational initiation / protein-synthesizing GTPase / eukaryotic 43S preinitiation complex / formation of translation preinitiation complex / eukaryotic 48S preinitiation complex / positive regulation of translational fidelity / Formation of the ternary complex, and subsequently, the 43S complex / Translation initiation complex formation / Ribosomal scanning and start codon recognition / Formation of a pool of free 40S subunits / L13a-mediated translational silencing of Ceruloplasmin expression / ribosomal small subunit binding / 90S preribosome / endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / regulation of translational fidelity / translation regulator activity / endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / translation initiation factor binding / translation initiation factor activity / rescue of stalled ribosome / maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) / maturation of SSU-rRNA / small-subunit processome / translational initiation / protein kinase C binding / maintenance of translational fidelity / modification-dependent protein catabolic process / cytoplasmic stress granule / protein tag activity / rRNA processing / ribosomal small subunit biogenesis / double-stranded RNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosome binding / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / cytosolic small ribosomal subunit / cytoplasmic translation / cytosolic large ribosomal subunit / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / protein ubiquitination / translation / ribonucleoprotein complex / positive regulation of protein phosphorylation / GTPase activity / mRNA binding / ubiquitin protein ligase binding / nucleolus / GTP binding / protein kinase binding / RNA binding / zinc ion binding / identical protein binding / nucleus / metal ion binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G, N-terminal / eIF3G, RNA recognition motif / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G / Eukaryotic translation initiation factor SUI1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B / eIF3B, RNA recognition motif / Translation initiation factor, beta propellor-like domain / Eukaryotic translation initiation factor eIF2A ...Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G, N-terminal / eIF3G, RNA recognition motif / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G / Eukaryotic translation initiation factor SUI1 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B / eIF3B, RNA recognition motif / Translation initiation factor, beta propellor-like domain / Eukaryotic translation initiation factor eIF2A / SUI1 domain superfamily / Translation initiation factor SUI1 / Translation initiation factor SUI1 family profile. / SUI1 domain / eIF3a, PCI domain, TPR-like region / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, N-terminal domain / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit 8 N-terminus / Translation initiation factor IF2/IF5 domain / Translation initiation factor IF2/IF5, N-terminal / Translation initiation factor IF2/IF5, zinc-binding / Translation initiation factor IF2/IF5 / Domain found in IF2B/IF5 / domain present in translation initiation factor eIF2B and eIF5 / Translation initiation factor 1A (eIF-1A), conserved site / Eukaryotic initiation factor 1A signature. / eukaryotic translation initiation factor 1A / Translation initiation factor 1A (eIF-1A) / Translation initiation factor 2, alpha subunit / Translation initiation factor 2, alpha subunit, middle domain superfamily / Translation initiation factor 2, alpha subunit, C-terminal / IF2a, S1-like domain / Eukaryotic translation initiation factor 2 alpha subunit / Initiation factor eIF2 gamma, C-terminal / Initiation factor eIF2 gamma, domain 2 / Initiation factor eIF2 gamma, GTP-binding domain / Initiation factor eIF2 gamma, C terminal / : / RNA-binding domain, S1, IF1 type / Translation initiation factor 1A / IF-1 / S1 domain IF1 type profile. / motif in proteasome subunits, Int-6, Nip-1 and TRIP-15 / PCI domain / Proteasome component (PCI) domain / PCI domain profile. / Translation elongation factor EF1A/initiation factor IF2gamma, C-terminal / S1 domain profile. / : / Ribosomal protein S26e signature. / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein L41 / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e, conserved site / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S21e signature. / : / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e, conserved site / Ribosomal protein S19e signature. / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / S27a-like superfamily / 40S Ribosomal protein S10 / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e subdomain, eukaryotes / Ribosomal protein S17e, conserved site / Ribosomal protein S17e signature. / Ribosomal protein S30 / : / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal protein S7e signature. / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19e / Translation elongation factor EFTu-like, domain 2 / Ribosomal protein S3Ae, conserved site / Ribosomal protein S19e / Ribosomal protein S3Ae signature. / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S27e signature. / Ribosomal protein S4e, N-terminal, conserved site / Ribosomal protein S4e signature. / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S8e, conserved site
類似検索 - ドメイン・相同性
Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta / Small ribosomal subunit protein eS32A / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha / Small ribosomal subunit protein uS11 / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / Eukaryotic translation initiation factor eIF-1 ...Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta / Small ribosomal subunit protein eS32A / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha / Small ribosomal subunit protein uS11 / Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C / Eukaryotic translation initiation factor eIF-1 / Small ribosomal subunit protein eS28 / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A / Eukaryotic translation initiation factor 1A / Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I / Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein / KLLA0F25542p / KLLA0F18040p / KLLA0F09812p / KLLA0F07843p / 40S ribosomal protein S12 / Small ribosomal subunit protein eS6 / KLLA0E23673p / 40S ribosomal protein S8 / Small ribosomal subunit protein uS2 / KLLA0E12277p / 40S ribosomal protein S27 / Small ribosomal subunit protein uS14 / KLLA0D10659p / 40S ribosomal protein S3 / 40S ribosomal protein S26 / 40S ribosomal protein S7 / 40S ribosomal protein S24 / 40S ribosomal protein S30 / KLLA0B08173p / Small ribosomal subunit protein uS8 / 40S ribosomal protein S25 / Small ribosomal subunit protein eS1 / 40S ribosomal protein S4 / KLLA0B01562p / KLLA0B01474p / KLLA0A10483p / KLLA0A07194p / Small ribosomal subunit protein eS21 / RPS23 / Small ribosomal subunit protein uS9
類似検索 - 構成要素
生物種Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母) / Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 5.75 Å
データ登録者Llacer JL / Hussain T
資金援助 英国, 2件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_U105184332 英国
Wellcome TrustWT096570 英国
引用ジャーナル: Mol Cell / 年: 2015
タイトル: Conformational Differences between Open and Closed States of the Eukaryotic Translation Initiation Complex.
著者: Jose L Llácer / Tanweer Hussain / Laura Marler / Colin Echeverría Aitken / Anil Thakur / Jon R Lorsch / Alan G Hinnebusch / V Ramakrishnan /
要旨: Translation initiation in eukaryotes begins with the formation of a pre-initiation complex (PIC) containing the 40S ribosomal subunit, eIF1, eIF1A, eIF3, ternary complex (eIF2-GTP-Met-tRNAi), and ...Translation initiation in eukaryotes begins with the formation of a pre-initiation complex (PIC) containing the 40S ribosomal subunit, eIF1, eIF1A, eIF3, ternary complex (eIF2-GTP-Met-tRNAi), and eIF5. The PIC, in an open conformation, attaches to the 5' end of the mRNA and scans to locate the start codon, whereupon it closes to arrest scanning. We present single particle cryo-electron microscopy (cryo-EM) reconstructions of 48S PICs from yeast in these open and closed states, at 6.0 Å and 4.9 Å, respectively. These reconstructions show eIF2β as well as a configuration of eIF3 that appears to encircle the 40S, occupying part of the subunit interface. Comparison of the complexes reveals a large conformational change in the 40S head from an open mRNA latch conformation to a closed one that constricts the mRNA entry channel and narrows the P site to enclose tRNAi, thus elucidating key events in start codon recognition.
履歴
ヘッダ(付随情報) 公開2016年8月24日-
登録2018年6月14日-
マップ公開2019年6月26日-
更新2024年11月13日-
現状2024年11月13日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6gsn
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_0058.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_0058.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 103 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈For optimal visualization of eIF2, and of eIF3c, eIF3b and eIf3a c-term at the subunit interface, gauss-filter the map by 1.34 and display it at 0.035
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.34 Å/pix.
x 300 pix.
= 402. Å		1.34 Å/pix.
x 300 pix.
= 402. Å		1.34 Å/pix.
x 300 pix.
= 402. Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.34 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベルBy EMDB: 0.045 / ムービー #1: 0.05
最小 - 最大-0.11900209 - 0.2749232
平均 (標準偏差)0.0003729743 (±0.018097945)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ300300300
Spacing300300300
セルA=B=C: 402.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.341.341.34
M x/y/z300300300
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z402.000402.000402.000
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS300300300
D min/max/mean-0.1190.2750.000

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添付データ

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ハーフマップ: #1

ファイルemd_0058_half_map_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: #2

ファイルemd_0058_half_map_2.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed ...

全体名称: Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation
要素
  • 複合体: Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation
    • 複合体: tRNA
      • RNA: tRNAi (75-MER)
    • 複合体: Initiation factors
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A,eIF3a
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G
    • 複合体: mRNA
      • RNA: mRNA
    • 複合体: Initiation factors
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor 1A
      • タンパク質・ペプチド: Eukaryotic translation initiation factor eIF-1
    • 細胞器官・細胞要素: Ribosome
      • RNA: 18S rRNA (1798-MER)
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0F09812p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0D08305p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0D10659p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0B08173p
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0F07843p
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0B01474p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0B01562p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0A07194p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0F25542p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0B06182p
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S28
      • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0E12277p
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S29
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
      • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L41-A
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S0
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S1
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S7
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0E23673p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0A10483p
      • タンパク質・ペプチド: KLLA0F18040p
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S22
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
      • タンパク質・ペプチド: RPS23
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
      • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER
  • リガンド: METHIONINE

+
超分子 #1: Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed ...

超分子名称: Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#47
分子量理論値: 1.8 MDa

+
超分子 #3: tRNA

超分子名称: tRNA / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #28
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)

+
超分子 #4: Initiation factors

超分子名称: Initiation factors / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #23-#27, #45-#47
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)

+
超分子 #5: mRNA

超分子名称: mRNA / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #20
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)

+
超分子 #6: Initiation factors

超分子名称: Initiation factors / タイプ: complex / ID: 6 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #21-#22
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)

+
超分子 #2: Ribosome

超分子名称: Ribosome / タイプ: organelle_or_cellular_component / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#19, #29-#44
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)

+
分子 #1: 18S rRNA (1798-MER)

分子名称: 18S rRNA (1798-MER) / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 579.239625 KDa
配列文字列: UAUCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAUAUG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUUAUACA GUGAAACUG CGAAUGGCUC AUUAAAUCAG UUAUCGUUUA UUUGAUAGUU CCUUUACUAC AUGGAUAUCU GUGGUAAUUC U AGAGCUAA ...文字列:
UAUCUGGUUG AUCCUGCCAG UAGUCAUAUG CUUGUCUCAA AGAUUAAGCC AUGCAUGUCU AAGUAUAAGC AAUUUAUACA GUGAAACUG CGAAUGGCUC AUUAAAUCAG UUAUCGUUUA UUUGAUAGUU CCUUUACUAC AUGGAUAUCU GUGGUAAUUC U AGAGCUAA UACAUGCUUA AAAUCUCGAC CCUUUGGAAG AGAUGUAUUU AUUAGAUAAA AAAUCAAUGU CUUCGGACUC CU UGAUGAU UCAUAAUAAC UUUUCGAAUC GCAUGGCCUU GUGCUGGCGA UGGUUCAUUC AAAUUUCUGC CCUAUCAACU UUC GAUGGU AGGAUAGUGG CCUACCAUGG UUUCAACGGG UAACGGGGAA UAAGGGUUCG AUUCCGGAGA GGGAGCCUGA GAAA CGGCU ACCACAUCCA AGGAAGGCAG CAGGCGCGCA AAUUACCCAA UCCUAAUUCA GGGAGGUAGU GACAAUAAAU AACGA UACA GGGCCCAUUC GGGUCUUGUA AUUGGAAUGA GUACAAUGUA AAUACCUUAA CGAGGAACAA CUGGAGGGCA AGUCUG GUG CCAGCAGCCG CGGUAAUUCC AGCUCCAGUA GCGUAUAUUA AAGUUGUUGC AGUUAAAAAG CUCGUAGUUG AACUUUG GG UCUGGUUGUC CGGUCCGACU UUAUGUCGCG CACUGGUUUU CAACCGGAUC UUUCCUUCUG GCUAACCUGU ACUCCUUG U GGGUGCAGGC GAACCAGGAC UUUUACUUUG AAAAAAUUAG AGUGUUCAAA GCAGGCGAAA GCUCGAAUAU AUUAGCAUG GAAUAAUGGA AUAGGACGUU UGGUUCUAUU UUGUUGGUUU CUAGGACCAU CGUAAUGAUU AAUAGGGACG GUCGGGGGCA UCAGUAUUC AAUUGUCAGA GGUGAAAUUC UUGGAUUUAU UGAAGACUAA CUACUGCGAA AGCAUUUGCC AAGGACGUUU U CAUUAAUC AAGAACGAAA GUUAGGGGAU CGAAGAUGAU CAGAUACCGU CGUAGUCUUA ACCAUAAACU AUGCCGACUA GG GAUCGGG UGGUGUUUUU CUUAUGACCC ACUCGGCACC UUACGAGAAA UCAAAGUCUU UGGGUUCUGG GGGGAGUAUG GUC GCAAGG CUGAAACUUA AAGGAAUUGA CGGAAGGGCA CCACCAGGAG UGGAGCCUGC GGCUUAAUUU GACUCAACAC GGGG AAACU CACCAGGUCC AGACACAAUA AGGAUUGACA GAUUGAGAGC UCUUUCUUGA UUUUGUGGGU GGUGGUGCAU GGCCG UUCU UAGUUGGUGG AGUGAUUUGU CUGCUUAAUU GCGAUAACGA ACGAGACCUU AACCUACUAA AUAGGGUUGC UGGCAC UUG CCGGUUGACU CUUCUUAGAG GGACUAUCGG UUUCAAGCCG AUGGAAGUUU GAGGCAAUAA CAGGUCUGUG AUGCCCU UA GACGUUCUGG GCCGCACGCG CGCUACACUG ACGGAGCCAG CGAGUACAAC CUUGGCCGAG AGGUCUGGGU AAUCUUGU G AAACUCCGUC GUGCUGGGGA UAGAGCAUUG UAAUUAUUGC UCUUCAACGA GGAAUUCCUA GUAAGCGCAA GUCAUCAGC UUGCGUUGAU UACGUCCCUG CCCUUUGUAC ACACCGCCCG UCGCUAGUAC CGAUUGAAUG GCUUAGUGAG GCCUCAGGAU UUGCUUAGA GAAGGGGGCA ACUCCAUCUC AGAGCGAAGA AUCUGGUCAA ACUUGGUCAU UUAGAGGAAC UAAAAGUCGU A ACAAGGUU UCCGUAGGUG AACCUGCGGA AGGAUCAUUA

GENBANK: GENBANK: CR382124.1

+
分子 #20: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 20 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 4.321563 KDa
配列文字列:
AUCUCUCUCU AUGC

+
分子 #28: tRNAi (75-MER)

分子名称: tRNAi (75-MER) / タイプ: rna / ID: 28 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 24.223482 KDa
配列文字列:
AGCGCCGUGG CGCAGUGGAA GCGCGCAGGU CUCAUAAACC UGAUGUCCUC GGAUCGAAAC CGAGCGGCGC UACCA

GENBANK: GENBANK: K00321.1

+
分子 #2: KLLA0F09812p

分子名称: KLLA0F09812p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 23.162922 KDa
配列文字列: GWVPVTKLGR LVKAGKISSI EEIFLHSLPV KEFQIIDQLL PNLKDEVMNI KPVQKQTRAG QRTRFKAVVV VGDSNGHVGL GIKTAKEVA GAIRAGIIIA KLSVIPIRRG YWGTNLGQPH SLATKTSGKC GSVSVRLIPA PRGSGIVASP AVKKLMQLAG V EDVYTSST ...文字列:
GWVPVTKLGR LVKAGKISSI EEIFLHSLPV KEFQIIDQLL PNLKDEVMNI KPVQKQTRAG QRTRFKAVVV VGDSNGHVGL GIKTAKEVA GAIRAGIIIA KLSVIPIRRG YWGTNLGQPH SLATKTSGKC GSVSVRLIPA PRGSGIVASP AVKKLMQLAG V EDVYTSST GSTRTLENTL KAAFVAIGNT YGFLTPNLWE VQALTPSPMD VYADYATAS

UniProtKB: KLLA0F09812p

+
分子 #3: KLLA0D08305p

分子名称: KLLA0D08305p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 24.830895 KDa
配列文字列: AIISKKRKLV ADGVFYAELN EFFTRELAEE GYSGVEVRVT PTKTEIIIRA TKVQDVVGEN GRRINELTLL IEKRFKYKRG TIALYAERV HDRGLSAVAQ AESMKFKLLN GLAIRRAAYG VVRYVMESGA KGCEVVISGK LRAARAKSMK FADGFLIHSG Q PVNDFIET ...文字列:
AIISKKRKLV ADGVFYAELN EFFTRELAEE GYSGVEVRVT PTKTEIIIRA TKVQDVVGEN GRRINELTLL IEKRFKYKRG TIALYAERV HDRGLSAVAQ AESMKFKLLN GLAIRRAAYG VVRYVMESGA KGCEVVISGK LRAARAKSMK FADGFLIHSG Q PVNDFIET ATRHVLLRQG VLGIKVKIMK DPSRNTSGPK ALPDAVTIIE PKEEEPVLEP SVKDY

UniProtKB: 40S ribosomal protein S3

+
分子 #4: KLLA0D10659p

分子名称: KLLA0D10659p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 22.912369 KDa
配列文字列: FVPVELATTI PVEIQQAQQE IKLFNKWSFE DVEVKDASLV DYIQISKPIY VAHTAGRYAN KRFRKAQCPI VERLTNSLMM NGRNNGKKL KAVRIVKHTL EIINVLTDQN PLQVVVDAII NSGPREDTTR VGGGGAARRQ AVDVSPLRRV NQSIALLTIG A REAAFRNI ...文字列:
FVPVELATTI PVEIQQAQQE IKLFNKWSFE DVEVKDASLV DYIQISKPIY VAHTAGRYAN KRFRKAQCPI VERLTNSLMM NGRNNGKKL KAVRIVKHTL EIINVLTDQN PLQVVVDAII NSGPREDTTR VGGGGAARRQ AVDVSPLRRV NQSIALLTIG A REAAFRNI KTIAETLAEE LINAAKGSST SYAIKKKDEL ERVAKSNR

UniProtKB: KLLA0D10659p

+
分子 #5: KLLA0B08173p

分子名称: KLLA0B08173p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 11.423085 KDa
配列文字列:
MLIPKEDRKK IYQHLFQEGV LVAKKDFNQP KHEEIDTKNL FVIKALQSLT SKGFVKTQFS WQYYYYTLTE EGVVYLREYL NLPEHIFPA TYLAGQS

UniProtKB: KLLA0B08173p

+
分子 #6: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 12.710457 KDa
配列文字列:
IEDALKVVLR TSLVHDGLAR GLRESAKALT RGEGQLAVLV ESVTEEAISK LVQGLATENN VPLIKVADAK QLGEWAGLGK IDRDGNARK VVGASVVVVK NWGADTQERE ILLEHFSQQ

UniProtKB: 40S ribosomal protein S12

+
分子 #7: KLLA0F07843p

分子名称: KLLA0F07843p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 13.220561 KDa
配列文字列:
KTYSYKGVDL EKLLEMPTED FVKLAPARVR RKFARGLSEK PAGLMKKLRA AKLSAPENEK PAVVRTHLRN MIIVPEMIGS VVGVYNGKV FNQVEIRPEM VGHYLGEFSI TYTPVRHG

UniProtKB: KLLA0F07843p

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S16

分子名称: 40S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 15.656257 KDa
配列文字列:
TVPSVQTFGK KKSATAVAHV KAGKGLIKVN GSPITLVQPE ILRFKVYEPL LLVGLDKFAN IDIRVKVTGG GHVSQVYAIR QAIAKGLVA YHQKFVDEQS KNELKKAFTS YDRTLLIADS RRPEPKKFGG RGARSRFQKS YR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #9: KLLA0B01474p

分子名称: KLLA0B01474p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 14.886174 KDa
配列文字列:
GRVRTKTVKR ASKALIEKYY PKLTMDFQTN KRLCDEIATI QSKRLRNKIA GYTTHLMKRI QKGPVRGISF KLQEEERERK DQYVPDVSA LDLSHSNDVL NVDTQTAELV NSLGLKLPLS VSSVSAVRDR R

UniProtKB: KLLA0B01474p

+
分子 #10: KLLA0B01562p

分子名称: KLLA0B01562p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 16.953404 KDa
配列文字列:
SLVVQEQGSF QHILRLLNTN VDGNINVVYA LTTIRGVGRR YANLVCKKAD VDLHKRAGEL TQEELERIVQ IMQNPTHYKI PAWFLNRQK DVNDGKDYHS LANNLESKLR DDLERLKKIR SHRGIRHFWG LRVRGQHTKT TGRRRA

UniProtKB: KLLA0B01562p

+
分子 #11: KLLA0A07194p

分子名称: KLLA0A07194p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 15.747814 KDa
配列文字列:
PGVSVRDVPA QDFINNYASF LQRQGKLEVP GYVDIVKTSA GNELPPQDSE GWFYKRAASV ARHIYLRKQV GVGKLNKLYG GAKNRGVRP HKHVDASGSI NRKVLQSLEK LGVVEISPKG GRRISDNGLR DLDRIAAATL EDEE

UniProtKB: KLLA0A07194p

+
分子 #12: KLLA0F25542p

分子名称: KLLA0F25542p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 12.032146 KDa
配列文字列:
QEVVIHKIRI NLTSTKVKQL ENVSANIIKN AETFKLVKKG PVRLPTKVLK ISTRKTPNGE GSKTWDTYEM RIHKRYIDLE APAHIVKRI TQITIEPGVD VEVIIAA

UniProtKB: KLLA0F25542p

+
分子 #13: KLLA0B06182p

分子名称: KLLA0B06182p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 7.939246 KDa
配列文字列:
AKHAVVLDQD KFDRIMKEAP TYRYVSVSVL VDRFKLGGSL ARVALRHLEN EGIIKPVSKH SKQAIYTRAT

UniProtKB: 40S ribosomal protein S25

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S28

分子名称: 40S ribosomal protein S28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 6.972152 KDa
配列文字列:
PVTLAKVIKV LGRTGSRGGV TQVRVEFLED TTRTIVRNVK GPVREGDILV LMESEREARR LR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS28

+
分子 #15: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a

分子名称: Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 7.958424 KDa
配列文字列:
KKVYTTPKKI RHKHKKVKLA VLNYYKVDDE GKVAKLRKEC PNCGPGIFLA NHGDRFYCGK CHSTFATQK

UniProtKB: Ubiquitin-ribosomal protein eS31 fusion protein

+
分子 #16: KLLA0E12277p

分子名称: KLLA0E12277p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 35.612676 KDa
配列文字列: SSNIMLVLRG TLEGHNGWVT SLSTSAAQPN LLVSGSRDKT LISWRLTENE QQFGVPVRSY KGHSHIVQDV VVSADGNYAV SASWDKTLR LWNLATGNSE ARFVGHTGDV LSVAIDANSS KIISASRDKT IRVWNTVGDC AYVLLGHTDW VTKVRVAPKN L EDGEVDDG ...文字列:
SSNIMLVLRG TLEGHNGWVT SLSTSAAQPN LLVSGSRDKT LISWRLTENE QQFGVPVRSY KGHSHIVQDV VVSADGNYAV SASWDKTLR LWNLATGNSE ARFVGHTGDV LSVAIDANSS KIISASRDKT IRVWNTVGDC AYVLLGHTDW VTKVRVAPKN L EDGEVDDG RITFVSAGMD KIVRSWSLNE DSYRIEADFI GHNNYINVVQ PSPDGSLAAS AGKDGQIYVW NLKHKSAFMN FD AKDEVFA LAFSPSRFWL TAATASGIKI YDLENEVLID ELKPEFAGYT KAQDPHAVSL AWSADGQTLF AGYTDNVIRV WQV MTAN

UniProtKB: KLLA0E12277p

+
分子 #17: 40S ribosomal protein S29

分子名称: 40S ribosomal protein S29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 6.322149 KDa
配列文字列:
ENVWYSHPRK FGKGSRQCRI SGSHSGLIRK YGLNIDRQSF REKANDIGFY KYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 6.608788 KDa
配列文字列:
VHGSLARAGK VKSQTPKVEK QEKPKQPKGR AYKRLLYTRR FVNVTLTNGK RKMNPSPS

UniProtKB: 40S ribosomal protein S30

+
分子 #19: 60S ribosomal protein L41-A

分子名称: 60S ribosomal protein L41-A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 3.354243 KDa
配列文字列:
MRAKWRKKRT RRLKRKRRKV RARSK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS32A

+
分子 #21: Eukaryotic translation initiation factor 1A

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 1A / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 12.659412 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌)
配列文字列:
NTKGGKKGRR GKNDSDGPKR ELIYKEEGQE YAQITKMLGN GRVEASCFDG NKRMAHIRGK LRKKVWMGQG DIILVSLRDF QDDQCDVVH KYNLDEARTL KNQGELPENA KI

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 1A

+
分子 #22: Eukaryotic translation initiation factor eIF-1

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor eIF-1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 10.29901 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌)
配列文字列:
EAATANYIHI RIQQRNGRKT LTTVQGVPEE YDLKRILKVL KKDFACNGNI VKDPEMGEII QLQGDQRAKV CEFMISQLGL QKKNIKIHG F

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor eIF-1

+
分子 #23: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A,eIF3a

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A,eIF3a
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 62.822781 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: PFRPENAIKR ADELISVGEK QAALQSLHDF ITARRIRWAT PSTVEPVVFK FLEIGVELKK GKLLKDGLHQ YKKLIQGSTE GLVSVGAVA RKFIDLVESK IASEQTRADE LQKQEIDDDL EGGVTPENLL ISVYESDQSV AGFNDEAITS WLRFTWESYR A VLDLLRNN ...文字列:
PFRPENAIKR ADELISVGEK QAALQSLHDF ITARRIRWAT PSTVEPVVFK FLEIGVELKK GKLLKDGLHQ YKKLIQGSTE GLVSVGAVA RKFIDLVESK IASEQTRADE LQKQEIDDDL EGGVTPENLL ISVYESDQSV AGFNDEAITS WLRFTWESYR A VLDLLRNN ALLEITYSGV VKKTMHFCLK YQRKNEFKRL AEMLRQHLDA ANYQQSKSGN NLVDLSDADT LQRYLDQRFQ QV DVSVKLE LWHEAYRSIE DVFHLMKISK RAPKPSTLAN YYENLVKVFF VSGDPLLHTT AWKKFYKLYS TNPRATEEEF KTY SSTIFL SAISTQLDEI PSIGYDPHLR MYRLLNLDAK PTRKEMLQSI IEDESIYGKV DEELKELYDI IEVNFDVDTV KQQL ENLLV KLSSKTYFSQ YIAPLRDVIM RRVFVAASQK FTTVSQSELY KLATLPAPLD LSAWDIEKSL LQAAVEDYVS ITIDH ESAK VTFA(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A

+
分子 #24: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 80.545891 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: YDSSDEESDE EDGKKVVKSA KEKLLDEMQD VYNKISQAEN SDDWLTISNE FDLISRLLVR AQQQNWGTPN IFIKVVAQVE DAVNNTQQA DLKNKAVARA YNTTKQRVKK VSRENEDSMA KFRNDPESFD KEPTADLDIS ANGFTISSSQ GNDQAVQEDF F TRLQTIID ...文字列:
YDSSDEESDE EDGKKVVKSA KEKLLDEMQD VYNKISQAEN SDDWLTISNE FDLISRLLVR AQQQNWGTPN IFIKVVAQVE DAVNNTQQA DLKNKAVARA YNTTKQRVKK VSRENEDSMA KFRNDPESFD KEPTADLDIS ANGFTISSSQ GNDQAVQEDF F TRLQTIID SRGKKTVNQQ SLISTLEELL TVAEKPYEFI MAYLTLIPSR FDASANLSYQ PIDQWKSSFN DISKLLSILD QT IDTYQVN EFADPIDFIE DEPKEDSDGV KRILGSIFSF VERLDDEFMK SLLNIDPHSS DYLIRLRDEQ SIYNLILRTQ LYF EATLKD EHDLERALTR PFVKRLDHIY YKSENLIKIM ETAAWNIIPA QFKSKFTSKD QLDSADYVDN LIDGLSTILS KQNN IAVQK RAILYNIYYT ALNKDFQTAK DMLLTSQVQT NINQFDSSLQ ILFNRVVVQL GLSAFKLCLI EECHQILNDL LSSSH LREI LGQQSLHRIS LNSSNNASAD ERARQCLPYH QHINLDLIDV VFLTCSLLIE IPRMTAFYSG IKVKRIPYSP KSIRRS LEH YDKLSFQGPP ETLRDYVLFA AKSMQKGNWR DSVKYLREIK SWALLPNMET VLNSLTERVQ VESLKTYFFS FKRFYSS FS VAKLAELFDL PENKVVEVLQ SVIAELEIPA KLNDEKTIFV VEKGDEITKL EEAMVKL

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C

+
分子 #25: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 47.230148 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: LSAEIINRQA TINIGTIGHV AHGKSTVVRA ISGVQTVRFK DELERNITIK LGYANAKIYK CQEPTCPEPD CYRSFKSDKE ISPKCQRPG CPGRYKLVRH VSFVDCPGHD ILMSTMLSGA AVMDAALLLI AGNESCPQPQ TSEHLAAIEI MKLKHVIILQ N KVDLMREE ...文字列:
LSAEIINRQA TINIGTIGHV AHGKSTVVRA ISGVQTVRFK DELERNITIK LGYANAKIYK CQEPTCPEPD CYRSFKSDKE ISPKCQRPG CPGRYKLVRH VSFVDCPGHD ILMSTMLSGA AVMDAALLLI AGNESCPQPQ TSEHLAAIEI MKLKHVIILQ N KVDLMREE SALEHQKSIL KFIRGTIADG APIVPISAQL KYNIDAVNEF IVKTIPVPPR DFMISPRLIV IRSFDVNKPG AE IEDLKGG VAGGSILNGV FKLGDEIEIR PGIVTKDDKG KIQCKPIFSN IVSLFAEQND LKFAVPGGLI GVGTKVDPTL CRA DRLVGQ VVGAKGHLPN IYTDIEINYF LLRRLLGVKT DGQKQAKVRK LEPNEVLMVN IGSTATGARV VAVKADMARL QLTS PACTE INEKIALSRR IEKHWRLIGW ATIKK

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit gamma

+
分子 #26: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 16.45809 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列:
VGLPYSELLS RFFNILRTNN PELAGDRSGP KFRIPPPVCL RDGKKTIFSN IQDIAEKLHR SPEHLIQYLF AELGTSGSVD GQKRLVIKG KFQSKQMENV LRRYILEYVT CKTCKSINTE LKREQSNRLF FMVCKSCGST RSVSS

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta

+
分子 #27: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha
タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 30.221979 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: TSHCRFYENK YPEIDDIVMV NVQQIAEMGA YVKLLEYDNI EGMILLSELS RRRIRSIQKL IRVGKNDVAV VLRVDKEKGY IDLSKRRVS SEDIIKCEEK YQKSKTVHSI LRYCAEKFQI PLEELYKTIA WPLSRKFGHA YEAFKLSIID ETVWEGIEPP S KDVLDELK ...文字列:
TSHCRFYENK YPEIDDIVMV NVQQIAEMGA YVKLLEYDNI EGMILLSELS RRRIRSIQKL IRVGKNDVAV VLRVDKEKGY IDLSKRRVS SEDIIKCEEK YQKSKTVHSI LRYCAEKFQI PLEELYKTIA WPLSRKFGHA YEAFKLSIID ETVWEGIEPP S KDVLDELK NYISKRLTPQ AVKIRADVEV SCFSYEGIDA IKDALKSAED MSTEQMQVKV KLVAAPLYVL TTQALDKQKG IE QLESAIE KITEVITKYG GVCNIT

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit alpha

+
分子 #29: 40S ribosomal protein S0

分子名称: 40S ribosomal protein S0 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 24.368662 KDa
配列文字列: SLPSTFDLTS EDAQLLLAAR VHLGAKNVQV HQEPYVYKAR PDGVNVINVG KTWEKIVLAA RIIAAIPNPE DVVAISSRTY GQRAVLKYA AHTGATPIAG RFTPGSFTNY ITRSFKEPRL VIVTDPRSDA QAIKESSYVN IPVIALTDLD SPSEYVDVAI P CNNRGKHS ...文字列:
SLPSTFDLTS EDAQLLLAAR VHLGAKNVQV HQEPYVYKAR PDGVNVINVG KTWEKIVLAA RIIAAIPNPE DVVAISSRTY GQRAVLKYA AHTGATPIAG RFTPGSFTNY ITRSFKEPRL VIVTDPRSDA QAIKESSYVN IPVIALTDLD SPSEYVDVAI P CNNRGKHS IGLIWYLLAR EVLRLRGALP DRTQPWAIMP DLYFYRNPEE IEQQTAEEEA V

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #30: 40S ribosomal protein S1

分子名称: 40S ribosomal protein S1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 26.404725 KDa
配列文字列: VGKNKRLSKG KKGLKKRVVD PFTRKEWYDI KAPSTFENRN VGKTLVNKSV GLKNASDSLK GRVVEVCLAD LQGSEDHSFR KVKLRVDEV QGKNLLTNFH GMDFTTDKLR SMVRKWQTLI EANVTVKTSD DYVLRIFAIA FTRKQANQVK RTSYAQSSHI R QIRKVISE ...文字列:
VGKNKRLSKG KKGLKKRVVD PFTRKEWYDI KAPSTFENRN VGKTLVNKSV GLKNASDSLK GRVVEVCLAD LQGSEDHSFR KVKLRVDEV QGKNLLTNFH GMDFTTDKLR SMVRKWQTLI EANVTVKTSD DYVLRIFAIA FTRKQANQVK RTSYAQSSHI R QIRKVISE ILTREVQNST LAQLTSKLIP EVINKEIENA TKDIFPLQNV HIRKVKLLKQ PKFDLGSLLS LHG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS1

+
分子 #31: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 29.486312 KDa
配列文字列: ARGPKKHLKR LAAPHHWMLD KLSGCYAPRP SAGPHKLRES LPLIVFLRNR LKYALNGREV KAILMQRHVK VDGKVRTDTT FPAGFMDVI TLEATNENFR LVYDVKGRFA VHRITDEEAS YKLAKVKKVQ LGKKGIPYVV THDGRTIRYP DPNIKVNDTV K VDLATGTI ...文字列:
ARGPKKHLKR LAAPHHWMLD KLSGCYAPRP SAGPHKLRES LPLIVFLRNR LKYALNGREV KAILMQRHVK VDGKVRTDTT FPAGFMDVI TLEATNENFR LVYDVKGRFA VHRITDEEAS YKLAKVKKVQ LGKKGIPYVV THDGRTIRYP DPNIKVNDTV K VDLATGTI TDFIKFDTGK LVYVTGGRNL GRVGTIVHRE RHEGGFDLVH IKDSLENTFV TRLNNVFVIG EPGRPWISLP KG KGIKLTI SEERDRRRAQ HGL

UniProtKB: 40S ribosomal protein S4

+
分子 #32: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 25.810977 KDa
配列文字列: MKLNISYPIN GTQKCIEIDD EHRVRVFYDK RIGQEVDGES VGDEFKGYVF KIAGGNDKQG FPMKQGVLLP TRVKLLLAKG HSCYRPRRN GERKRKSVRG AIVGPDLAVL ALIITKKGEQ EIEGITNDTV PKRLGPKRAN NIRKFFGLTK EDDVRDYVIR R EVTKGDKS ...文字列:
MKLNISYPIN GTQKCIEIDD EHRVRVFYDK RIGQEVDGES VGDEFKGYVF KIAGGNDKQG FPMKQGVLLP TRVKLLLAKG HSCYRPRRN GERKRKSVRG AIVGPDLAVL ALIITKKGEQ EIEGITNDTV PKRLGPKRAN NIRKFFGLTK EDDVRDYVIR R EVTKGDKS YTKAPKIQRL VTPQRLQRKR QQKSLKIKNA QAQREAAAEY AQLLAKRLSE RKAEKAEV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS6

+
分子 #33: 40S ribosomal protein S7

分子名称: 40S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 21.03357 KDa
配列文字列:
PQAKILSQAP TELELQVAQA FIDLENNSPE LKADLRALQF KSIREIEVAG GKKALAVFVP VPSLAAYHKV QIKLTRELEK KFQDRHVIF LAERRILPKP SRKSRQTQKR PRSRTLTAVH DKILEDLVFP TEIVGKRVRY LVGGNKIQKI LLNSKDVQHI D NKLESFQA VYNKLTGKQI VFEIPS

UniProtKB: 40S ribosomal protein S7

+
分子 #34: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 22.511531 KDa
配列文字列: GISRDSRHKR AATGAKRAQF RKKRKFELGR QAANTKIGTK RIHPVRTRGG NQKFRALRIE TGNFSWASEG VARKTRITGV VYHPSNNEL VRTNTLTKAA IVQIDATPFR QWYESHYGQS LGKKKNTKAE EETATTSKNT ERKWAARAAE AKIEHAVDSQ F GAGRLYAA ...文字列:
GISRDSRHKR AATGAKRAQF RKKRKFELGR QAANTKIGTK RIHPVRTRGG NQKFRALRIE TGNFSWASEG VARKTRITGV VYHPSNNEL VRTNTLTKAA IVQIDATPFR QWYESHYGQS LGKKKNTKAE EETATTSKNT ERKWAARAAE AKIEHAVDSQ F GAGRLYAA ISSRPGQSGR CDGYILEGEE LAFYLRRLTA KK

UniProtKB: 40S ribosomal protein S8

+
分子 #35: KLLA0E23673p

分子名称: KLLA0E23673p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 20.882344 KDa
配列文字列:
PRAPRTYSKT YSTPKRPYES ARLDAELKLA GEYGLKNKRE IYRISFQLSK IRRAARDLLT RDEKDPKRLF EGNALIRRLV RIGVLSEDK KKLDYVLALK VEDFLERRLQ TQVYKLGLAK SVHHARVLIS QRHIAVGKQI VNIPSFMVRL ESEKHIDFAR T SPFGGARP GRVARKRAAA AGGE

UniProtKB: KLLA0E23673p

+
分子 #36: KLLA0A10483p

分子名称: KLLA0A10483p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 17.712734 KDa
配列文字列:
STELTVQSER AFQKQPHIFT NPKAKANRKT KRWYKNVGLG FKTPKTAIEG SYIDKKCPFT GLVSIRGKIL TGTVVSTRMH RTIVIRRDY LHYVPKYNRY EKRHKNVPAH VSPAFRVQVG DIVTVGQCRP ISKTVRFNVL KVASATGKAN KQFAKF

UniProtKB: KLLA0A10483p

+
分子 #37: KLLA0F18040p

分子名称: KLLA0F18040p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 16.858678 KDa
配列文字列:
GRMHSKGKGM SSSAIPYSRN APAWFKGSSD GVVEQIIKYA RKGLTPSQIG VLLRDAHGVT QAKVITGNKI LRILKSNGLA PEIPEDLYF LIKKAVSVRK HLERNRKDKD AKFRLILIES RIHRLARYYR TVSVLPPNWK YESATASALV N

UniProtKB: KLLA0F18040p

+
分子 #38: 40S ribosomal protein S14

分子名称: 40S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 13.458439 KDa
配列文字列:
SQVFGVARIF ASFNDTFVHV TDLSGRETIA RVTGGMKVKA DRDESSPYAA MLAAQDVAAK CKEVGITAVH IKIRATGGTR SKTPGPGGQ AALRALARSG LRIGRIEDVT PVPSDSTRKK GGRRGRRL

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #39: 40S ribosomal protein S21

分子名称: 40S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 9.797949 KDa
配列文字列:
MENDKGQLVE LYVPRKCSAT NRIIKAKDHS SVQINIAQVD EEGRAIPGEY VTYALSGYIR ARGEADDSLN RLAQQDGLLK NVWSYSR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein eS21

+
分子 #40: 40S ribosomal protein S22

分子名称: 40S ribosomal protein S22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 14.513846 KDa
配列文字列:
TRTSVLADAL NAINNAEKTG KRQVLIRPSS KVIIKFLQVM QKHGYIGEFE YIDDHRSGKI VVQLNGRLNK CGVISPRFNV KIADVEKWT ANLLPARQFG YVILTTSAGI MDHEEAHRKH VSGKILGFVY

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #41: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 15.063354 KDa
配列文字列:
SDAITIRTRK VISNPLLARK QFVVDVLHPN RANVSKDELR EKLAEAYKAE KDAVSVFGFR TQYGGGKSTG FGLVYNSVAD AKKFEPAYR LVRYGLAEKV EKASRQQRKQ RKNRGKKIFG TGKSIAKKAA RRNAD

UniProtKB: 40S ribosomal protein S24

+
分子 #42: RPS23

分子名称: RPS23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 15.916701 KDa
配列文字列:
GKGKPRGLNS ARKLRVHRRN NRWAETTYKK RLLGTAFKSS PFGGSSHAKG IVLEKIGIES KQPNSAIRKC VRVQLIKNGK KVTAFVPND GCLNFVDEND EVLLAGFGRK GKAKGDIPGV RFKVVKVSGV SLLALWKEKK EKPRS

UniProtKB: RPS23

+
分子 #43: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 11.166179 KDa
配列文字列:
PKKRASNGRN KKGRGHVKPV RCVNCSRSVP KDKAIKRMAI RNIVEAAAIR DLSEASVYAE YALPKTYNKL HYCISCAIHA RIVRVRSRT DRRIRAPPQ

UniProtKB: 40S ribosomal protein S26

+
分子 #44: 40S ribosomal protein S27

分子名称: 40S ribosomal protein S27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) (酵母)
分子量理論値: 8.753168 KDa
配列文字列:
VLVQDLLHPT AASEARKHKL KTLVQSPRSH FLDVKCPGCL NITTVFSHAQ TAVTCESCST VLCTPTGGKA KLSEGTSFRR K

UniProtKB: 40S ribosomal protein S27

+
分子 #45: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B
タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 76.738898 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: EFNFDQYIVV NGAPVIPSAK VPVLKKALTS LFSKAGKVVN MEFPIDEATG KTKGFLFVEC GSMNDAKKII KSFHGKRLDL KHRLFLYTM KDVERYNSDD FDTEFREPDM PTFVPSSSLK SWLMDDKVRD QFVLQDDVKT SVFWNSMFNE EDSLVESREN W STNYVRFS ...文字列:
EFNFDQYIVV NGAPVIPSAK VPVLKKALTS LFSKAGKVVN MEFPIDEATG KTKGFLFVEC GSMNDAKKII KSFHGKRLDL KHRLFLYTM KDVERYNSDD FDTEFREPDM PTFVPSSSLK SWLMDDKVRD QFVLQDDVKT SVFWNSMFNE EDSLVESREN W STNYVRFS PKGTYLFSYH QQGVTAWGGP NFDRLRRFYH PDVRNSSVSP NEKYLVTFST EPIIVEEDNE FSPFTKKNEG HQ LCIWDIA SGLLMATFPV IKSPYLKWPL VRWSYNDKYC ARMVGDSLIV HDATKNFMPL EAKALKPSGI RDFSFAPEGV KLQ PFRNGD EPSVLLAYWT PETNNSACTA TIAEVPRGRV LKTVNLVQVS NVTLHWQNQA EFLCFNVERH TKSGKTQFSN LQIC RLTER DIPVEKVELK DSVFEFGWEP HGNRFVTISV HEVADMNYAI PANTIRFYAP ETKEKTDVIK RWSLVKEIPK TFANT VSWS PAGRFVVVGA LVGPNMRRSD LQFYDMDYPG EKNINDNNDV SASLKDVAHP TYSAATNITW DPSGRYVTAW SSSLKH KVE HGYKIFNIAG NLVKEDIIAG FKNFAWRPRP ASILSNAERK KVRKNLREWS AQFEEQDAME ADTAMRDLIL HQRELLK QW TEYREKIGQE MEKSMNFKIF DVQP

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B

+
分子 #46: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I
タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 38.229754 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列: MKAIKLTGHE RPLTQVKYNK EGDLLFSCSK DSSASVWYSL NGERLGTLDG HTGTIWSIDV DCFTKYCVTG SADYSIKLWD VSNGQCVAT WKSPVPVKRV EFSPCGNYFL AILDNVMKNP GSINIYEIER DSATHELTKV SEEPIHKIIT HEGLDAATVA G WSTKGKYI ...文字列:
MKAIKLTGHE RPLTQVKYNK EGDLLFSCSK DSSASVWYSL NGERLGTLDG HTGTIWSIDV DCFTKYCVTG SADYSIKLWD VSNGQCVAT WKSPVPVKRV EFSPCGNYFL AILDNVMKNP GSINIYEIER DSATHELTKV SEEPIHKIIT HEGLDAATVA G WSTKGKYI IAGHKDGKIS KYDVSNNYEY VDSIDLHEKS ISDMQFSPDL TYFITSSRDT NSFLVDVSTL QVLKKYETDC PL NTAVITP LKEFIILGGG QEAKDVTTTS ANEGKFEARF YHKIFEEEIG RVQGHFGPLN TVAISPQGTS YASGGEDGFI RLH HFEKSY FDFKYDVEKA AEAKEH

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit I

+
分子 #47: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G

分子名称: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G
タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) (パン酵母)
分子量理論値: 5.576158 KDa
組換発現生物種: Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)
配列文字列:
SVAERKNWHK YGSEKGSPAG PSAVTARLGE EVELRLSRNW KQAEEERIQ

UniProtKB: Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit G

+
分子 #48: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 81 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #49: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 4 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #50: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER

分子名称: PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 1 / 式: GCP
分子量理論値: 521.208 Da
Chemical component information

ChemComp-G2P:
PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER / GMPCPP / GMP-CPP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM

+
分子 #51: METHIONINE

分子名称: METHIONINE / タイプ: ligand / ID: 51 / コピー数: 1 / 式: MET
分子量理論値: 149.211 Da
Chemical component information

ChemComp-MET:
METHIONINE / メチオニン

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度0.18 mg/mL
緩衝液pH: 6.5
構成要素:
濃度名称
20.0 mMMES
8.0 mMMagnessium acetate
40.0 mMPotassium acetate
10.0 mMAmmonium acetate
2.0 mMDithiothreitol (DTT)
0.25 mMGDPCP
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK I

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
温度最低: 90.0 K / 最高: 100.0 K
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
検出モード: INTEGRATING / 撮影したグリッド数: 3 / 実像数: 5500 / 平均露光時間: 1.1 sec. / 平均電子線量: 32.0 e/Å2
詳細: Images were collected in movie-mode at 32 frames per second
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm / 最大 デフォーカス（公称値）: 3.5 µm / 最小 デフォーカス（公称値）: 1.5 µm / 倍率（公称値）: 59000
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

粒子像選択選択した数: 1182309
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
PDBモデル - PDB ID:

4v88

最終 再構成想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 5.75 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4) / 使用した粒子像数: 12586
初期 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 角度割当タイプ: ANGULAR RECONSTITUTION / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)
最終 3次元分類ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 1.4)

-
原子モデル構築 1

精密化空間: RECIPROCAL / プロトコル: OTHER / 当てはまり具合の基準: FSC
得られたモデル

PDB-6gsn:
Structure of a partial yeast 48S preinitiation complex in closed conformation

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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