ChemComp-DVS: 5'-S-[3-(N'-benzylcarbamimidamido)propyl]-5'-thioadenosine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: DVS
• 名称: 名称: 5'-S-[3-(N'-benzylcarbamimidamido)propyl]-5'-thioadenosine

Chemical information

組成

組成式: C₂₁H₂₈N₈O₃S / 原子数: 61 / 化学式量: 472.564 / 形式電荷: 0

その他

8g2f

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: DVS / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 8G2F

履歴

作成	2023年4月26日
公開	2023年5月10日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: N=C(NCc1ccccc1)NCCCSCC1OC(n2cnc3c(N)ncnc32)C(O)C1O
• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CSCCCNC(=N)NCc4ccccc4)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: c1ccc(cc1)CNC(=N)NCCCSCC2C(C(C(O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CSCCCNC(=N)NCc4ccccc4)[C@@H](O)[C@H]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: [H]/N=C(/NCCCSC[C@@H]1[C@H]([C@H]([C@@H](O1)n2cnc3c2ncnc3N)O)O)\NCc4ccccc4

InChI

• InChI 1.06: InChI=1S/C21H28N8O3S/c22-18-15-19(27-11-26-18)29(12-28-15)20-17(31)16(30)14(32-20)10-33-8-4-7-24-21(23)25-9-13-5-2-1-3-6-13/h1-3,5-6,11-12,14,16-17,20,30-31H,4,7-10H2,(H2,22,26,27)(H3,23,24,25)/t14-,16-,17-,20-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.06: LTPOXWXTHQVJKG-WVSUBDOOSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 5'-S-[3-(N'-benzylcarbamimidamido)propyl]-5'-thioadenosine
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: 1-[3-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]propyl]-3-(phenylmethyl)guanidine

PDBエントリ

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PDB-8g2f:
Crystal Structure of PRMT3 with Compound II710