ChemComp-DM9: N-HYDROXYMETHYL-N-(2-METHOXYETHYL)-DAUNOMYCIN

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: DM9
名称	名称: N-hydroxymethyl-N-(2-methoxyethyl)-daunomycin

組成

組成式: C₃₁H₃₉NO₁₂ / 原子数: 83 / 化学式量: 617.641 / 形式電荷: 0

その他

482d

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAD / 3文字コード: DM9 / モデル座標のPDB-ID: 482D

履歴

作成	1999年7月30日
記述子を修正	2011年6月4日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 10.04	O=C(C)C5(O)CC(OC1OC(C(O)C(N(CCOC)CO)C1)C)c4c(O)c3c(O)c2c(OC)cccc2c(O)c3c(O)c4C5
CACTVS 3.341	COCCN(CO)[CH]1C[CH](O[CH](C)[CH]1O)O[CH]2C[C](O)(Cc3c(O)c4c(O)c5cccc(OC)c5c(O)c4c(O)c23)C(C)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	CC1C(C(CC(O1)OC2CC(Cc3c2c(c4c(c3O)c(c5cccc(c5c4O)OC)O)O)(C(=O)C)O)N(CCOC)CO)O

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.341	COCCN(CO)[C@H]1C[C@@H](O[C@@H](C)[C@H]1O)O[C@H]2C[C@@](O)(Cc3c(O)c4c(O)c5cccc(OC)c5c(O)c4c(O)c23)C(C)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	C[C@H]1[C@H]([C@H](C[C@@H](O1)O[C@H]2C[C@@](Cc3c2c(c4c(c3O)c(c5cccc(c5c4O)OC)O)O)(C(=O)C)O)[N@@](CCOC)CO)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C31H39NO12/c1-14-26(35)18(32(13-33)8-9-41-3)10-21(43-14)44-20-12-31(40,15(2)34)11-17-23(20)30(39)25-24(28(17)37)27(36)16-6-5-7-19(42-4)22(16)29(25)38/h5-7,14,18,20-21,26,33,35-40H,8-13H2,1-4H3/t14-,18-,20-,21-,26+,31-/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	IURHBLXSEHXXFF-XGGCRALDSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	(1S,3S)-3-acetyl-3,5,6,11,12-pentahydroxy-10-methoxy-1,2,3,4-tetrahydrotetracen-1-yl 2,3,6-trideoxy-3-[(hydroxymethyl)(2-methoxyethyl)amino]-alpha-L-lyxo-hexopyranoside
OpenEye OEToolkits 1.5.0	1-[(2S,4S)-2,5,6,11,12-pentahydroxy-4-[(2R,4S,5S,6S)-5-hydroxy-4-(hydroxymethyl-(2-methoxyethyl)amino)-6-methyl-oxan-2-yl]oxy-7-methoxy-3,4-dihydro-1H-tetracen-2-yl]ethanone

全1件を表示しています

PDB-482d:
RELEASE OF THE CYANO MOIETY IN THE CRYSTAL STRUCTURE OF N-CYANOMETHYL-N-(2-METHOXYETHYL)-DAUNOMYCIN COMPLEXED WITH D(CGATCG)

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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