ChemComp-UDG: (2R,3R,4R,5S,6R)-2-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-d...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: UDG
• 名称: 名称: (2R,3R,4R,5S,6R)-2-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino}tetrahydro-2H-pyran-4-yl (3R)-3-hydroxytetradecanoate; 日化辞名称: UDP-2,3-ジ(3-ヒドロキシミリストイル)グルコサミン

Chemical information

組成

組成式: C₄₃H₇₇N₃O₂₀P₂ / 原子数: 145 / 化学式量: 1018.027 / 形式電荷: 0

その他

4ggi
PDB 未公開エントリ

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: UDG / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4GGI

履歴

作成	2012年8月8日
公開	2012年9月28日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / LipidMaps / 日化辞 / PubChem / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1C=CN(C(=O)N1)C2OC(C(O)C2O)COP(=O)(OP(=O)(OC3OC(C(O)C(OC(=O)CC(O)CCCCCCCCCCC)C3NC(=O)CC(O)CCCCCCCCCCC)CO)O)O
• CACTVS 3.370: CCCCCCCCCCC[CH](O)CC(=O)N[CH]1[CH](O[CH](CO)[CH](O)[CH]1OC(=O)C[CH](O)CCCCCCCCCCC)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CCCCCCCCCCCC(CC(=O)NC1C(C(C(OC1OP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)OC(=O)CC(CCCCCCCCCCC)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: CCCCCCCCCCC[C@@H](O)CC(=O)N[C@H]1[C@H](O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1OC(=O)C[C@H](O)CCCCCCCCCCC)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)N3C=CC(=O)NC3=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: CCCCCCCCCCC[C@H](CC(=O)N[C@@H]1[C@H]([C@@H]([C@H](O[C@@H]1O[P@](=O)(O)O[P@@](=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)N3C=CC(=O)NC3=O)O)O)CO)O)OC(=O)C[C@@H](CCCCCCCCCCC)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C43H77N3O20P2/c1-3-5-7-9-11-13-15-17-19-21-29(48)25-34(51)44-36-40(64-35(52)26-30(49)22-20-18-16-14-12-10-8-6-4-2)38(54)31(27-47)63-42(36)65-68(59,60)66-67(57,58)61-28-32-37(53)39(55)41(62-32)46-24-23-33(50)45-43(46)56/h23-24,29-32,36-42,47-49,53-55H,3-22,25-28H2,1-2H3,(H,44,51)(H,57,58)(H,59,60)(H,45,50,56)/t29-,30-,31-,32-,36-,37-,38-,39-,40-,41-,42-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: KOJCFMYSTWNMQW-RUAJDYCTSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: (2R,3R,4R,5S,6R)-2-{[(S)-{[(S)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-{[(3R)-3-hydroxytetradecanoyl]amino}tetrahydro-2H-pyran-4-yl (3R)-3-hydroxytetradecanoate (non-preferred name)
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [(2R,3R,4R,5S,6R)-2-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-6-(hydroxymethyl)-5-oxidanyl-3-[[(3R)-3-oxidanyltetradecanoyl]amino]oxan-4-yl] (3R)-3-oxidanyltetradecanoate

PDBエントリ

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PDB-4j6e:
Structure of LPXI D225A Mutant