ChemComp-TXS: 1-(2,5-dideoxy-5-pyrrolidin-1-yl-beta-L-erythro-pentofuranosyl)-5...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: TXS
• 名称: 名称: 1-(2,5-dideoxy-5-pyrrolidin-1-yl-beta-L-erythro-pentofuranosyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione; 別称: 5'-deoxy-5'-pyrrolidin-1-ylthymidine

Chemical information

組成

組成式: C₁₄H₂₁N₃O₄ / 原子数: 42 / 化学式量: 295.334 / 形式電荷: 0

その他

3d8z

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: TXS / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 3D8Z

履歴

作成	2008年5月28日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / DrugBank / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=C1NC(=O)N(C=C1C)C2OC(C(O)C2)CN3CCCC3
• CACTVS 3.341: CC1=CN([CH]2C[CH](O)[CH](CN3CCCC3)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2CC(C(O2)CN3CCCC3)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: CC1=CN([C@@H]2C[C@@H](O)[C@H](CN3CCCC3)O2)C(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC1=CN(C(=O)NC1=O)[C@@H]2C[C@H]([C@@H](O2)CN3CCCC3)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C14H21N3O4/c1-9-7-17(14(20)15-13(9)19)12-6-10(18)11(21-12)8-16-4-2-3-5-16/h7,10-12,18H,2-6,8H2,1H3,(H,15,19,20)/t10-,11+,12+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: XUSBTLVYPZUOAW-WOPDTQHZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 1-(2,5-dideoxy-5-pyrrolidin-1-yl-beta-L-erythro-pentofuranosyl)-5-methylpyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: 1-[(2S,4R,5S)-4-hydroxy-5-(pyrrolidin-1-ylmethyl)oxolan-2-yl]-5-methyl-pyrimidine-2,4-dione

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-3d8z:
RNase A- 5'-Deoxy-5'-N-pyrrolidinothymidine complex