ChemComp-RVK: Adenosine 5'-diphosphoric acid beta-[(3beta,4beta-dihydroxy-5beta...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: RVK
• 名称: 名称: Adenosine 5'-diphosphoric acid beta-[(3beta,4beta-dihydroxy-5beta-methoxytetrahydrofuran-2alpha-yl)methyl] estere; 別称: [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] [(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-methoxy-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate; [[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-Aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] [(2R,3S,4R,5S)-3,4-dihydroxy-5-methoxyoxolan-2-yl]methyl hydrogen phosphate; J3.653.949F; alpha-1''-O-methyl-ADP ribose; 日化辞名称: アデノシン5′-二りん酸β-[(3β,4β-ジヒドロキシ-5β-メトキシテトラヒドロフラン-2α-イル)メチル]

Chemical information

組成

組成式: C₁₆H₂₅N₅O₁₄P₂ / 原子数: 62 / 化学式量: 573.342 / 形式電荷: 0

その他

7aqm

タイプ: non-polymer / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: RVK / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 7AQM

履歴

作成	2020年10月23日
Modify synonyms	2021年3月8日
公開	2021年6月16日

• 外部リンク: UniChem / Brenda / 日化辞 / PubChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• CACTVS 3.385: CO[CH]1O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)n3cnc4c(N)ncnc34)[CH](O)[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: COC1C(C(C(O1)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: CO[C@H]1O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)n3cnc4c(N)ncnc34)[C@@H](O)[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 2.0.7: CO[C@@H]1[C@@H]([C@@H]([C@H](O1)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C16H25N5O14P2/c1-30-16-12(25)10(23)7(34-16)3-32-37(28,29)35-36(26,27)31-2-6-9(22)11(24)15(33-6)21-5-20-8-13(17)18-4-19-14(8)21/h4-7,9-12,15-16,22-25H,2-3H2,1H3,(H,26,27)(H,28,29)(H2,17,18,19)/t6-,7-,9-,10-,11-,12-,15-,16+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: XNNSDOSOBTWHPT-DBXCYWGHSA-N

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-7aqm:
ADP-ribosylserine hydrolase ARH3 of Latimeria chalumnae in complex with alpha-1''-O-methyl-ADP-ribose (meADPr)

PDB-8azn:
Structure of SARS-CoV-2 NSP3 macrodomain in complex with alpha-1-O-Me-ADPR