ChemComp-MAR: 4'-EPI-4'-(2-DEOXYFUCOSE)DAUNOMYCIN

IDまたはキーワード:

登録情報	データベース: PDB化学物質要素 / ID: MAR
名称	名称: 4'-epi-4'-(2-deoxyfucose)daunomycin / 別称: MAR70; DAUNOMYCIN DERIVATIVE / 日化辞名称: MAR-70

組成

組成式: C₃₃H₃₉NO₁₃ / 原子数: 86 / 化学式量: 657.662 / 形式電荷: 0

その他

1d35

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAD / 3文字コード: MAR / モデル座標のPDB-ID: 1D35

履歴

作成	1999年7月8日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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SMILES

ACDLabs 10.04	O=C2c1c(O)c6c(c(O)c1C(=O)c3cccc(OC)c23)CC(O)(C(=O)C)CC6OC5OC(C(OC4OC(C(O)C(O)C4)C)C(N)C5)C
CACTVS 3.341	COc1cccc2C(=O)c3c(O)c4C[C](O)(C[CH](O[CH]5C[CH](N)[CH](O[CH]6C[CH](O)[CH](O)[CH](C)O6)[CH](C)O5)c4c(O)c3C(=O)c12)C(C)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	CC1C(C(CC(O1)OC2C(OC(CC2N)OC3CC(Cc4c3c(c5c(c4O)C(=O)c6cccc(c6C5=O)OC)O)(C(=O)C)O)C)O)O

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SMILES CANONICAL

CACTVS 3.341	COc1cccc2C(=O)c3c(O)c4C[C@](O)(C[C@H](O[C@H]5C[C@H](N)[C@H](O[C@H]6C[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](C)O6)[C@H](C)O5)c4c(O)c3C(=O)c12)C(C)=O
OpenEye OEToolkits 1.5.0	C[C@H]1[C@@H]([C@H](C[C@@H](O1)O[C@@H]2[C@@H](O[C@H](C[C@@H]2N)O[C@H]3C[C@@](Cc4c3c(c5c(c4O)C(=O)c6cccc(c6C5=O)OC)O)(C(=O)C)O)C)O)O

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InChI

InChI 1.03	InChI=1S/C33H39NO13/c1-12-27(37)18(36)9-22(44-12)47-32-13(2)45-21(8-17(32)34)46-20-11-33(42,14(3)35)10-16-24(20)31(41)26-25(29(16)39)28(38)15-6-5-7-19(43-4)23(15)30(26)40/h5-7,12-13,17-18,20-22,27,32,36-37,39,41-42H,8-11,34H2,1-4H3/t12-,13-,17-,18-,20-,21-,22-,27-,32+,33-/m0/s1

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InChIKey

InChI 1.03	QTGKDZKONUUXOU-NIGIIATCSA-N

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SYSTEMATIC NAME

ACDLabs 10.04	(1S,3S)-3-acetyl-3,5,12-trihydroxy-10-methoxy-6,11-dioxo-1,2,3,4,6,11-hexahydrotetracen-1-yl 3-amino-2,3,6-trideoxy-4-O-(2,6-dideoxy-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)-alpha-L-lyxo-hexopyranoside
OpenEye OEToolkits 1.5.0	(7S,9S)-7-[(2R,4S,5S,6S)-4-amino-5-[(2S,4S,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-methyl-oxan-2-yl]oxy-6-methyl-oxan-2-yl]oxy-9-ethanoyl-6,9,11-trihydroxy-4-methoxy-8,10-dihydro-7H-tetracene-5,12-dione

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PDB-1d35:
FACILE FORMATION OF A CROSSLINKED ADDUCT BETWEEN DNA AND THE DAUNORUBICIN DERIVATIVE MAR70 MEDIATED BY FORMALDEHYDE: MOLECULAR STRUCTURE OF THE MAR70-D(CGTNACG) COVALENT ADDUC

PDB-1d36:
FACILE FORMATION OF A CROSSLINKED ADDUCT BETWEEN DNA AND THE DAUNORUBICIN DERIVATIVE MAR70 MEDIATED BY FORMALDEHYDE: MOLECULAR STRUCTURE OF THE MAR70-D(CGTNACG) COVALENT ADDUC

PDB-1r68:
Role of the amino sugar in DNA binding of disaccharide anthracyclines: crystal structure of MAR70/d(CGATCG) complex

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