ChemComp-KPS: pseudouridine 5'-phosphate, linear

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: KPS
• 名称: 名称: pseudouridine 5'-phosphate, linear; 別称: 1-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-5-O-phosphono-D-ribitol

Chemical information

組成

組成式: C₉H₁₅N₂O₉P / 原子数: 36 / 化学式量: 326.197 / 形式電荷: 0

その他

4gil

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: KPS / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4GIL

履歴

作成	2012年8月16日
Modify name	2012年9月12日
公開	2012年10月26日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / PubChem / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1C(=CNC(=O)N1)CC(O)C(O)C(O)COP(=O)(O)O
• CACTVS 3.370: O[CH](CO[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH](O)CC1=CNC(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C1=C(C(=O)NC(=O)N1)CC(C(C(COP(=O)(O)O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: O[C@H](CO[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H](O)CC1=CNC(=O)NC1=O
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: C1=C(C(=O)NC(=O)N1)C[C@@H]([C@@H]([C@@H](COP(=O)(O)O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C9H15N2O9P/c12-5(1-4-2-10-9(16)11-8(4)15)7(14)6(13)3-20-21(17,18)19/h2,5-7,12-14H,1,3H2,(H2,17,18,19)(H2,10,11,15,16)/t5-,6+,7-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: GIMVKTFECLUQAU-XVMARJQXSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 1-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-5-O-phosphono-D-ribitol
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [(2R,3S,4S)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)-1H-pyrimidin-5-yl]-2,3,4-tris(oxidanyl)pentyl] dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全1件を表示しています

PDB-4gil:
Crystal Structure of Pseudouridine Monophosphate Glycosidase/Linear Pseudouridine 5'-Phosphate Adduct