ChemComp-HPD: 1-HYDROXY-PENTANE-3,4-DIOL-5-PHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: HPD
• 名称: 名称: 1-hydroxy-pentane-3,4-diol-5-phosphate / 別称: OPEN FORM OF 2'-DEOXY-RIBOFURANOSE-5'-PHOSPHATE

Chemical information

組成

組成式: C₅H₁₃O₇P / 原子数: 26 / 化学式量: 216.126 / 形式電荷: 0

その他

1jcl

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: HPD / モデル座標のPDB-ID: 1JCL

履歴

作成	2001年6月20日
記述子を修正	2011年6月4日
Modify synonyms	2020年6月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P(O)(O)OCC(O)C(O)CCO
• CACTVS 3.341: OCC[CH](O)[CH](O)CO[P](O)(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C(CO)C(C(COP(=O)(O)O)O)O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: OCC[C@H](O)[C@H](O)CO[P](O)(O)=O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C(CO)[C@@H]([C@@H](COP(=O)(O)O)O)O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C5H13O7P/c6-2-1-4(7)5(8)3-12-13(9,10)11/h4-8H,1-3H2,(H2,9,10,11)/t4-,5+/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: YCHBTVQJICBXEI-CRCLSJGQSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: 2-deoxy-5-O-phosphono-D-erythro-pentitol
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: [(2R,3S)-2,3,5-trihydroxypentyl] dihydrogen phosphate

PDBエントリ

全3件を表示しています

PDB-1jcj:
OBSERVATION OF COVALENT INTERMEDIATES IN AN ENZYME MECHANISM AT ATOMIC RESOLUTION

PDB-1jcl:
OBSERVATION OF COVALENT INTERMEDIATES IN AN ENZYME MECHANISM AT ATOMIC RESOLUTION

PDB-1ub3:
Crystal Structure of Tetrameric Structure of Aldolase from thermus thermophilus HB8