ChemComp-HEJ: 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phos...

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: HEJ
• 名称: 名称: 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-amine; 別称: Vidarabine-TRIPHOSPHATE / 日化辞名称: ara-ATP

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / 原子数: 47 / 化学式量: 507.181 / 形式電荷: 0

その他

6dwj

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: HEJ / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 6DWJ

履歴

作成	2018年6月27日
Modify synonyms	2018年6月27日
公開	2018年10月24日
Modify synonyms	2021年3月1日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEMBL / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: Nc1ncnc2c1ncn2C3OC(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(=O)O)C(O)C3O
• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]3O
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16N5O13P3/c11-8-5-9(13-2-12-8)15(3-14-5)10-7(17)6(16)4(26-10)1-25-30(21,22)28-31(23,24)27-29(18,19)20/h2-4,6-7,10,16-17H,1H2,(H,21,22)(H,23,24)(H2,11,12,13)(H2,18,19,20)/t4-,6-,7+,10-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: ZKHQWZAMYRWXGA-UHTZMRCNSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 9-{5-O-[(S)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}phosphoryl]-beta-D-arabinofuranosyl}-9H-purin-6-amine
• OpenEye OEToolkits 2.0.6: [[(2~{R},3~{S},4~{S},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-6dwj:
SAMHD1 Bound to Vidarabine-TP in the Catalytic Pocket

PDB-6r4t:
Crystal structure of the Pri1 subunit of human primase bound to vidarabine triphosphate