ChemComp-6NQ: 2'-Bromo-2'-deoxyadenosine 5'-[beta,gamma-imide]triphosphoric acid

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 6NQ
• 名称: 名称: 2'-Bromo-2'-deoxyadenosine 5'-[beta,gamma-imide]triphosphoric acid; 日化辞名称: 2′-ブロモ-2′-デオキシアデノシン5′-[β,γ-イミド]三りん酸

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₆BrN₆O₁₁P₃ / 原子数: 47 / 化学式量: 569.093 / 形式電荷: 0

その他

5jvl

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 6NQ / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5JVL

履歴

作成	2016年5月11日
公開	2017年4月5日

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詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: c12c(c(N)ncn1)ncn2C3OC(COP(=O)(O)OP(O)(NP(O)(O)=O)=O)C(C3Br)O
• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[CH]3O[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)N[P](O)(O)=O)[CH](O)[CH]3Br
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C3C(C(C(O3)COP(=O)(O)OP(=O)(NP(=O)(O)O)O)O)Br)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@H]3O[C@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)N[P](O)(O)=O)[C@@H](O)[C@H]3Br
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)COP(=O)(O)OP(=O)(NP(=O)(O)O)O)O)Br)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H16BrN6O11P3/c11-5-7(18)4(1-26-31(24,25)28-30(22,23)16-29(19,20)21)27-10(5)17-3-15-6-8(12)13-2-14-9(6)17/h2-5,7,10,18H,1H2,(H,24,25)(H2,12,13,14)(H4,16,19,20,21,22,23)/t4-,5-,7-,10-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: GLCRVGHVCJLAHS-QYYRPYCUSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2'-bromo-2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonoamino)phosphoryl]oxy}phosphoryl]adenosine
• OpenEye OEToolkits 2.0.4: [[[[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-bromanyl-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-oxidanyl-phosphoryl]amino]phosphonic acid

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-5jvl:
C4-type pyruvate phospate dikinase: nucleotide binding domain with bound ATP analogue

PDB-5jvn:
C3-type pyruvate phosphate dikinase: intermediate state of the central domain in the swiveling mechanism