ChemComp-4UO: 2,3-dihydroxanthosine

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 4UO
• 名称: 名称: 2,3-dihydroxanthosine / 別称: Xanthosine

Chemical information

組成

組成式: C₁₀H₁₂N₄O₆ / 原子数: 32 / 化学式量: 284.225 / 形式電荷: 0

その他

5bqp

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 4UO / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 5BQP

履歴

作成	2015年6月1日
公開	2015年7月1日
Modify synonyms	2020年6月5日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 12.01: O=C1NC(=O)Nc2c1ncn2C3C(C(C(O3)CO)O)O
• CACTVS 3.385: OC[CH]1O[CH]([CH](O)[CH]1O)n2cnc3C(=O)NC(=O)Nc23
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: c1nc2c(n1C3C(C(C(O3)CO)O)O)NC(=O)NC2=O

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.385: OC[C@H]1O[C@H]([C@H](O)[C@@H]1O)n2cnc3C(=O)NC(=O)Nc23
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: c1nc2c(n1[C@H]3[C@@H]([C@@H]([C@H](O3)CO)O)O)NC(=O)NC2=O

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C10H12N4O6/c15-1-3-5(16)6(17)9(20-3)14-2-11-4-7(14)12-10(19)13-8(4)18/h2-3,5-6,9,15-17H,1H2,(H2,12,13,18,19)/t3-,5-,6-,9-/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: UBORTCNDUKBEOP-UUOKFMHZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 12.01: 2,3-dihydroxanthosine
• OpenEye OEToolkits 1.9.2: 9-[(2R,3R,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]-3H-purine-2,6-dione

PDBエントリ

全6件を表示しています

PDB-5bqp:
Hypoxanthine-guanine-xanthine phosphoribosyltransferase (HGXPRT) from Sulfolobus solfataricus with xanthosine and phosphate bound in the nucleotide binding site and with sulfate bound in the pyrophosphate binding site

PDB-6lov:
crystal structure of alpha-momorcharin in complex with xanthosine

PDB-7dca:
The structure of the Arabidopsis thaliana guanosine deaminase bound by xanthosine

PDB-7dh1:
The structure of the Arabidopsis thaliana guanosine deaminase in reaction with N2-Methylguanosine

PDB-7dm5:
The structure of the Arabidopsis thaliana guanosine deaminase in reaction with guanosine

PDB-7dpk:
The structure of the exchange reaction of the Arabidopsis thaliana guanosine deaminase in complex with 7-deazaguaosine by guanosine