ChemComp-0OJ: South-methanocarba-2'-deoxyadenosine triphosphate

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: 0OJ
• 名称: 名称: South-methanocarba-2'-deoxyadenosine triphosphate; 日化辞名称: [(1S,2R,3S,5S)-3-ヒドロキシ-5-(6-アミノ-9H-プリン-9-イル)ビシクロ[3.1.0]ヘキサン(以下略)

Chemical information

組成

組成式: C₁₂H₁₈N₅O₁₁P₃ / 原子数: 49 / 化学式量: 501.22 / 形式電荷: 0

その他

4ebd

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: 0OJ / 理論座標の詳細: Corina / モデル座標のPDB-ID: 4EBD

履歴

作成	2012年4月3日

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詳細

SMILES

• CACTVS 3.370: Nc1ncnc2n(cnc12)[C]34C[CH](O)[CH](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[CH]3C4
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: c1nc(c2c(n1)n(cn2)C34CC3C(C(C4)O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)N

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.370: Nc1ncnc2n(cnc12)[C@@]34C[C@H](O)[C@@H](CO[P](O)(=O)O[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O)[C@@H]3C4
• OpenEye OEToolkits 1.7.6: c1nc(c2c(n1)n(cn2)[C@]34C[C@H]3[C@@H]([C@H](C4)O)COP(=O)(O)OP(=O)(O)OP(=O)(O)O)N

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C12H18N5O11P3/c13-10-9-11(15-4-14-10)17(5-16-9)12-1-7(12)6(8(18)2-12)3-26-30(22,23)28-31(24,25)27-29(19,20)21/h4-8,18H,1-3H2,(H,22,23)(H,24,25)(H2,13,14,15)(H2,19,20,21)/t6-,7-,8-,12-/m0/s1

InChIKey

• InChI 1.03: DNBZILMJAUSGHT-QZOVBDONSA-N

SYSTEMATIC NAME

• OpenEye OEToolkits 1.7.6: [[(1S,2R,3S,5S)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3-oxidanyl-2-bicyclo[3.1.0]hexanyl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate

PDBエントリ

全2件を表示しています

PDB-4ebd:
Conformationally Restrained North-methanocarba-2'-deoxyadenosine Corrects the Error-Prone Nature of Human DNA Polymerase Iota

PDB-4gc7:
Crystal structure of Dpo4 in complex with S-MC-dADP opposite dT