ChemComp-CDI: 2C-METHYL-D-ERYTHRITOL 2,4-CYCLODIPHOSPHATE

基本情報

• 登録情報: データベース: PDB化学物質要素 / ID: CDI
• 名称: 名称: 2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate; 日化辞名称: (7R)-2,4,7β-トリヒドロキシ-8α-(ヒドロキシメチル)-8-メチル-1,3,5-トリオキサ-2,4-ジホス(以下略)

Chemical information

組成

組成式: C₅H₁₂O₉P₂ / 原子数: 28 / 化学式量: 278.091 / 形式電荷: 0

その他

1jy8

タイプ: NON-POLYMER / PDB分類: HETAIN / 3文字コード: CDI / モデル座標のPDB-ID: 1JY8

履歴

作成	2001年9月18日
記述子を修正	2011年6月4日

• 外部リンク: UniChem / ChemSpider / Brenda / ChEBI / DrugBank / KEGG_Ligand / Metabolights / 日化辞 / PubChem / PubChem_TPharma / SureChEMBL / ZINC / Wikipedia search / Google search

詳細

SMILES

• ACDLabs 10.04: O=P1(OP(=O)(OCC(O)C(O1)(C)CO)O)O
• CACTVS 3.341: C[C]1(CO)O[P](O)(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: CC1(C(COP(=O)(OP(=O)(O1)O)O)O)CO

SMILES CANONICAL

• CACTVS 3.341: C[C@@]1(CO)O[P@@](O)(=O)O[P@@](O)(=O)OC[C@H]1O
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: C[C@@]1([C@@H](CO[P@](=O)(O[P@](=O)(O1)O)O)O)CO

InChI

• InChI 1.03: InChI=1S/C5H12O9P2/c1-5(3-6)4(7)2-12-15(8,9)14-16(10,11)13-5/h4,6-7H,2-3H2,1H3,(H,8,9)(H,10,11)/t4-,5+/m1/s1

InChIKey

• InChI 1.03: SFRQRNJMIIUYDI-UHNVWZDZSA-N

SYSTEMATIC NAME

• ACDLabs 10.04: (2R,4S,6S,7R)-6-(hydroxymethyl)-6-methyl-1,3,5,2,4-trioxadiphosphocane-2,4,7-triol 2,4-dioxide
• OpenEye OEToolkits 1.5.0: (2R,4S,6S,7R)-2,4-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-6-methyl-2,4-dioxo-1,3,5-trioxa-2$l^{5},4$l^{5}-diphosphacyclooctan-7-ol

PDBエントリ

全5件を表示しています

PDB-1h48:
The structure of 2C-Methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase in complex with CMP and product

PDB-1jy8:
2C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase (IspF)

PDB-1knj:
Co-Crystal Structure of 2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate Synthase (ispF) from E. coli Involved in Mevalonate-Independent Isoprenoid Biosynthesis, Complexed with CMP/MECDP/Mn2+

PDB-4g9p:
Structure of the GcpE-MEcPP (IspG) complex from Thermus thermophilus

PDB-4s38:
IspG in complex MEcPP